MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1

Total Repeats: 89164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021905	GAG	2	6	526227	526232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528827353
11002	NC_021905	GAA	2	6	526241	526246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528827353
11003	NC_021905	TCAACA	2	12	526270	526281	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	528827353
11004	NC_021905	CGC	2	6	526286	526291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827353
11005	NC_021905	TCA	2	6	526333	526338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827353
11006	NC_021905	CGG	2	6	526373	526378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827353
11007	NC_021905	TGA	2	6	526393	526398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827353
11008	NC_021905	CGA	2	6	526405	526410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827353
11009	NC_021905	TCA	2	6	526411	526416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827353
11010	NC_021905	GCG	2	6	526428	526433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827353
11011	NC_021905	GC	3	6	526436	526441	0 %	0 %	50 %	50 %	528827353
11012	NC_021905	GCC	2	6	526445	526450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827353
11013	NC_021905	CTCGGC	2	12	526470	526481	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528827353
11014	NC_021905	CCA	2	6	526505	526510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528827353
11015	NC_021905	ATC	2	6	526551	526556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827353
11016	NC_021905	TCG	2	6	526615	526620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827353
11017	NC_021905	CAT	2	6	526727	526732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827353
11018	NC_021905	CGT	2	6	526782	526787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827353
11019	NC_021905	AGA	2	6	526866	526871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528827354
11020	NC_021905	TAC	2	6	526916	526921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827354
11021	NC_021905	GC	4	8	526930	526937	0 %	0 %	50 %	50 %	528827354
11022	NC_021905	CGA	2	6	527089	527094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827354
11023	NC_021905	CGT	2	6	527116	527121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827354
11024	NC_021905	GC	3	6	527128	527133	0 %	0 %	50 %	50 %	528827354
11025	NC_021905	TCG	2	6	527250	527255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827354
11026	NC_021905	AGC	2	6	527258	527263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827354
11027	NC_021905	GC	3	6	527269	527274	0 %	0 %	50 %	50 %	528827354
11028	NC_021905	CGG	2	6	527329	527334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827354
11029	NC_021905	CAG	3	9	527336	527344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827354
11030	NC_021905	GCCGTC	2	12	527363	527374	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528827354
11031	NC_021905	ATCGTC	2	12	527477	527488	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528827354
11032	NC_021905	GCA	2	6	527500	527505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827354
11033	NC_021905	CG	4	8	527509	527516	0 %	0 %	50 %	50 %	528827354
11034	NC_021905	TCG	2	6	527553	527558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827354
11035	NC_021905	CAT	2	6	527617	527622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827354
11036	NC_021905	ATG	3	9	527711	527719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827355
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11038	NC_021905	CGA	2	6	527838	527843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827355
11039	NC_021905	CGCC	2	8	527898	527905	0 %	0 %	25 %	75 %	528827355
11040	NC_021905	CGC	2	6	527955	527960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827355
11041	NC_021905	CGC	2	6	528120	528125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827355
11042	NC_021905	ATG	2	6	528208	528213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827355
11043	NC_021905	CCA	2	6	528290	528295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528827355
11044	NC_021905	CTA	2	6	528312	528317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827355
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11048	NC_021905	TGC	2	6	528720	528725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827356
11049	NC_021905	ATC	2	6	528791	528796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827356
11050	NC_021905	GC	3	6	528806	528811	0 %	0 %	50 %	50 %	528827356
11051	NC_021905	GAG	2	6	528815	528820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528827356
11052	NC_021905	AGCG	2	8	528821	528828	25 %	0 %	50 %	25 %	528827356
11053	NC_021905	CGA	2	6	528853	528858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827356
11054	NC_021905	GTC	2	6	528863	528868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827356
11055	NC_021905	TCG	2	6	528891	528896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827356
11056	NC_021905	TGC	2	6	528912	528917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827356
