MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021014	CAT	2	6	103931	103936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152391
1502	NC_021014	CAT	2	6	103991	103996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152391
1503	NC_021014	CATA	2	8	104021	104028	50 %	25 %	0 %	25 %	479152391
1504	NC_021014	CAC	2	6	104048	104053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152391
1505	NC_021014	TTCT	2	8	104250	104257	0 %	75 %	0 %	25 %	479152391
1506	NC_021014	GAT	2	6	104273	104278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152391
1507	NC_021014	GGA	2	6	104287	104292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152391
1508	NC_021014	CGG	2	6	104367	104372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152391
1509	NC_021014	AGC	2	6	104449	104454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152391
1510	NC_021014	GGC	2	6	104461	104466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152391
1511	NC_021014	GAG	2	6	104588	104593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152391
1512	NC_021014	ATG	2	6	104604	104609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152391
1513	NC_021014	TGA	2	6	104653	104658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152391
1514	NC_021014	AG	3	6	104714	104719	50 %	0 %	50 %	0 %	479152391
1515	NC_021014	GAA	2	6	104743	104748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152391
1516	NC_021014	GCT	2	6	104764	104769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152391
1517	NC_021014	A	6	6	104783	104788	100 %	0 %	0 %	0 %	479152391
1518	NC_021014	ACA	2	6	104828	104833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152391
1519	NC_021014	AG	3	6	104879	104884	50 %	0 %	50 %	0 %	479152391
1520	NC_021014	T	6	6	104953	104958	0 %	100 %	0 %	0 %	479152391
1521	NC_021014	A	7	7	104978	104984	100 %	0 %	0 %	0 %	479152391
1522	NC_021014	A	6	6	104992	104997	100 %	0 %	0 %	0 %	479152391
1523	NC_021014	CAG	2	6	105198	105203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152392
1524	NC_021014	CAGG	2	8	105213	105220	25 %	0 %	50 %	25 %	479152392
1525	NC_021014	AG	3	6	105284	105289	50 %	0 %	50 %	0 %	479152392
1526	NC_021014	AGAA	2	8	105325	105332	75 %	0 %	25 %	0 %	479152392
1527	NC_021014	GTG	2	6	105378	105383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152392
1528	NC_021014	TCT	2	6	105399	105404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152392
1529	NC_021014	GAAA	2	8	105452	105459	75 %	0 %	25 %	0 %	479152392
1530	NC_021014	TGA	2	6	105497	105502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152392
1531	NC_021014	AGGA	2	8	105538	105545	50 %	0 %	50 %	0 %	479152392
1532	NC_021014	GAAGA	2	10	105612	105621	60 %	0 %	40 %	0 %	479152392
1533	NC_021014	AGT	2	6	105629	105634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152392
1534	NC_021014	GAA	2	6	105664	105669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152392
1535	NC_021014	ATC	2	6	105759	105764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152392
1536	NC_021014	TGA	2	6	105872	105877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152392
1537	NC_021014	AGC	2	6	105878	105883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152392
1538	NC_021014	ATG	2	6	105912	105917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152392
1539	NC_021014	CAGG	2	8	105960	105967	25 %	0 %	50 %	25 %	479152392
1540	NC_021014	GAA	2	6	106037	106042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152392
1541	NC_021014	GAA	2	6	106055	106060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152392
1542	NC_021014	GA	4	8	106158	106165	50 %	0 %	50 %	0 %	479152392
1543	NC_021014	CAAAA	2	10	106190	106199	80 %	0 %	0 %	20 %	479152392
1544	NC_021014	TGA	2	6	106632	106637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152393
1545	NC_021014	AGG	2	6	106712	106717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152393
1546	NC_021014	GAA	2	6	106731	106736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152393
1547	NC_021014	AGG	2	6	106761	106766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152393
1548	NC_021014	GAT	2	6	106837	106842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152393
1549	NC_021014	TGT	2	6	106857	106862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152393
1550	NC_021014	ATT	2	6	106865	106870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152393
1551	NC_021014	TGA	2	6	106872	106877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152393
1552	NC_021014	GA	3	6	106876	106881	50 %	0 %	50 %	0 %	479152393
1553	NC_021014	GA	3	6	106919	106924	50 %	0 %	50 %	0 %	479152393
1554	NC_021014	GAC	2	6	107017	107022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152393
1555	NC_021014	AG	3	6	107082	107087	50 %	0 %	50 %	0 %	479152393
1556	NC_021014	AGC	2	6	107100	107105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152393
1557	NC_021014	TGCT	2	8	107120	107127	0 %	50 %	25 %	25 %	479152393
1558	NC_021014	AG	3	6	107167	107172	50 %	0 %	50 %	0 %	479152393
1559	NC_021014	GAA	2	6	107181	107186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152393
1560	NC_021014	CTA	2	6	107205	107210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152393
1561	NC_021014	CAT	3	9	107235	107243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152393
1562	NC_021014	AGA	2	6	107253	107258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152393
1563	NC_021014	AAG	2	6	107285	107290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152393
1564	NC_021014	TGA	2	6	107298	107303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152393
1565	NC_021014	GGCA	2	8	107321	107328	25 %	0 %	50 %	25 %	479152393
1566	NC_021014	A	6	6	107328	107333	100 %	0 %	0 %	0 %	479152393
1567	NC_021014	TTG	2	6	107342	107347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152393
1568	NC_021014	TCA	2	6	107348	107353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152393
1569	NC_021014	CGG	3	9	107442	107450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152393
