MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_021014	T	6	6	2405888	2405893	0 %	100 %	0 %	0 %	479154547
36002	NC_021014	ATC	2	6	2406088	2406093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154548
36003	NC_021014	AGATG	2	10	2406115	2406124	40 %	20 %	40 %	0 %	479154548
36004	NC_021014	GCCA	2	8	2406144	2406151	25 %	0 %	25 %	50 %	479154548
36005	NC_021014	T	6	6	2406177	2406182	0 %	100 %	0 %	0 %	479154548
36006	NC_021014	CATC	2	8	2406203	2406210	25 %	25 %	0 %	50 %	479154548
36007	NC_021014	GACA	2	8	2406218	2406225	50 %	0 %	25 %	25 %	479154548
36008	NC_021014	CTG	2	6	2406245	2406250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154548
36009	NC_021014	CCA	2	6	2406281	2406286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479154548
36010	NC_021014	CTG	2	6	2406342	2406347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154549
36011	NC_021014	CCA	2	6	2406386	2406391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479154549
36012	NC_021014	ATA	2	6	2406425	2406430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479154549
36013	NC_021014	T	6	6	2406472	2406477	0 %	100 %	0 %	0 %	479154549
36014	NC_021014	TAA	2	6	2406496	2406501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479154549
36015	NC_021014	TTC	2	6	2406616	2406621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154549
36016	NC_021014	T	6	6	2406624	2406629	0 %	100 %	0 %	0 %	479154549
36017	NC_021014	AAGA	2	8	2406633	2406640	75 %	0 %	25 %	0 %	479154549
36018	NC_021014	TTC	2	6	2406694	2406699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154549
36019	NC_021014	TCT	2	6	2406741	2406746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154549
36020	NC_021014	ATG	2	6	2407012	2407017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154550
36021	NC_021014	TA	3	6	2407024	2407029	50 %	50 %	0 %	0 %	479154550
36022	NC_021014	ATC	2	6	2407034	2407039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154550
36023	NC_021014	TGCC	2	8	2407057	2407064	0 %	25 %	25 %	50 %	479154550
36024	NC_021014	CTGA	2	8	2407072	2407079	25 %	25 %	25 %	25 %	479154550
36025	NC_021014	ATC	2	6	2407111	2407116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154550
36026	NC_021014	ATATCT	2	12	2407139	2407150	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479154550
36027	NC_021014	A	6	6	2407182	2407187	100 %	0 %	0 %	0 %	479154550
36028	NC_021014	GCA	2	6	2407196	2407201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154550
36029	NC_021014	CA	3	6	2407200	2407205	50 %	0 %	0 %	50 %	479154550
36030	NC_021014	CTG	2	6	2407242	2407247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154550
36031	NC_021014	TCTCC	2	10	2407366	2407375	0 %	40 %	0 %	60 %	479154550
36032	NC_021014	CA	3	6	2407392	2407397	50 %	0 %	0 %	50 %	479154550
36033	NC_021014	TC	3	6	2407587	2407592	0 %	50 %	0 %	50 %	479154550
36034	NC_021014	A	7	7	2407632	2407638	100 %	0 %	0 %	0 %	479154550
36035	NC_021014	AAT	2	6	2407694	2407699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479154550
36036	NC_021014	ATTT	2	8	2407814	2407821	25 %	75 %	0 %	0 %	479154551
36037	NC_021014	TAA	2	6	2407822	2407827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479154551
36038	NC_021014	CTG	2	6	2407888	2407893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154551
36039	NC_021014	CTT	3	9	2407929	2407937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154551
36040	NC_021014	GTA	2	6	2408031	2408036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154551
36041	NC_021014	CTG	2	6	2408069	2408074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154551
36042	NC_021014	TCT	2	6	2408078	2408083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154551
36043	NC_021014	CTG	3	9	2408139	2408147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154551
36044	NC_021014	CCA	2	6	2408184	2408189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479154551
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36047	NC_021014	CGA	2	6	2408318	2408323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154551
36048	NC_021014	TC	3	6	2408424	2408429	0 %	50 %	0 %	50 %	479154551
36049	NC_021014	CGGA	2	8	2408461	2408468	25 %	0 %	50 %	25 %	479154551
36050	NC_021014	TCT	2	6	2408483	2408488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154551
36051	NC_021014	TCC	2	6	2408501	2408506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479154551
36052	NC_021014	CAG	2	6	2408516	2408521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154551
