MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_021014	ATT	2	6	1319922	1319927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153563
19503	NC_021014	TCG	2	6	1319944	1319949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153563
19504	NC_021014	CAGA	2	8	1319964	1319971	50 %	0 %	25 %	25 %	479153563
19505	NC_021014	GAA	2	6	1320002	1320007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153563
19506	NC_021014	GAA	2	6	1320035	1320040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153563
19507	NC_021014	TGA	2	6	1320073	1320078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153563
19508	NC_021014	ATG	2	6	1320149	1320154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153563
19509	NC_021014	GAG	2	6	1320212	1320217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153563
19510	NC_021014	CGG	2	6	1320247	1320252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153563
19511	NC_021014	AGG	2	6	1320264	1320269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153563
19512	NC_021014	CTT	2	6	1320335	1320340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153563
19513	NC_021014	ACA	2	6	1320365	1320370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153563
19514	NC_021014	GGC	2	6	1320371	1320376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153563
19515	NC_021014	TAT	2	6	1320406	1320411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153563
19516	NC_021014	AG	3	6	1320498	1320503	50 %	0 %	50 %	0 %	479153563
19517	NC_021014	TCT	2	6	1320511	1320516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153563
19518	NC_021014	GAG	2	6	1320551	1320556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153563
19519	NC_021014	AAT	2	6	1320608	1320613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153563
19520	NC_021014	ATA	2	6	1320624	1320629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153563
19521	NC_021014	ATA	2	6	1320690	1320695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153563
19522	NC_021014	GAT	2	6	1320845	1320850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153563
19523	NC_021014	GGT	2	6	1320863	1320868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153563
19524	NC_021014	GCA	2	6	1320997	1321002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153563
19525	NC_021014	A	6	6	1321102	1321107	100 %	0 %	0 %	0 %	479153563
19526	NC_021014	CCTTG	2	10	1321180	1321189	0 %	40 %	20 %	40 %	479153563
19527	NC_021014	AGC	3	9	1321294	1321302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153563
19528	NC_021014	TGA	2	6	1321305	1321310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153563
19529	NC_021014	GAT	2	6	1321342	1321347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153563
19530	NC_021014	GAA	2	6	1321451	1321456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153563
19531	NC_021014	CCT	2	6	1322284	1322289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153564
19532	NC_021014	GGA	2	6	1322319	1322324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153564
19533	NC_021014	CAT	2	6	1322395	1322400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153564
19534	NC_021014	CAG	2	6	1322424	1322429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153564
19535	NC_021014	A	7	7	1322441	1322447	100 %	0 %	0 %	0 %	479153564
19536	NC_021014	T	6	6	1322456	1322461	0 %	100 %	0 %	0 %	479153564
19537	NC_021014	AT	3	6	1322489	1322494	50 %	50 %	0 %	0 %	479153564
19538	NC_021014	A	6	6	1322990	1322995	100 %	0 %	0 %	0 %	479153565
19539	NC_021014	CAT	2	6	1323020	1323025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153565
19540	NC_021014	GACA	2	8	1323027	1323034	50 %	0 %	25 %	25 %	479153565
19541	NC_021014	GAT	2	6	1323089	1323094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153565
19542	NC_021014	AGA	2	6	1323133	1323138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153565
19543	NC_021014	ATT	2	6	1323228	1323233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153565
19544	NC_021014	GAA	2	6	1323256	1323261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153565
19545	NC_021014	A	7	7	1323271	1323277	100 %	0 %	0 %	0 %	479153565
19546	NC_021014	CTG	2	6	1323342	1323347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153565
19547	NC_021014	ATG	2	6	1323399	1323404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153565
19548	NC_021014	TCT	2	6	1323508	1323513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153566
19549	NC_021014	T	7	7	1323584	1323590	0 %	100 %	0 %	0 %	479153566
19550	NC_021014	ATTTT	2	10	1323592	1323601	20 %	80 %	0 %	0 %	479153566
19551	NC_021014	TC	3	6	1323901	1323906	0 %	50 %	0 %	50 %	479153567
19552	NC_021014	ATTG	2	8	1323947	1323954	25 %	50 %	25 %	0 %	479153567
19553	NC_021014	A	6	6	1324004	1324009	100 %	0 %	0 %	0 %	479153567
19554	NC_021014	GAT	2	6	1324074	1324079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153567
19555	NC_021014	TA	3	6	1324192	1324197	50 %	50 %	0 %	0 %	479153567
19556	NC_021014	TGG	2	6	1324323	1324328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153568
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19558	NC_021014	CTG	2	6	1324378	1324383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153568
19559	NC_021014	AGG	2	6	1324389	1324394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153568
19560	NC_021014	TGC	2	6	1324456	1324461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153568
19561	NC_021014	CAG	2	6	1324565	1324570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153568
19562	NC_021014	A	6	6	1324630	1324635	100 %	0 %	0 %	0 %	479153568
19563	NC_021014	TAC	2	6	1324655	1324660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153568
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19566	NC_021014	A	6	6	1324788	1324793	100 %	0 %	0 %	0 %	479153568
19567	NC_021014	AAG	2	6	1324820	1324825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153568
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19569	NC_021014	TGTGG	2	10	1324841	1324850	0 %	40 %	60 %	0 %	479153568
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19573	NC_021014	TGTA	2	8	1325842	1325849	25 %	50 %	25 %	0 %	479153569
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19575	NC_021014	A	6	6	1325882	1325887	100 %	0 %	0 %	0 %	479153569
19576	NC_021014	TTAT	2	8	1325895	1325902	25 %	75 %	0 %	0 %	479153569
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19583	NC_021014	CAT	2	6	1326302	1326307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153569
19584	NC_021014	GAA	2	6	1326308	1326313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153569
19585	NC_021014	GCG	2	6	1326345	1326350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153570
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19589	NC_021014	GA	3	6	1326522	1326527	50 %	0 %	50 %	0 %	479153570
19590	NC_021014	AAAG	2	8	1326548	1326555	75 %	0 %	25 %	0 %	479153570
19591	NC_021014	A	7	7	1326594	1326600	100 %	0 %	0 %	0 %	479153570
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19598	NC_021014	AAGA	2	8	1326827	1326834	75 %	0 %	25 %	0 %	479153570
19599	NC_021014	GA	3	6	1326833	1326838	50 %	0 %	50 %	0 %	479153570
19600	NC_021014	AAG	2	6	1326843	1326848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153570
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19602	NC_021014	GT	3	6	1326952	1326957	0 %	50 %	50 %	0 %	479153570
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19607	NC_021014	T	6	6	1327094	1327099	0 %	100 %	0 %	0 %	479153570
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19612	NC_021014	ATC	2	6	1327347	1327352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153570
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19615	NC_021014	GAGAT	2	10	1327441	1327450	40 %	20 %	40 %	0 %	479153570
19616	NC_021014	GA	3	6	1327506	1327511	50 %	0 %	50 %	0 %	479153570
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19833	NC_021014	A	7	7	1344700	1344706	100 %	0 %	0 %	0 %	479153583
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19837	NC_021014	AAAT	2	8	1344911	1344918	75 %	25 %	0 %	0 %	479153584
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19842	NC_021014	A	7	7	1345079	1345085	100 %	0 %	0 %	0 %	479153585
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19847	NC_021014	A	6	6	1345248	1345253	100 %	0 %	0 %	0 %	479153586
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