MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 65450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021040	TGC	2	6	92188	92193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201902
1502	NC_021040	TCC	2	6	92235	92240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201902
1503	NC_021040	TGG	2	6	92293	92298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201902
1504	NC_021040	T	7	7	92341	92347	0 %	100 %	0 %	0 %	479201902
1505	NC_021040	AT	3	6	92386	92391	50 %	50 %	0 %	0 %	479201902
1506	NC_021040	AGC	2	6	92403	92408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201902
1507	NC_021040	ACT	2	6	92460	92465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201902
1508	NC_021040	TCA	2	6	92550	92555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201902
1509	NC_021040	TCC	2	6	92722	92727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201902
1510	NC_021040	TCT	2	6	92758	92763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201902
1511	NC_021040	AAG	2	6	92777	92782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201902
1512	NC_021040	A	6	6	92819	92824	100 %	0 %	0 %	0 %	479201902
1513	NC_021040	TCT	2	6	92869	92874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201902
1514	NC_021040	TAA	2	6	92878	92883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201902
1515	NC_021040	AT	3	6	92886	92891	50 %	50 %	0 %	0 %	479201902
1516	NC_021040	TGG	2	6	92908	92913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201902
1517	NC_021040	ATT	2	6	92918	92923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201902
1518	NC_021040	AAC	2	6	92937	92942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201902
1519	NC_021040	AAAACC	2	12	92950	92961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201902
1520	NC_021040	TAA	2	6	94023	94028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201903
1521	NC_021040	T	8	8	94068	94075	0 %	100 %	0 %	0 %	479201903
1522	NC_021040	ACA	2	6	94131	94136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201903
1523	NC_021040	TCA	2	6	94146	94151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201903
1524	NC_021040	ATT	2	6	94265	94270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201903
1525	NC_021040	CAG	2	6	94311	94316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201904
1526	NC_021040	ATA	2	6	94321	94326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201904
1527	NC_021040	AT	3	6	94473	94478	50 %	50 %	0 %	0 %	479201904
1528	NC_021040	TTTC	2	8	94481	94488	0 %	75 %	0 %	25 %	479201904
1529	NC_021040	T	6	6	94539	94544	0 %	100 %	0 %	0 %	479201904
1530	NC_021040	CAT	2	6	94545	94550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201904
1531	NC_021040	TTTG	2	8	94577	94584	0 %	75 %	25 %	0 %	479201904
1532	NC_021040	TTATT	2	10	95666	95675	20 %	80 %	0 %	0 %	479201905
1533	NC_021040	A	6	6	95724	95729	100 %	0 %	0 %	0 %	479201905
1534	NC_021040	A	6	6	95767	95772	100 %	0 %	0 %	0 %	479201905
1535	NC_021040	AGG	2	6	95781	95786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201905
1536	NC_021040	GAA	2	6	95805	95810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201906
1537	NC_021040	AGC	2	6	95927	95932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201906
1538	NC_021040	GCA	2	6	95934	95939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201906
1539	NC_021040	AGC	2	6	95942	95947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201906
1540	NC_021040	GGC	2	6	95997	96002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201906
1541	NC_021040	CAGA	2	8	96039	96046	50 %	0 %	25 %	25 %	479201906
1542	NC_021040	CTG	2	6	96166	96171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201906
1543	NC_021040	CTG	2	6	96177	96182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201906
1544	NC_021040	GAA	2	6	96213	96218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201906
1545	NC_021040	TAT	2	6	96237	96242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201906
1546	NC_021040	GTTT	2	8	96285	96292	0 %	75 %	25 %	0 %	479201906
1547	NC_021040	GGAT	2	8	96365	96372	25 %	25 %	50 %	0 %	479201906
1548	NC_021040	AT	3	6	96371	96376	50 %	50 %	0 %	0 %	479201906
1549	NC_021040	TG	3	6	97801	97806	0 %	50 %	50 %	0 %	479201907
1550	NC_021040	GCTG	2	8	97829	97836	0 %	25 %	50 %	25 %	479201907
1551	NC_021040	GGAT	2	8	97869	97876	25 %	25 %	50 %	0 %	479201907
1552	NC_021040	GAC	2	6	97896	97901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201907
1553	NC_021040	GCG	2	6	97957	97962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201907
1554	NC_021040	CGAT	2	8	97982	97989	25 %	25 %	25 %	25 %	479201907
1555	NC_021040	CAATTT	2	12	97994	98005	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479201907
1556	NC_021040	AGA	2	6	98073	98078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201907
1557	NC_021040	CGGA	2	8	98103	98110	25 %	0 %	50 %	25 %	479201907
1558	NC_021040	TGACC	2	10	98126	98135	20 %	20 %	20 %	40 %	479201907
1559	NC_021040	TGT	2	6	98189	98194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201907
1560	NC_021040	GAT	2	6	98229	98234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201907
1561	NC_021040	AT	3	6	98233	98238	50 %	50 %	0 %	0 %	479201907
1562	NC_021040	CCT	2	6	98267	98272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201907
1563	NC_021040	CCG	2	6	98307	98312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201907
1564	NC_021040	CAT	2	6	99536	99541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201908
1565	NC_021040	GCA	2	6	99565	99570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201908
1566	NC_021040	GGTATC	2	12	99589	99600	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479201908
1567	NC_021040	ATT	2	6	99672	99677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201908
1568	NC_021040	GTT	2	6	99721	99726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201908
1569	NC_021040	ATT	2	6	99781	99786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201909
1570	NC_021040	CGT	2	6	99802	99807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201909
1571	NC_021040	CAT	2	6	99814	99819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201909
1572	NC_021040	AGC	2	6	99885	99890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201909
1573	NC_021040	GAT	2	6	99898	99903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201909
1574	NC_021040	CAA	2	6	99925	99930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201909
