MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus champanellensis 18P13

Total Repeats: 41603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_021039	GCT	2	6	1173432	1173437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200216
19003	NC_021039	CCA	2	6	1173508	1173513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479200216
19004	NC_021039	TAA	2	6	1173597	1173602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479200216
19005	NC_021039	GCAAA	2	10	1173689	1173698	60 %	0 %	20 %	20 %	479200216
19006	NC_021039	GGA	2	6	1173704	1173709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479200216
19007	NC_021039	GCT	2	6	1173721	1173726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200216
19008	NC_021039	TAA	2	6	1173759	1173764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479200216
19009	NC_021039	T	7	7	1173821	1173827	0 %	100 %	0 %	0 %	479200216
19010	NC_021039	CA	3	6	1173881	1173886	50 %	0 %	0 %	50 %	479200216
19011	NC_021039	CGC	2	6	1173905	1173910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479200216
19012	NC_021039	AAT	2	6	1174004	1174009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479200216
19013	NC_021039	TGT	2	6	1174045	1174050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479200216
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19015	NC_021039	AATA	2	8	1174918	1174925	75 %	25 %	0 %	0 %	479200217
19016	NC_021039	T	6	6	1174998	1175003	0 %	100 %	0 %	0 %	479200217
19017	NC_021039	ATA	2	6	1175017	1175022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479200217
19018	NC_021039	CTG	2	6	1175064	1175069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200217
19019	NC_021039	TTC	2	6	1175103	1175108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479200217
19020	NC_021039	ATT	2	6	1175115	1175120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479200217
19021	NC_021039	ATT	2	6	1175124	1175129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479200217
19022	NC_021039	TCA	2	6	1175140	1175145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479200217
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19024	NC_021039	CTC	2	6	1175157	1175162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479200217
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19042	NC_021039	AATA	2	8	1176344	1176351	75 %	25 %	0 %	0 %	479200217
19043	NC_021039	TCAG	2	8	1176367	1176374	25 %	25 %	25 %	25 %	479200217
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19051	NC_021039	AT	3	6	1176678	1176683	50 %	50 %	0 %	0 %	479200217
19052	NC_021039	TA	3	6	1176770	1176775	50 %	50 %	0 %	0 %	479200217
19053	NC_021039	GTAG	2	8	1176819	1176826	25 %	25 %	50 %	0 %	479200217
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19055	NC_021039	AGT	2	6	1176923	1176928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479200217
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19059	NC_021039	TTTCT	2	10	1177090	1177099	0 %	80 %	0 %	20 %	479200217
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19065	NC_021039	GCA	2	6	1177769	1177774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479200218
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19067	NC_021039	TGC	2	6	1178075	1178080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200219
19068	NC_021039	GCGG	2	8	1178096	1178103	0 %	0 %	75 %	25 %	479200219
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19089	NC_021039	GTGG	2	8	1179375	1179382	0 %	25 %	75 %	0 %	479200219
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19099	NC_021039	TACA	2	8	1180086	1180093	50 %	25 %	0 %	25 %	479200219
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19105	NC_021039	CGG	2	6	1180193	1180198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479200219
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19109	NC_021039	GGACGG	2	12	1180292	1180303	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	479200219
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19111	NC_021039	CGGA	2	8	1180384	1180391	25 %	0 %	50 %	25 %	479200219
19112	NC_021039	TCA	2	6	1180450	1180455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479200219
19113	NC_021039	CAGC	2	8	1180486	1180493	25 %	0 %	25 %	50 %	479200219
19114	NC_021039	GGATCC	2	12	1180541	1180552	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479200219
19115	NC_021039	TGA	2	6	1180610	1180615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479200219
19116	NC_021039	GGT	2	6	1180676	1180681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479200219
19117	NC_021039	AGC	2	6	1180754	1180759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479200219
19118	NC_021039	AGGC	2	8	1180771	1180778	25 %	0 %	50 %	25 %	479200219
19119	NC_021039	CAA	2	6	1180871	1180876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479200219
19120	NC_021039	AT	3	6	1180883	1180888	50 %	50 %	0 %	0 %	479200219
19121	NC_021039	GCT	2	6	1180889	1180894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200219
19122	NC_021039	CGG	2	6	1180961	1180966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479200219
19123	NC_021039	ACA	2	6	1180978	1180983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479200219
19124	NC_021039	CAT	2	6	1181042	1181047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479200219
