MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
39001	NC_021014	TGC	2	6	2605003	2605008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154709
39002	NC_021014	T	6	6	2605051	2605056	0 %	100 %	0 %	0 %	479154709
39003	NC_021014	CGAAAT	2	12	2605112	2605123	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479154709
39004	NC_021014	TCA	2	6	2605206	2605211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154709
39005	NC_021014	CTT	2	6	2605280	2605285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154710
39006	NC_021014	CTA	2	6	2605295	2605300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154710
39007	NC_021014	T	6	6	2605361	2605366	0 %	100 %	0 %	0 %	479154710
39008	NC_021014	CTG	2	6	2605425	2605430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154710
39009	NC_021014	ACC	2	6	2605537	2605542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479154710
39010	NC_021014	ATC	2	6	2605585	2605590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154710
39011	NC_021014	GAA	2	6	2605636	2605641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154710
39012	NC_021014	TCC	2	6	2605734	2605739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479154710
39013	NC_021014	CCG	2	6	2605774	2605779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479154710
39014	NC_021014	ATG	2	6	2605824	2605829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154710
39015	NC_021014	TGA	2	6	2605831	2605836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154710
39016	NC_021014	CCG	3	9	2605957	2605965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479154710
39017	NC_021014	TCC	2	6	2605968	2605973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479154710
39018	NC_021014	AAG	2	6	2606004	2606009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154710
39019	NC_021014	TCACT	2	10	2606048	2606057	20 %	40 %	0 %	40 %	479154710
39020	NC_021014	AAC	2	6	2606061	2606066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479154710
39021	NC_021014	TGC	2	6	2606145	2606150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154710
39022	NC_021014	GAA	2	6	2606343	2606348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154711
39023	NC_021014	GAA	2	6	2606364	2606369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154711
39024	NC_021014	CA	3	6	2606392	2606397	50 %	0 %	0 %	50 %	479154711
39025	NC_021014	GAC	2	6	2606418	2606423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154711
39026	NC_021014	GATTAT	2	12	2606433	2606444	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479154711
39027	NC_021014	GTT	2	6	2606574	2606579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479154711
39028	NC_021014	GCC	2	6	2606629	2606634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479154711
39029	NC_021014	A	6	6	2606710	2606715	100 %	0 %	0 %	0 %	479154711
39030	NC_021014	AACA	2	8	2606743	2606750	75 %	0 %	0 %	25 %	479154711
39031	NC_021014	GCA	2	6	2606764	2606769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154711
39032	NC_021014	TTCC	2	8	2606900	2606907	0 %	50 %	0 %	50 %	479154711
39033	NC_021014	GCA	2	6	2606979	2606984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154711
39034	NC_021014	CT	3	6	2606998	2607003	0 %	50 %	0 %	50 %	479154711
39035	NC_021014	TTTA	2	8	2607096	2607103	25 %	75 %	0 %	0 %	479154711
39036	NC_021014	CCAC	2	8	2607126	2607133	25 %	0 %	0 %	75 %	479154712
39037	NC_021014	CAT	2	6	2607233	2607238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154712
39038	NC_021014	CTG	2	6	2607288	2607293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154712
39039	NC_021014	AGC	2	6	2607356	2607361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154712
39040	NC_021014	TCTTTT	2	12	2607379	2607390	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479154712
39041	NC_021014	TCA	2	6	2607393	2607398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154712
39042	NC_021014	CAG	2	6	2607414	2607419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154712
39043	NC_021014	T	6	6	2607446	2607451	0 %	100 %	0 %	0 %	479154712
39044	NC_021014	TCA	2	6	2607571	2607576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154712
39045	NC_021014	CTG	2	6	2607592	2607597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154712
39046	NC_021014	ATG	2	6	2607656	2607661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154712
39047	NC_021014	CTT	2	6	2607664	2607669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154712
39048	NC_021014	A	6	6	2607686	2607691	100 %	0 %	0 %	0 %	479154712
39049	NC_021014	TTC	2	6	2607759	2607764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154712
