MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_021014	GTTTTA	2	12	2858821	2858832	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479154940
42502	NC_021014	GGC	2	6	2858846	2858851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479154940
42503	NC_021014	ATA	2	6	2858868	2858873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479154940
42504	NC_021014	AT	3	6	2858888	2858893	50 %	50 %	0 %	0 %	479154940
42505	NC_021014	ATA	2	6	2858920	2858925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479154940
42506	NC_021014	TA	3	6	2858924	2858929	50 %	50 %	0 %	0 %	479154940
42507	NC_021014	ACA	2	6	2858948	2858953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479154940
42508	NC_021014	TG	3	6	2859007	2859012	0 %	50 %	50 %	0 %	479154940
42509	NC_021014	GAT	2	6	2859044	2859049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154940
42510	NC_021014	TCC	2	6	2859150	2859155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479154940
42511	NC_021014	ATCA	2	8	2859158	2859165	50 %	25 %	0 %	25 %	479154940
42512	NC_021014	TGC	2	6	2859217	2859222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154940
42513	NC_021014	CGG	2	6	2860447	2860452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479154941
42514	NC_021014	CTG	2	6	2860501	2860506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154941
42515	NC_021014	CGG	2	6	2860507	2860512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479154941
42516	NC_021014	CAG	2	6	2860575	2860580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154941
42517	NC_021014	A	6	6	2860585	2860590	100 %	0 %	0 %	0 %	479154941
42518	NC_021014	ATT	2	6	2860689	2860694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154942
42519	NC_021014	AGA	2	6	2860725	2860730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154942
42520	NC_021014	GAA	2	6	2860815	2860820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154942
42521	NC_021014	TCTG	2	8	2860882	2860889	0 %	50 %	25 %	25 %	479154942
42522	NC_021014	ACAA	2	8	2860899	2860906	75 %	0 %	0 %	25 %	479154942
42523	NC_021014	TCCA	2	8	2860934	2860941	25 %	25 %	0 %	50 %	479154942
42524	NC_021014	T	6	6	2860981	2860986	0 %	100 %	0 %	0 %	479154942
42525	NC_021014	AAG	2	6	2861417	2861422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154943
42526	NC_021014	A	6	6	2861460	2861465	100 %	0 %	0 %	0 %	479154943
42527	NC_021014	TGTGGT	2	12	2861474	2861485	0 %	50 %	50 %	0 %	479154943
42528	NC_021014	TGGA	2	8	2862104	2862111	25 %	25 %	50 %	0 %	479154944
42529	NC_021014	T	7	7	2862173	2862179	0 %	100 %	0 %	0 %	479154944
42530	NC_021014	TCT	2	6	2862194	2862199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154944
42531	NC_021014	TTA	2	6	2862226	2862231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154944
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42533	NC_021014	TTC	2	6	2862384	2862389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154944
42534	NC_021014	CAG	2	6	2862403	2862408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154944
42535	NC_021014	CAG	2	6	2862426	2862431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154944
42536	NC_021014	GAAG	2	8	2862434	2862441	50 %	0 %	50 %	0 %	479154944
42537	NC_021014	A	7	7	2862449	2862455	100 %	0 %	0 %	0 %	479154944
42538	NC_021014	A	6	6	2862554	2862559	100 %	0 %	0 %	0 %	479154944
42539	NC_021014	AGC	2	6	2862586	2862591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154944
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42541	NC_021014	TAT	2	6	2862705	2862710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154944
42542	NC_021014	GAG	2	6	2862823	2862828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479154945
42543	NC_021014	TCG	2	6	2862830	2862835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154945
42544	NC_021014	GAT	2	6	2862856	2862861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154945
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42546	NC_021014	GAA	2	6	2862918	2862923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154945
42547	NC_021014	GAT	2	6	2862931	2862936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154945
42548	NC_021014	GAA	3	9	2862939	2862947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154945
42549	NC_021014	A	7	7	2862960	2862966	100 %	0 %	0 %	0 %	479154945
42550	NC_021014	CAG	2	6	2862985	2862990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154945
42551	NC_021014	A	6	6	2863002	2863007	100 %	0 %	0 %	0 %	479154945
42552	NC_021014	CAG	2	6	2863027	2863032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154945
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42554	NC_021014	GATG	2	8	2863060	2863067	25 %	25 %	50 %	0 %	479154945
42555	NC_021014	CAG	2	6	2863090	2863095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154945
42556	NC_021014	TGC	2	6	2863122	2863127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154945
42557	NC_021014	GCAG	2	8	2863170	2863177	25 %	0 %	50 %	25 %	479154945
