MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 65450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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51002	NC_021040	CTGC	2	8	3227601	3227608	0 %	25 %	25 %	50 %	479204540
51003	NC_021040	TTA	2	6	3227613	3227618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479204540
51004	NC_021040	AGG	2	6	3227773	3227778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479204540
51005	NC_021040	CA	3	6	3227804	3227809	50 %	0 %	0 %	50 %	479204540
51006	NC_021040	AG	3	6	3227812	3227817	50 %	0 %	50 %	0 %	479204540
51007	NC_021040	CTA	2	6	3227823	3227828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204540
51008	NC_021040	T	6	6	3227837	3227842	0 %	100 %	0 %	0 %	479204540
51009	NC_021040	TCA	2	6	3227852	3227857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204540
51010	NC_021040	GAA	2	6	3227862	3227867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479204540
51011	NC_021040	TTTCAT	2	12	3227868	3227879	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479204540
51012	NC_021040	GTT	2	6	3227922	3227927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479204540
51013	NC_021040	TTG	2	6	3227939	3227944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479204540
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51015	NC_021040	TCA	2	6	3228038	3228043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204540
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51017	NC_021040	TC	3	6	3228102	3228107	0 %	50 %	0 %	50 %	479204540
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51025	NC_021040	TC	3	6	3228519	3228524	0 %	50 %	0 %	50 %	479204540
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51035	NC_021040	CTG	2	6	3229176	3229181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479204541
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51039	NC_021040	CGCC	2	8	3229369	3229376	0 %	0 %	25 %	75 %	479204541
51040	NC_021040	ATC	2	6	3229404	3229409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204541
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51117	NC_021040	CACGGT	2	12	3233601	3233612	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479204546
51118	NC_021040	TAA	2	6	3233699	3233704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479204546
51119	NC_021040	ATC	2	6	3233737	3233742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204546
51120	NC_021040	CTG	2	6	3233748	3233753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479204546
51121	NC_021040	TCC	2	6	3233756	3233761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479204546
51122	NC_021040	CTA	3	9	3233826	3233834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204546
51123	NC_021040	T	6	6	3233865	3233870	0 %	100 %	0 %	0 %	479204546
51124	NC_021040	TTC	2	6	3233911	3233916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479204547
51125	NC_021040	GC	3	6	3233942	3233947	0 %	0 %	50 %	50 %	479204547
51126	NC_021040	TCA	2	6	3233961	3233966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204547
51127	NC_021040	TCG	2	6	3233969	3233974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479204547
51128	NC_021040	T	6	6	3234002	3234007	0 %	100 %	0 %	0 %	479204547
51129	NC_021040	TCC	2	6	3234044	3234049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479204547
51130	NC_021040	TGA	2	6	3234144	3234149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204547
51131	NC_021040	TTC	2	6	3234168	3234173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479204547
51132	NC_021040	ATA	2	6	3234206	3234211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479204547
51133	NC_021040	GGT	2	6	3234220	3234225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479204547
51134	NC_021040	CTGCAT	2	12	3234406	3234417	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479204547
51135	NC_021040	T	6	6	3234560	3234565	0 %	100 %	0 %	0 %	479204547
51136	NC_021040	TCA	2	6	3234578	3234583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204547
51137	NC_021040	GCA	2	6	3234602	3234607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204547
51138	NC_021040	TTC	2	6	3234650	3234655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479204547
51139	NC_021040	CTTT	2	8	3234663	3234670	0 %	75 %	0 %	25 %	479204547
51140	NC_021040	GCTGGA	2	12	3234741	3234752	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479204547
51141	NC_021040	GAA	2	6	3234841	3234846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479204547
51142	NC_021040	CAT	2	6	3234847	3234852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204547
51143	NC_021040	GTC	2	6	3234866	3234871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479204547
51144	NC_021040	TTC	2	6	3234880	3234885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479204547
51145	NC_021040	ATCG	2	8	3234898	3234905	25 %	25 %	25 %	25 %	479204547
51146	NC_021040	TCC	2	6	3235025	3235030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479204547
51147	NC_021040	TTC	2	6	3235065	3235070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479204547
51148	NC_021040	GTC	2	6	3235072	3235077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479204547
51149	NC_021040	CAG	2	6	3235096	3235101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204547
51150	NC_021040	T	6	6	3235129	3235134	0 %	100 %	0 %	0 %	479204547
51151	NC_021040	GCT	2	6	3235318	3235323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479204547
51152	NC_021040	ATG	2	6	3235328	3235333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204547
51153	NC_021040	TGA	2	6	3235335	3235340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204547
51154	NC_021040	TTC	2	6	3235393	3235398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479204547
51155	NC_021040	TTC	2	6	3235422	3235427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479204547
51156	NC_021040	GTAAA	2	10	3235555	3235564	60 %	20 %	20 %	0 %	479204547
51157	NC_021040	CGG	2	6	3235592	3235597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479204547
