MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 65450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_021040	ACC	2	6	3412139	3412144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479204698
54002	NC_021040	AGT	2	6	3412150	3412155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204698
54003	NC_021040	CGGT	2	8	3412164	3412171	0 %	25 %	50 %	25 %	479204698
54004	NC_021040	ATC	2	6	3412370	3412375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204698
54005	NC_021040	GACA	2	8	3412379	3412386	50 %	0 %	25 %	25 %	479204698
54006	NC_021040	CGAT	2	8	3412407	3412414	25 %	25 %	25 %	25 %	479204698
54007	NC_021040	ATC	2	6	3412418	3412423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204698
54008	NC_021040	GAA	2	6	3412508	3412513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479204698
54009	NC_021040	ATGG	2	8	3412615	3412622	25 %	25 %	50 %	0 %	479204698
54010	NC_021040	GTT	2	6	3412643	3412648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479204698
54011	NC_021040	GAT	2	6	3412652	3412657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204698
54012	NC_021040	TAAG	2	8	3412659	3412666	50 %	25 %	25 %	0 %	479204698
54013	NC_021040	CCA	2	6	3412709	3412714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479204698
54014	NC_021040	ACTGC	2	10	3412811	3412820	20 %	20 %	20 %	40 %	479204698
54015	NC_021040	AT	3	6	3412855	3412860	50 %	50 %	0 %	0 %	479204698
54016	NC_021040	ATCT	2	8	3412895	3412902	25 %	50 %	0 %	25 %	479204698
54017	NC_021040	TCCG	2	8	3412929	3412936	0 %	25 %	25 %	50 %	479204698
54018	NC_021040	GGT	2	6	3412970	3412975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479204698
54019	NC_021040	GCA	2	6	3413006	3413011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204698
54020	NC_021040	AG	3	6	3413039	3413044	50 %	0 %	50 %	0 %	479204698
54021	NC_021040	GCA	2	6	3413048	3413053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204698
54022	NC_021040	CGACA	2	10	3413083	3413092	40 %	0 %	20 %	40 %	479204698
54023	NC_021040	TCA	3	9	3413172	3413180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204698
54024	NC_021040	TGC	2	6	3413185	3413190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479204698
54025	NC_021040	TCT	2	6	3413203	3413208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479204698
54026	NC_021040	TCA	2	6	3413310	3413315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204698
54027	NC_021040	TGA	2	6	3413317	3413322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204698
54028	NC_021040	GAA	2	6	3413351	3413356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479204698
54029	NC_021040	GAA	2	6	3413447	3413452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479204699
54030	NC_021040	AGC	2	6	3413455	3413460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204699
54031	NC_021040	GCA	2	6	3413472	3413477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204699
54032	NC_021040	GATC	2	8	3413607	3413614	25 %	25 %	25 %	25 %	479204699
54033	NC_021040	A	6	6	3413626	3413631	100 %	0 %	0 %	0 %	479204699
54034	NC_021040	AAAG	2	8	3413643	3413650	75 %	0 %	25 %	0 %	479204699
54035	NC_021040	GAT	2	6	3413740	3413745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204699
54036	NC_021040	CGC	2	6	3413791	3413796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479204699
54037	NC_021040	TATCA	2	10	3413800	3413809	40 %	40 %	0 %	20 %	479204699
54038	NC_021040	ATG	3	9	3413846	3413854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204699
54039	NC_021040	AAG	2	6	3413869	3413874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479204699
54040	NC_021040	TGA	2	6	3413963	3413968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204699
54041	NC_021040	GCT	2	6	3413970	3413975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479204699
54042	NC_021040	TGA	2	6	3413988	3413993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204699
54043	NC_021040	AGA	2	6	3413994	3413999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479204699
54044	NC_021040	GCA	3	9	3414007	3414015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204699
54045	NC_021040	TGA	2	6	3414029	3414034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204699
54046	NC_021040	ATA	2	6	3414370	3414375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479204700
54047	NC_021040	GAT	2	6	3414525	3414530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204700
54048	NC_021040	CGG	2	6	3414596	3414601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479204700
54049	NC_021040	CGA	2	6	3414668	3414673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204700
54050	NC_021040	GATC	2	8	3414674	3414681	25 %	25 %	25 %	25 %	479204700
54051	NC_021040	CCGG	2	8	3414684	3414691	0 %	0 %	50 %	50 %	479204700
54052	NC_021040	TCT	2	6	3414785	3414790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479204700
54053	NC_021040	GGT	2	6	3414807	3414812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479204700
54054	NC_021040	GGT	2	6	3414828	3414833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479204700
54055	NC_021040	ATGAA	2	10	3414955	3414964	60 %	20 %	20 %	0 %	479204700
54056	NC_021040	ACC	2	6	3414987	3414992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479204700
54057	NC_021040	GCC	2	6	3415016	3415021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479204700
54058	NC_021040	CAGG	2	8	3415131	3415138	25 %	0 %	50 %	25 %	479204700
