MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus torques L2-14 draft genome

Total Repeats: 55759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021015	TCT	2	6	187664	187669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155906
3002	NC_021015	ATT	2	6	187687	187692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155906
3003	NC_021015	ACCA	2	8	187707	187714	50 %	0 %	0 %	50 %	479155906
3004	NC_021015	TAAT	2	8	187789	187796	50 %	50 %	0 %	0 %	479155906
3005	NC_021015	TG	3	6	187850	187855	0 %	50 %	50 %	0 %	479155906
3006	NC_021015	GTA	2	6	187858	187863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155906
3007	NC_021015	T	6	6	187978	187983	0 %	100 %	0 %	0 %	479155906
3008	NC_021015	CAG	2	6	188016	188021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155906
3009	NC_021015	TTC	2	6	188025	188030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155906
3010	NC_021015	CTC	2	6	188054	188059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155906
3011	NC_021015	AATATC	2	12	188121	188132	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479155906
3012	NC_021015	AATC	2	8	188135	188142	50 %	25 %	0 %	25 %	479155906
3013	NC_021015	C	6	6	188197	188202	0 %	0 %	0 %	100 %	479155906
3014	NC_021015	T	6	6	188204	188209	0 %	100 %	0 %	0 %	479155906
3015	NC_021015	T	6	6	188357	188362	0 %	100 %	0 %	0 %	479155906
3016	NC_021015	CTA	2	6	188420	188425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155906
3017	NC_021015	TCT	2	6	188429	188434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155906
3018	NC_021015	ATTT	2	8	188486	188493	25 %	75 %	0 %	0 %	479155906
3019	NC_021015	TGTTTC	2	12	188502	188513	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479155906
3020	NC_021015	TTC	2	6	188526	188531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155906
3021	NC_021015	CAAT	2	8	188612	188619	50 %	25 %	0 %	25 %	479155906
3022	NC_021015	GCCA	2	8	188638	188645	25 %	0 %	25 %	50 %	479155906
3023	NC_021015	TTC	2	6	188666	188671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155907
3024	NC_021015	A	7	7	188682	188688	100 %	0 %	0 %	0 %	479155907
3025	NC_021015	GT	3	6	188793	188798	0 %	50 %	50 %	0 %	479155907
3026	NC_021015	TGA	2	6	188802	188807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155907
3027	NC_021015	TGG	2	6	188815	188820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155907
3028	NC_021015	CAT	2	6	188850	188855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155907
3029	NC_021015	CTT	2	6	188868	188873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155907
3030	NC_021015	ATC	2	6	188914	188919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155907
3031	NC_021015	CAG	2	6	189112	189117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155907
3032	NC_021015	TGT	2	6	189178	189183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155907
3033	NC_021015	CCG	2	6	189191	189196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155907
3034	NC_021015	ATC	2	6	189302	189307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155907
3035	NC_021015	A	7	7	189312	189318	100 %	0 %	0 %	0 %	479155907
3036	NC_021015	T	6	6	189331	189336	0 %	100 %	0 %	0 %	479155907
3037	NC_021015	TGC	2	6	189355	189360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155908
3038	NC_021015	TCTT	2	8	189376	189383	0 %	75 %	0 %	25 %	479155908
3039	NC_021015	TCTTGT	2	12	189471	189482	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479155908
3040	NC_021015	TCC	2	6	189603	189608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155908
3041	NC_021015	AAAT	2	8	189671	189678	75 %	25 %	0 %	0 %	479155908
3042	NC_021015	GT	3	6	189752	189757	0 %	50 %	50 %	0 %	479155908
3043	NC_021015	GCT	2	6	189779	189784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155908
3044	NC_021015	TCT	3	9	189819	189827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155908
3045	NC_021015	CTC	2	6	189923	189928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155908
3046	NC_021015	CTG	2	6	190076	190081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155908
3047	NC_021015	AT	3	6	190115	190120	50 %	50 %	0 %	0 %	479155908
3048	NC_021015	AAG	2	6	190124	190129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155908
3049	NC_021015	T	6	6	190164	190169	0 %	100 %	0 %	0 %	479155908
3050	NC_021015	TCG	2	6	190183	190188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155908
3051	NC_021015	T	6	6	190194	190199	0 %	100 %	0 %	0 %	479155908
3052	NC_021015	GCG	2	6	194554	194559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155909
3053	NC_021015	CTG	2	6	194588	194593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155909
3054	NC_021015	AT	3	6	194629	194634	50 %	50 %	0 %	0 %	479155909
3055	NC_021015	CAC	2	6	194711	194716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155909
3056	NC_021015	AC	3	6	194724	194729	50 %	0 %	0 %	50 %	479155909
3057	NC_021015	GAT	2	6	194813	194818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155909
3058	NC_021015	GTC	2	6	194827	194832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155909
