MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_021014	TCA	2	6	2752181	2752186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154838
41002	NC_021014	CAT	2	6	2752197	2752202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154838
41003	NC_021014	CGGA	2	8	2752210	2752217	25 %	0 %	50 %	25 %	479154838
41004	NC_021014	TTG	2	6	2752247	2752252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479154838
41005	NC_021014	AATAC	2	10	2752256	2752265	60 %	20 %	0 %	20 %	479154838
41006	NC_021014	CCA	2	6	2752338	2752343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479154838
41007	NC_021014	GTTGCC	2	12	2752376	2752387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154838
41008	NC_021014	TTC	2	6	2752415	2752420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154838
41009	NC_021014	T	6	6	2752480	2752485	0 %	100 %	0 %	0 %	479154838
41010	NC_021014	CCA	2	6	2752818	2752823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479154839
41011	NC_021014	A	6	6	2752828	2752833	100 %	0 %	0 %	0 %	479154839
41012	NC_021014	TTC	2	6	2752905	2752910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154839
41013	NC_021014	TAC	2	6	2752936	2752941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154839
41014	NC_021014	TC	3	6	2752944	2752949	0 %	50 %	0 %	50 %	479154839
41015	NC_021014	ACC	2	6	2752997	2753002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479154839
41016	NC_021014	TGC	3	9	2753099	2753107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154839
41017	NC_021014	CACGGA	2	12	2753772	2753783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154840
41018	NC_021014	TCCT	2	8	2753805	2753812	0 %	50 %	0 %	50 %	479154840
41019	NC_021014	ATA	2	6	2753854	2753859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479154840
41020	NC_021014	GAT	2	6	2753944	2753949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154840
41021	NC_021014	CTC	2	6	2753959	2753964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479154840
41022	NC_021014	GAT	2	6	2753970	2753975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154840
41023	NC_021014	TTC	2	6	2753993	2753998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154840
41024	NC_021014	CA	3	6	2754041	2754046	50 %	0 %	0 %	50 %	479154840
41025	NC_021014	GAT	2	6	2754133	2754138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154840
41026	NC_021014	TCGGA	2	10	2754166	2754175	20 %	20 %	40 %	20 %	479154840
41027	NC_021014	GTA	2	6	2754230	2754235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154840
41028	NC_021014	GAA	2	6	2754378	2754383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154840
41029	NC_021014	AGA	2	6	2754389	2754394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154840
41030	NC_021014	TCCGGA	2	12	2754407	2754418	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479154840
41031	NC_021014	AAG	2	6	2754487	2754492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154840
41032	NC_021014	GAT	2	6	2754571	2754576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154840
41033	NC_021014	AAAATC	2	12	2754589	2754600	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479154840
41034	NC_021014	CGG	2	6	2754620	2754625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479154840
41035	NC_021014	TCA	2	6	2754651	2754656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154840
41036	NC_021014	TTC	2	6	2754689	2754694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154840
41037	NC_021014	TCG	2	6	2754701	2754706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154840
41038	NC_021014	TCC	2	6	2754710	2754715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479154840
41039	NC_021014	CCTTT	2	10	2754792	2754801	0 %	60 %	0 %	40 %	479154840
41040	NC_021014	CATC	2	8	2754810	2754817	25 %	25 %	0 %	50 %	479154840
41041	NC_021014	CT	3	6	2754940	2754945	0 %	50 %	0 %	50 %	479154840
41042	NC_021014	GCC	2	6	2754958	2754963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479154840
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41044	NC_021014	CAT	2	6	2755038	2755043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154840
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41046	NC_021014	TTCC	2	8	2755257	2755264	0 %	50 %	0 %	50 %	479154840
41047	NC_021014	T	6	6	2755337	2755342	0 %	100 %	0 %	0 %	479154840
