MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 65450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_021040	AATGG	2	10	933949	933958	40 %	20 %	40 %	0 %	479202596
15002	NC_021040	GCAG	2	8	933985	933992	25 %	0 %	50 %	25 %	479202596
15003	NC_021040	AT	3	6	934259	934264	50 %	50 %	0 %	0 %	479202597
15004	NC_021040	ATT	2	6	934279	934284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202597
15005	NC_021040	TTA	2	6	934344	934349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202597
15006	NC_021040	ACT	2	6	934369	934374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202597
15007	NC_021040	AGA	2	6	934407	934412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202597
15008	NC_021040	T	6	6	934439	934444	0 %	100 %	0 %	0 %	479202597
15009	NC_021040	AG	3	6	934457	934462	50 %	0 %	50 %	0 %	479202597
15010	NC_021040	TGA	2	6	934497	934502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202597
15011	NC_021040	GTT	2	6	934507	934512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202597
15012	NC_021040	A	6	6	934547	934552	100 %	0 %	0 %	0 %	479202597
15013	NC_021040	A	6	6	934611	934616	100 %	0 %	0 %	0 %	479202597
15014	NC_021040	AAT	2	6	934635	934640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202597
15015	NC_021040	GAT	2	6	934660	934665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202597
15016	NC_021040	ATT	2	6	934669	934674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202597
15017	NC_021040	ATG	2	6	934747	934752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202597
15018	NC_021040	TGA	2	6	934781	934786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202597
15019	NC_021040	AGT	2	6	934827	934832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202597
15020	NC_021040	TGC	2	6	934857	934862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202597
15021	NC_021040	TGC	2	6	934905	934910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202597
15022	NC_021040	ATT	2	6	934911	934916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202597
15023	NC_021040	ATC	2	6	934967	934972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202597
15024	NC_021040	TGC	2	6	935022	935027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202597
15025	NC_021040	A	7	7	935046	935052	100 %	0 %	0 %	0 %	479202597
15026	NC_021040	A	6	6	935074	935079	100 %	0 %	0 %	0 %	479202597
15027	NC_021040	TCT	2	6	935091	935096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202597
15028	NC_021040	TTAC	2	8	935173	935180	25 %	50 %	0 %	25 %	479202597
15029	NC_021040	ACT	2	6	935185	935190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202597
15030	NC_021040	CCT	2	6	935242	935247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479202597
15031	NC_021040	GAA	2	6	935251	935256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202597
15032	NC_021040	GAG	2	6	935260	935265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202597
15033	NC_021040	AG	3	6	935274	935279	50 %	0 %	50 %	0 %	479202597
15034	NC_021040	ACA	2	6	935312	935317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202597
15035	NC_021040	GGT	2	6	935328	935333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202597
15036	NC_021040	TGC	2	6	935399	935404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202597
15037	NC_021040	GAT	2	6	935431	935436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202597
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15039	NC_021040	CT	3	6	935517	935522	0 %	50 %	0 %	50 %	479202597
15040	NC_021040	AGA	2	6	935535	935540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202597
15041	NC_021040	GTT	2	6	935548	935553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202597
15042	NC_021040	AG	3	6	935572	935577	50 %	0 %	50 %	0 %	479202597
15043	NC_021040	TAT	2	6	935584	935589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202597
15044	NC_021040	AGA	2	6	935604	935609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202597
15045	NC_021040	CAA	2	6	935633	935638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202597
15046	NC_021040	TTAT	2	8	935648	935655	25 %	75 %	0 %	0 %	479202597
15047	NC_021040	GGTGA	2	10	935713	935722	20 %	20 %	60 %	0 %	479202597
15048	NC_021040	TGC	2	6	935754	935759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202597
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15050	NC_021040	GGA	2	6	935814	935819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202597
15051	NC_021040	CT	3	6	935868	935873	0 %	50 %	0 %	50 %	479202597
15052	NC_021040	ATC	2	6	935905	935910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202597
15053	NC_021040	ATTT	2	8	936003	936010	25 %	75 %	0 %	0 %	479202597
15054	NC_021040	ATT	2	6	936121	936126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202597
15055	NC_021040	A	6	6	936164	936169	100 %	0 %	0 %	0 %	479202597
15056	NC_021040	TAAA	2	8	936223	936230	75 %	25 %	0 %	0 %	479202598
15057	NC_021040	GA	3	6	936238	936243	50 %	0 %	50 %	0 %	479202598
15058	NC_021040	AAT	2	6	936245	936250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202598
15059	NC_021040	GTA	2	6	936291	936296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202598
15060	NC_021040	TGG	2	6	936344	936349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202598
15061	NC_021040	TAAAAA	2	12	936407	936418	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	479202598
15062	NC_021040	T	7	7	936422	936428	0 %	100 %	0 %	0 %	479202598
15063	NC_021040	A	6	6	936507	936512	100 %	0 %	0 %	0 %	479202598
15064	NC_021040	AAG	2	6	936538	936543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202598
15065	NC_021040	A	6	6	936579	936584	100 %	0 %	0 %	0 %	479202598
15066	NC_021040	GGT	2	6	936600	936605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202598
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15084	NC_021040	CCAG	2	8	937894	937901	25 %	0 %	25 %	50 %	479202600
15085	NC_021040	CGG	2	6	937912	937917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202600
15086	NC_021040	GTTT	2	8	938050	938057	0 %	75 %	25 %	0 %	479202600