3059	NC_021015	TG	3	6	194846	194851	0 %	50 %	50 %	0 %	479155909
3060	NC_021015	TCTG	2	8	194962	194969	0 %	50 %	25 %	25 %	479155909
3061	NC_021015	TGTTTC	2	12	194988	194999	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479155909
3062	NC_021015	CTT	2	6	195017	195022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155909
3063	NC_021015	TCT	2	6	195085	195090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155909
3064	NC_021015	CAT	3	9	195107	195115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155909
3065	NC_021015	GTC	2	6	195181	195186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155909
3066	NC_021015	CAA	2	6	195201	195206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155909
3067	NC_021015	GCT	2	6	195214	195219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155909
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3069	NC_021015	T	7	7	196022	196028	0 %	100 %	0 %	0 %	479155910
3070	NC_021015	CTG	2	6	196081	196086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155910
3071	NC_021015	AAACA	2	10	196137	196146	80 %	0 %	0 %	20 %	479155910
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3084	NC_021015	GAT	2	6	198623	198628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155911
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3086	NC_021015	ACA	2	6	198727	198732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155911
3087	NC_021015	TTC	2	6	198792	198797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155911
3088	NC_021015	TAT	3	9	198809	198817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155911
3089	NC_021015	GCA	2	6	198848	198853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155911
3090	NC_021015	ATC	2	6	199023	199028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155911
3091	NC_021015	TCT	3	9	199061	199069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155911
3092	NC_021015	TCA	2	6	199097	199102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155911
3093	NC_021015	ACCAGT	2	12	199135	199146	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479155911
3094	NC_021015	TTG	2	6	199154	199159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155911
3095	NC_021015	AAC	2	6	199243	199248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155911
3096	NC_021015	AT	3	6	199258	199263	50 %	50 %	0 %	0 %	479155911
3097	NC_021015	TCA	2	6	199307	199312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155912
3098	NC_021015	ACTT	2	8	199412	199419	25 %	50 %	0 %	25 %	479155912
3099	NC_021015	CAT	2	6	199421	199426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155912
3100	NC_021015	TCCA	2	8	199443	199450	25 %	25 %	0 %	50 %	479155912
3101	NC_021015	TC	3	6	199478	199483	0 %	50 %	0 %	50 %	479155912
3102	NC_021015	TGAT	2	8	199503	199510	25 %	50 %	25 %	0 %	479155912
3103	NC_021015	TTCACT	2	12	199603	199614	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479155912
3104	NC_021015	CTG	2	6	199736	199741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155912
3105	NC_021015	GCA	2	6	199771	199776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155912
3106	NC_021015	CAT	2	6	199853	199858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155912
3107	NC_021015	CTG	2	6	199905	199910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155912
3108	NC_021015	CAT	2	6	199934	199939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155912
3109	NC_021015	TC	3	6	200010	200015	0 %	50 %	0 %	50 %	479155912
3110	NC_021015	GTC	2	6	200026	200031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155912
3111	NC_021015	T	6	6	200053	200058	0 %	100 %	0 %	0 %	479155912
3112	NC_021015	CAA	2	6	200117	200122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155912
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3115	NC_021015	AGG	2	6	200308	200313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155912
3116	NC_021015	GAT	2	6	200343	200348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155912
3117	NC_021015	AAG	2	6	200355	200360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155912
3118	NC_021015	TTCTT	2	10	200361	200370	0 %	80 %	0 %	20 %	479155912
3119	NC_021015	CTT	2	6	200386	200391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155912
3120	NC_021015	ATC	2	6	200415	200420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155912
3121	NC_021015	ACC	2	6	200431	200436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155912
3122	NC_021015	TTTC	2	8	200451	200458	0 %	75 %	0 %	25 %	479155912
3123	NC_021015	T	7	7	200650	200656	0 %	100 %	0 %	0 %	479155913
3124	NC_021015	CCA	2	6	200686	200691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155913
3125	NC_021015	ATC	2	6	200699	200704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155913
3126	NC_021015	CTG	2	6	200713	200718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155913
3127	NC_021015	TTC	2	6	200771	200776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155913
3128	NC_021015	TTC	2	6	200786	200791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155913
