MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 65450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021040	A	6	6	284259	284264	100 %	0 %	0 %	0 %	479202073
4502	NC_021040	GCA	2	6	284280	284285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202073
4503	NC_021040	AGG	2	6	284333	284338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202073
4504	NC_021040	TCG	2	6	284373	284378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202074
4505	NC_021040	AAT	3	9	284396	284404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202074
4506	NC_021040	GAT	2	6	284450	284455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202074
4507	NC_021040	ATGC	2	8	284536	284543	25 %	25 %	25 %	25 %	479202074
4508	NC_021040	GGA	2	6	284582	284587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202074
4509	NC_021040	ACA	2	6	284625	284630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202074
4510	NC_021040	GCT	2	6	284645	284650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202074
4511	NC_021040	GCG	2	6	284663	284668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202074
4512	NC_021040	GCT	2	6	284675	284680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202074
4513	NC_021040	ATC	2	6	284736	284741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202074
4514	NC_021040	CAG	2	6	284769	284774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202074
4515	NC_021040	CTAT	2	8	284778	284785	25 %	50 %	0 %	25 %	479202074
4516	NC_021040	GCA	2	6	284799	284804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202074
4517	NC_021040	ATT	2	6	284838	284843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202074
4518	NC_021040	TGGA	2	8	284862	284869	25 %	25 %	50 %	0 %	479202074
4519	NC_021040	TTC	2	6	284933	284938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202074
4520	NC_021040	TGG	2	6	284983	284988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202074
4521	NC_021040	AGC	2	6	285004	285009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202074
4522	NC_021040	GGT	2	6	285017	285022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202074
4523	NC_021040	CTT	2	6	285092	285097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202074
4524	NC_021040	TCC	2	6	285127	285132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479202074
4525	NC_021040	AAG	2	6	285143	285148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202074
4526	NC_021040	GA	3	6	285185	285190	50 %	0 %	50 %	0 %	479202074
4527	NC_021040	ATG	2	6	285218	285223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202074
4528	NC_021040	GAA	2	6	285224	285229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202074
4529	NC_021040	GCT	2	6	285239	285244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202074
4530	NC_021040	GAT	2	6	285245	285250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202074
4531	NC_021040	ATC	2	6	285306	285311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202074
4532	NC_021040	TTC	2	6	285330	285335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202074
4533	NC_021040	TTC	2	6	285386	285391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202074
4534	NC_021040	GAA	2	6	285416	285421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202074
4535	NC_021040	ATG	2	6	285516	285521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202074
4536	NC_021040	CAG	2	6	285613	285618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202074
4537	NC_021040	TTGA	2	8	285677	285684	25 %	50 %	25 %	0 %	479202074
4538	NC_021040	ATT	2	6	285717	285722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202074
4539	NC_021040	AAG	2	6	285761	285766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202074
4540	NC_021040	AC	3	6	285804	285809	50 %	0 %	0 %	50 %	479202074
4541	NC_021040	TCT	2	6	285838	285843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202074
4542	NC_021040	CAT	2	6	285914	285919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202074
4543	NC_021040	AAT	2	6	285923	285928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202074
4544	NC_021040	AAT	2	6	285965	285970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202074
4545	NC_021040	CCG	2	6	286112	286117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202074
4546	NC_021040	GAA	2	6	286126	286131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202074
4547	NC_021040	GAA	2	6	286246	286251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202074
4548	NC_021040	GTT	2	6	286265	286270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202074
4549	NC_021040	GA	3	6	286308	286313	50 %	0 %	50 %	0 %	479202074
4550	NC_021040	AG	3	6	286316	286321	50 %	0 %	50 %	0 %	479202074
4551	NC_021040	GTTC	2	8	286328	286335	0 %	50 %	25 %	25 %	479202074
4552	NC_021040	GTG	2	6	286368	286373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202074
4553	NC_021040	GCAT	2	8	286397	286404	25 %	25 %	25 %	25 %	479202074
4554	NC_021040	AAT	2	6	286415	286420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202074
4555	NC_021040	AAG	2	6	286421	286426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202074
4556	NC_021040	TGAT	2	8	286455	286462	25 %	50 %	25 %	0 %	479202074
4557	NC_021040	AT	3	6	286472	286477	50 %	50 %	0 %	0 %	479202074
4558	NC_021040	GGT	2	6	286601	286606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202074
4559	NC_021040	AT	3	6	286627	286632	50 %	50 %	0 %	0 %	479202074
4560	NC_021040	TAT	2	6	286682	286687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202074
4561	NC_021040	GAG	2	6	286715	286720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202074
4562	NC_021040	GCT	2	6	286732	286737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202074
4563	NC_021040	AGG	2	6	286744	286749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202074
4564	NC_021040	AAG	2	6	286764	286769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202074
