MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus champanellensis 18P13

Total Repeats: 41603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_021039	CCTC	2	8	2242122	2242129	0 %	25 %	0 %	75 %	479201131
36002	NC_021039	CAC	2	6	2242214	2242219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479201131
36003	NC_021039	TGC	2	6	2242360	2242365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201131
36004	NC_021039	CAG	2	6	2242436	2242441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201131
36005	NC_021039	GT	3	6	2242444	2242449	0 %	50 %	50 %	0 %	479201131
36006	NC_021039	TGC	2	6	2242481	2242486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201131
36007	NC_021039	TCT	2	6	2242489	2242494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201131
36008	NC_021039	GCA	2	6	2242619	2242624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201132
36009	NC_021039	CATG	2	8	2242653	2242660	25 %	25 %	25 %	25 %	479201132
36010	NC_021039	CAT	2	6	2242690	2242695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201132
36011	NC_021039	ACA	2	6	2242710	2242715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201132
36012	NC_021039	TTC	2	6	2242739	2242744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201132
36013	NC_021039	GCC	2	6	2242813	2242818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201132
36014	NC_021039	GATCTT	2	12	2242933	2242944	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479201132
36015	NC_021039	GAA	2	6	2243360	2243365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201133
36016	NC_021039	ATC	2	6	2243409	2243414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201133
36017	NC_021039	GGC	2	6	2243444	2243449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201133
36018	NC_021039	ACA	2	6	2243484	2243489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201133
36019	NC_021039	CTC	2	6	2243551	2243556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201133
36020	NC_021039	GCT	2	6	2243634	2243639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201133
36021	NC_021039	CGG	2	6	2243711	2243716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201133
36022	NC_021039	CAA	2	6	2243740	2243745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201133
36023	NC_021039	CTG	2	6	2243756	2243761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201133
36024	NC_021039	AGA	2	6	2243809	2243814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201133
36025	NC_021039	AG	3	6	2243855	2243860	50 %	0 %	50 %	0 %	479201133
36026	NC_021039	GCG	2	6	2243861	2243866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201133
36027	NC_021039	CTTTC	2	10	2243871	2243880	0 %	60 %	0 %	40 %	479201133
36028	NC_021039	ATC	2	6	2243987	2243992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201133
36029	NC_021039	CCGC	2	8	2244015	2244022	0 %	0 %	25 %	75 %	479201133
36030	NC_021039	ATC	2	6	2244096	2244101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201133
36031	NC_021039	ATC	2	6	2244230	2244235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201133
36032	NC_021039	ACA	2	6	2244243	2244248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201133
36033	NC_021039	CCTGTG	2	12	2244364	2244375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201133
36034	NC_021039	CAA	2	6	2244397	2244402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201133
36035	NC_021039	GGAT	2	8	2244409	2244416	25 %	25 %	50 %	0 %	479201133
36036	NC_021039	TGC	2	6	2244543	2244548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201133
36037	NC_021039	GTC	2	6	2244740	2244745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201133
36038	NC_021039	CAT	2	6	2244766	2244771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201133
36039	NC_021039	GGTCAT	2	12	2244859	2244870	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479201133
36040	NC_021039	GGAC	2	8	2244883	2244890	25 %	0 %	50 %	25 %	479201133
36041	NC_021039	GA	3	6	2244981	2244986	50 %	0 %	50 %	0 %	479201133
36042	NC_021039	CGG	2	6	2245000	2245005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201133
36043	NC_021039	GAA	2	6	2245040	2245045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201133
36044	NC_021039	GGA	2	6	2245075	2245080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201133
36045	NC_021039	A	6	6	2245217	2245222	100 %	0 %	0 %	0 %	479201133
36046	NC_021039	CA	3	6	2245357	2245362	50 %	0 %	0 %	50 %	479201134
36047	NC_021039	CA	3	6	2245386	2245391	50 %	0 %	0 %	50 %	479201134
36048	NC_021039	AAC	2	6	2245433	2245438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201134
36049	NC_021039	ACA	2	6	2245461	2245466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201134
36050	NC_021039	CTG	2	6	2245508	2245513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201134
36051	NC_021039	ATC	2	6	2245550	2245555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201134
36052	NC_021039	CTG	2	6	2245581	2245586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201134
36053	NC_021039	TCT	2	6	2245614	2245619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201134
36054	NC_021039	GCG	2	6	2245687	2245692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201134
36055	NC_021039	GAT	2	6	2245715	2245720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201134
36056	NC_021039	GGA	2	6	2245765	2245770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201134
36057	NC_021039	GCG	2	6	2246046	2246051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201134
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36060	NC_021039	AT	3	6	2246284	2246289	50 %	50 %	0 %	0 %	479201134
36061	NC_021039	CTGG	2	8	2246356	2246363	0 %	25 %	50 %	25 %	479201134
36062	NC_021039	TAT	2	6	2246462	2246467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201134
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36065	NC_021039	TAT	2	6	2246594	2246599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201134
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36067	NC_021039	GGTCAT	2	12	2246827	2246838	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479201134
36068	NC_021039	GGAC	2	8	2246851	2246858	25 %	0 %	50 %	25 %	479201134