3129	NC_021015	CTG	2	6	200821	200826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155913
3130	NC_021015	GCT	3	9	200850	200858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155913
3131	NC_021015	ATT	2	6	200951	200956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155913
3132	NC_021015	CAT	2	6	200957	200962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155913
3133	NC_021015	CTT	2	6	201030	201035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155913
3134	NC_021015	TCTG	2	8	201105	201112	0 %	50 %	25 %	25 %	479155913
3135	NC_021015	T	9	9	201123	201131	0 %	100 %	0 %	0 %	479155913
3136	NC_021015	TGCA	2	8	201153	201160	25 %	25 %	25 %	25 %	479155913
3137	NC_021015	TTC	2	6	201165	201170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155913
3138	NC_021015	TAA	2	6	201174	201179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155913
3139	NC_021015	TCC	2	6	201188	201193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155913
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3142	NC_021015	CTT	2	6	201370	201375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155913
3143	NC_021015	TTC	2	6	201392	201397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155913
3144	NC_021015	T	6	6	201447	201452	0 %	100 %	0 %	0 %	479155913
3145	NC_021015	TTTTAT	2	12	201458	201469	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479155913
3146	NC_021015	ATAAAT	2	12	201476	201487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155913
3147	NC_021015	AT	3	6	201486	201491	50 %	50 %	0 %	0 %	479155913
3148	NC_021015	GTT	2	6	201541	201546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155913
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3150	NC_021015	T	6	6	201559	201564	0 %	100 %	0 %	0 %	479155913
3151	NC_021015	GAA	2	6	201574	201579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155913
3152	NC_021015	A	7	7	201578	201584	100 %	0 %	0 %	0 %	479155913
3153	NC_021015	TCAC	2	8	201621	201628	25 %	25 %	0 %	50 %	479155913
3154	NC_021015	T	6	6	201648	201653	0 %	100 %	0 %	0 %	479155913
3155	NC_021015	TC	3	6	201662	201667	0 %	50 %	0 %	50 %	479155913
3156	NC_021015	ATT	2	6	202045	202050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155914
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3159	NC_021015	CTT	2	6	202100	202105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155914
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3226	NC_021015	GCT	2	6	205845	205850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155918
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3232	NC_021015	ATTT	2	8	205971	205978	25 %	75 %	0 %	0 %	479155919
3233	NC_021015	CTT	2	6	206049	206054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155919
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3235	NC_021015	TCT	2	6	206098	206103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155919
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3239	NC_021015	TCC	2	6	206257	206262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155919
3240	NC_021015	GAT	2	6	206320	206325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155919
3241	NC_021015	CAT	2	6	206330	206335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155919
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3243	NC_021015	GCA	2	6	206377	206382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155919
3244	NC_021015	TCT	2	6	206401	206406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155919
3245	NC_021015	CT	3	6	206492	206497	0 %	50 %	0 %	50 %	479155919
3246	NC_021015	ATC	2	6	206572	206577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155919
3247	NC_021015	TTC	2	6	206583	206588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155919
3248	NC_021015	GCA	2	6	206597	206602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155919
3249	NC_021015	TAT	2	6	206636	206641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155919
3250	NC_021015	GGC	2	6	206783	206788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155919
3251	NC_021015	CAG	2	6	206877	206882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155919
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3254	NC_021015	TCTG	2	8	206959	206966	0 %	50 %	25 %	25 %	479155919
3255	NC_021015	GTC	2	6	207070	207075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155919
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3263	NC_021015	CATT	2	8	207272	207279	25 %	50 %	0 %	25 %	479155919
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3265	NC_021015	AT	3	6	207679	207684	50 %	50 %	0 %	0 %	479155920
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3267	NC_021015	CTG	2	6	207710	207715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155920
3268	NC_021015	TTG	2	6	207731	207736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155920
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3273	NC_021015	TTCT	2	8	207888	207895	0 %	75 %	0 %	25 %	479155920
3274	NC_021015	TCT	2	6	207910	207915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155920