54059	NC_021040	CCG	2	6	3415174	3415179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479204700
54060	NC_021040	ACAG	2	8	3415199	3415206	50 %	0 %	25 %	25 %	479204700
54061	NC_021040	GAT	2	6	3415539	3415544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204700
54062	NC_021040	TTC	2	6	3415596	3415601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479204700
54063	NC_021040	TGGA	2	8	3415624	3415631	25 %	25 %	50 %	0 %	479204700
54064	NC_021040	ATG	3	9	3415690	3415698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204700
54065	NC_021040	CGAT	2	8	3415729	3415736	25 %	25 %	25 %	25 %	479204700
54066	NC_021040	TAA	2	6	3415758	3415763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479204700
54067	NC_021040	AGA	2	6	3415781	3415786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479204701
54068	NC_021040	T	6	6	3415828	3415833	0 %	100 %	0 %	0 %	479204701
54069	NC_021040	GT	3	6	3415885	3415890	0 %	50 %	50 %	0 %	479204701
54070	NC_021040	CTT	2	6	3416019	3416024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479204701
54071	NC_021040	GAAA	2	8	3416444	3416451	75 %	0 %	25 %	0 %	479204702
54072	NC_021040	GC	3	6	3416547	3416552	0 %	0 %	50 %	50 %	479204702
54073	NC_021040	CTTT	2	8	3416577	3416584	0 %	75 %	0 %	25 %	479204702
54074	NC_021040	GTT	2	6	3416616	3416621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479204702
54075	NC_021040	CGG	2	6	3416686	3416691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479204702
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54077	NC_021040	GCA	2	6	3416766	3416771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204702
54078	NC_021040	TG	3	6	3416940	3416945	0 %	50 %	50 %	0 %	479204702
54079	NC_021040	TTTC	2	8	3416987	3416994	0 %	75 %	0 %	25 %	479204702
54080	NC_021040	GCT	2	6	3417015	3417020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479204702
54081	NC_021040	CTG	2	6	3417063	3417068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479204702
54082	NC_021040	T	6	6	3417074	3417079	0 %	100 %	0 %	0 %	479204702
54083	NC_021040	AAGAT	2	10	3417095	3417104	60 %	20 %	20 %	0 %	479204702
54084	NC_021040	CCGT	2	8	3417185	3417192	0 %	25 %	25 %	50 %	479204703
54085	NC_021040	TGTACT	2	12	3417241	3417252	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479204703
54086	NC_021040	GGGAAA	2	12	3417574	3417585	50 %	0 %	50 %	0 %	479204703
54087	NC_021040	ATTT	2	8	3417640	3417647	25 %	75 %	0 %	0 %	479204703
54088	NC_021040	A	6	6	3417734	3417739	100 %	0 %	0 %	0 %	479204703
54089	NC_021040	TAA	2	6	3417752	3417757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479204703
54090	NC_021040	TGT	2	6	3419483	3419488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479204704
54091	NC_021040	GAT	2	6	3419490	3419495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204704
54092	NC_021040	TTC	2	6	3419607	3419612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479204704
54093	NC_021040	CTG	2	6	3419699	3419704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479204704
54094	NC_021040	TAAT	2	8	3419812	3419819	50 %	50 %	0 %	0 %	479204704
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54097	NC_021040	TTTG	2	8	3420041	3420048	0 %	75 %	25 %	0 %	479204704
54098	NC_021040	ATGA	2	8	3420151	3420158	50 %	25 %	25 %	0 %	479204704
54099	NC_021040	CAT	2	6	3420161	3420166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204704
54100	NC_021040	CAT	2	6	3420188	3420193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204704
54101	NC_021040	CAT	2	6	3420221	3420226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204704
54102	NC_021040	TCTG	2	8	3420232	3420239	0 %	50 %	25 %	25 %	479204704
54103	NC_021040	CTT	2	6	3420312	3420317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479204704
54104	NC_021040	TG	3	6	3420336	3420341	0 %	50 %	50 %	0 %	479204704
54105	NC_021040	TTAA	2	8	3421378	3421385	50 %	50 %	0 %	0 %	479204705
54106	NC_021040	ACA	2	6	3421423	3421428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479204705
54107	NC_021040	GAGAAA	2	12	3421796	3421807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479204706
54108	NC_021040	TGC	2	6	3421837	3421842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479204706
54109	NC_021040	GC	3	6	3421873	3421878	0 %	0 %	50 %	50 %	479204706
54110	NC_021040	AGC	2	6	3421880	3421885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204706
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54112	NC_021040	GAC	2	6	3421961	3421966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204706
54113	NC_021040	AGA	2	6	3421988	3421993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479204706
54114	NC_021040	GCA	2	6	3422013	3422018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204706
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54470	NC_021040	CGGA	2	8	3439910	3439917	25 %	0 %	50 %	25 %	479204721
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54472	NC_021040	GCG	2	6	3439957	3439962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479204721
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54475	NC_021040	A	7	7	3441298	3441304	100 %	0 %	0 %	0 %	479204722
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54480	NC_021040	ATA	2	6	3441404	3441409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479204722
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54500	NC_021040	AG	4	8	3442356	3442363	50 %	0 %	50 %	0 %	479204722

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