MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45002	NC_021014	TGAT	2	8	3030980	3030987	25 %	50 %	25 %	0 %	479155112
45003	NC_021014	AAC	2	6	3031194	3031199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155112
45004	NC_021014	GCA	2	6	3031288	3031293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155112
45005	NC_021014	GAGG	2	8	3031356	3031363	25 %	0 %	75 %	0 %	479155112
45006	NC_021014	GAA	2	6	3031436	3031441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155113
45007	NC_021014	AGA	2	6	3031449	3031454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155113
45008	NC_021014	CCAT	2	8	3031507	3031514	25 %	25 %	0 %	50 %	479155113
45009	NC_021014	GCGT	2	8	3031557	3031564	0 %	25 %	50 %	25 %	479155113
45010	NC_021014	CGGG	2	8	3031608	3031615	0 %	0 %	75 %	25 %	479155113
45011	NC_021014	GAC	2	6	3031703	3031708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155113
45012	NC_021014	GAA	2	6	3031748	3031753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155113
45013	NC_021014	CAGG	2	8	3031811	3031818	25 %	0 %	50 %	25 %	479155113
45014	NC_021014	TGA	2	6	3031876	3031881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155113
45015	NC_021014	ATT	2	6	3031882	3031887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155113
45016	NC_021014	AT	3	6	3031927	3031932	50 %	50 %	0 %	0 %	479155113
45017	NC_021014	CGG	2	6	3031998	3032003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155113
45018	NC_021014	CAG	2	6	3032112	3032117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155113
45019	NC_021014	TGAA	2	8	3032127	3032134	50 %	25 %	25 %	0 %	479155113
45020	NC_021014	TGT	2	6	3032142	3032147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155113
45021	NC_021014	GAA	2	6	3032209	3032214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155113
45022	NC_021014	CAA	2	6	3032237	3032242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155113
45023	NC_021014	A	6	6	3032241	3032246	100 %	0 %	0 %	0 %	479155113
45024	NC_021014	GAA	2	6	3032249	3032254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155113
45025	NC_021014	A	6	6	3032292	3032297	100 %	0 %	0 %	0 %	479155113
45026	NC_021014	CAG	2	6	3032493	3032498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155114
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45028	NC_021014	CAG	2	6	3032520	3032525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155114
45029	NC_021014	GACG	2	8	3032534	3032541	25 %	0 %	50 %	25 %	479155114
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45031	NC_021014	A	6	6	3033678	3033683	100 %	0 %	0 %	0 %	479155115
45032	NC_021014	A	6	6	3033732	3033737	100 %	0 %	0 %	0 %	479155115
45033	NC_021014	ACTG	2	8	3033757	3033764	25 %	25 %	25 %	25 %	479155115
45034	NC_021014	GAG	2	6	3033767	3033772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155115
45035	NC_021014	GCAG	2	8	3033814	3033821	25 %	0 %	50 %	25 %	479155115
45036	NC_021014	ACAGA	2	10	3033830	3033839	60 %	0 %	20 %	20 %	479155115
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45039	NC_021014	TGA	2	6	3034255	3034260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155115
45040	NC_021014	CCATT	2	10	3034264	3034273	20 %	40 %	0 %	40 %	479155115
45041	NC_021014	CA	3	6	3034324	3034329	50 %	0 %	0 %	50 %	479155115
45042	NC_021014	GA	3	6	3034377	3034382	50 %	0 %	50 %	0 %	479155115
45043	NC_021014	CAA	2	6	3034570	3034575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155115
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45051	NC_021014	CTG	2	6	3034875	3034880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155115
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45054	NC_021014	AGGA	2	8	3035148	3035155	50 %	0 %	50 %	0 %	479155116
45055	NC_021014	GA	3	6	3035164	3035169	50 %	0 %	50 %	0 %	479155116
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45063	NC_021014	AGT	2	6	3035684	3035689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155117
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45119	NC_021014	CAGC	2	8	3039945	3039952	25 %	0 %	25 %	50 %	479155120
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45239	NC_021014	AAAT	2	8	3053757	3053764	75 %	25 %	0 %	0 %	479155129
45240	NC_021014	GAA	2	6	3053845	3053850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155129
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45243	NC_021014	TAAA	2	8	3053937	3053944	75 %	25 %	0 %	0 %	479155129
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45247	NC_021014	CAT	2	6	3054966	3054971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155130
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45331	NC_021014	GTG	2	6	3061850	3061855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155135
45332	NC_021014	T	6	6	3061858	3061863	0 %	100 %	0 %	0 %	479155135
45333	NC_021014	TTA	2	6	3061877	3061882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155135
45334	NC_021014	GA	3	6	3061965	3061970	50 %	0 %	50 %	0 %	479155135
45335	NC_021014	GCT	2	6	3061974	3061979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155135
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45340	NC_021014	TGGG	2	8	3062124	3062131	0 %	25 %	75 %	0 %	479155135
45341	NC_021014	GAA	2	6	3062398	3062403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155136
45342	NC_021014	A	6	6	3062402	3062407	100 %	0 %	0 %	0 %	479155136
45343	NC_021014	GCA	2	6	3062426	3062431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155136
45344	NC_021014	TACAGA	2	12	3062593	3062604	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479155136
45345	NC_021014	CAG	2	6	3062612	3062617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155136
45346	NC_021014	CAC	2	6	3062623	3062628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155136
45347	NC_021014	GATGA	2	10	3062675	3062684	40 %	20 %	40 %	0 %	479155136
45348	NC_021014	GAT	2	6	3062741	3062746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155136
45349	NC_021014	CGG	2	6	3062953	3062958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155136
45350	NC_021014	CGG	2	6	3063013	3063018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155136
45351	NC_021014	ATT	2	6	3063021	3063026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155136
45352	NC_021014	CAGTT	2	10	3063057	3063066	20 %	40 %	20 %	20 %	479155136
45353	NC_021014	CATC	2	8	3063096	3063103	25 %	25 %	0 %	50 %	479155136
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45355	NC_021014	TCC	2	6	3063342	3063347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155136
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45470	NC_021014	CCGG	2	8	3072402	3072409	0 %	0 %	50 %	50 %	479155142
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45472	NC_021014	CGG	2	6	3072464	3072469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155142
45473	NC_021014	GAG	2	6	3072475	3072480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155142
45474	NC_021014	CTG	2	6	3072483	3072488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155142
45475	NC_021014	ACAG	2	8	3072644	3072651	50 %	0 %	25 %	25 %	479155142
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45477	NC_021014	AAAG	2	8	3072767	3072774	75 %	0 %	25 %	0 %	479155142
45478	NC_021014	CCGT	2	8	3072806	3072813	0 %	25 %	25 %	50 %	479155142
45479	NC_021014	A	6	6	3072841	3072846	100 %	0 %	0 %	0 %	479155142
45480	NC_021014	AGA	2	6	3072853	3072858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155142
45481	NC_021014	A	6	6	3072858	3072863	100 %	0 %	0 %	0 %	479155142
45482	NC_021014	AATA	2	8	3072898	3072905	75 %	25 %	0 %	0 %	479155142
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45492	NC_021014	GAC	2	6	3073417	3073422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155144
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