4565	NC_021040	AAG	2	6	288643	288648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202075
4566	NC_021040	GAA	2	6	288684	288689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202075
4567	NC_021040	TGT	2	6	288757	288762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202075
4568	NC_021040	GTC	2	6	288766	288771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202075
4569	NC_021040	GCT	2	6	288792	288797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202075
4570	NC_021040	AGATA	2	10	288854	288863	60 %	20 %	20 %	0 %	479202075
4571	NC_021040	TAT	2	6	288884	288889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202075
4572	NC_021040	ATG	2	6	288895	288900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202075
4573	NC_021040	CTG	2	6	288928	288933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202075
4574	NC_021040	CAC	2	6	288943	288948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479202075
4575	NC_021040	TGA	2	6	289037	289042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202075
4576	NC_021040	ATTG	2	8	289064	289071	25 %	50 %	25 %	0 %	479202075
4577	NC_021040	TGA	2	6	289079	289084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202075
4578	NC_021040	TGC	2	6	289103	289108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202075
4579	NC_021040	AGAA	2	8	289152	289159	75 %	0 %	25 %	0 %	479202075
4580	NC_021040	ATG	2	6	289178	289183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202075
4581	NC_021040	GA	3	6	289191	289196	50 %	0 %	50 %	0 %	479202076
4582	NC_021040	AAG	2	6	289299	289304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202076
4583	NC_021040	C	6	6	289379	289384	0 %	0 %	0 %	100 %	479202076
4584	NC_021040	ATA	2	6	289464	289469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202076
4585	NC_021040	TTTG	2	8	289503	289510	0 %	75 %	25 %	0 %	479202076
4586	NC_021040	T	6	6	289516	289521	0 %	100 %	0 %	0 %	479202076
4587	NC_021040	ATGA	2	8	289544	289551	50 %	25 %	25 %	0 %	479202076
4588	NC_021040	AAT	2	6	289609	289614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202076
4589	NC_021040	ATT	2	6	289678	289683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202076
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4592	NC_021040	GAT	2	6	289761	289766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202076
4593	NC_021040	CAG	2	6	289805	289810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202077
4594	NC_021040	AGA	2	6	289824	289829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202077
4595	NC_021040	TGG	2	6	289841	289846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202077
4596	NC_021040	AT	3	6	289921	289926	50 %	50 %	0 %	0 %	479202077
4597	NC_021040	TC	3	6	289944	289949	0 %	50 %	0 %	50 %	479202077
4598	NC_021040	GCAA	2	8	290036	290043	50 %	0 %	25 %	25 %	479202077
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4602	NC_021040	CTGG	2	8	290226	290233	0 %	25 %	50 %	25 %	479202077
4603	NC_021040	CAA	2	6	290250	290255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202077
4604	NC_021040	GAGCA	2	10	290260	290269	40 %	0 %	40 %	20 %	479202077
4605	NC_021040	GAT	2	6	290380	290385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202077
4606	NC_021040	GGC	2	6	290403	290408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202077
4607	NC_021040	TTC	2	6	290467	290472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202077
4608	NC_021040	CAG	2	6	290527	290532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202077
4609	NC_021040	ATC	2	6	290551	290556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202077
4610	NC_021040	GTGC	2	8	290563	290570	0 %	25 %	50 %	25 %	479202077
4611	NC_021040	GAA	2	6	290580	290585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202077
4612	NC_021040	TTA	2	6	290684	290689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202077
4613	NC_021040	CTC	2	6	290739	290744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479202077
4614	NC_021040	AGC	2	6	290780	290785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202077
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4616	NC_021040	ATC	2	6	290881	290886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202077
4617	NC_021040	TCT	2	6	290963	290968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202077
4618	NC_021040	GC	3	6	291269	291274	0 %	0 %	50 %	50 %	479202077
4619	NC_021040	TCCG	2	8	291302	291309	0 %	25 %	25 %	50 %	479202077
4620	NC_021040	GGT	2	6	291327	291332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202077
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4622	NC_021040	ATG	2	6	291422	291427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202077
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4989	NC_021040	CTG	2	6	320733	320738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202100
4990	NC_021040	T	8	8	320791	320798	0 %	100 %	0 %	0 %	479202100
4991	NC_021040	ATT	2	6	320843	320848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202100
4992	NC_021040	GA	3	6	321166	321171	50 %	0 %	50 %	0 %	479202101
4993	NC_021040	ATT	2	6	321184	321189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202101
4994	NC_021040	CTG	2	6	321212	321217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202101
4995	NC_021040	CGG	2	6	321323	321328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202101
4996	NC_021040	AGC	2	6	321362	321367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202101
4997	NC_021040	ATG	2	6	321373	321378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202101
4998	NC_021040	CAGG	2	8	321442	321449	25 %	0 %	50 %	25 %	479202101
4999	NC_021040	GCG	2	6	321488	321493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202101
5000	NC_021040	ATGC	2	8	321566	321573	25 %	25 %	25 %	25 %	479202101

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