19125	NC_021039	TAC	2	6	1181048	1181053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479200219
19126	NC_021039	CGG	2	6	1181090	1181095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479200219
19127	NC_021039	TGA	2	6	1181152	1181157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479200219
19128	NC_021039	CTG	2	6	1181158	1181163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200219
19129	NC_021039	TAT	2	6	1181343	1181348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479200219
19130	NC_021039	TGGAA	2	10	1181364	1181373	40 %	20 %	40 %	0 %	479200219
19131	NC_021039	GCTG	2	8	1181397	1181404	0 %	25 %	50 %	25 %	479200220
19132	NC_021039	CTC	2	6	1181407	1181412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479200220
19133	NC_021039	TAT	2	6	1181452	1181457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479200220
19134	NC_021039	GCAG	2	8	1181460	1181467	25 %	0 %	50 %	25 %	479200220
19135	NC_021039	GCG	2	6	1181479	1181484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479200220
19136	NC_021039	TGCTTT	2	12	1181489	1181500	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479200220
19137	NC_021039	TGCA	2	8	1181502	1181509	25 %	25 %	25 %	25 %	479200220
19138	NC_021039	TGC	2	6	1181510	1181515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200220
19139	NC_021039	GA	3	6	1181548	1181553	50 %	0 %	50 %	0 %	479200220
19140	NC_021039	TCT	2	6	1181582	1181587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479200220
19141	NC_021039	TAT	2	6	1181665	1181670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479200220
19142	NC_021039	GGGGA	2	10	1181743	1181752	20 %	0 %	80 %	0 %	479200220
19143	NC_021039	TCAT	2	8	1181767	1181774	25 %	50 %	0 %	25 %	479200220
19144	NC_021039	CTTT	2	8	1181776	1181783	0 %	75 %	0 %	25 %	479200220
19145	NC_021039	GGAT	2	8	1181786	1181793	25 %	25 %	50 %	0 %	479200220
19146	NC_021039	GCA	2	6	1181803	1181808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479200220
19147	NC_021039	GCA	2	6	1181814	1181819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479200220
19148	NC_021039	GCT	2	6	1181829	1181834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200220
19149	NC_021039	CGG	2	6	1181876	1181881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479200220
19150	NC_021039	CTA	2	6	1182000	1182005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479200220
19151	NC_021039	TGA	2	6	1183864	1183869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479200221
19152	NC_021039	TGC	2	6	1183924	1183929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200221
19153	NC_021039	TGC	2	6	1183931	1183936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200221
19154	NC_021039	CCAAT	2	10	1183993	1184002	40 %	20 %	0 %	40 %	479200221
19155	NC_021039	GAT	3	9	1184022	1184030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479200221
19156	NC_021039	TAT	2	6	1184052	1184057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479200221
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19158	NC_021039	TTC	2	6	1184076	1184081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479200221
19159	NC_021039	AC	3	6	1184149	1184154	50 %	0 %	0 %	50 %	479200221
19160	NC_021039	TAT	2	6	1184247	1184252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479200221
19161	NC_021039	TTC	2	6	1184256	1184261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479200221
19162	NC_021039	AT	3	6	1184289	1184294	50 %	50 %	0 %	0 %	479200221
19163	NC_021039	ATG	2	6	1184353	1184358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479200221
19164	NC_021039	TGA	3	9	1184372	1184380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479200221
19165	NC_021039	CGG	2	6	1184408	1184413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479200221
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19171	NC_021039	GCA	2	6	1184605	1184610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479200221
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19175	NC_021039	CAG	2	6	1184894	1184899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479200221
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19178	NC_021039	CGGA	2	8	1185042	1185049	25 %	0 %	50 %	25 %	479200221
19179	NC_021039	GCT	2	6	1185058	1185063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200221
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19185	NC_021039	CTA	2	6	1185359	1185364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479200221
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19194	NC_021039	ATGTA	2	10	1185766	1185775	40 %	40 %	20 %	0 %	479200221
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19207	NC_021039	TGA	2	6	1186502	1186507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479200221
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19212	NC_021039	CTG	2	6	1186914	1186919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200221
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19215	NC_021039	TGC	2	6	1187341	1187346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200222
19216	NC_021039	TGCAGC	2	12	1187353	1187364	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479200222
19217	NC_021039	CTG	2	6	1187391	1187396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200222
19218	NC_021039	CTG	2	6	1187440	1187445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200222