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36054	NC_021014	CTT	2	6	2409634	2409639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154552
36055	NC_021014	CA	3	6	2409672	2409677	50 %	0 %	0 %	50 %	479154552
36056	NC_021014	CA	3	6	2409679	2409684	50 %	0 %	0 %	50 %	479154552
36057	NC_021014	GCT	2	6	2409693	2409698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154552
36058	NC_021014	CA	3	6	2409732	2409737	50 %	0 %	0 %	50 %	479154552
36059	NC_021014	TCT	2	6	2409777	2409782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154552
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36063	NC_021014	GA	3	6	2410622	2410627	50 %	0 %	50 %	0 %	479154553
36064	NC_021014	T	6	6	2410731	2410736	0 %	100 %	0 %	0 %	479154553
36065	NC_021014	CTGG	2	8	2410762	2410769	0 %	25 %	50 %	25 %	479154553
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36067	NC_021014	CAT	2	6	2410825	2410830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154553
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36084	NC_021014	CAG	2	6	2411797	2411802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154553
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36090	NC_021014	TA	3	6	2413249	2413254	50 %	50 %	0 %	0 %	479154554
36091	NC_021014	GAAG	2	8	2413268	2413275	50 %	0 %	50 %	0 %	479154554
36092	NC_021014	ATA	2	6	2413284	2413289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479154554
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36100	NC_021014	ACT	2	6	2413880	2413885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154554
36101	NC_021014	A	6	6	2413940	2413945	100 %	0 %	0 %	0 %	479154554
36102	NC_021014	CCTG	2	8	2414042	2414049	0 %	25 %	25 %	50 %	479154554
36103	NC_021014	AGCC	2	8	2414998	2415005	25 %	0 %	25 %	50 %	479154555
36104	NC_021014	TGC	2	6	2415017	2415022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154555
36105	NC_021014	A	6	6	2415033	2415038	100 %	0 %	0 %	0 %	479154555
36106	NC_021014	A	6	6	2415045	2415050	100 %	0 %	0 %	0 %	479154555
36107	NC_021014	ATA	2	6	2415055	2415060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479154555
36108	NC_021014	GCCA	2	8	2415090	2415097	25 %	0 %	25 %	50 %	479154555
36109	NC_021014	GGATC	2	10	2415116	2415125	20 %	20 %	40 %	20 %	479154555
36110	NC_021014	TCTT	2	8	2415138	2415145	0 %	75 %	0 %	25 %	479154555
36111	NC_021014	ATT	2	6	2415153	2415158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154555
36112	NC_021014	CAT	2	6	2415991	2415996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154556
36113	NC_021014	TTA	2	6	2416013	2416018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154556
36114	NC_021014	ACAG	2	8	2416097	2416104	50 %	0 %	25 %	25 %	479154556
36115	NC_021014	ATC	2	6	2416105	2416110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154556
36116	NC_021014	ATT	2	6	2416231	2416236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154556
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36118	NC_021014	TAT	2	6	2416296	2416301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154556
36119	NC_021014	CAT	2	6	2416303	2416308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154556
36120	NC_021014	ATA	2	6	2416319	2416324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479154556
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36125	NC_021014	T	6	6	2416567	2416572	0 %	100 %	0 %	0 %	479154556
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36236	NC_021014	CAC	2	6	2424008	2424013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479154565
36237	NC_021014	CTT	2	6	2424150	2424155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154565
36238	NC_021014	CGGC	2	8	2424170	2424177	0 %	0 %	50 %	50 %	479154565
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36351	NC_021014	TCTTT	2	10	2430195	2430204	0 %	80 %	0 %	20 %	479154576
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36353	NC_021014	CAGAA	2	10	2430264	2430273	60 %	0 %	20 %	20 %	479154576
36354	NC_021014	AGA	2	6	2430276	2430281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154576
36355	NC_021014	ATTG	2	8	2430291	2430298	25 %	50 %	25 %	0 %	479154576
36356	NC_021014	TCA	2	6	2430299	2430304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154576
36357	NC_021014	AT	3	6	2430364	2430369	50 %	50 %	0 %	0 %	479154576
36358	NC_021014	AG	3	6	2430487	2430492	50 %	0 %	50 %	0 %	479154576
36359	NC_021014	TCT	2	6	2430496	2430501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154576
36360	NC_021014	TGA	2	6	2430506	2430511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154576