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36071	NC_021039	CTG	2	6	2246956	2246961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201134
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36113	NC_021039	ACC	2	6	2249040	2249045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479201136
36114	NC_021039	GACA	2	8	2249099	2249106	50 %	0 %	25 %	25 %	479201136
36115	NC_021039	CAA	2	6	2249261	2249266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201136
36116	NC_021039	GCA	2	6	2249371	2249376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201136
36117	NC_021039	TACC	2	8	2249408	2249415	25 %	25 %	0 %	50 %	479201136
36118	NC_021039	GT	3	6	2249533	2249538	0 %	50 %	50 %	0 %	479201136
36119	NC_021039	CAG	2	6	2249562	2249567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201136
36120	NC_021039	TACAAT	2	12	2249589	2249600	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479201136
36121	NC_021039	TCA	2	6	2249620	2249625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201136
36122	NC_021039	AGC	2	6	2249671	2249676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201136
36123	NC_021039	CAA	2	6	2249774	2249779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201136
36124	NC_021039	GCAA	2	8	2249952	2249959	50 %	0 %	25 %	25 %	479201136
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36131	NC_021039	CAT	2	6	2250325	2250330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201136
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36133	NC_021039	TAC	2	6	2250387	2250392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201136
36134	NC_021039	CAA	2	6	2250407	2250412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201136
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36138	NC_021039	CTG	2	6	2250514	2250519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201136
36139	NC_021039	CCA	2	6	2250523	2250528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479201136
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36142	NC_021039	TG	3	6	2250690	2250695	0 %	50 %	50 %	0 %	479201136
36143	NC_021039	AAAAG	2	10	2250787	2250796	80 %	0 %	20 %	0 %	479201136
36144	NC_021039	CCA	2	6	2250852	2250857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479201137
36145	NC_021039	ATCCG	2	10	2250869	2250878	20 %	20 %	20 %	40 %	479201137
36146	NC_021039	CTG	2	6	2250886	2250891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201137
36147	NC_021039	GCA	2	6	2250910	2250915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201137
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36201	NC_021039	AGA	2	6	2253905	2253910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201139
36202	NC_021039	CTG	2	6	2253993	2253998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201140
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36214	NC_021039	CTC	2	6	2254605	2254610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201140
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36216	NC_021039	T	6	6	2254671	2254676	0 %	100 %	0 %	0 %	479201140
36217	NC_021039	TTG	2	6	2254678	2254683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201140
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36221	NC_021039	TCC	2	6	2254910	2254915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201141
36222	NC_021039	TCC	2	6	2254922	2254927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201141
36223	NC_021039	CTT	2	6	2254966	2254971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201141
36224	NC_021039	TCC	2	6	2254982	2254987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201141
36225	NC_021039	GGC	2	6	2254990	2254995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201141
36226	NC_021039	GCAA	2	8	2255003	2255010	50 %	0 %	25 %	25 %	479201141
36227	NC_021039	CCG	2	6	2255022	2255027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201141
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36341	NC_021039	TTCCTG	2	12	2262458	2262469	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479201146
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36345	NC_021039	TGG	2	6	2262798	2262803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201146
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36460	NC_021039	GAG	2	6	2270697	2270702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201153
36461	NC_021039	A	7	7	2270718	2270724	100 %	0 %	0 %	0 %	479201153
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36464	NC_021039	CAG	2	6	2270794	2270799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201153
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36480	NC_021039	CGG	2	6	2271540	2271545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201154
36481	NC_021039	C	6	6	2271591	2271596	0 %	0 %	0 %	100 %	479201154
36482	NC_021039	CCG	2	6	2271642	2271647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201154
36483	NC_021039	CAAA	2	8	2271651	2271658	75 %	0 %	0 %	25 %	479201154
36484	NC_021039	GAT	2	6	2271730	2271735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201154
36485	NC_021039	TCT	2	6	2271756	2271761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201154
36486	NC_021039	TCCGTT	2	12	2271851	2271862	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479201154
36487	NC_021039	TCC	2	6	2271884	2271889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201154
36488	NC_021039	GCA	3	9	2271900	2271908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201154
36489	NC_021039	TCC	2	6	2271914	2271919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201154
36490	NC_021039	CAG	2	6	2271949	2271954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201154
36491	NC_021039	T	6	6	2271956	2271961	0 %	100 %	0 %	0 %	479201154
36492	NC_021039	TTC	3	9	2271967	2271975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201154
36493	NC_021039	CCG	2	6	2272026	2272031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201154
36494	NC_021039	TCC	2	6	2272046	2272051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201154
36495	NC_021039	CA	3	6	2272256	2272261	50 %	0 %	0 %	50 %	479201155
36496	NC_021039	ACG	2	6	2272315	2272320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201155
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