MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 65450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_021040	GA	3	6	815967	815972	50 %	0 %	50 %	0 %	479202499
13003	NC_021040	ATATGT	2	12	815987	815998	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479202499
13004	NC_021040	GGAG	2	8	816135	816142	25 %	0 %	75 %	0 %	479202499
13005	NC_021040	TG	3	6	816187	816192	0 %	50 %	50 %	0 %	479202499
13006	NC_021040	GCT	2	6	816317	816322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202500
13007	NC_021040	CGT	2	6	816325	816330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202500
13008	NC_021040	GTTTT	2	10	816389	816398	0 %	80 %	20 %	0 %	479202500
13009	NC_021040	GGC	2	6	816515	816520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202500
13010	NC_021040	TCTTA	2	10	816541	816550	20 %	60 %	0 %	20 %	479202500
13011	NC_021040	TTTA	2	8	816639	816646	25 %	75 %	0 %	0 %	479202500
13012	NC_021040	T	6	6	816729	816734	0 %	100 %	0 %	0 %	479202500
13013	NC_021040	GGC	2	6	816755	816760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202500
13014	NC_021040	T	6	6	816808	816813	0 %	100 %	0 %	0 %	479202500
13015	NC_021040	A	6	6	816828	816833	100 %	0 %	0 %	0 %	479202500
13016	NC_021040	GTG	2	6	816870	816875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202500
13017	NC_021040	ATT	2	6	817046	817051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202500
13018	NC_021040	A	7	7	817085	817091	100 %	0 %	0 %	0 %	479202500
13019	NC_021040	TTA	2	6	817146	817151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202500
13020	NC_021040	CAGAT	2	10	817171	817180	40 %	20 %	20 %	20 %	479202500
13021	NC_021040	TATG	2	8	817254	817261	25 %	50 %	25 %	0 %	479202500
13022	NC_021040	GAA	2	6	817296	817301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202500
13023	NC_021040	TTGCAT	2	12	817312	817323	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479202500
13024	NC_021040	CA	3	6	817370	817375	50 %	0 %	0 %	50 %	479202500
13025	NC_021040	T	7	7	817391	817397	0 %	100 %	0 %	0 %	479202500
13026	NC_021040	AT	3	6	817406	817411	50 %	50 %	0 %	0 %	479202500
13027	NC_021040	AGAC	2	8	817449	817456	50 %	0 %	25 %	25 %	479202500
13028	NC_021040	GAA	2	6	817458	817463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202500
13029	NC_021040	CTT	2	6	817512	817517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202500
13030	NC_021040	GT	3	6	817538	817543	0 %	50 %	50 %	0 %	479202500
13031	NC_021040	CAG	2	6	817608	817613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202500
13032	NC_021040	GAA	2	6	817671	817676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202500
13033	NC_021040	AGC	3	9	817831	817839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202500
13034	NC_021040	GAG	2	6	817842	817847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202500
13035	NC_021040	TAA	2	6	817895	817900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202500
13036	NC_021040	A	6	6	817924	817929	100 %	0 %	0 %	0 %	479202500
13037	NC_021040	A	7	7	818013	818019	100 %	0 %	0 %	0 %	479202500
13038	NC_021040	CTGG	2	8	818058	818065	0 %	25 %	50 %	25 %	479202501
13039	NC_021040	CTG	2	6	818104	818109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202501
13040	NC_021040	TG	3	6	818130	818135	0 %	50 %	50 %	0 %	479202501
13041	NC_021040	GGA	2	6	818139	818144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202501
13042	NC_021040	TGA	2	6	818238	818243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202501
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13044	NC_021040	TA	3	6	818275	818280	50 %	50 %	0 %	0 %	479202501
13045	NC_021040	ATCT	2	8	818404	818411	25 %	50 %	0 %	25 %	479202501
13046	NC_021040	T	6	6	818588	818593	0 %	100 %	0 %	0 %	479202501
13047	NC_021040	ATTTTT	2	12	818595	818606	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479202501
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13050	NC_021040	TG	3	6	818726	818731	0 %	50 %	50 %	0 %	479202501
13051	NC_021040	ATA	2	6	818768	818773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202501
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13053	NC_021040	A	8	8	818825	818832	100 %	0 %	0 %	0 %	479202501
13054	NC_021040	TGG	2	6	818934	818939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202501
13055	NC_021040	TTA	2	6	818979	818984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202501
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13057	NC_021040	GCA	2	6	818992	818997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202501
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13059	NC_021040	ATA	2	6	819089	819094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202501
13060	NC_021040	T	6	6	819232	819237	0 %	100 %	0 %	0 %	479202501
13061	NC_021040	TGTT	2	8	819308	819315	0 %	75 %	25 %	0 %	479202501
13062	NC_021040	CAA	2	6	819320	819325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202501
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13067	NC_021040	ATA	2	6	819406	819411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202501
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13070	NC_021040	CTG	2	6	819462	819467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202501
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13076	NC_021040	AAAT	2	8	819890	819897	75 %	25 %	0 %	0 %	479202502