42558	NC_021014	CAG	2	6	2863216	2863221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154945
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42560	NC_021014	GCT	2	6	2863342	2863347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154945
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42562	NC_021014	GAA	2	6	2863423	2863428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154945
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42567	NC_021014	GCAG	2	8	2863650	2863657	25 %	0 %	50 %	25 %	479154945
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42571	NC_021014	GAA	2	6	2863801	2863806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154945
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42573	NC_021014	AGA	2	6	2863862	2863867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154945
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42583	NC_021014	TGGA	2	8	2866484	2866491	25 %	25 %	50 %	0 %	479154948
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42585	NC_021014	GCC	3	9	2866549	2866557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479154948
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42587	NC_021014	AAGG	2	8	2866718	2866725	50 %	0 %	50 %	0 %	479154948
42588	NC_021014	CGG	2	6	2866792	2866797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479154948
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42591	NC_021014	ATC	2	6	2866943	2866948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154948
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42596	NC_021014	ACAG	2	8	2867177	2867184	50 %	0 %	25 %	25 %	479154948
42597	NC_021014	AG	3	6	2867183	2867188	50 %	0 %	50 %	0 %	479154948
42598	NC_021014	ATG	3	9	2867319	2867327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154948
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42600	NC_021014	CTT	2	6	2867417	2867422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154948
42601	NC_021014	GTT	2	6	2867429	2867434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479154948
42602	NC_021014	GAT	2	6	2867488	2867493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154948
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42604	NC_021014	GAC	2	6	2867552	2867557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154948
42605	NC_021014	CTGG	2	8	2867605	2867612	0 %	25 %	50 %	25 %	479154948
42606	NC_021014	TGG	2	6	2867648	2867653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479154948
42607	NC_021014	TTA	2	6	2867671	2867676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154948
42608	NC_021014	TGG	2	6	2867697	2867702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479154948
42609	NC_021014	AG	3	6	2867708	2867713	50 %	0 %	50 %	0 %	479154948
42610	NC_021014	CA	3	6	2867743	2867748	50 %	0 %	0 %	50 %	479154948
42611	NC_021014	GATAT	2	10	2867877	2867886	40 %	40 %	20 %	0 %	479154948
42612	NC_021014	TCT	3	9	2867889	2867897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154948
42613	NC_021014	CCA	2	6	2867950	2867955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479154948
42614	NC_021014	TGA	2	6	2868078	2868083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154948
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42617	NC_021014	GCACT	2	10	2868450	2868459	20 %	20 %	20 %	40 %	479154948
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42735	NC_021014	ATG	2	6	2875247	2875252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154955
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42852	NC_021014	GTC	2	6	2882067	2882072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154962
42853	NC_021014	GAT	2	6	2882073	2882078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154962
42854	NC_021014	GAA	2	6	2882081	2882086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154962
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42862	NC_021014	ACGG	2	8	2882439	2882446	25 %	0 %	50 %	25 %	479154962
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42955	NC_021014	AGC	2	6	2887444	2887449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154967
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42957	NC_021014	CGG	2	6	2887641	2887646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479154967
42958	NC_021014	GA	3	6	2887663	2887668	50 %	0 %	50 %	0 %	479154967
42959	NC_021014	TGG	2	6	2887683	2887688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479154967
42960	NC_021014	TTTC	2	8	2887836	2887843	0 %	75 %	0 %	25 %	479154967
42961	NC_021014	CTGA	2	8	2887942	2887949	25 %	25 %	25 %	25 %	479154967
42962	NC_021014	GATG	2	8	2887951	2887958	25 %	25 %	50 %	0 %	479154967
42963	NC_021014	GCTG	2	8	2887996	2888003	0 %	25 %	50 %	25 %	479154967
42964	NC_021014	ATA	2	6	2888055	2888060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479154968
42965	NC_021014	CCG	2	6	2888227	2888232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479154968
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