MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_021014	TGCA	2	8	3242845	3242852	25 %	25 %	25 %	25 %	479155293
48002	NC_021014	CAG	2	6	3242874	3242879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155293
48003	NC_021014	CCG	2	6	3242903	3242908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155293
48004	NC_021014	CT	4	8	3242932	3242939	0 %	50 %	0 %	50 %	479155293
48005	NC_021014	TGC	2	6	3242941	3242946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155293
48006	NC_021014	CAC	2	6	3242987	3242992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155293
48007	NC_021014	TCCT	2	8	3243019	3243026	0 %	50 %	0 %	50 %	479155293
48008	NC_021014	TC	4	8	3243045	3243052	0 %	50 %	0 %	50 %	479155293
48009	NC_021014	CTT	2	6	3243054	3243059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155293
48010	NC_021014	CAT	2	6	3243069	3243074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155293
48011	NC_021014	AGA	2	6	3243092	3243097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155293
48012	NC_021014	A	6	6	3243109	3243114	100 %	0 %	0 %	0 %	479155293
48013	NC_021014	GCC	2	6	3243130	3243135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155293
48014	NC_021014	TCC	2	6	3243191	3243196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155293
48015	NC_021014	TCT	2	6	3243237	3243242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155293
48016	NC_021014	CA	3	6	3243283	3243288	50 %	0 %	0 %	50 %	479155293
48017	NC_021014	AAG	2	6	3243331	3243336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155293
48018	NC_021014	GCA	2	6	3243393	3243398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155293
48019	NC_021014	GAT	2	6	3243433	3243438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155293
48020	NC_021014	ATA	2	6	3243466	3243471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155293
48021	NC_021014	GATCT	2	10	3243475	3243484	20 %	40 %	20 %	20 %	479155293
48022	NC_021014	ATC	2	6	3243517	3243522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155293
48023	NC_021014	CAG	2	6	3243542	3243547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155293
48024	NC_021014	CAA	2	6	3243549	3243554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155293
48025	NC_021014	GAA	2	6	3243700	3243705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155293
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48028	NC_021014	TAT	2	6	3243816	3243821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155293
48029	NC_021014	TCAG	2	8	3243839	3243846	25 %	25 %	25 %	25 %	479155293
48030	NC_021014	TCT	2	6	3243855	3243860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155293
48031	NC_021014	GAT	2	6	3243895	3243900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155293
48032	NC_021014	CTG	2	6	3243972	3243977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155293
48033	NC_021014	T	6	6	3244000	3244005	0 %	100 %	0 %	0 %	479155293
48034	NC_021014	GAT	2	6	3244063	3244068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155293
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48038	NC_021014	GTTC	2	8	3245314	3245321	0 %	50 %	25 %	25 %	479155294
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48041	NC_021014	GAAT	2	8	3245480	3245487	50 %	25 %	25 %	0 %	479155294
48042	NC_021014	AGA	2	6	3245509	3245514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155294
48043	NC_021014	TAT	2	6	3245571	3245576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155294
48044	NC_021014	TGC	2	6	3245728	3245733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155295
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48046	NC_021014	TCA	2	6	3245940	3245945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155295
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48049	NC_021014	CTCATA	2	12	3246127	3246138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155295
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48053	NC_021014	GATCAG	2	12	3246343	3246354	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479155295
48054	NC_021014	ATC	2	6	3246380	3246385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155295
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48058	NC_021014	TA	3	6	3246543	3246548	50 %	50 %	0 %	0 %	479155295
48059	NC_021014	C	6	6	3246619	3246624	0 %	0 %	0 %	100 %	479155295
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48061	NC_021014	TC	3	6	3246670	3246675	0 %	50 %	0 %	50 %	479155295
48062	NC_021014	T	6	6	3246733	3246738	0 %	100 %	0 %	0 %	479155295
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48469	NC_021014	TGG	2	6	3277630	3277635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155323
48470	NC_021014	TTC	2	6	3277661	3277666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155323
48471	NC_021014	T	7	7	3277691	3277697	0 %	100 %	0 %	0 %	479155323
48472	NC_021014	C	6	6	3277860	3277865	0 %	0 %	0 %	100 %	479155323
48473	NC_021014	CATT	2	8	3277867	3277874	25 %	50 %	0 %	25 %	479155323
48474	NC_021014	TGAA	2	8	3278373	3278380	50 %	25 %	25 %	0 %	479155324
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48477	NC_021014	TGC	2	6	3278621	3278626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155325
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48479	NC_021014	CCTGCA	2	12	3278685	3278696	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479155325
48480	NC_021014	GTC	2	6	3278756	3278761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155325
48481	NC_021014	CT	3	6	3278863	3278868	0 %	50 %	0 %	50 %	479155325
48482	NC_021014	CGC	2	6	3279001	3279006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155325
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48492	NC_021014	CTA	2	6	3279721	3279726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155325
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48496	NC_021014	TCC	2	6	3279894	3279899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155325
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48499	NC_021014	TTTC	2	8	3280111	3280118	0 %	75 %	0 %	25 %	479155325
48500	NC_021014	CTTTG	2	10	3280136	3280145	0 %	60 %	20 %	20 %	479155325

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