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13093	NC_021040	TAT	2	6	820762	820767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202503
13094	NC_021040	ATG	2	6	820792	820797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202503
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13100	NC_021040	A	6	6	821029	821034	100 %	0 %	0 %	0 %	479202503
13101	NC_021040	TGA	2	6	821061	821066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202503
13102	NC_021040	AGA	2	6	821068	821073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202503
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13105	NC_021040	TCA	2	6	821201	821206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202503
13106	NC_021040	GGC	2	6	821274	821279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202503
13107	NC_021040	GCA	3	9	821350	821358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202503
13108	NC_021040	CTTC	2	8	821368	821375	0 %	50 %	0 %	50 %	479202503
13109	NC_021040	GATC	2	8	821402	821409	25 %	25 %	25 %	25 %	479202503
13110	NC_021040	TGC	2	6	821451	821456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202503
13111	NC_021040	CAGA	2	8	821476	821483	50 %	0 %	25 %	25 %	479202503
13112	NC_021040	AGA	2	6	821487	821492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202503
13113	NC_021040	A	6	6	821500	821505	100 %	0 %	0 %	0 %	479202503
13114	NC_021040	AAT	2	6	821800	821805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202503
13115	NC_021040	GGTAA	2	10	821815	821824	40 %	20 %	40 %	0 %	479202503
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13117	NC_021040	TGA	2	6	821895	821900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202503
13118	NC_021040	CAGCGT	2	12	821950	821961	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479202503
13119	NC_021040	GCT	2	6	822046	822051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202503
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13121	NC_021040	GAT	2	6	822200	822205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202504
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13243	NC_021040	GGA	2	6	829321	829326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202511
13244	NC_021040	T	6	6	829328	829333	0 %	100 %	0 %	0 %	479202511
13245	NC_021040	AAG	2	6	829478	829483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202511
13246	NC_021040	AG	3	6	829540	829545	50 %	0 %	50 %	0 %	479202511
13247	NC_021040	ATC	2	6	829698	829703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202511
13248	NC_021040	CGT	2	6	829736	829741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202511
13249	NC_021040	CTG	2	6	829780	829785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202511
13250	NC_021040	AG	3	6	829805	829810	50 %	0 %	50 %	0 %	479202511
13251	NC_021040	TGA	2	6	829851	829856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202511
13252	NC_021040	AGT	2	6	829939	829944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202511
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13255	NC_021040	AGGA	2	8	830058	830065	50 %	0 %	50 %	0 %	479202511
13256	NC_021040	TAT	2	6	830606	830611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202512
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13261	NC_021040	AT	3	6	831009	831014	50 %	50 %	0 %	0 %	479202512
13262	NC_021040	CGG	2	6	831045	831050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202512
13263	NC_021040	ATCC	2	8	831062	831069	25 %	25 %	0 %	50 %	479202512
13264	NC_021040	AT	3	6	831081	831086	50 %	50 %	0 %	0 %	479202512
13265	NC_021040	A	7	7	831095	831101	100 %	0 %	0 %	0 %	479202512
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13271	NC_021040	A	6	6	831504	831509	100 %	0 %	0 %	0 %	479202512
13272	NC_021040	TTG	2	6	831518	831523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202512
13273	NC_021040	TAG	2	6	831542	831547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202512
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13279	NC_021040	GGATC	2	10	831862	831871	20 %	20 %	40 %	20 %	479202512
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13283	NC_021040	ATTC	2	8	832362	832369	25 %	50 %	0 %	25 %	479202513
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13288	NC_021040	CTGG	2	8	832805	832812	0 %	25 %	50 %	25 %	479202514
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13350	NC_021040	AAAAG	2	10	836347	836356	80 %	0 %	20 %	0 %	479202516
13351	NC_021040	ATTT	2	8	836372	836379	25 %	75 %	0 %	0 %	479202516
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13355	NC_021040	A	7	7	836699	836705	100 %	0 %	0 %	0 %	479202517
13356	NC_021040	ATATT	2	10	836758	836767	40 %	60 %	0 %	0 %	479202517
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13358	NC_021040	CAGA	2	8	836857	836864	50 %	0 %	25 %	25 %	479202517
13359	NC_021040	CT	3	6	836906	836911	0 %	50 %	0 %	50 %	479202517
13360	NC_021040	GAT	2	6	836978	836983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202517
13361	NC_021040	GAT	2	6	837050	837055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202517
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13485	NC_021040	AGA	2	6	843667	843672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202522
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