MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 65450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_021040	ATTT	2	8	1180455	1180462	25 %	75 %	0 %	0 %	479202810
19003	NC_021040	AAAAC	2	10	1180478	1180487	80 %	0 %	0 %	20 %	479202810
19004	NC_021040	GAA	2	6	1180577	1180582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202810
19005	NC_021040	GCA	2	6	1180597	1180602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202810
19006	NC_021040	GAT	2	6	1180603	1180608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202810
19007	NC_021040	ATT	2	6	1180696	1180701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202810
19008	NC_021040	GAAA	2	8	1180720	1180727	75 %	0 %	25 %	0 %	479202810
19009	NC_021040	T	6	6	1180756	1180761	0 %	100 %	0 %	0 %	479202810
19010	NC_021040	GAA	2	6	1180835	1180840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202810
19011	NC_021040	ATG	2	6	1180868	1180873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202810
19012	NC_021040	TGA	2	6	1180885	1180890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202810
19013	NC_021040	AAG	2	6	1181118	1181123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202810
19014	NC_021040	CGAT	2	8	1181139	1181146	25 %	25 %	25 %	25 %	479202810
19015	NC_021040	ATT	2	6	1181228	1181233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202810
19016	NC_021040	CTG	2	6	1181267	1181272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202810
19017	NC_021040	AGATCG	2	12	1181286	1181297	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479202810
19018	NC_021040	CTT	2	6	1181315	1181320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202810
19019	NC_021040	GGT	2	6	1181366	1181371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202810
19020	NC_021040	CAG	2	6	1181375	1181380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202810
19021	NC_021040	GGA	2	6	1181500	1181505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202810
19022	NC_021040	TCT	2	6	1181528	1181533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202810
19023	NC_021040	AGG	2	6	1181647	1181652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202810
19024	NC_021040	AAT	2	6	1181664	1181669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202810
19025	NC_021040	CGT	2	6	1181938	1181943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202811
19026	NC_021040	CTG	2	6	1181945	1181950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202811
19027	NC_021040	TGC	2	6	1181953	1181958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202811
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19029	NC_021040	ATC	2	6	1182006	1182011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202811
19030	NC_021040	GTATC	2	10	1182069	1182078	20 %	40 %	20 %	20 %	479202811
19031	NC_021040	TTATT	2	10	1182106	1182115	20 %	80 %	0 %	0 %	479202811
19032	NC_021040	GCA	2	6	1182120	1182125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202811
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19034	NC_021040	TGTA	2	8	1182163	1182170	25 %	50 %	25 %	0 %	479202811
19035	NC_021040	AG	3	6	1182171	1182176	50 %	0 %	50 %	0 %	479202811
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19038	NC_021040	GTAT	2	8	1182240	1182247	25 %	50 %	25 %	0 %	479202811
19039	NC_021040	A	6	6	1182269	1182274	100 %	0 %	0 %	0 %	479202811
19040	NC_021040	CAA	2	6	1182311	1182316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202811
19041	NC_021040	AGAA	2	8	1182347	1182354	75 %	0 %	25 %	0 %	479202811
19042	NC_021040	GGC	2	6	1182507	1182512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202811
19043	NC_021040	TAT	2	6	1182536	1182541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202811
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19052	NC_021040	AAT	2	6	1182866	1182871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202812
19053	NC_021040	GGTT	2	8	1182937	1182944	0 %	50 %	50 %	0 %	479202812
19054	NC_021040	GA	3	6	1182986	1182991	50 %	0 %	50 %	0 %	479202812
19055	NC_021040	TTC	2	6	1183118	1183123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202812
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19082	NC_021040	GAG	2	6	1184206	1184211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202813
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19091	NC_021040	A	7	7	1184454	1184460	100 %	0 %	0 %	0 %	479202813
19092	NC_021040	T	6	6	1184535	1184540	0 %	100 %	0 %	0 %	479202813
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19097	NC_021040	GTGAT	2	10	1184645	1184654	20 %	40 %	40 %	0 %	479202813
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19102	NC_021040	GAAAA	2	10	1185045	1185054	80 %	0 %	20 %	0 %	479202814
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19104	NC_021040	GCA	2	6	1186316	1186321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202815
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19106	NC_021040	AT	3	6	1186342	1186347	50 %	50 %	0 %	0 %	479202815
19107	NC_021040	GACT	2	8	1186381	1186388	25 %	25 %	25 %	25 %	479202815
19108	NC_021040	AGA	2	6	1186444	1186449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202815
19109	NC_021040	AATG	2	8	1186498	1186505	50 %	25 %	25 %	0 %	479202815
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19115	NC_021040	AT	3	6	1186885	1186890	50 %	50 %	0 %	0 %	479202815
19116	NC_021040	GCA	2	6	1186891	1186896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202815
19117	NC_021040	GGA	2	6	1186918	1186923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202815
19118	NC_021040	GCT	2	6	1186928	1186933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202815
19119	NC_021040	TG	3	6	1186968	1186973	0 %	50 %	50 %	0 %	479202815
