MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46501	NC_021014	CCAT	2	8	3148671	3148678	25 %	25 %	0 %	50 %	479155206
46502	NC_021014	GAT	2	6	3148693	3148698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155206
46503	NC_021014	TTCA	2	8	3148709	3148716	25 %	50 %	0 %	25 %	479155206
46504	NC_021014	GCA	2	6	3148806	3148811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155206
46505	NC_021014	TC	3	6	3148881	3148886	0 %	50 %	0 %	50 %	479155206
46506	NC_021014	CAT	2	6	3148925	3148930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155206
46507	NC_021014	ATA	2	6	3148949	3148954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155206
46508	NC_021014	AAGA	2	8	3148987	3148994	75 %	0 %	25 %	0 %	479155206
46509	NC_021014	CCA	2	6	3149010	3149015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155206
46510	NC_021014	GAT	2	6	3149038	3149043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155206
46511	NC_021014	CTGT	2	8	3149055	3149062	0 %	50 %	25 %	25 %	479155206
46512	NC_021014	TCC	2	6	3149082	3149087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155206
46513	NC_021014	AGA	2	6	3149097	3149102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155206
46514	NC_021014	CTT	2	6	3149117	3149122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155206
46515	NC_021014	CT	3	6	3149207	3149212	0 %	50 %	0 %	50 %	479155206
46516	NC_021014	GCATC	2	10	3149230	3149239	20 %	20 %	20 %	40 %	479155206
46517	NC_021014	CAT	2	6	3149242	3149247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155206
46518	NC_021014	CCAG	2	8	3149278	3149285	25 %	0 %	25 %	50 %	479155206
46519	NC_021014	GTCCA	2	10	3149451	3149460	20 %	20 %	20 %	40 %	479155206
46520	NC_021014	TGA	2	6	3149481	3149486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155206
46521	NC_021014	ATA	2	6	3149543	3149548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155206
46522	NC_021014	TCC	2	6	3149564	3149569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155206
46523	NC_021014	CCA	2	6	3149641	3149646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155206
46524	NC_021014	CAC	2	6	3149650	3149655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155206
46525	NC_021014	ACA	2	6	3149775	3149780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155206
46526	NC_021014	GCC	2	6	3149843	3149848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155206
46527	NC_021014	TGATCT	2	12	3149851	3149862	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479155206
46528	NC_021014	CCTG	2	8	3149880	3149887	0 %	25 %	25 %	50 %	479155206
46529	NC_021014	TCC	2	6	3150105	3150110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155206
46530	NC_021014	ATA	2	6	3150224	3150229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155206
46531	NC_021014	ATC	2	6	3150249	3150254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155206
46532	NC_021014	ACA	2	6	3150273	3150278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155206
46533	NC_021014	GCA	2	6	3150285	3150290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155206
46534	NC_021014	A	6	6	3150302	3150307	100 %	0 %	0 %	0 %	479155206
46535	NC_021014	CATCA	2	10	3150347	3150356	40 %	20 %	0 %	40 %	479155206
46536	NC_021014	CCT	2	6	3150367	3150372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155206
46537	NC_021014	AT	3	6	3150408	3150413	50 %	50 %	0 %	0 %	479155206
46538	NC_021014	ACAG	2	8	3150656	3150663	50 %	0 %	25 %	25 %	479155207
46539	NC_021014	ATG	2	6	3150665	3150670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155207
46540	NC_021014	A	6	6	3150799	3150804	100 %	0 %	0 %	0 %	479155207
46541	NC_021014	AGA	2	6	3150863	3150868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155208
46542	NC_021014	CGGA	2	8	3150943	3150950	25 %	0 %	50 %	25 %	479155208
46543	NC_021014	TTTC	2	8	3150961	3150968	0 %	75 %	0 %	25 %	479155208
46544	NC_021014	ATG	2	6	3150990	3150995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155208
46545	NC_021014	CA	3	6	3151067	3151072	50 %	0 %	0 %	50 %	479155208
46546	NC_021014	AAG	2	6	3151117	3151122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155208
46547	NC_021014	CAT	2	6	3151130	3151135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155208
46548	NC_021014	CAG	2	6	3151267	3151272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155208
46549	NC_021014	TGC	2	6	3151286	3151291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155208
46550	NC_021014	GAA	2	6	3151299	3151304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155208
46551	NC_021014	ATATC	2	10	3151307	3151316	40 %	40 %	0 %	20 %	479155208
46552	NC_021014	TTA	2	6	3151358	3151363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155208
46553	NC_021014	CGGA	2	8	3151367	3151374	25 %	0 %	50 %	25 %	479155208
46554	NC_021014	GCT	2	6	3151383	3151388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155208
46555	NC_021014	A	6	6	3151402	3151407	100 %	0 %	0 %	0 %	479155208
46556	NC_021014	ACC	2	6	3151416	3151421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155208
46557	NC_021014	GCT	2	6	3151508	3151513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155208
46558	NC_021014	GCA	2	6	3151527	3151532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155208
46559	NC_021014	TC	3	6	3151536	3151541	0 %	50 %	0 %	50 %	479155208
46560	NC_021014	CAA	2	6	3151546	3151551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155208
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46562	NC_021014	TTACT	2	10	3152510	3152519	20 %	60 %	0 %	20 %	479155209
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46564	NC_021014	CGC	2	6	3152581	3152586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155209
46565	NC_021014	CTGA	2	8	3152683	3152690	25 %	25 %	25 %	25 %	479155209
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46570	NC_021014	TTC	2	6	3152839	3152844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155209
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46577	NC_021014	ATC	2	6	3153050	3153055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155209
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46579	NC_021014	TGC	2	6	3153217	3153222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155209
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46584	NC_021014	ACA	3	9	3153455	3153463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155209
46585	NC_021014	ATT	2	6	3153493	3153498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155209