39050	NC_021014	CTG	2	6	2607772	2607777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154712
39051	NC_021014	CTA	2	6	2607884	2607889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154713
39052	NC_021014	T	6	6	2607897	2607902	0 %	100 %	0 %	0 %	479154713
39053	NC_021014	TC	3	6	2607958	2607963	0 %	50 %	0 %	50 %	479154713
39054	NC_021014	T	6	6	2607990	2607995	0 %	100 %	0 %	0 %	479154713
39055	NC_021014	TTTC	2	8	2608089	2608096	0 %	75 %	0 %	25 %	479154713
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39057	NC_021014	T	6	6	2608140	2608145	0 %	100 %	0 %	0 %	479154713
39058	NC_021014	AAAT	2	8	2608179	2608186	75 %	25 %	0 %	0 %	479154713
39059	NC_021014	CAT	2	6	2608279	2608284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154713
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39061	NC_021014	CTG	2	6	2608340	2608345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154713
39062	NC_021014	TGA	2	6	2608388	2608393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154713
39063	NC_021014	ATCG	2	8	2608397	2608404	25 %	25 %	25 %	25 %	479154713
39064	NC_021014	CAT	2	6	2608411	2608416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154713
39065	NC_021014	GCT	2	6	2608428	2608433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154713
39066	NC_021014	ATG	2	6	2608434	2608439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154713
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39071	NC_021014	ATA	2	6	2608724	2608729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479154714
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39074	NC_021014	TCA	2	6	2608974	2608979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154714
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39076	NC_021014	CCATCT	2	12	2609136	2609147	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	479154714
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39087	NC_021014	CCT	2	6	2609596	2609601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479154714
39088	NC_021014	ATC	2	6	2609622	2609627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154714
39089	NC_021014	CAG	2	6	2609723	2609728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154714
39090	NC_021014	ATC	2	6	2609768	2609773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154714
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39097	NC_021014	T	7	7	2611185	2611191	0 %	100 %	0 %	0 %	479154715
39098	NC_021014	TGC	2	6	2611201	2611206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154715
39099	NC_021014	GAT	2	6	2611208	2611213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154715
39100	NC_021014	CCGTT	2	10	2611229	2611238	0 %	40 %	20 %	40 %	479154715
39101	NC_021014	CAT	2	6	2611271	2611276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154715
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39103	NC_021014	TAA	2	6	2611310	2611315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479154715
39104	NC_021014	TTTC	2	8	2611331	2611338	0 %	75 %	0 %	25 %	479154715
39105	NC_021014	TTC	2	6	2611356	2611361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154715
39106	NC_021014	ACC	2	6	2611470	2611475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479154715
39107	NC_021014	T	6	6	2611491	2611496	0 %	100 %	0 %	0 %	479154715
39108	NC_021014	TCA	2	6	2611499	2611504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154715
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39110	NC_021014	TCA	2	6	2611526	2611531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154715
39111	NC_021014	GCT	2	6	2611549	2611554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154715
39112	NC_021014	T	6	6	2611566	2611571	0 %	100 %	0 %	0 %	479154715
39113	NC_021014	GTT	2	6	2611610	2611615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479154715
39114	NC_021014	AGC	2	6	2611638	2611643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154715
39115	NC_021014	TTTTC	2	10	2611693	2611702	0 %	80 %	0 %	20 %	479154715
39116	NC_021014	AGA	2	6	2611714	2611719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154715
39117	NC_021014	AG	3	6	2611789	2611794	50 %	0 %	50 %	0 %	479154715
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39223	NC_021014	CT	3	6	2618421	2618426	0 %	50 %	0 %	50 %	479154725
39224	NC_021014	CAGT	2	8	2618512	2618519	25 %	25 %	25 %	25 %	479154725
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39231	NC_021014	TA	3	6	2618773	2618778	50 %	50 %	0 %	0 %	479154725
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