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41051	NC_021014	CAAAGC	2	12	2755590	2755601	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479154840
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41053	NC_021014	TC	3	6	2755677	2755682	0 %	50 %	0 %	50 %	479154840
41054	NC_021014	CTT	2	6	2755731	2755736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154840
41055	NC_021014	GTCT	2	8	2755746	2755753	0 %	50 %	25 %	25 %	479154840
41056	NC_021014	TAT	2	6	2755788	2755793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154840
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41060	NC_021014	T	6	6	2755947	2755952	0 %	100 %	0 %	0 %	479154840
41061	NC_021014	ATATTT	2	12	2755990	2756001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154840
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41063	NC_021014	T	7	7	2756491	2756497	0 %	100 %	0 %	0 %	479154841
41064	NC_021014	GA	3	6	2756670	2756675	50 %	0 %	50 %	0 %	479154841
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41085	NC_021014	AAAG	2	8	2758446	2758453	75 %	0 %	25 %	0 %	479154842
41086	NC_021014	CAC	2	6	2758470	2758475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479154842
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41088	NC_021014	CTT	2	6	2758526	2758531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154842
41089	NC_021014	TTCT	2	8	2758578	2758585	0 %	75 %	0 %	25 %	479154842
41090	NC_021014	CAT	2	6	2758613	2758618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154842
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41093	NC_021014	TCT	2	6	2758766	2758771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154842
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41097	NC_021014	TCTG	2	8	2758988	2758995	0 %	50 %	25 %	25 %	479154842
41098	NC_021014	TGC	3	9	2759076	2759084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154842
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41101	NC_021014	T	7	7	2759340	2759346	0 %	100 %	0 %	0 %	479154843
41102	NC_021014	TCT	2	6	2759359	2759364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154843
41103	NC_021014	TCTGGT	2	12	2759388	2759399	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479154843
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41106	NC_021014	TGTC	2	8	2759573	2759580	0 %	50 %	25 %	25 %	479154843
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41111	NC_021014	AAG	2	6	2760029	2760034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154844
41112	NC_021014	TCT	2	6	2760077	2760082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154844
41113	NC_021014	AAT	2	6	2760096	2760101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479154844
41114	NC_021014	TTG	2	6	2760145	2760150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479154844
41115	NC_021014	T	6	6	2760203	2760208	0 %	100 %	0 %	0 %	479154844
41116	NC_021014	CAT	2	6	2760226	2760231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154844
41117	NC_021014	GCA	2	6	2760263	2760268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154845
41118	NC_021014	AC	3	6	2760278	2760283	50 %	0 %	0 %	50 %	479154845
41119	NC_021014	AT	3	6	2760290	2760295	50 %	50 %	0 %	0 %	479154845
41120	NC_021014	CTG	2	6	2760296	2760301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154845
41121	NC_021014	ATC	2	6	2760342	2760347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154845
41122	NC_021014	AGC	2	6	2760423	2760428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154845
41123	NC_021014	ACG	2	6	2760465	2760470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154845
41124	NC_021014	GTA	2	6	2760477	2760482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154845
41125	NC_021014	ATT	2	6	2760501	2760506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154845
41126	NC_021014	CTG	2	6	2760591	2760596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154845
41127	NC_021014	T	7	7	2761057	2761063	0 %	100 %	0 %	0 %	479154846
41128	NC_021014	ATC	2	6	2761092	2761097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154846
41129	NC_021014	ATT	2	6	2761179	2761184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154846
41130	NC_021014	TA	3	6	2761241	2761246	50 %	50 %	0 %	0 %	479154846
41131	NC_021014	TTC	3	9	2761287	2761295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154846
