MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40502	NC_021014	ATGC	2	8	2718035	2718042	25 %	25 %	25 %	25 %	479154809
40503	NC_021014	GTT	2	6	2718090	2718095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479154809
40504	NC_021014	GGAC	2	8	2718144	2718151	25 %	0 %	50 %	25 %	479154809
40505	NC_021014	T	6	6	2718163	2718168	0 %	100 %	0 %	0 %	479154809
40506	NC_021014	TCA	2	6	2718241	2718246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154809
40507	NC_021014	CGG	2	6	2718267	2718272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479154809
40508	NC_021014	TCT	2	6	2718281	2718286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154809
40509	NC_021014	TGC	3	9	2718294	2718302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154809
40510	NC_021014	CT	3	6	2718303	2718308	0 %	50 %	0 %	50 %	479154809
40511	NC_021014	CAT	2	6	2718498	2718503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154809
40512	NC_021014	T	6	6	2718534	2718539	0 %	100 %	0 %	0 %	479154809
40513	NC_021014	CAT	2	6	2718569	2718574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154809
40514	NC_021014	GCC	2	6	2718576	2718581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479154809
40515	NC_021014	AAC	2	6	2718603	2718608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479154809
40516	NC_021014	CTT	2	6	2718623	2718628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154809
40517	NC_021014	CTG	2	6	2718967	2718972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154810
40518	NC_021014	AGA	2	6	2718985	2718990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154810
40519	NC_021014	ATC	2	6	2718996	2719001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154810
40520	NC_021014	GATC	2	8	2719070	2719077	25 %	25 %	25 %	25 %	479154810
40521	NC_021014	CA	3	6	2719079	2719084	50 %	0 %	0 %	50 %	479154810
40522	NC_021014	CCG	2	6	2719165	2719170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479154810
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40524	NC_021014	CGGA	2	8	2719227	2719234	25 %	0 %	50 %	25 %	479154810
40525	NC_021014	GGAA	2	8	2719343	2719350	50 %	0 %	50 %	0 %	479154810
40526	NC_021014	GAT	2	6	2719517	2719522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154810
40527	NC_021014	CTTT	2	8	2719664	2719671	0 %	75 %	0 %	25 %	479154810
40528	NC_021014	T	6	6	2719706	2719711	0 %	100 %	0 %	0 %	479154810
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40531	NC_021014	CAT	2	6	2719886	2719891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154810
40532	NC_021014	TCTT	2	8	2719956	2719963	0 %	75 %	0 %	25 %	479154810
40533	NC_021014	T	6	6	2721246	2721251	0 %	100 %	0 %	0 %	479154811
40534	NC_021014	ATC	2	6	2721336	2721341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154811
40535	NC_021014	TCCA	2	8	2721345	2721352	25 %	25 %	0 %	50 %	479154811
40536	NC_021014	CACTGG	2	12	2721439	2721450	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479154811
40537	NC_021014	TCA	2	6	2721459	2721464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154811
40538	NC_021014	GTTCAG	2	12	2721491	2721502	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479154811
40539	NC_021014	AAG	2	6	2721518	2721523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154811
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40544	NC_021014	CTTCT	2	10	2721665	2721674	0 %	60 %	0 %	40 %	479154811
40545	NC_021014	T	6	6	2721766	2721771	0 %	100 %	0 %	0 %	479154811
40546	NC_021014	GTA	2	6	2721776	2721781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154811
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40553	NC_021014	TGGT	2	8	2722397	2722404	0 %	50 %	50 %	0 %	479154812
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40613	NC_021014	CAT	2	6	2726585	2726590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154817
40614	NC_021014	CAG	2	6	2726634	2726639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154817
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40851	NC_021014	GCCACT	2	12	2741902	2741913	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479154830
40852	NC_021014	TCC	2	6	2742112	2742117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479154830
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40954	NC_021014	TCC	2	6	2749749	2749754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479154835
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40961	NC_021014	ACG	2	6	2750384	2750389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154836
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40964	NC_021014	CTG	2	6	2750555	2750560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154836
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