15087	NC_021040	GGC	2	6	938109	938114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202600
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15092	NC_021040	GATTG	2	10	938351	938360	20 %	40 %	40 %	0 %	479202600
15093	NC_021040	CTG	2	6	938411	938416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202600
15094	NC_021040	TGC	2	6	938566	938571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202600
15095	NC_021040	AG	3	6	938575	938580	50 %	0 %	50 %	0 %	479202600
15096	NC_021040	GAA	2	6	938584	938589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202600
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15104	NC_021040	GA	3	6	939083	939088	50 %	0 %	50 %	0 %	479202601
15105	NC_021040	CCGT	2	8	939140	939147	0 %	25 %	25 %	50 %	479202601
15106	NC_021040	GGC	2	6	939181	939186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202601
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15108	NC_021040	GCC	2	6	939280	939285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202601
15109	NC_021040	AACAG	2	10	939322	939331	60 %	0 %	20 %	20 %	479202601
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15111	NC_021040	TTG	2	6	939383	939388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202601
15112	NC_021040	TCT	2	6	939396	939401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202601
15113	NC_021040	TGT	2	6	939438	939443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202601
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15116	NC_021040	TTTC	2	8	939691	939698	0 %	75 %	0 %	25 %	479202601
15117	NC_021040	GAAGC	2	10	939752	939761	40 %	0 %	40 %	20 %	479202601
15118	NC_021040	GCG	2	6	940060	940065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202601
15119	NC_021040	CAT	2	6	940119	940124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202601
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15121	NC_021040	AC	3	6	940223	940228	50 %	0 %	0 %	50 %	479202601
15122	NC_021040	AAC	2	6	940273	940278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202601
15123	NC_021040	CGG	2	6	940481	940486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202601
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15130	NC_021040	CAAC	2	8	941040	941047	50 %	0 %	0 %	50 %	479202602
15131	NC_021040	GGA	2	6	941137	941142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202602
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15133	NC_021040	ATG	2	6	941930	941935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202603
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15145	NC_021040	CTG	2	6	942384	942389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202604
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15241	NC_021040	GGA	2	6	949398	949403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202613
15242	NC_021040	TCA	2	6	949415	949420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202613
15243	NC_021040	ATC	2	6	949441	949446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202613
15244	NC_021040	GAA	2	6	949510	949515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202613
15245	NC_021040	A	6	6	949514	949519	100 %	0 %	0 %	0 %	479202613
15246	NC_021040	ACT	2	6	949562	949567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202613
15247	NC_021040	GGGGC	2	10	949574	949583	0 %	0 %	80 %	20 %	479202613
15248	NC_021040	ATC	2	6	949702	949707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202613
15249	NC_021040	GGA	2	6	949737	949742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202613
15250	NC_021040	TGCC	2	8	949797	949804	0 %	25 %	25 %	50 %	479202613
15251	NC_021040	GAA	2	6	949893	949898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202613
15252	NC_021040	GGC	2	6	950046	950051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202613
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15255	NC_021040	CAGA	2	8	950131	950138	50 %	0 %	25 %	25 %	479202613
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15262	NC_021040	ATC	2	6	950776	950781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202614
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15272	NC_021040	GGT	2	6	951265	951270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202614
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15284	NC_021040	AGAAA	2	10	951811	951820	80 %	0 %	20 %	0 %	479202614
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15287	NC_021040	T	6	6	951958	951963	0 %	100 %	0 %	0 %	479202614
15288	NC_021040	CTGG	2	8	951997	952004	0 %	25 %	50 %	25 %	479202614
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15302	NC_021040	AG	3	6	952707	952712	50 %	0 %	50 %	0 %	479202614
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15348	NC_021040	CTG	2	6	955332	955337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202617
15349	NC_021040	TCA	2	6	955372	955377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202617
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15352	NC_021040	ATG	2	6	955402	955407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202617
15353	NC_021040	TCC	2	6	955411	955416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479202618
15354	NC_021040	TCCG	2	8	955437	955444	0 %	25 %	25 %	50 %	479202618
15355	NC_021040	TTG	2	6	955455	955460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202618
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15358	NC_021040	TGCT	2	8	955563	955570	0 %	50 %	25 %	25 %	479202618
15359	NC_021040	ATGG	2	8	955781	955788	25 %	25 %	50 %	0 %	479202619
15360	NC_021040	GAAT	2	8	955894	955901	50 %	25 %	25 %	0 %	479202619
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15482	NC_021040	CTG	2	6	965554	965559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202630
15483	NC_021040	TAT	2	6	965638	965643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202630
15484	NC_021040	TTG	2	6	965648	965653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202630
15485	NC_021040	TAC	2	6	966250	966255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202631
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