MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia solanacearum FQY_4 megaplasmid

Total Repeats: 47834

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021745	CAT	2	6	1230	1235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525710957
2	NC_021745	G	6	6	1245	1250	0 %	0 %	100 %	0 %	525710957
3	NC_021745	CGA	2	6	1290	1295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710957
4	NC_021745	GCG	2	6	1331	1336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710957
5	NC_021745	CG	3	6	1384	1389	0 %	0 %	50 %	50 %	525710957
6	NC_021745	CGC	2	6	1400	1405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710957
7	NC_021745	TGA	2	6	1439	1444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525710957
8	NC_021745	CCAG	2	8	1446	1453	25 %	0 %	25 %	50 %	525710957
9	NC_021745	GC	3	6	1479	1484	0 %	0 %	50 %	50 %	525710957
10	NC_021745	GGC	2	6	1493	1498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710957
11	NC_021745	GAA	3	9	1590	1598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525710957
12	NC_021745	CCG	2	6	1629	1634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710957
13	NC_021745	GGC	2	6	1696	1701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710957
14	NC_021745	CAG	2	6	1729	1734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710957
15	NC_021745	CAA	2	6	1788	1793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525710957
16	NC_021745	TCGA	2	8	1813	1820	25 %	25 %	25 %	25 %	525710957
17	NC_021745	TGG	2	6	1858	1863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525710957
18	NC_021745	TCG	2	6	1904	1909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710957
19	NC_021745	GC	4	8	1965	1972	0 %	0 %	50 %	50 %	525710957
20	NC_021745	CTT	2	6	2031	2036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525710957
21	NC_021745	TGG	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525710957
22	NC_021745	CACG	2	8	2216	2223	25 %	0 %	25 %	50 %	525710957
23	NC_021745	CCG	2	6	3255	3260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710958
24	NC_021745	TGA	2	6	3268	3273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525710958
25	NC_021745	GAC	2	6	3777	3782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710959
26	NC_021745	GCAT	2	8	3788	3795	25 %	25 %	25 %	25 %	525710959
27	NC_021745	TCG	2	6	3836	3841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710959
28	NC_021745	GGC	2	6	3873	3878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710959
29	NC_021745	GACTAC	2	12	3973	3984	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525710959
30	NC_021745	CTT	2	6	4022	4027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525710959
31	NC_021745	GTT	2	6	4035	4040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525710959
32	NC_021745	CAT	2	6	4056	4061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525710959
33	NC_021745	CGC	2	6	4076	4081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710959
34	NC_021745	GCG	2	6	4093	4098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710959
35	NC_021745	GGC	2	6	4101	4106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710959
36	NC_021745	GCA	2	6	4119	4124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710959
37	NC_021745	TGA	2	6	4221	4226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525710959
38	NC_021745	CAT	2	6	4347	4352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525710959
39	NC_021745	GTT	2	6	4371	4376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525710959
40	NC_021745	GGCA	2	8	4385	4392	25 %	0 %	50 %	25 %	525710959
41	NC_021745	CGC	2	6	4439	4444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710960
42	NC_021745	GCT	2	6	4517	4522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710960
43	NC_021745	GCG	2	6	4580	4585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710960
44	NC_021745	GTC	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710960
45	NC_021745	CAG	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710960
46	NC_021745	CAG	2	6	4695	4700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710960
47	NC_021745	GC	3	6	4772	4777	0 %	0 %	50 %	50 %	525710960
48	NC_021745	CGC	2	6	4781	4786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710960
49	NC_021745	AGC	2	6	4870	4875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710960
50	NC_021745	CTT	2	6	4920	4925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525710960
51	NC_021745	GAT	2	6	4926	4931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525710960
52	NC_021745	A	7	7	4940	4946	100 %	0 %	0 %	0 %	525710960
53	NC_021745	GAA	2	6	4947	4952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525710960
54	NC_021745	CAA	2	6	4991	4996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525710960
55	NC_021745	GTT	2	6	5006	5011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525710960
56	NC_021745	TGA	2	6	5038	5043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525710960
57	NC_021745	AAGAC	2	10	5113	5122	60 %	0 %	20 %	20 %	525710960
58	NC_021745	GGA	2	6	5147	5152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525710960
59	NC_021745	GCC	2	6	5230	5235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710960
60	NC_021745	CTG	2	6	5265	5270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710960
61	NC_021745	GAC	2	6	5322	5327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710960
62	NC_021745	GGC	2	6	5330	5335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710960
63	NC_021745	TGG	2	6	5347	5352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525710960
64	NC_021745	GCT	2	6	5387	5392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710960
65	NC_021745	AGCC	2	8	5395	5402	25 %	0 %	25 %	50 %	525710960
66	NC_021745	AGC	2	6	5742	5747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710961
67	NC_021745	CCAT	2	8	5766	5773	25 %	25 %	0 %	50 %	525710961
68	NC_021745	CGC	2	6	5867	5872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710961
69	NC_021745	CTGG	2	8	5881	5888	0 %	25 %	50 %	25 %	525710961
70	NC_021745	G	6	6	5958	5963	0 %	0 %	100 %	0 %	525710961
71	NC_021745	ATCGGT	2	12	6089	6100	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525710961
72	NC_021745	ATGG	2	8	6121	6128	25 %	25 %	50 %	0 %	525710961
73	NC_021745	CG	3	6	6158	6163	0 %	0 %	50 %	50 %	525710961
74	NC_021745	GC	3	6	6179	6184	0 %	0 %	50 %	50 %	525710961
75	NC_021745	GGC	2	6	6199	6204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710961
