MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 65450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_021040	TG	3	6	1335042	1335047	0 %	50 %	50 %	0 %	479202942
21502	NC_021040	CAC	2	6	1335128	1335133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479202942
21503	NC_021040	CT	3	6	1335160	1335165	0 %	50 %	0 %	50 %	479202942
21504	NC_021040	TCT	2	6	1335169	1335174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202942
21505	NC_021040	TGA	2	6	1335236	1335241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202942
21506	NC_021040	TCT	2	6	1335311	1335316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202942
21507	NC_021040	CGAT	2	8	1335395	1335402	25 %	25 %	25 %	25 %	479202942
21508	NC_021040	TTTA	2	8	1335429	1335436	25 %	75 %	0 %	0 %	479202942
21509	NC_021040	T	6	6	1335471	1335476	0 %	100 %	0 %	0 %	479202942
21510	NC_021040	ATG	2	6	1335492	1335497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202942
21511	NC_021040	TACCGA	2	12	1335548	1335559	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479202942
21512	NC_021040	TGA	2	6	1335593	1335598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202942
21513	NC_021040	TG	3	6	1335604	1335609	0 %	50 %	50 %	0 %	479202942
21514	NC_021040	T	6	6	1335678	1335683	0 %	100 %	0 %	0 %	479202942
21515	NC_021040	CGGG	2	8	1335819	1335826	0 %	0 %	75 %	25 %	479202942
21516	NC_021040	TTTA	2	8	1335843	1335850	25 %	75 %	0 %	0 %	479202942
21517	NC_021040	TCA	2	6	1335887	1335892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202942
21518	NC_021040	CAC	2	6	1335980	1335985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479202942
21519	NC_021040	T	6	6	1336051	1336056	0 %	100 %	0 %	0 %	479202942
21520	NC_021040	TC	4	8	1336078	1336085	0 %	50 %	0 %	50 %	479202942
21521	NC_021040	CG	3	6	1336128	1336133	0 %	0 %	50 %	50 %	479202942
21522	NC_021040	CGC	2	6	1336139	1336144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202942
21523	NC_021040	AGC	2	6	1336153	1336158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202942
21524	NC_021040	GTT	2	6	1336171	1336176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202942
21525	NC_021040	AAT	2	6	1336197	1336202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202942
21526	NC_021040	TTTCAT	2	12	1336227	1336238	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479202942
21527	NC_021040	TC	3	6	1336247	1336252	0 %	50 %	0 %	50 %	479202942
21528	NC_021040	TG	3	6	1336258	1336263	0 %	50 %	50 %	0 %	479202942
21529	NC_021040	A	6	6	1336290	1336295	100 %	0 %	0 %	0 %	479202942
21530	NC_021040	TA	3	6	1336302	1336307	50 %	50 %	0 %	0 %	479202942
21531	NC_021040	T	7	7	1336337	1336343	0 %	100 %	0 %	0 %	479202942
21532	NC_021040	AAC	2	6	1336548	1336553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202943
21533	NC_021040	TGA	2	6	1336678	1336683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202943
21534	NC_021040	GACAG	2	10	1336739	1336748	40 %	0 %	40 %	20 %	479202943
21535	NC_021040	GAAAA	2	10	1336773	1336782	80 %	0 %	20 %	0 %	479202943
21536	NC_021040	GA	3	6	1336808	1336813	50 %	0 %	50 %	0 %	479202943
21537	NC_021040	TATG	2	8	1336875	1336882	25 %	50 %	25 %	0 %	479202943
21538	NC_021040	AG	3	6	1336917	1336922	50 %	0 %	50 %	0 %	479202943
21539	NC_021040	TCT	2	6	1336931	1336936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202943
21540	NC_021040	CTG	2	6	1336985	1336990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202943
21541	NC_021040	A	6	6	1337076	1337081	100 %	0 %	0 %	0 %	479202943
21542	NC_021040	A	6	6	1337101	1337106	100 %	0 %	0 %	0 %	479202943
21543	NC_021040	T	6	6	1337141	1337146	0 %	100 %	0 %	0 %	479202943
21544	NC_021040	GAT	2	6	1337640	1337645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202944
21545	NC_021040	ATCA	2	8	1337656	1337663	50 %	25 %	0 %	25 %	479202944
21546	NC_021040	ACA	2	6	1337692	1337697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202944
21547	NC_021040	GAC	2	6	1337715	1337720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202944
21548	NC_021040	AGA	2	6	1337721	1337726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202944
21549	NC_021040	GCT	2	6	1337746	1337751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202944
21550	NC_021040	AG	3	6	1337809	1337814	50 %	0 %	50 %	0 %	479202944
21551	NC_021040	GAA	2	6	1337830	1337835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202944
21552	NC_021040	TGGA	2	8	1337852	1337859	25 %	25 %	50 %	0 %	479202944
21553	NC_021040	CTA	2	6	1337913	1337918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202944
21554	NC_021040	TAT	2	6	1337949	1337954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202944
21555	NC_021040	ATG	2	6	1338020	1338025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202944
