MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43502	NC_021014	AAT	2	6	2921839	2921844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155020
43503	NC_021014	GTAAG	2	10	2921958	2921967	40 %	20 %	40 %	0 %	479155020
43504	NC_021014	TAT	2	6	2922052	2922057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155021
43505	NC_021014	CAA	2	6	2922085	2922090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155021
43506	NC_021014	T	6	6	2922150	2922155	0 %	100 %	0 %	0 %	479155021
43507	NC_021014	GTCC	2	8	2922288	2922295	0 %	25 %	25 %	50 %	479155021
43508	NC_021014	CTT	2	6	2922395	2922400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155021
43509	NC_021014	GAG	2	6	2922410	2922415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155021
43510	NC_021014	GGTCC	2	10	2922434	2922443	0 %	20 %	40 %	40 %	479155021
43511	NC_021014	GTGAT	2	10	2922471	2922480	20 %	40 %	40 %	0 %	479155021
43512	NC_021014	GCC	2	6	2922514	2922519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155021
43513	NC_021014	AAG	2	6	2922617	2922622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155021
43514	NC_021014	ATG	2	6	2922641	2922646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155021
43515	NC_021014	GCA	2	6	2922860	2922865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155021
43516	NC_021014	GTAA	2	8	2922889	2922896	50 %	25 %	25 %	0 %	479155021
43517	NC_021014	TGC	2	6	2923779	2923784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155022
43518	NC_021014	T	6	6	2923808	2923813	0 %	100 %	0 %	0 %	479155022
43519	NC_021014	CGT	2	6	2923887	2923892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155022
43520	NC_021014	TAA	2	6	2923900	2923905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155022
43521	NC_021014	GT	3	6	2924108	2924113	0 %	50 %	50 %	0 %	479155023
43522	NC_021014	AGAAA	2	10	2924118	2924127	80 %	0 %	20 %	0 %	479155023
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43525	NC_021014	TTCC	2	8	2924353	2924360	0 %	50 %	0 %	50 %	479155023
43526	NC_021014	AG	3	6	2924375	2924380	50 %	0 %	50 %	0 %	479155023
43527	NC_021014	TGCAG	2	10	2924388	2924397	20 %	20 %	40 %	20 %	479155023
43528	NC_021014	GCA	2	6	2924422	2924427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155023
43529	NC_021014	ATC	2	6	2924431	2924436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155023
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43531	NC_021014	GGCTGA	2	12	2924616	2924627	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479155023
43532	NC_021014	ATT	2	6	2924693	2924698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155023
43533	NC_021014	TAC	2	6	2924778	2924783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155023
43534	NC_021014	A	6	6	2924843	2924848	100 %	0 %	0 %	0 %	479155023
43535	NC_021014	TGA	2	6	2924895	2924900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155023
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43538	NC_021014	TGA	2	6	2924985	2924990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155023
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43541	NC_021014	TGG	2	6	2925102	2925107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155023
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43543	NC_021014	CGCAG	2	10	2925256	2925265	20 %	0 %	40 %	40 %	479155023
43544	NC_021014	ATC	2	6	2925329	2925334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155023
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43551	NC_021014	CA	3	6	2925496	2925501	50 %	0 %	0 %	50 %	479155023
43552	NC_021014	GCG	2	6	2925521	2925526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155023
43553	NC_021014	AG	3	6	2925583	2925588	50 %	0 %	50 %	0 %	479155023
43554	NC_021014	ATC	2	6	2925601	2925606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155023
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43562	NC_021014	GCAG	2	8	2926093	2926100	25 %	0 %	50 %	25 %	479155023
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43605	NC_021014	ATGA	2	8	2929216	2929223	50 %	25 %	25 %	0 %	479155024
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43965	NC_021014	CTT	2	6	2952339	2952344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155047
43966	NC_021014	GGT	2	6	2952438	2952443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155047
43967	NC_021014	ATG	2	6	2952466	2952471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155047
43968	NC_021014	GCA	2	6	2952504	2952509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155047
43969	NC_021014	GATA	2	8	2952605	2952612	50 %	25 %	25 %	0 %	479155048
43970	NC_021014	AGG	2	6	2952637	2952642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155048
43971	NC_021014	TCA	2	6	2952659	2952664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155048
43972	NC_021014	CTA	2	6	2952668	2952673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155048
43973	NC_021014	TGA	2	6	2952694	2952699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155048
43974	NC_021014	AAGA	2	8	2952713	2952720	75 %	0 %	25 %	0 %	479155048
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43977	NC_021014	A	6	6	2952848	2952853	100 %	0 %	0 %	0 %	479155048
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43980	NC_021014	ATCGTG	2	12	2958458	2958469	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479155049
43981	NC_021014	GTG	2	6	2958602	2958607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155049
43982	NC_021014	GTG	2	6	2958741	2958746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155049
43983	NC_021014	AGT	2	6	2958775	2958780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155049
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43985	NC_021014	AG	3	6	2958848	2958853	50 %	0 %	50 %	0 %	479155049
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43988	NC_021014	ATC	2	6	2959020	2959025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155049
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43992	NC_021014	GAAG	2	8	2959078	2959085	50 %	0 %	50 %	0 %	479155049
43993	NC_021014	GAA	2	6	2959106	2959111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155050
43994	NC_021014	AAGA	2	8	2959123	2959130	75 %	0 %	25 %	0 %	479155050
43995	NC_021014	AGA	2	6	2959219	2959224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155050
43996	NC_021014	AGA	2	6	2959317	2959322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155050
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43999	NC_021014	GAA	2	6	2959544	2959549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155050
44000	NC_021014	CGG	2	6	2961463	2961468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155051

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