MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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49002	NC_021014	CTG	2	6	3313534	3313539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155354
49003	NC_021014	TGC	2	6	3313556	3313561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155354
49004	NC_021014	CTG	2	6	3313594	3313599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155354
49005	NC_021014	AGA	2	6	3313610	3313615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155354
49006	NC_021014	CAC	2	6	3313648	3313653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155354
49007	NC_021014	GCT	2	6	3313719	3313724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155354
49008	NC_021014	TCA	2	6	3313737	3313742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155354
49009	NC_021014	TC	3	6	3313747	3313752	0 %	50 %	0 %	50 %	479155354
49010	NC_021014	TCAT	2	8	3313818	3313825	25 %	50 %	0 %	25 %	479155354
49011	NC_021014	TCT	2	6	3313854	3313859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155354
49012	NC_021014	T	7	7	3313859	3313865	0 %	100 %	0 %	0 %	479155354
49013	NC_021014	TGA	2	6	3313873	3313878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155354
49014	NC_021014	CTT	2	6	3313882	3313887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155354
49015	NC_021014	TTG	2	6	3313894	3313899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155354
49016	NC_021014	AAC	2	6	3314099	3314104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155355
49017	NC_021014	TCC	2	6	3314109	3314114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155355
49018	NC_021014	AGTG	2	8	3314139	3314146	25 %	25 %	50 %	0 %	479155355
49019	NC_021014	TCC	2	6	3314358	3314363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155355
49020	NC_021014	TCA	2	6	3314433	3314438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155355
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49022	NC_021014	CCT	2	6	3314538	3314543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155356
49023	NC_021014	TTG	2	6	3314579	3314584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155356
49024	NC_021014	CCG	2	6	3314732	3314737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155356
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49032	NC_021014	GTAT	2	8	3315217	3315224	25 %	50 %	25 %	0 %	479155356
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49038	NC_021014	TCG	2	6	3315572	3315577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155356
49039	NC_021014	AGCTTC	2	12	3315581	3315592	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479155356
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49041	NC_021014	T	6	6	3315735	3315740	0 %	100 %	0 %	0 %	479155356
49042	NC_021014	ATGG	2	8	3315803	3315810	25 %	25 %	50 %	0 %	479155356
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49101	NC_021014	T	6	6	3319828	3319833	0 %	100 %	0 %	0 %	479155362
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49116	NC_021014	GCT	2	6	3320785	3320790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155363
49117	NC_021014	TGA	2	6	3320792	3320797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155363
49118	NC_021014	ACCAAC	2	12	3320814	3320825	50 %	0 %	0 %	50 %	479155363
49119	NC_021014	TGC	2	6	3320874	3320879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155363
49120	NC_021014	AAC	2	6	3321006	3321011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155363
49121	NC_021014	CTG	2	6	3321044	3321049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155363
49122	NC_021014	GAA	2	6	3321101	3321106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155363
49123	NC_021014	ATC	2	6	3321112	3321117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155363
49124	NC_021014	TTG	2	6	3321118	3321123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155363
49125	NC_021014	GCT	2	6	3321140	3321145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155363
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49128	NC_021014	GCT	2	6	3321244	3321249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155363
49129	NC_021014	TAC	2	6	3321288	3321293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155363
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49131	NC_021014	CAT	2	6	3321576	3321581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155363
49132	NC_021014	GCT	2	6	3321640	3321645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155363
49133	NC_021014	TGC	2	6	3321669	3321674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155363
49134	NC_021014	TCT	2	6	3321676	3321681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155363
49135	NC_021014	GCT	2	6	3321700	3321705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155363
49136	NC_021014	TGC	2	6	3321729	3321734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155363
49137	NC_021014	T	6	6	3321757	3321762	0 %	100 %	0 %	0 %	479155363
49138	NC_021014	ATG	2	6	3322935	3322940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155364
49139	NC_021014	CA	3	6	3322990	3322995	50 %	0 %	0 %	50 %	479155364
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49143	NC_021014	CTT	2	6	3323278	3323283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155365
49144	NC_021014	TTA	2	6	3323294	3323299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155365
49145	NC_021014	ACA	3	9	3323366	3323374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155365
49146	NC_021014	TCT	3	9	3323380	3323388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155365
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49148	NC_021014	ACCA	2	8	3323701	3323708	50 %	0 %	0 %	50 %	479155365
49149	NC_021014	TGA	2	6	3323715	3323720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155365
49150	NC_021014	TCT	2	6	3323723	3323728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155365
49151	NC_021014	TGA	2	6	3323745	3323750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155365
49152	NC_021014	ACC	2	6	3323764	3323769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155365
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49155	NC_021014	GAT	2	6	3323926	3323931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155365
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49162	NC_021014	T	6	6	3324091	3324096	0 %	100 %	0 %	0 %	479155365
49163	NC_021014	TCA	2	6	3324273	3324278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155365
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49181	NC_021014	TTC	2	6	3326481	3326486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155367