46586	NC_021014	CCTGCA	2	12	3153503	3153514	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479155209
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46588	NC_021014	T	6	6	3153606	3153611	0 %	100 %	0 %	0 %	479155210
46589	NC_021014	TCC	2	6	3153687	3153692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155211
46590	NC_021014	T	6	6	3153698	3153703	0 %	100 %	0 %	0 %	479155211
46591	NC_021014	TGGCA	2	10	3153737	3153746	20 %	20 %	40 %	20 %	479155211
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46596	NC_021014	TAAG	2	8	3154083	3154090	50 %	25 %	25 %	0 %	479155211
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46600	NC_021014	TTC	2	6	3154173	3154178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155211
46601	NC_021014	ATA	2	6	3154194	3154199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155211
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46603	NC_021014	T	6	6	3154283	3154288	0 %	100 %	0 %	0 %	479155211
46604	NC_021014	GTT	2	6	3154310	3154315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155211
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46606	NC_021014	T	7	7	3154448	3154454	0 %	100 %	0 %	0 %	479155211
46607	NC_021014	CTG	2	6	3154523	3154528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155211
46608	NC_021014	CTC	2	6	3154534	3154539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155211
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46611	NC_021014	TTC	2	6	3154762	3154767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155212
46612	NC_021014	TCC	2	6	3154771	3154776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155212
46613	NC_021014	CAT	2	6	3154787	3154792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155212
46614	NC_021014	AC	3	6	3154823	3154828	50 %	0 %	0 %	50 %	479155212
46615	NC_021014	GATC	2	8	3154838	3154845	25 %	25 %	25 %	25 %	479155212
46616	NC_021014	CTG	2	6	3154871	3154876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155212
46617	NC_021014	TCC	2	6	3154906	3154911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155212
46618	NC_021014	GAA	2	6	3154990	3154995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155212
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46620	NC_021014	T	6	6	3155153	3155158	0 %	100 %	0 %	0 %	479155212
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46626	NC_021014	TTCT	2	8	3155430	3155437	0 %	75 %	0 %	25 %	479155212
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46633	NC_021014	TCT	2	6	3155695	3155700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155212
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46642	NC_021014	CCT	2	6	3156089	3156094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155212
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46646	NC_021014	CGC	2	6	3156353	3156358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155212
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46650	NC_021014	TCT	2	6	3156564	3156569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155213
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46702	NC_021014	CA	3	6	3159509	3159514	50 %	0 %	0 %	50 %	479155215
46703	NC_021014	A	6	6	3159516	3159521	100 %	0 %	0 %	0 %	479155215
46704	NC_021014	CAG	2	6	3159547	3159552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155215
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46707	NC_021014	CAGAT	2	10	3160417	3160426	40 %	20 %	20 %	20 %	479155216
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46715	NC_021014	ATA	2	6	3160908	3160913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155216
46716	NC_021014	TAATCA	2	12	3160927	3160938	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479155216
46717	NC_021014	TTG	2	6	3160961	3160966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155216
46718	NC_021014	ATCTGC	2	12	3160980	3160991	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479155216
46719	NC_021014	ACC	2	6	3161185	3161190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155216
46720	NC_021014	TGC	2	6	3161217	3161222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155216
46721	NC_021014	CCG	2	6	3161248	3161253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155216
46722	NC_021014	CA	3	6	3161263	3161268	50 %	0 %	0 %	50 %	479155216
46723	NC_021014	CACT	2	8	3161302	3161309	25 %	25 %	0 %	50 %	479155216
46724	NC_021014	GCT	2	6	3161342	3161347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155216
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46728	NC_021014	AT	3	6	3161491	3161496	50 %	50 %	0 %	0 %	479155216
46729	NC_021014	TCC	2	6	3161587	3161592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155217
46730	NC_021014	CTG	2	6	3161665	3161670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155217
46731	NC_021014	TCT	3	9	3161684	3161692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155217
46732	NC_021014	TTC	2	6	3161698	3161703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155217
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46734	NC_021014	CAC	2	6	3161783	3161788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155217
46735	NC_021014	GAA	2	6	3161809	3161814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155217
46736	NC_021014	CAC	2	6	3161819	3161824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155217
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46739	NC_021014	CTG	3	9	3161907	3161915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155217
46740	NC_021014	CTG	2	6	3161919	3161924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155217
46741	NC_021014	CTG	2	6	3161946	3161951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155217
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46842	NC_021014	GCT	2	6	3167985	3167990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155220
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46845	NC_021014	GCC	2	6	3168079	3168084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155220
46846	NC_021014	CCATA	2	10	3168108	3168117	40 %	20 %	0 %	40 %	479155220
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46848	NC_021014	AG	3	6	3168288	3168293	50 %	0 %	50 %	0 %	479155220
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46998	NC_021014	TTTA	2	8	3177414	3177421	25 %	75 %	0 %	0 %	479155228
46999	NC_021014	GCT	2	6	3177427	3177432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155228
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