51158	NC_021040	TCCA	2	8	3235654	3235661	25 %	25 %	0 %	50 %	479204547
51159	NC_021040	T	6	6	3235663	3235668	0 %	100 %	0 %	0 %	479204547
51160	NC_021040	TCT	2	6	3235689	3235694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479204547
51161	NC_021040	TTA	2	6	3235709	3235714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479204547
51162	NC_021040	GCAC	2	8	3235784	3235791	25 %	0 %	25 %	50 %	479204547
51163	NC_021040	CGGTA	2	10	3235809	3235818	20 %	20 %	40 %	20 %	479204547
51164	NC_021040	AG	3	6	3235885	3235890	50 %	0 %	50 %	0 %	479204547
51165	NC_021040	TTC	2	6	3235894	3235899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479204547
51166	NC_021040	TCC	2	6	3235916	3235921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479204547
51167	NC_021040	TGT	2	6	3235929	3235934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479204547
51168	NC_021040	TAC	2	6	3235945	3235950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204547
51169	NC_021040	TGA	2	6	3235956	3235961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204547
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51171	NC_021040	TTG	2	6	3235989	3235994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479204547
51172	NC_021040	TTCT	2	8	3236065	3236072	0 %	75 %	0 %	25 %	479204547
51173	NC_021040	TCA	2	6	3236078	3236083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204547
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51176	NC_021040	ATC	2	6	3236524	3236529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204547
51177	NC_021040	GAA	2	6	3236725	3236730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479204548
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51179	NC_021040	GCT	2	6	3236795	3236800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479204548
51180	NC_021040	CATC	2	8	3236804	3236811	25 %	25 %	0 %	50 %	479204548
51181	NC_021040	TC	3	6	3236810	3236815	0 %	50 %	0 %	50 %	479204548
51182	NC_021040	ATTTTT	2	12	3236910	3236921	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479204548
51183	NC_021040	GCG	2	6	3236936	3236941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479204548
51184	NC_021040	TGA	2	6	3236969	3236974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204548
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51186	NC_021040	GAA	2	6	3237200	3237205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479204548
51187	NC_021040	CTT	2	6	3237223	3237228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479204548
51188	NC_021040	ACC	2	6	3237243	3237248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479204548
51189	NC_021040	CGA	2	6	3237263	3237268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479204548
51190	NC_021040	TCT	2	6	3237351	3237356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479204548
51191	NC_021040	GGTCA	2	10	3237357	3237366	20 %	20 %	40 %	20 %	479204548
51192	NC_021040	CT	3	6	3237384	3237389	0 %	50 %	0 %	50 %	479204548
51193	NC_021040	GCT	2	6	3237464	3237469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479204548
51194	NC_021040	TGTC	2	8	3237525	3237532	0 %	50 %	25 %	25 %	479204548
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51196	NC_021040	TGA	2	6	3237563	3237568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204548
51197	NC_021040	CAGT	2	8	3237572	3237579	25 %	25 %	25 %	25 %	479204548
51198	NC_021040	ACC	2	6	3237696	3237701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479204548
51199	NC_021040	ATG	2	6	3237712	3237717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204548
51200	NC_021040	TGC	2	6	3237760	3237765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479204548
51201	NC_021040	AC	3	6	3237782	3237787	50 %	0 %	0 %	50 %	479204548
51202	NC_021040	CCT	2	6	3237830	3237835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479204548
51203	NC_021040	TGC	2	6	3237836	3237841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479204548
51204	NC_021040	TAAG	2	8	3237846	3237853	50 %	25 %	25 %	0 %	479204548
51205	NC_021040	ACC	2	6	3237870	3237875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479204548
51206	NC_021040	ATG	2	6	3237897	3237902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204548
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51213	NC_021040	ATTC	2	8	3238293	3238300	25 %	50 %	0 %	25 %	479204548
51214	NC_021040	ATG	2	6	3238428	3238433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479204548
51215	NC_021040	ATAC	2	8	3238461	3238468	50 %	25 %	0 %	25 %	479204548
51216	NC_021040	ATCTGG	2	12	3238504	3238515	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479204548
51217	NC_021040	T	6	6	3238544	3238549	0 %	100 %	0 %	0 %	479204548
51218	NC_021040	TTA	2	6	3238611	3238616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479204549
51219	NC_021040	TAA	2	6	3238677	3238682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479204549
51220	NC_021040	AAT	2	6	3238713	3238718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479204549
51221	NC_021040	CAT	2	6	3238749	3238754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204549
51222	NC_021040	AG	3	6	3238819	3238824	50 %	0 %	50 %	0 %	479204549
51223	NC_021040	CTG	2	6	3238837	3238842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479204549
51224	NC_021040	A	6	6	3238884	3238889	100 %	0 %	0 %	0 %	479204549
51225	NC_021040	ATC	2	6	3238894	3238899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479204549
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51227	NC_021040	GAAA	2	8	3239000	3239007	75 %	0 %	25 %	0 %	479204549
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51230	NC_021040	CCG	2	6	3239021	3239026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479204549
51231	NC_021040	TC	3	6	3239081	3239086	0 %	50 %	0 %	50 %	479204549
51232	NC_021040	T	7	7	3239097	3239103	0 %	100 %	0 %	0 %	479204549
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51234	NC_021040	ATA	2	6	3239297	3239302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479204549
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