19219	NC_021039	AGG	2	6	1187560	1187565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479200222
19220	NC_021039	CAG	2	6	1187577	1187582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479200222
19221	NC_021039	TGAA	2	8	1187632	1187639	50 %	25 %	25 %	0 %	479200222
19222	NC_021039	GCA	2	6	1187642	1187647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479200222
19223	NC_021039	TTC	2	6	1187669	1187674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479200222
19224	NC_021039	GAATG	2	10	1187712	1187721	40 %	20 %	40 %	0 %	479200222
19225	NC_021039	AGA	2	6	1187894	1187899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479200222
19226	NC_021039	GGA	2	6	1187915	1187920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479200222
19227	NC_021039	GCT	2	6	1187926	1187931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200222
19228	NC_021039	CAC	2	6	1187963	1187968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479200222
19229	NC_021039	CTG	2	6	1187994	1187999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200222
19230	NC_021039	CAGTTT	2	12	1188063	1188074	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479200222
19231	NC_021039	TGC	2	6	1188100	1188105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200222
19232	NC_021039	TCT	2	6	1188233	1188238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479200222
19233	NC_021039	CGCTG	2	10	1188242	1188251	0 %	20 %	40 %	40 %	479200222
19234	NC_021039	GGCAC	2	10	1188261	1188270	20 %	0 %	40 %	40 %	479200222
19235	NC_021039	CTGC	2	8	1188284	1188291	0 %	25 %	25 %	50 %	479200222
19236	NC_021039	CTG	2	6	1188354	1188359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200222
19237	NC_021039	ACT	2	6	1188377	1188382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479200222
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19464	NC_021039	TGC	2	6	1201925	1201930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200236
19465	NC_021039	GAA	2	6	1201983	1201988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479200236
19466	NC_021039	GAT	2	6	1202121	1202126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479200236
19467	NC_021039	GCT	2	6	1202144	1202149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200236
19468	NC_021039	GTG	2	6	1202177	1202182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479200236
19469	NC_021039	TGC	2	6	1202221	1202226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200236
19470	NC_021039	ATCA	2	8	1202238	1202245	50 %	25 %	0 %	25 %	479200236
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19472	NC_021039	GGC	2	6	1202454	1202459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479200236
19473	NC_021039	GCG	2	6	1202508	1202513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479200236
19474	NC_021039	GGA	2	6	1202609	1202614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479200236
19475	NC_021039	CAG	2	6	1202627	1202632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479200236
19476	NC_021039	CAT	2	6	1203004	1203009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479200237
19477	NC_021039	CCA	2	6	1203030	1203035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479200237
19478	NC_021039	CT	3	6	1203043	1203048	0 %	50 %	0 %	50 %	479200237
19479	NC_021039	TGAT	2	8	1203081	1203088	25 %	50 %	25 %	0 %	479200237
19480	NC_021039	GCAG	2	8	1203167	1203174	25 %	0 %	50 %	25 %	479200237
19481	NC_021039	TTATA	2	10	1203325	1203334	40 %	60 %	0 %	0 %	479200237
19482	NC_021039	GTAA	2	8	1203335	1203342	50 %	25 %	25 %	0 %	479200237
19483	NC_021039	ATC	2	6	1203401	1203406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479200237
19484	NC_021039	TAC	2	6	1203458	1203463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479200237
19485	NC_021039	CTC	2	6	1203514	1203519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479200237
19486	NC_021039	CAC	2	6	1203583	1203588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479200237
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19488	NC_021039	GGC	2	6	1203731	1203736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479200237
19489	NC_021039	ATG	2	6	1203764	1203769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479200237
19490	NC_021039	TGA	2	6	1203787	1203792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479200237
19491	NC_021039	GTCT	2	8	1203794	1203801	0 %	50 %	25 %	25 %	479200237
19492	NC_021039	CGA	2	6	1203823	1203828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479200237
19493	NC_021039	TGA	2	6	1203862	1203867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479200237
19494	NC_021039	AAG	2	6	1204112	1204117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479200238
19495	NC_021039	CTGAA	2	10	1204137	1204146	40 %	20 %	20 %	20 %	479200238
19496	NC_021039	GCTG	2	8	1204171	1204178	0 %	25 %	50 %	25 %	479200238
19497	NC_021039	TGG	2	6	1204236	1204241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479200238
19498	NC_021039	ATG	2	6	1204341	1204346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479200238
19499	NC_021039	TCC	2	6	1204364	1204369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479200238
19500	NC_021039	GCT	2	6	1204426	1204431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479200238

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