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49187	NC_021014	TCT	2	6	3326977	3326982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155368
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49189	NC_021014	GAA	2	6	3327061	3327066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155368
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49200	NC_021014	CAC	2	6	3327781	3327786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155368
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49202	NC_021014	AAG	2	6	3327872	3327877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155368
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49206	NC_021014	CT	3	6	3328055	3328060	0 %	50 %	0 %	50 %	479155368
49207	NC_021014	CTG	2	6	3328175	3328180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155368
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49217	NC_021014	CTG	2	6	3328780	3328785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155369
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49225	NC_021014	T	7	7	3329012	3329018	0 %	100 %	0 %	0 %	479155369
49226	NC_021014	TTC	2	6	3329029	3329034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155369
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49230	NC_021014	CTG	2	6	3329116	3329121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155369
49231	NC_021014	TCT	2	6	3329211	3329216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155369
49232	NC_021014	CT	3	6	3329224	3329229	0 %	50 %	0 %	50 %	479155369
49233	NC_021014	TGA	2	6	3329304	3329309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155369
49234	NC_021014	TCA	2	6	3329312	3329317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155369
49235	NC_021014	CAGATC	2	12	3329395	3329406	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479155369
49236	NC_021014	TGC	2	6	3329428	3329433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155369
49237	NC_021014	TGC	2	6	3329452	3329457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155369
49238	NC_021014	TCTTTT	2	12	3329582	3329593	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479155369
49239	NC_021014	AT	3	6	3329666	3329671	50 %	50 %	0 %	0 %	479155369
49240	NC_021014	CTT	2	6	3329695	3329700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155369
49241	NC_021014	GATCAC	2	12	3329731	3329742	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479155369
49242	NC_021014	CCAT	2	8	3329786	3329793	25 %	25 %	0 %	50 %	479155369
49243	NC_021014	AT	3	6	3329792	3329797	50 %	50 %	0 %	0 %	479155369
49244	NC_021014	GCT	3	9	3329852	3329860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155369
49245	NC_021014	TCA	2	6	3329945	3329950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155369
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49247	NC_021014	TTTC	2	8	3330341	3330348	0 %	75 %	0 %	25 %	479155370
49248	NC_021014	TTGC	2	8	3330382	3330389	0 %	50 %	25 %	25 %	479155370
49249	NC_021014	TC	3	6	3330419	3330424	0 %	50 %	0 %	50 %	479155370
49250	NC_021014	CT	3	6	3330425	3330430	0 %	50 %	0 %	50 %	479155370
49251	NC_021014	TCC	2	6	3330520	3330525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155370
49252	NC_021014	TC	4	8	3330535	3330542	0 %	50 %	0 %	50 %	479155370
49253	NC_021014	CTG	2	6	3330618	3330623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155370
49254	NC_021014	AAGCTC	2	12	3330639	3330650	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479155370
49255	NC_021014	GAA	2	6	3330680	3330685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155370
49256	NC_021014	GTAT	2	8	3330768	3330775	25 %	50 %	25 %	0 %	479155370
49257	NC_021014	CTC	2	6	3330783	3330788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155370
49258	NC_021014	CACAT	2	10	3330825	3330834	40 %	20 %	0 %	40 %	479155370
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49260	NC_021014	AC	3	6	3331153	3331158	50 %	0 %	0 %	50 %	479155370
49261	NC_021014	GGAA	2	8	3331173	3331180	50 %	0 %	50 %	0 %	479155370
49262	NC_021014	CTTAT	2	10	3331264	3331273	20 %	60 %	0 %	20 %	479155371
49263	NC_021014	GAA	2	6	3331296	3331301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155371
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49267	NC_021014	TCT	2	6	3331388	3331393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155371
49268	NC_021014	ACC	2	6	3331481	3331486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155371
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49271	NC_021014	GCT	2	6	3331580	3331585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155371
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49275	NC_021014	TA	3	6	3331999	3332004	50 %	50 %	0 %	0 %	479155371
49276	NC_021014	GCC	2	6	3332017	3332022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155371
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49302	NC_021014	TCT	2	6	3333364	3333369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155373
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49332	NC_021014	CTTCTC	2	12	3334779	3334790	0 %	50 %	0 %	50 %	479155374
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49335	NC_021014	TTC	2	6	3334857	3334862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155374
49336	NC_021014	TCAT	2	8	3335026	3335033	25 %	50 %	0 %	25 %	479155374
49337	NC_021014	AACA	2	8	3335070	3335077	75 %	0 %	0 %	25 %	479155374
49338	NC_021014	CAA	2	6	3335102	3335107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155374
49339	NC_021014	TCC	2	6	3335239	3335244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155374
49340	NC_021014	CCTG	2	8	3335275	3335282	0 %	25 %	25 %	50 %	479155374
49341	NC_021014	A	8	8	3335283	3335290	100 %	0 %	0 %	0 %	479155374
49342	NC_021014	GCC	2	6	3335308	3335313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155374
49343	NC_021014	T	6	6	3335400	3335405	0 %	100 %	0 %	0 %	479155374
49344	NC_021014	GAT	2	6	3335408	3335413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155374
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49347	NC_021014	TGA	2	6	3335564	3335569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155374
49348	NC_021014	CAC	2	6	3335604	3335609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155374
49349	NC_021014	CCT	2	6	3335684	3335689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155374
49350	NC_021014	T	7	7	3335704	3335710	0 %	100 %	0 %	0 %	479155374
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49354	NC_021014	TGC	2	6	3335790	3335795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155374
49355	NC_021014	CTTT	2	8	3335904	3335911	0 %	75 %	0 %	25 %	479155375
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