1570	NC_021014	CTG	2	6	107525	107530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152393
1571	NC_021014	ATG	2	6	107539	107544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152393
1572	NC_021014	CAA	2	6	107553	107558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152393
1573	NC_021014	CATT	2	8	107597	107604	25 %	50 %	0 %	25 %	479152393
1574	NC_021014	GAAAAA	2	12	107611	107622	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479152393
1575	NC_021014	A	6	6	107663	107668	100 %	0 %	0 %	0 %	479152394
1576	NC_021014	TTC	2	6	107846	107851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152394
1577	NC_021014	GAA	2	6	107855	107860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152394
1578	NC_021014	A	7	7	107914	107920	100 %	0 %	0 %	0 %	479152394
1579	NC_021014	TCC	2	6	107935	107940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152394
1580	NC_021014	ATA	2	6	107993	107998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152394
1581	NC_021014	CTT	2	6	108004	108009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152394
1582	NC_021014	CAG	2	6	108058	108063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152394
1583	NC_021014	GAGCA	2	10	108067	108076	40 %	0 %	40 %	20 %	479152394
1584	NC_021014	ACGA	2	8	108094	108101	50 %	0 %	25 %	25 %	479152394
1585	NC_021014	CAATG	2	10	108171	108180	40 %	20 %	20 %	20 %	479152394
1586	NC_021014	TGC	2	6	108214	108219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152394
1587	NC_021014	CTT	2	6	108270	108275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152394
1588	NC_021014	AAG	2	6	108277	108282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152394
1589	NC_021014	AG	3	6	108281	108286	50 %	0 %	50 %	0 %	479152394
1590	NC_021014	GAA	2	6	108357	108362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152394
1591	NC_021014	GTT	2	6	108373	108378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152394
1592	NC_021014	GGT	3	9	108379	108387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152394
1593	NC_021014	TGCC	2	8	108474	108481	0 %	25 %	25 %	50 %	479152394
1594	NC_021014	CAT	2	6	108540	108545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152394
1595	NC_021014	ACA	2	6	108598	108603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152394
1596	NC_021014	CAA	2	6	108651	108656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152394
1597	NC_021014	GATG	2	8	108678	108685	25 %	25 %	50 %	0 %	479152394
1598	NC_021014	GAT	2	6	108844	108849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152394
1599	NC_021014	CA	3	6	108921	108926	50 %	0 %	0 %	50 %	479152394
1600	NC_021014	CAG	2	6	108929	108934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152394
1601	NC_021014	CAT	2	6	108975	108980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152394
1602	NC_021014	CAG	2	6	108983	108988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152394
1603	NC_021014	GA	3	6	109195	109200	50 %	0 %	50 %	0 %	479152394
1604	NC_021014	CAA	2	6	109248	109253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152394
1605	NC_021014	ACCG	2	8	109317	109324	25 %	0 %	25 %	50 %	479152394
1606	NC_021014	TGG	2	6	109501	109506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152394
1607	NC_021014	CAA	2	6	109520	109525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152394
1608	NC_021014	GAAA	2	8	109533	109540	75 %	0 %	25 %	0 %	479152394
1609	NC_021014	ACA	2	6	109670	109675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152395
1610	NC_021014	ATG	3	9	109697	109705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152395
1611	NC_021014	GA	3	6	109734	109739	50 %	0 %	50 %	0 %	479152395
1612	NC_021014	AG	3	6	109754	109759	50 %	0 %	50 %	0 %	479152395
1613	NC_021014	GAG	2	6	109763	109768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152395
1614	NC_021014	CAG	2	6	109770	109775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152395
1615	NC_021014	TCC	2	6	109779	109784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152395
1616	NC_021014	GCA	2	6	109826	109831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152395
1617	NC_021014	GT	3	6	109864	109869	0 %	50 %	50 %	0 %	479152395
1618	NC_021014	GAAGA	2	10	110029	110038	60 %	0 %	40 %	0 %	479152395
1619	NC_021014	ATC	2	6	110175	110180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152395
1620	NC_021014	AGG	2	6	110254	110259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152395
1621	NC_021014	GCAG	2	8	110272	110279	25 %	0 %	50 %	25 %	479152395
1622	NC_021014	GAT	2	6	110311	110316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152395
1623	NC_021014	CAGA	2	8	110345	110352	50 %	0 %	25 %	25 %	479152395
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1986	NC_021014	CT	3	6	133427	133432	0 %	50 %	0 %	50 %	479152413
1987	NC_021014	CCG	2	6	133476	133481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152413
1988	NC_021014	AG	3	6	133497	133502	50 %	0 %	50 %	0 %	479152413
1989	NC_021014	GCC	2	6	133571	133576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152413
1990	NC_021014	TGAAC	2	10	133600	133609	40 %	20 %	20 %	20 %	479152413
1991	NC_021014	ATC	2	6	133643	133648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152413
1992	NC_021014	GAT	2	6	133670	133675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152413
1993	NC_021014	CT	3	6	133677	133682	0 %	50 %	0 %	50 %	479152413
1994	NC_021014	CTT	2	6	133828	133833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152413
1995	NC_021014	TTG	2	6	133846	133851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152413
1996	NC_021014	ATC	2	6	134084	134089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152414
1997	NC_021014	GAA	2	6	134151	134156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152414
1998	NC_021014	ATGGA	2	10	134158	134167	40 %	20 %	40 %	0 %	479152414
1999	NC_021014	T	6	6	134287	134292	0 %	100 %	0 %	0 %	479152414
2000	NC_021014	GCT	2	6	134408	134413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152414

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