41132	NC_021014	GTA	2	6	2761324	2761329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154846
41133	NC_021014	TTTG	2	8	2761330	2761337	0 %	75 %	25 %	0 %	479154846
41134	NC_021014	CTT	2	6	2761356	2761361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154846
41135	NC_021014	AGTT	2	8	2761370	2761377	25 %	50 %	25 %	0 %	479154846
41136	NC_021014	AT	3	6	2761401	2761406	50 %	50 %	0 %	0 %	479154846
41137	NC_021014	TTG	2	6	2761451	2761456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479154846
41138	NC_021014	CTA	2	6	2761487	2761492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154846
41139	NC_021014	AT	3	6	2761522	2761527	50 %	50 %	0 %	0 %	479154846
41140	NC_021014	AATA	2	8	2761844	2761851	75 %	25 %	0 %	0 %	479154847
41141	NC_021014	A	7	7	2761856	2761862	100 %	0 %	0 %	0 %	479154847
41142	NC_021014	AT	4	8	2761865	2761872	50 %	50 %	0 %	0 %	479154847
41143	NC_021014	CTT	2	6	2761873	2761878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154847
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41145	NC_021014	TCT	2	6	2761956	2761961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154847
41146	NC_021014	CA	3	6	2762003	2762008	50 %	0 %	0 %	50 %	479154847
41147	NC_021014	TA	3	6	2762032	2762037	50 %	50 %	0 %	0 %	479154847
41148	NC_021014	TCA	2	6	2762112	2762117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154847
41149	NC_021014	ATCC	2	8	2762128	2762135	25 %	25 %	0 %	50 %	479154847
41150	NC_021014	TCA	2	6	2762250	2762255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154847
41151	NC_021014	TCA	2	6	2762286	2762291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154847
41152	NC_021014	ATC	2	6	2762333	2762338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154847
41153	NC_021014	AT	3	6	2762340	2762345	50 %	50 %	0 %	0 %	479154847
41154	NC_021014	TCG	2	6	2762382	2762387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154847
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41157	NC_021014	CTTTT	2	10	2762654	2762663	0 %	80 %	0 %	20 %	479154847
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41167	NC_021014	ATC	3	9	2763498	2763506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154848
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41172	NC_021014	GAT	2	6	2765717	2765722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154849
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41176	NC_021014	CAT	2	6	2765897	2765902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154849
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41179	NC_021014	GAT	2	6	2766665	2766670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154850
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41182	NC_021014	TTC	2	6	2767357	2767362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154851
41183	NC_021014	TCAA	2	8	2767377	2767384	50 %	25 %	0 %	25 %	479154851
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41191	NC_021014	A	6	6	2767770	2767775	100 %	0 %	0 %	0 %	479154851
41192	NC_021014	CATA	2	8	2767849	2767856	50 %	25 %	0 %	25 %	479154851
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41200	NC_021014	A	6	6	2768922	2768927	100 %	0 %	0 %	0 %	479154853
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41211	NC_021014	TTC	2	6	2769481	2769486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154853
41212	NC_021014	ATTT	2	8	2769535	2769542	25 %	75 %	0 %	0 %	479154853
41213	NC_021014	TAC	3	9	2769589	2769597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154853
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41215	NC_021014	T	7	7	2770302	2770308	0 %	100 %	0 %	0 %	479154854
41216	NC_021014	CGATC	2	10	2770376	2770385	20 %	20 %	20 %	40 %	479154854
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41218	NC_021014	GAA	2	6	2770499	2770504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154854
41219	NC_021014	A	7	7	2770507	2770513	100 %	0 %	0 %	0 %	479154854
41220	NC_021014	A	7	7	2770547	2770553	100 %	0 %	0 %	0 %	479154854
41221	NC_021014	T	6	6	2770640	2770645	0 %	100 %	0 %	0 %	479154854
41222	NC_021014	CCATA	2	10	2770705	2770714	40 %	20 %	0 %	40 %	479154854
41223	NC_021014	AC	3	6	2770730	2770735	50 %	0 %	0 %	50 %	479154854
41224	NC_021014	AGC	2	6	2770776	2770781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154854