36361	NC_021014	CATC	2	8	2430512	2430519	25 %	25 %	0 %	50 %	479154576
36362	NC_021014	ATC	2	6	2430546	2430551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154576
36363	NC_021014	T	6	6	2430615	2430620	0 %	100 %	0 %	0 %	479154576
36364	NC_021014	TGG	2	6	2430659	2430664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479154576
36365	NC_021014	CGC	2	6	2430674	2430679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479154576
36366	NC_021014	TAC	2	6	2430690	2430695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154576
36367	NC_021014	TCC	2	6	2430721	2430726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479154576
36368	NC_021014	T	6	6	2430746	2430751	0 %	100 %	0 %	0 %	479154576
36369	NC_021014	TCA	2	6	2430784	2430789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154577
36370	NC_021014	CA	3	6	2430874	2430879	50 %	0 %	0 %	50 %	479154577
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36372	NC_021014	GCT	2	6	2430925	2430930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154577
36373	NC_021014	TGC	2	6	2431016	2431021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154577
36374	NC_021014	TCA	2	6	2431053	2431058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154577
36375	NC_021014	GCA	2	6	2431069	2431074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154577
36376	NC_021014	AT	3	6	2431099	2431104	50 %	50 %	0 %	0 %	479154577
36377	NC_021014	CAC	2	6	2431129	2431134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479154577
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36380	NC_021014	T	6	6	2431172	2431177	0 %	100 %	0 %	0 %	479154577
36381	NC_021014	T	6	6	2431194	2431199	0 %	100 %	0 %	0 %	479154577
36382	NC_021014	CTTT	2	8	2431208	2431215	0 %	75 %	0 %	25 %	479154577
36383	NC_021014	ATC	2	6	2431310	2431315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154577
36384	NC_021014	GCA	2	6	2431368	2431373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154577
36385	NC_021014	TCT	2	6	2431379	2431384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154577
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36388	NC_021014	ATC	2	6	2431490	2431495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154578
36389	NC_021014	CTCAAT	2	12	2431535	2431546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154578
36390	NC_021014	TTCT	2	8	2431555	2431562	0 %	75 %	0 %	25 %	479154578
36391	NC_021014	CG	3	6	2433109	2433114	0 %	0 %	50 %	50 %	479154579
36392	NC_021014	AT	3	6	2433146	2433151	50 %	50 %	0 %	0 %	479154579
36393	NC_021014	CTA	2	6	2433234	2433239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154579
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36424	NC_021014	AAG	2	6	2434617	2434622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154580
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36452	NC_021014	TCA	2	6	2435694	2435699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154581
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36455	NC_021014	T	6	6	2435817	2435822	0 %	100 %	0 %	0 %	479154581
36456	NC_021014	CCT	2	6	2435886	2435891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479154581
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36461	NC_021014	CT	3	6	2435954	2435959	0 %	50 %	0 %	50 %	479154582
36462	NC_021014	TA	3	6	2436050	2436055	50 %	50 %	0 %	0 %	479154582
36463	NC_021014	CAT	2	6	2436114	2436119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154582
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36466	NC_021014	CGG	2	6	2436292	2436297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479154582
36467	NC_021014	AGC	3	9	2436482	2436490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154582
36468	NC_021014	AGGC	2	8	2436596	2436603	25 %	0 %	50 %	25 %	479154582
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36470	NC_021014	GCAA	2	8	2439647	2439654	50 %	0 %	25 %	25 %	479154583
36471	NC_021014	ATT	2	6	2439664	2439669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154583
36472	NC_021014	CTT	2	6	2439717	2439722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154583
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36474	NC_021014	GCA	2	6	2440243	2440248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154584
36475	NC_021014	AAG	2	6	2440256	2440261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154584
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36482	NC_021014	CA	3	6	2441495	2441500	50 %	0 %	0 %	50 %	479154585
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