1575	NC_021040	ATC	2	6	100085	100090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201909
1576	NC_021040	GCA	3	9	100172	100180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201909
1577	NC_021040	ACGA	2	8	100205	100212	50 %	0 %	25 %	25 %	479201909
1578	NC_021040	GGT	2	6	100253	100258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201909
1579	NC_021040	AAT	2	6	100278	100283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201909
1580	NC_021040	TGA	2	6	100328	100333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201910
1581	NC_021040	TTCT	2	8	100345	100352	0 %	75 %	0 %	25 %	479201910
1582	NC_021040	GGT	2	6	100460	100465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201910
1583	NC_021040	ATG	2	6	100513	100518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201910
1584	NC_021040	AAG	2	6	100656	100661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201910
1585	NC_021040	AGA	3	9	100703	100711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201910
1586	NC_021040	AG	3	6	100742	100747	50 %	0 %	50 %	0 %	479201910
1587	NC_021040	AAG	2	6	102375	102380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201911
1588	NC_021040	ACA	2	6	102617	102622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201911
1589	NC_021040	TCG	3	9	102629	102637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201911
1590	NC_021040	AAGG	2	8	102664	102671	50 %	0 %	50 %	0 %	479201911
1591	NC_021040	AAC	2	6	102766	102771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201911
1592	NC_021040	CAT	2	6	102789	102794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201911
1593	NC_021040	ATG	2	6	102835	102840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201911
1594	NC_021040	AGG	2	6	102899	102904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201911
1595	NC_021040	ATTT	2	8	102969	102976	25 %	75 %	0 %	0 %	479201911
1596	NC_021040	ATG	2	6	103021	103026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201911
1597	NC_021040	GGC	2	6	103035	103040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201911
1598	NC_021040	ACAG	2	8	103042	103049	50 %	0 %	25 %	25 %	479201911
1599	NC_021040	CAG	2	6	103114	103119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201911
1600	NC_021040	CGG	2	6	103134	103139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201911
1601	NC_021040	AGA	2	6	103151	103156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201911
1602	NC_021040	AGA	2	6	103160	103165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201911
1603	NC_021040	A	6	6	103165	103170	100 %	0 %	0 %	0 %	479201911
1604	NC_021040	GTA	2	6	103230	103235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201912
1605	NC_021040	CGG	2	6	103295	103300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201912
1606	NC_021040	GCACA	2	10	103323	103332	40 %	0 %	20 %	40 %	479201912
1607	NC_021040	TAT	2	6	103355	103360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201912
1608	NC_021040	GTT	2	6	103398	103403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201912
1609	NC_021040	CGG	2	6	103484	103489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201912
1610	NC_021040	GA	3	6	103504	103509	50 %	0 %	50 %	0 %	479201912
1611	NC_021040	GGT	2	6	103620	103625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201912
1612	NC_021040	GGT	2	6	103641	103646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201912
1613	NC_021040	CGG	2	6	103706	103711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201912
1614	NC_021040	AG	3	6	103746	103751	50 %	0 %	50 %	0 %	479201912
1615	NC_021040	GCC	2	6	103829	103834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201912
1616	NC_021040	TGA	2	6	103889	103894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201912
1617	NC_021040	ATA	2	6	103924	103929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201912
1618	NC_021040	GAC	2	6	104100	104105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201912
1619	NC_021040	GAG	2	6	104232	104237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201912
1620	NC_021040	TGT	2	6	104240	104245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201912
1621	NC_021040	GAG	2	6	104349	104354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201912
1622	NC_021040	TTG	2	6	104362	104367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201912
1623	NC_021040	AAGA	2	8	104378	104385	75 %	0 %	25 %	0 %	479201912
1624	NC_021040	GATG	2	8	104501	104508	25 %	25 %	50 %	0 %	479201912
1625	NC_021040	GCT	2	6	104520	104525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201912
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1629	NC_021040	ATC	2	6	104822	104827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201913
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1633	NC_021040	ATC	2	6	104952	104957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201913
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1641	NC_021040	TA	3	6	105534	105539	50 %	50 %	0 %	0 %	479201914
1642	NC_021040	A	6	6	105658	105663	100 %	0 %	0 %	0 %	479201914
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1649	NC_021040	GTTTGG	2	12	105891	105902	0 %	50 %	50 %	0 %	479201914
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1652	NC_021040	CAACC	2	10	106634	106643	40 %	0 %	0 %	60 %	479201915
1653	NC_021040	CA	3	6	106686	106691	50 %	0 %	0 %	50 %	479201915
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1989	NC_021040	CCGG	2	8	128521	128528	0 %	0 %	50 %	50 %	479201928
1990	NC_021040	GGA	2	6	128546	128551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201928
1991	NC_021040	TGC	2	6	128554	128559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201928
1992	NC_021040	AGAA	2	8	128562	128569	75 %	0 %	25 %	0 %	479201928
1993	NC_021040	ACCGC	2	10	128576	128585	20 %	0 %	20 %	60 %	479201928
1994	NC_021040	AT	3	6	128629	128634	50 %	50 %	0 %	0 %	479201928
1995	NC_021040	ATG	2	6	128664	128669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201928
1996	NC_021040	AGC	2	6	128683	128688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201928
1997	NC_021040	TATG	2	8	128904	128911	25 %	50 %	25 %	0 %	479201929
1998	NC_021040	CAG	2	6	128993	128998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201929
1999	NC_021040	A	7	7	129056	129062	100 %	0 %	0 %	0 %	479201929
2000	NC_021040	CAG	2	6	129066	129071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201929

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