76	NC_021745	ACG	2	6	6378	6383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710961
77	NC_021745	CAG	2	6	6392	6397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710961
78	NC_021745	CGG	2	6	6485	6490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710961
79	NC_021745	G	6	6	6501	6506	0 %	0 %	100 %	0 %	525710961
80	NC_021745	GGGT	2	8	6521	6528	0 %	25 %	75 %	0 %	525710961
81	NC_021745	ACA	2	6	6777	6782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525710962
82	NC_021745	AGCC	2	8	6873	6880	25 %	0 %	25 %	50 %	525710962
83	NC_021745	TGC	2	6	6890	6895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710962
84	NC_021745	GGA	2	6	6930	6935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525710962
85	NC_021745	GCA	3	9	6940	6948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710962
86	NC_021745	GAT	2	6	6960	6965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525710962
87	NC_021745	GC	3	6	6978	6983	0 %	0 %	50 %	50 %	525710962
88	NC_021745	GC	3	6	6987	6992	0 %	0 %	50 %	50 %	525710962
89	NC_021745	GAA	2	6	7044	7049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525710962
90	NC_021745	GTCCA	2	10	7072	7081	20 %	20 %	20 %	40 %	525710962
91	NC_021745	CTGGGC	2	12	7129	7140	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525710962
92	NC_021745	GCTGT	2	10	7144	7153	0 %	40 %	40 %	20 %	525710962
93	NC_021745	CGA	2	6	7173	7178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710962
94	NC_021745	CTG	2	6	7207	7212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710962
95	NC_021745	GCA	2	6	7233	7238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710962
96	NC_021745	TCG	2	6	7274	7279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710962
97	NC_021745	CGC	2	6	7295	7300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710962
98	NC_021745	GTG	2	6	7321	7326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525710962
99	NC_021745	TCG	2	6	7370	7375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710962
100	NC_021745	CGC	2	6	7436	7441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710962
101	NC_021745	ATC	2	6	7451	7456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525710962
102	NC_021745	GCG	2	6	7481	7486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710962
103	NC_021745	GAG	2	6	7525	7530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525710962
104	NC_021745	GCA	2	6	7574	7579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710962
105	NC_021745	GCC	2	6	7847	7852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710963
106	NC_021745	CG	3	6	7903	7908	0 %	0 %	50 %	50 %	525710963
107	NC_021745	CTT	2	6	7929	7934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525710963
108	NC_021745	CCCA	2	8	7946	7953	25 %	0 %	0 %	75 %	525710963
109	NC_021745	GCC	2	6	8005	8010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710963
110	NC_021745	ACG	2	6	8079	8084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710964
111	NC_021745	TCT	2	6	8130	8135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525710964
112	NC_021745	GTCG	2	8	8140	8147	0 %	25 %	50 %	25 %	525710964
113	NC_021745	TCG	2	6	8154	8159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710964
114	NC_021745	CTT	2	6	8212	8217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525710964
115	NC_021745	CGG	3	9	8253	8261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710964
116	NC_021745	GGCT	2	8	8297	8304	0 %	25 %	50 %	25 %	525710964
117	NC_021745	GC	4	8	8338	8345	0 %	0 %	50 %	50 %	525710964
118	NC_021745	GTCG	2	8	8353	8360	0 %	25 %	50 %	25 %	525710964
119	NC_021745	CCA	2	6	8409	8414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525710964
120	NC_021745	GCT	2	6	8434	8439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710964
121	NC_021745	CTG	2	6	8453	8458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710964
122	NC_021745	GTCG	2	8	8467	8474	0 %	25 %	50 %	25 %	525710964
123	NC_021745	GCG	2	6	8475	8480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710964
124	NC_021745	GCT	2	6	8593	8598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710964
125	NC_021745	GCA	2	6	8608	8613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710964
126	NC_021745	TTC	2	6	8663	8668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525710964
127	NC_021745	GC	3	6	8682	8687	0 %	0 %	50 %	50 %	525710964
128	NC_021745	GGA	2	6	8716	8721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525710964
129	NC_021745	GAA	2	6	8755	8760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525710964
130	NC_021745	CG	3	6	8793	8798	0 %	0 %	50 %	50 %	525710964
131	NC_021745	GGT	2	6	8809	8814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525710964
132	NC_021745	GGC	2	6	8828	8833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710964
133	NC_021745	GCT	3	9	8932	8940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710964
134	NC_021745	CTG	2	6	8948	8953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710964
135	NC_021745	GGT	2	6	8959	8964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525710964
136	NC_021745	GGC	2	6	8966	8971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710964
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140	NC_021745	GGT	2	6	9142	9147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525710964
141	NC_021745	GTT	2	6	9157	9162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525710964
142	NC_021745	GC	4	8	9175	9182	0 %	0 %	50 %	50 %	525710964
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152	NC_021745	GGCC	2	8	9544	9551	0 %	0 %	50 %	50 %	525710965
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259	NC_021745	CAG	2	6	12702	12707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710967
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262	NC_021745	GCG	2	6	12786	12791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710967
263	NC_021745	GCA	2	6	12811	12816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710967
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391	NC_021745	GGC	2	6	16750	16755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710970
392	NC_021745	CGA	2	6	16756	16761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710970
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394	NC_021745	GTT	2	6	16795	16800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525710970
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