41225	NC_021014	CGCC	2	8	2770841	2770848	0 %	0 %	25 %	75 %	479154854
41226	NC_021014	AGC	2	6	2770947	2770952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154854
41227	NC_021014	AGA	2	6	2770960	2770965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154854
41228	NC_021014	ATCC	2	8	2770991	2770998	25 %	25 %	0 %	50 %	479154854
41229	NC_021014	CCA	2	6	2771031	2771036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479154854
41230	NC_021014	GCT	2	6	2771056	2771061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154854
41231	NC_021014	AGA	2	6	2771101	2771106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154854
41232	NC_021014	A	6	6	2771131	2771136	100 %	0 %	0 %	0 %	479154854
41233	NC_021014	TCA	2	6	2771331	2771336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154855
41234	NC_021014	GAT	2	6	2771345	2771350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154855
41235	NC_021014	ATC	2	6	2771351	2771356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154855
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41465	NC_021014	AGT	2	6	2783208	2783213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154864
41466	NC_021014	CTTA	2	8	2783222	2783229	25 %	50 %	0 %	25 %	479154864
41467	NC_021014	GTA	2	6	2783238	2783243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154864
41468	NC_021014	CAGC	2	8	2783266	2783273	25 %	0 %	25 %	50 %	479154864
41469	NC_021014	TCT	2	6	2783318	2783323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154864
41470	NC_021014	A	7	7	2783327	2783333	100 %	0 %	0 %	0 %	479154864
41471	NC_021014	CTG	2	6	2783350	2783355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154864
41472	NC_021014	TCAT	2	8	2783364	2783371	25 %	50 %	0 %	25 %	479154864
41473	NC_021014	GTA	2	6	2783494	2783499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154866
41474	NC_021014	TG	3	6	2783527	2783532	0 %	50 %	50 %	0 %	479154866
41475	NC_021014	TGATC	2	10	2783573	2783582	20 %	40 %	20 %	20 %	479154866
41476	NC_021014	GAT	2	6	2783586	2783591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154866
41477	NC_021014	TCA	3	9	2783593	2783601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154866
41478	NC_021014	T	6	6	2783630	2783635	0 %	100 %	0 %	0 %	479154866
41479	NC_021014	TTC	2	6	2784317	2784322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154867
41480	NC_021014	TAT	2	6	2784350	2784355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154867
41481	NC_021014	A	8	8	2784357	2784364	100 %	0 %	0 %	0 %	479154867
41482	NC_021014	TTG	2	6	2784374	2784379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479154867
41483	NC_021014	GTG	2	6	2784394	2784399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479154867
41484	NC_021014	A	8	8	2784484	2784491	100 %	0 %	0 %	0 %	479154867
41485	NC_021014	AGA	2	6	2784524	2784529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154867
41486	NC_021014	GAA	2	6	2784570	2784575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154867
41487	NC_021014	TC	4	8	2784615	2784622	0 %	50 %	0 %	50 %	479154867
41488	NC_021014	AT	3	6	2784668	2784673	50 %	50 %	0 %	0 %	479154867
41489	NC_021014	CTT	2	6	2784690	2784695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154867
41490	NC_021014	TCT	2	6	2784740	2784745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154867
41491	NC_021014	TGGC	2	8	2784754	2784761	0 %	25 %	50 %	25 %	479154867
41492	NC_021014	ATT	2	6	2785086	2785091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154868
41493	NC_021014	AT	3	6	2785146	2785151	50 %	50 %	0 %	0 %	479154868
41494	NC_021014	TTG	2	6	2785155	2785160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479154868
41495	NC_021014	TGC	2	6	2785181	2785186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154868
41496	NC_021014	ATA	2	6	2785323	2785328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479154868
41497	NC_021014	CTG	2	6	2785354	2785359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154868
41498	NC_021014	TACT	2	8	2785450	2785457	25 %	50 %	0 %	25 %	479154868
41499	NC_021014	T	6	6	2785469	2785474	0 %	100 %	0 %	0 %	479154868
41500	NC_021014	GTT	2	6	2785488	2785493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479154868

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