19120	NC_021040	ATG	2	6	1187028	1187033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202815
19121	NC_021040	GAT	3	9	1187075	1187083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202815
19122	NC_021040	TGG	2	6	1187088	1187093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202815
19123	NC_021040	A	6	6	1187179	1187184	100 %	0 %	0 %	0 %	479202815
19124	NC_021040	AT	3	6	1187209	1187214	50 %	50 %	0 %	0 %	479202815
19125	NC_021040	AT	3	6	1187320	1187325	50 %	50 %	0 %	0 %	479202815
19126	NC_021040	CAGC	2	8	1187335	1187342	25 %	0 %	25 %	50 %	479202815
19127	NC_021040	GCA	2	6	1187348	1187353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202815
19128	NC_021040	ATTC	2	8	1187384	1187391	25 %	50 %	0 %	25 %	479202815
19129	NC_021040	TTC	2	6	1187432	1187437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202815
19130	NC_021040	GCAG	2	8	1187443	1187450	25 %	0 %	50 %	25 %	479202815
19131	NC_021040	GAA	2	6	1187578	1187583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202815
19132	NC_021040	GAT	2	6	1187624	1187629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202815
19133	NC_021040	CGG	2	6	1187641	1187646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202815
19134	NC_021040	GAC	2	6	1187707	1187712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202815
19135	NC_021040	A	6	6	1187746	1187751	100 %	0 %	0 %	0 %	479202815
19136	NC_021040	TGA	2	6	1187838	1187843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202815
19137	NC_021040	AT	3	6	1187911	1187916	50 %	50 %	0 %	0 %	479202815
19138	NC_021040	CTTT	2	8	1187960	1187967	0 %	75 %	0 %	25 %	479202816
19139	NC_021040	T	6	6	1187965	1187970	0 %	100 %	0 %	0 %	479202816
19140	NC_021040	T	8	8	1188067	1188074	0 %	100 %	0 %	0 %	479202816
19141	NC_021040	A	6	6	1188078	1188083	100 %	0 %	0 %	0 %	479202816
19142	NC_021040	CAC	2	6	1188105	1188110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479202816
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19145	NC_021040	TTC	2	6	1188336	1188341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202816
19146	NC_021040	AC	3	6	1188402	1188407	50 %	0 %	0 %	50 %	479202816
19147	NC_021040	TGA	2	6	1188428	1188433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202816
19148	NC_021040	GGCA	2	8	1188513	1188520	25 %	0 %	50 %	25 %	479202816
19149	NC_021040	ATTT	2	8	1188573	1188580	25 %	75 %	0 %	0 %	479202817
19150	NC_021040	CAG	2	6	1188581	1188586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202817
19151	NC_021040	T	6	6	1188623	1188628	0 %	100 %	0 %	0 %	479202817
19152	NC_021040	CGCCTG	2	12	1188644	1188655	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479202817
19153	NC_021040	GGTT	2	8	1188691	1188698	0 %	50 %	50 %	0 %	479202817
19154	NC_021040	GC	3	6	1188719	1188724	0 %	0 %	50 %	50 %	479202817
19155	NC_021040	TAA	2	6	1188750	1188755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202817
19156	NC_021040	ATTT	2	8	1188790	1188797	25 %	75 %	0 %	0 %	479202817
19157	NC_021040	T	7	7	1188795	1188801	0 %	100 %	0 %	0 %	479202817
19158	NC_021040	GGT	2	6	1188812	1188817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202817
19159	NC_021040	ATCTT	2	10	1188840	1188849	20 %	60 %	0 %	20 %	479202817
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19161	NC_021040	GCA	2	6	1188876	1188881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202817
19162	NC_021040	TG	4	8	1188904	1188911	0 %	50 %	50 %	0 %	479202817
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19166	NC_021040	ATA	2	6	1189089	1189094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202817
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19168	NC_021040	T	7	7	1189183	1189189	0 %	100 %	0 %	0 %	479202818
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19173	NC_021040	ACGG	2	8	1189421	1189428	25 %	0 %	50 %	25 %	479202818
19174	NC_021040	TCT	2	6	1189440	1189445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202818
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19188	NC_021040	GTT	2	6	1190239	1190244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202819
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19209	NC_021040	GT	3	6	1191075	1191080	0 %	50 %	50 %	0 %	479202819
19210	NC_021040	CTTTA	2	10	1191106	1191115	20 %	60 %	0 %	20 %	479202819
19211	NC_021040	TGTT	2	8	1191426	1191433	0 %	75 %	25 %	0 %	479202820
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19220	NC_021040	AGA	2	6	1192135	1192140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202821
19221	NC_021040	ACA	2	6	1192162	1192167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202821
19222	NC_021040	TTGAAA	2	12	1192369	1192380	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479202821
19223	NC_021040	AAG	2	6	1192387	1192392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202821
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19225	NC_021040	AAAAG	2	10	1192468	1192477	80 %	0 %	20 %	0 %	479202821
19226	NC_021040	AGA	2	6	1192544	1192549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202821
19227	NC_021040	T	6	6	1192558	1192563	0 %	100 %	0 %	0 %	479202821
19228	NC_021040	GTG	2	6	1192564	1192569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202821
19229	NC_021040	GAT	2	6	1192573	1192578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202821
19230	NC_021040	ATA	3	9	1192610	1192618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202821
19231	NC_021040	TGA	2	6	1192638	1192643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202821
19232	NC_021040	GCA	2	6	1192678	1192683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202821
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19234	NC_021040	GCA	2	6	1192714	1192719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202821
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