21556	NC_021040	GCA	2	6	1338073	1338078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202944
21557	NC_021040	GTA	2	6	1338136	1338141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202944
21558	NC_021040	A	6	6	1338244	1338249	100 %	0 %	0 %	0 %	479202944
21559	NC_021040	TGC	2	6	1338396	1338401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202944
21560	NC_021040	GAA	2	6	1338420	1338425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202944
21561	NC_021040	TAAA	2	8	1338523	1338530	75 %	25 %	0 %	0 %	479202945
21562	NC_021040	AG	3	6	1338535	1338540	50 %	0 %	50 %	0 %	479202945
21563	NC_021040	A	6	6	1338542	1338547	100 %	0 %	0 %	0 %	479202945
21564	NC_021040	AGG	2	6	1338616	1338621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202945
21565	NC_021040	TCTG	2	8	1338699	1338706	0 %	50 %	25 %	25 %	479202945
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21567	NC_021040	TA	3	6	1338769	1338774	50 %	50 %	0 %	0 %	479202945
21568	NC_021040	GTA	2	6	1338795	1338800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202945
21569	NC_021040	GAG	2	6	1338822	1338827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202945
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21571	NC_021040	A	6	6	1338855	1338860	100 %	0 %	0 %	0 %	479202945
21572	NC_021040	CCGG	2	8	1338945	1338952	0 %	0 %	50 %	50 %	479202945
21573	NC_021040	TCG	2	6	1338967	1338972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202945
21574	NC_021040	GCACTT	2	12	1339014	1339025	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479202945
21575	NC_021040	ATGA	2	8	1339035	1339042	50 %	25 %	25 %	0 %	479202945
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21578	NC_021040	A	6	6	1339102	1339107	100 %	0 %	0 %	0 %	479202945
21579	NC_021040	GCG	2	6	1339132	1339137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202945
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21583	NC_021040	CGG	2	6	1339270	1339275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202945
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21585	NC_021040	GCG	2	6	1339479	1339484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202946
21586	NC_021040	A	6	6	1339586	1339591	100 %	0 %	0 %	0 %	479202946
21587	NC_021040	GCAAT	2	10	1339633	1339642	40 %	20 %	20 %	20 %	479202946
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21589	NC_021040	A	6	6	1339656	1339661	100 %	0 %	0 %	0 %	479202946
21590	NC_021040	GGA	2	6	1339730	1339735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202946
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21592	NC_021040	CGGT	2	8	1339911	1339918	0 %	25 %	50 %	25 %	479202946
21593	NC_021040	GCG	2	6	1339935	1339940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202946
21594	NC_021040	CCG	2	6	1339970	1339975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202946
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21598	NC_021040	GCG	2	6	1340112	1340117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202946
21599	NC_021040	GCAT	2	8	1340130	1340137	25 %	25 %	25 %	25 %	479202946
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21601	NC_021040	ACG	2	6	1340302	1340307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202946
21602	NC_021040	A	6	6	1340320	1340325	100 %	0 %	0 %	0 %	479202946
21603	NC_021040	CGATCA	2	12	1340335	1340346	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479202946
21604	NC_021040	CTT	2	6	1340409	1340414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202946
21605	NC_021040	GT	4	8	1340445	1340452	0 %	50 %	50 %	0 %	479202946
21606	NC_021040	GGA	2	6	1340453	1340458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202946
21607	NC_021040	TC	3	6	1340519	1340524	0 %	50 %	0 %	50 %	479202946
21608	NC_021040	AGA	2	6	1340525	1340530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202946
21609	NC_021040	T	6	6	1340600	1340605	0 %	100 %	0 %	0 %	479202946
21610	NC_021040	TA	3	6	1340632	1340637	50 %	50 %	0 %	0 %	479202946
21611	NC_021040	TCT	2	6	1340645	1340650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202946
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21613	NC_021040	CG	3	6	1340756	1340761	0 %	0 %	50 %	50 %	479202946
21614	NC_021040	TAT	2	6	1340769	1340774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202946
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21966	NC_021040	GCA	2	6	1368948	1368953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202966
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21972	NC_021040	GAA	2	6	1369371	1369376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202966
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