MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 65450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_021040	GCA	2	6	3442393	3442398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204722
54502	NC_021040	ATC	2	6	3442688	3442693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204723
54503	NC_021040	ACATC	2	10	3442749	3442758	40 %	20 %	0 %	40 %	479204723
54504	NC_021040	TGGA	2	8	3442773	3442780	25 %	25 %	50 %	0 %	479204723
54505	NC_021040	AAC	2	6	3442870	3442875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479204723
54506	NC_021040	GT	3	6	3442938	3442943	0 %	50 %	50 %	0 %	479204723
54507	NC_021040	A	6	6	3442946	3442951	100 %	0 %	0 %	0 %	479204723
54508	NC_021040	AT	3	6	3443008	3443013	50 %	50 %	0 %	0 %	479204723
54509	NC_021040	GGT	2	6	3443033	3443038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479204723
54510	NC_021040	CAG	3	9	3443039	3443047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204723
54511	NC_021040	GCA	2	6	3443111	3443116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204723
54512	NC_021040	ATCA	2	8	3443162	3443169	50 %	25 %	0 %	25 %	479204723
54513	NC_021040	CATC	2	8	3443197	3443204	25 %	25 %	0 %	50 %	479204723
54514	NC_021040	CAT	2	6	3443236	3443241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204723
54515	NC_021040	GGA	2	6	3443341	3443346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479204723
54516	NC_021040	A	6	6	3443383	3443388	100 %	0 %	0 %	0 %	479204724
54517	NC_021040	GAA	2	6	3443416	3443421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479204724
54518	NC_021040	CG	3	6	3443431	3443436	0 %	0 %	50 %	50 %	479204724
54519	NC_021040	TCA	2	6	3443441	3443446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204724
54520	NC_021040	TGATCG	2	12	3443453	3443464	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479204724
54521	NC_021040	ACA	2	6	3443503	3443508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479204724
54522	NC_021040	CCG	2	6	3443557	3443562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479204724
54523	NC_021040	GAT	2	6	3443859	3443864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204724
54524	NC_021040	AT	3	6	3443964	3443969	50 %	50 %	0 %	0 %	479204724
54525	NC_021040	CGG	2	6	3444036	3444041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479204724
54526	NC_021040	TTA	2	6	3444128	3444133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479204724
54527	NC_021040	AGAA	2	8	3444157	3444164	75 %	0 %	25 %	0 %	479204724
54528	NC_021040	AGG	2	6	3444173	3444178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479204724
54529	NC_021040	ATGA	2	8	3444189	3444196	50 %	25 %	25 %	0 %	479204725
54530	NC_021040	ATCA	2	8	3444197	3444204	50 %	25 %	0 %	25 %	479204725
54531	NC_021040	A	7	7	3444204	3444210	100 %	0 %	0 %	0 %	479204725
54532	NC_021040	TTG	2	6	3444262	3444267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479204725
54533	NC_021040	CTT	2	6	3444273	3444278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479204725
54534	NC_021040	ATC	2	6	3444345	3444350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204725
54535	NC_021040	TCCA	2	8	3444361	3444368	25 %	25 %	0 %	50 %	479204725
54536	NC_021040	ATT	2	6	3444377	3444382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479204725
54537	NC_021040	TAT	2	6	3444466	3444471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479204725
54538	NC_021040	CTTT	2	8	3444480	3444487	0 %	75 %	0 %	25 %	479204725
54539	NC_021040	GCA	2	6	3444495	3444500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204725
54540	NC_021040	GCA	2	6	3444720	3444725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204725
54541	NC_021040	AGA	2	6	3444742	3444747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479204725
54542	NC_021040	GTT	2	6	3444770	3444775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479204725
54543	NC_021040	TGGT	2	8	3444844	3444851	0 %	50 %	50 %	0 %	479204725
54544	NC_021040	GGT	2	6	3444855	3444860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479204725
54545	NC_021040	ATT	2	6	3444948	3444953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479204725
54546	NC_021040	TCA	2	6	3444963	3444968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204725
54547	NC_021040	TAG	2	6	3444996	3445001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204725
54548	NC_021040	GCA	2	6	3445089	3445094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204726
54549	NC_021040	CGA	2	6	3445145	3445150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204726
54550	NC_021040	GAT	2	6	3445213	3445218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204726
54551	NC_021040	TCA	2	6	3445226	3445231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204726
54552	NC_021040	TTA	2	6	3445269	3445274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479204726
54553	NC_021040	GCA	2	6	3445387	3445392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204726
54554	NC_021040	AAC	2	6	3445405	3445410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479204726
54555	NC_021040	AGA	2	6	3445545	3445550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479204726
54556	NC_021040	GCA	2	6	3445588	3445593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204726
54557	NC_021040	A	6	6	3445593	3445598	100 %	0 %	0 %	0 %	479204726
54558	NC_021040	ACAG	2	8	3445620	3445627	50 %	0 %	25 %	25 %	479204726
54559	NC_021040	CGG	2	6	3445650	3445655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479204726
54560	NC_021040	AG	3	6	3445671	3445676	50 %	0 %	50 %	0 %	479204726
54561	NC_021040	GA	3	6	3445679	3445684	50 %	0 %	50 %	0 %	479204726
54562	NC_021040	GAC	2	6	3445695	3445700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204726
54563	NC_021040	AT	3	6	3445787	3445792	50 %	50 %	0 %	0 %	479204726
54564	NC_021040	AGTATC	2	12	3445832	3445843	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479204726
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54566	NC_021040	GTCA	2	8	3445892	3445899	25 %	25 %	25 %	25 %	479204726
54567	NC_021040	CG	3	6	3445993	3445998	0 %	0 %	50 %	50 %	479204726
54568	NC_021040	TCGG	2	8	3446098	3446105	0 %	25 %	50 %	25 %	479204726
54569	NC_021040	AGTGA	2	10	3446134	3446143	40 %	20 %	40 %	0 %	479204726
54570	NC_021040	CG	3	6	3446147	3446152	0 %	0 %	50 %	50 %	479204726
54571	NC_021040	ATT	2	6	3446155	3446160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479204726
54572	NC_021040	CATATC	2	12	3446165	3446176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204726
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54578	NC_021040	ATT	2	6	3446540	3446545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479204726
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54581	NC_021040	TGT	2	6	3447002	3447007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479204727
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54585	NC_021040	GCA	2	6	3447069	3447074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204727
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54587	NC_021040	A	6	6	3447090	3447095	100 %	0 %	0 %	0 %	479204727
54588	NC_021040	AAG	2	6	3447103	3447108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479204727
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54598	NC_021040	ATG	2	6	3447856	3447861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204727
54599	NC_021040	ATTT	2	8	3447865	3447872	25 %	75 %	0 %	0 %	479204727
54600	NC_021040	ATG	4	12	3448006	3448017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204727
54601	NC_021040	AAC	2	6	3448026	3448031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479204727
54602	NC_021040	TGA	2	6	3448058	3448063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204727
54603	NC_021040	GCT	2	6	3448098	3448103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479204727
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54605	NC_021040	AT	3	6	3448292	3448297	50 %	50 %	0 %	0 %	479204727
54606	NC_021040	A	7	7	3448364	3448370	100 %	0 %	0 %	0 %	479204727
54607	NC_021040	TGAGGA	2	12	3448371	3448382	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479204727
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54614	NC_021040	GTA	2	6	3450576	3450581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204729
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54733	NC_021040	TATT	2	8	3456516	3456523	25 %	75 %	0 %	0 %	479204734
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