MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_021014	CCT	2	6	1544534	1544539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153768
23003	NC_021014	GCA	2	6	1544540	1544545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153768
23004	NC_021014	A	6	6	1544678	1544683	100 %	0 %	0 %	0 %	479153768
23005	NC_021014	CGGC	2	8	1544808	1544815	0 %	0 %	50 %	50 %	479153768
23006	NC_021014	CAA	2	6	1544904	1544909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153768
23007	NC_021014	GT	3	6	1544919	1544924	0 %	50 %	50 %	0 %	479153768
23008	NC_021014	CAG	2	6	1544928	1544933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153768
23009	NC_021014	TGA	2	6	1545015	1545020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153768
23010	NC_021014	AGAGA	2	10	1545285	1545294	60 %	0 %	40 %	0 %	479153769
23011	NC_021014	AGG	2	6	1545310	1545315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153769
23012	NC_021014	AG	3	6	1545387	1545392	50 %	0 %	50 %	0 %	479153769
23013	NC_021014	TTC	2	6	1545505	1545510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153769
23014	NC_021014	CAG	2	6	1545522	1545527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153769
23015	NC_021014	ATGAG	2	10	1545580	1545589	40 %	20 %	40 %	0 %	479153769
23016	NC_021014	AT	3	6	1545596	1545601	50 %	50 %	0 %	0 %	479153769
23017	NC_021014	A	7	7	1545606	1545612	100 %	0 %	0 %	0 %	479153769
23018	NC_021014	GCAG	2	8	1545617	1545624	25 %	0 %	50 %	25 %	479153769
23019	NC_021014	AGG	2	6	1545628	1545633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153769
23020	NC_021014	TGA	2	6	1545686	1545691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153769
23021	NC_021014	TCA	2	6	1545824	1545829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153769
23022	NC_021014	GGA	2	6	1546048	1546053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153769
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23024	NC_021014	A	6	6	1546674	1546679	100 %	0 %	0 %	0 %	479153770
23025	NC_021014	GGC	2	6	1546716	1546721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153770
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23028	NC_021014	TAC	2	6	1546810	1546815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153770
23029	NC_021014	TCT	2	6	1546821	1546826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153770
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23031	NC_021014	TGC	2	6	1546853	1546858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153770
23032	NC_021014	ATG	2	6	1546954	1546959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153770
23033	NC_021014	A	6	6	1546984	1546989	100 %	0 %	0 %	0 %	479153770
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23040	NC_021014	GACAA	2	10	1547489	1547498	60 %	0 %	20 %	20 %	479153771
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23043	NC_021014	GAA	2	6	1547561	1547566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153771
23044	NC_021014	AGG	2	6	1547742	1547747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153771
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23054	NC_021014	TTTTGT	2	12	1548292	1548303	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	479153771
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23099	NC_021014	T	7	7	1550673	1550679	0 %	100 %	0 %	0 %	479153774
23100	NC_021014	TC	3	6	1550707	1550712	0 %	50 %	0 %	50 %	479153774
23101	NC_021014	CGTA	2	8	1550777	1550784	25 %	25 %	25 %	25 %	479153774
23102	NC_021014	GGA	3	9	1550801	1550809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153774
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23108	NC_021014	GGA	2	6	1551143	1551148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153774
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23117	NC_021014	CTT	2	6	1551552	1551557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153774
23118	NC_021014	TGG	2	6	1551562	1551567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153774
23119	NC_021014	A	6	6	1551570	1551575	100 %	0 %	0 %	0 %	479153774
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23220	NC_021014	CAT	2	6	1557988	1557993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153779
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23227	NC_021014	TAT	2	6	1558346	1558351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153779
23228	NC_021014	GA	3	6	1558360	1558365	50 %	0 %	50 %	0 %	479153779
23229	NC_021014	TGA	2	6	1558459	1558464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153779
23230	NC_021014	TAAGGG	2	12	1558480	1558491	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479153779
23231	NC_021014	TGA	2	6	1558498	1558503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153779
23232	NC_021014	GCG	2	6	1558540	1558545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153779
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23467	NC_021014	A	6	6	1572949	1572954	100 %	0 %	0 %	0 %	479153793
23468	NC_021014	TGC	2	6	1573025	1573030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153793
23469	NC_021014	GCA	2	6	1573124	1573129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153793
23470	NC_021014	CCA	2	6	1573131	1573136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153793
23471	NC_021014	GAA	2	6	1573142	1573147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153793
23472	NC_021014	GAT	2	6	1573154	1573159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153793
23473	NC_021014	GAG	2	6	1573232	1573237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153793
23474	NC_021014	GAT	2	6	1573286	1573291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153793
23475	NC_021014	ATA	2	6	1573329	1573334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153793
23476	NC_021014	AAC	2	6	1573364	1573369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153793
23477	NC_021014	TAT	2	6	1573433	1573438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153793
23478	NC_021014	GAT	2	6	1573544	1573549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153793
23479	NC_021014	A	6	6	1573616	1573621	100 %	0 %	0 %	0 %	479153793
23480	NC_021014	TCC	2	6	1573721	1573726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153793
23481	NC_021014	A	6	6	1573796	1573801	100 %	0 %	0 %	0 %	479153793
23482	NC_021014	TC	3	6	1573893	1573898	0 %	50 %	0 %	50 %	479153793
23483	NC_021014	CGG	2	6	1573900	1573905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153793
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23486	NC_021014	A	6	6	1573962	1573967	100 %	0 %	0 %	0 %	479153793
23487	NC_021014	GCA	2	6	1574027	1574032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153794
23488	NC_021014	ATG	2	6	1574106	1574111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153794
23489	NC_021014	AGCTGG	2	12	1574121	1574132	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479153794
23490	NC_021014	TGC	2	6	1574146	1574151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153794
23491	NC_021014	ATG	2	6	1574213	1574218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153794
23492	NC_021014	GCGT	2	8	1574242	1574249	0 %	25 %	50 %	25 %	479153794
23493	NC_021014	CAA	2	6	1574253	1574258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153794
23494	NC_021014	CT	3	6	1574260	1574265	0 %	50 %	0 %	50 %	479153794
23495	NC_021014	ATC	2	6	1574288	1574293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153794
23496	NC_021014	TGC	2	6	1574377	1574382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153794
23497	NC_021014	GGA	3	9	1574438	1574446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153794
23498	NC_021014	TC	4	8	1574457	1574464	0 %	50 %	0 %	50 %	479153794
23499	NC_021014	AAC	2	6	1574548	1574553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153794
23500	NC_021014	GA	3	6	1574697	1574702	50 %	0 %	50 %	0 %	479153794

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