3275	NC_021015	CCTG	2	8	207961	207968	0 %	25 %	25 %	50 %	479155920
3276	NC_021015	GAA	3	9	208022	208030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155920
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3279	NC_021015	ATCG	2	8	208215	208222	25 %	25 %	25 %	25 %	479155920
3280	NC_021015	TCCT	2	8	208248	208255	0 %	50 %	0 %	50 %	479155920
3281	NC_021015	GAA	2	6	208259	208264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155920
3282	NC_021015	TCC	2	6	208290	208295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155920
3283	NC_021015	TG	3	6	208332	208337	0 %	50 %	50 %	0 %	479155920
3284	NC_021015	TTG	2	6	208534	208539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155920
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3286	NC_021015	TGC	2	6	208566	208571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155920
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3304	NC_021015	AT	3	6	209387	209392	50 %	50 %	0 %	0 %	479155921
3305	NC_021015	CATG	2	8	209438	209445	25 %	25 %	25 %	25 %	479155921
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3314	NC_021015	ATC	2	6	210575	210580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155923
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3317	NC_021015	CT	3	6	210718	210723	0 %	50 %	0 %	50 %	479155923
3318	NC_021015	ATT	2	6	210725	210730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155923
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3342	NC_021015	GAAA	2	8	212568	212575	75 %	0 %	25 %	0 %	479155924
3343	NC_021015	AT	3	6	212598	212603	50 %	50 %	0 %	0 %	479155924
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3346	NC_021015	TCT	2	6	212703	212708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155924
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3349	NC_021015	CAG	2	6	212890	212895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155924
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3352	NC_021015	AAT	2	6	212942	212947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155924
3353	NC_021015	TTC	2	6	213095	213100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155925
3354	NC_021015	TCCGT	2	10	213105	213114	0 %	40 %	20 %	40 %	479155925
3355	NC_021015	CTG	2	6	213187	213192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155925
3356	NC_021015	TCA	2	6	213390	213395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155925
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3358	NC_021015	GAA	2	6	213468	213473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155925
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3360	NC_021015	TAC	2	6	213652	213657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155926
3361	NC_021015	TTTC	2	8	213674	213681	0 %	75 %	0 %	25 %	479155926
3362	NC_021015	TCT	3	9	213685	213693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155926
3363	NC_021015	ATGGAA	2	12	213759	213770	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479155926
3364	NC_021015	GTT	2	6	213795	213800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155926
3365	NC_021015	ATC	2	6	213850	213855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155926
3366	NC_021015	CAGA	2	8	213864	213871	50 %	0 %	25 %	25 %	479155926
3367	NC_021015	TTC	2	6	213922	213927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155926
3368	NC_021015	CTC	2	6	213984	213989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155926
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3370	NC_021015	ATC	2	6	214050	214055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155926
3371	NC_021015	TC	3	6	214054	214059	0 %	50 %	0 %	50 %	479155926
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3483	NC_021015	TGCC	2	8	219083	219090	0 %	25 %	25 %	50 %	479155932
3484	NC_021015	T	7	7	219119	219125	0 %	100 %	0 %	0 %	479155932
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3488	NC_021015	ATA	2	6	219174	219179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155932
3489	NC_021015	TTC	2	6	219215	219220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155932
3490	NC_021015	TCT	2	6	219225	219230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155932
3491	NC_021015	TCT	2	6	219304	219309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155932
3492	NC_021015	TCTG	2	8	219330	219337	0 %	50 %	25 %	25 %	479155932
3493	NC_021015	TGT	2	6	219350	219355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155932
3494	NC_021015	T	6	6	219366	219371	0 %	100 %	0 %	0 %	479155932
3495	NC_021015	TCCAT	2	10	219378	219387	20 %	40 %	0 %	40 %	479155932
3496	NC_021015	TTGAT	2	10	219462	219471	20 %	60 %	20 %	0 %	479155932
3497	NC_021015	TAA	2	6	219492	219497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155932
3498	NC_021015	TCT	2	6	219519	219524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155932
3499	NC_021015	TCCTG	2	10	219533	219542	0 %	40 %	20 %	40 %	479155932
3500	NC_021015	TGA	2	6	219588	219593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155932

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