11057	NC_021905	GCG	2	6	528957	528962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827356
11058	NC_021905	CCGA	2	8	529025	529032	25 %	0 %	25 %	50 %	528827356
11059	NC_021905	CTG	2	6	529040	529045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827356
11060	NC_021905	GTC	2	6	529057	529062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827356
11061	NC_021905	GCCGG	2	10	529063	529072	0 %	0 %	60 %	40 %	528827356
11062	NC_021905	CGA	2	6	529126	529131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827356
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11064	NC_021905	GCC	2	6	529374	529379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827357
11065	NC_021905	GTC	2	6	529472	529477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827357
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11069	NC_021905	CTG	2	6	529634	529639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827357
11070	NC_021905	GTG	2	6	529656	529661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528827357
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11078	NC_021905	CGAG	2	8	530369	530376	25 %	0 %	50 %	25 %	528827358
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11088	NC_021905	CCGCG	2	10	530822	530831	0 %	0 %	40 %	60 %	528827358
11089	NC_021905	GCA	2	6	530847	530852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827358
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11100	NC_021905	GCCG	2	8	531383	531390	0 %	0 %	50 %	50 %	528827358
11101	NC_021905	CTT	2	6	531408	531413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827358
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11103	NC_021905	TGG	2	6	531421	531426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528827358
11104	NC_021905	CCG	2	6	531430	531435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827358
11105	NC_021905	CG	3	6	531455	531460	0 %	0 %	50 %	50 %	528827358
11106	NC_021905	GC	3	6	531467	531472	0 %	0 %	50 %	50 %	528827358
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11115	NC_021905	GACG	2	8	531930	531937	25 %	0 %	50 %	25 %	528827359
11116	NC_021905	GAG	2	6	531979	531984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528827359
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11118	NC_021905	TGC	2	6	532040	532045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827359
11119	NC_021905	CG	3	6	532065	532070	0 %	0 %	50 %	50 %	528827359
11120	NC_021905	ATG	2	6	532172	532177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827359
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11122	NC_021905	GCA	2	6	532310	532315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827359
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11474	NC_021905	GGA	2	6	549533	549538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528827374
11475	NC_021905	CGAT	2	8	549607	549614	25 %	25 %	25 %	25 %	528827374
11476	NC_021905	CGG	2	6	549643	549648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827374
11477	NC_021905	TTG	2	6	549663	549668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528827374
11478	NC_021905	CGGCG	2	10	549688	549697	0 %	0 %	60 %	40 %	528827374
11479	NC_021905	TG	3	6	549763	549768	0 %	50 %	50 %	0 %	528827374
11480	NC_021905	TGCG	2	8	549945	549952	0 %	25 %	50 %	25 %	528827375
11481	NC_021905	TCG	2	6	550000	550005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827375
11482	NC_021905	CTG	2	6	550079	550084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827375
11483	NC_021905	TGC	2	6	550195	550200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827375
11484	NC_021905	GGA	2	6	550220	550225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528827375
11485	NC_021905	CGG	2	6	550263	550268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827375
11486	NC_021905	TCG	2	6	550270	550275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827375
11487	NC_021905	CGT	2	6	550279	550284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827375
11488	NC_021905	GAT	2	6	550298	550303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827375
11489	NC_021905	GC	3	6	550326	550331	0 %	0 %	50 %	50 %	528827375
11490	NC_021905	AGC	2	6	550380	550385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827375
11491	NC_021905	CG	3	6	550422	550427	0 %	0 %	50 %	50 %	528827375
11492	NC_021905	CGA	2	6	550447	550452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827375
11493	NC_021905	GTC	2	6	550514	550519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827375
11494	NC_021905	ATG	3	9	550524	550532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827375
11495	NC_021905	ATCAG	2	10	550630	550639	40 %	20 %	20 %	20 %	528827376
11496	NC_021905	TCT	2	6	550641	550646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827376
11497	NC_021905	TCA	2	6	550707	550712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827376
11498	NC_021905	TCT	2	6	550713	550718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827376
11499	NC_021905	ATG	2	6	550721	550726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827376
11500	NC_021905	GCTC	2	8	550763	550770	0 %	25 %	25 %	50 %	528827376

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