MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_021014	AAG	2	6	1290010	1290015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153530
19002	NC_021014	GAG	2	6	1290139	1290144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153530
19003	NC_021014	TGA	2	6	1290195	1290200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153530
19004	NC_021014	GCT	2	6	1290232	1290237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153530
19005	NC_021014	ATC	2	6	1290361	1290366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153531
19006	NC_021014	AGATC	2	10	1290367	1290376	40 %	20 %	20 %	20 %	479153531
19007	NC_021014	GTCT	2	8	1290419	1290426	0 %	50 %	25 %	25 %	479153531
19008	NC_021014	TG	3	6	1290603	1290608	0 %	50 %	50 %	0 %	479153531
19009	NC_021014	GCA	2	6	1290691	1290696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153531
19010	NC_021014	TCC	2	6	1290735	1290740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153531
19011	NC_021014	CAT	2	6	1290820	1290825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153531
19012	NC_021014	AGA	2	6	1290900	1290905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153531
19013	NC_021014	A	7	7	1290921	1290927	100 %	0 %	0 %	0 %	479153531
19014	NC_021014	TGT	2	6	1290934	1290939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153531
19015	NC_021014	TA	4	8	1290966	1290973	50 %	50 %	0 %	0 %	479153531
19016	NC_021014	CAT	2	6	1291007	1291012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153531
19017	NC_021014	TGA	2	6	1291033	1291038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153531
19018	NC_021014	AGA	2	6	1291041	1291046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153531
19019	NC_021014	GAA	2	6	1291136	1291141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153531
19020	NC_021014	T	7	7	1291147	1291153	0 %	100 %	0 %	0 %	479153531
19021	NC_021014	TCT	2	6	1291186	1291191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153532
19022	NC_021014	GAT	2	6	1291338	1291343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153532
19023	NC_021014	CCGGT	2	10	1291365	1291374	0 %	20 %	40 %	40 %	479153532
19024	NC_021014	CAC	2	6	1291386	1291391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153532
19025	NC_021014	TCT	2	6	1291504	1291509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153532
19026	NC_021014	CGC	2	6	1291511	1291516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479153532
19027	NC_021014	TTC	2	6	1291518	1291523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153532
19028	NC_021014	ACA	2	6	1291555	1291560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153532
19029	NC_021014	TCA	2	6	1291639	1291644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153532
19030	NC_021014	CCA	2	6	1291658	1291663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153532
19031	NC_021014	GTG	2	6	1291700	1291705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153532
19032	NC_021014	CTT	2	6	1291721	1291726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153532
19033	NC_021014	CAT	2	6	1291728	1291733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153532
19034	NC_021014	GTA	2	6	1291764	1291769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153532
19035	NC_021014	CCAG	2	8	1291841	1291848	25 %	0 %	25 %	50 %	479153532
19036	NC_021014	TTGT	2	8	1291870	1291877	0 %	75 %	25 %	0 %	479153532
19037	NC_021014	GGA	2	6	1291983	1291988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153532
19038	NC_021014	GGATGA	2	12	1292015	1292026	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479153532
19039	NC_021014	GTA	2	6	1292028	1292033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153532
19040	NC_021014	CGTAGT	2	12	1292042	1292053	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479153532
19041	NC_021014	GTC	2	6	1292091	1292096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153532
19042	NC_021014	TGA	2	6	1292177	1292182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153533
19043	NC_021014	T	6	6	1292185	1292190	0 %	100 %	0 %	0 %	479153533
19044	NC_021014	TTC	2	6	1292241	1292246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153533
19045	NC_021014	GATAAG	2	12	1292251	1292262	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479153533
19046	NC_021014	CTT	2	6	1292267	1292272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153533
19047	NC_021014	T	6	6	1292282	1292287	0 %	100 %	0 %	0 %	479153533
19048	NC_021014	T	6	6	1292289	1292294	0 %	100 %	0 %	0 %	479153533
19049	NC_021014	AGC	2	6	1292307	1292312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153533
19050	NC_021014	AGC	2	6	1292331	1292336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153533
19051	NC_021014	T	6	6	1292353	1292358	0 %	100 %	0 %	0 %	479153533
19052	NC_021014	TG	3	6	1292383	1292388	0 %	50 %	50 %	0 %	479153533
19053	NC_021014	T	6	6	1292400	1292405	0 %	100 %	0 %	0 %	479153533
19054	NC_021014	TGG	2	6	1292433	1292438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153533
19055	NC_021014	CGGA	2	8	1292452	1292459	25 %	0 %	50 %	25 %	479153533
19056	NC_021014	CTG	2	6	1294297	1294302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153534
19057	NC_021014	TCT	2	6	1294316	1294321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153534
19058	NC_021014	CTG	2	6	1294429	1294434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153534
19059	NC_021014	CGC	2	6	1294448	1294453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479153534
19060	NC_021014	GGT	2	6	1294509	1294514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153534
19061	NC_021014	AGGATG	2	12	1294528	1294539	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479153534
19062	NC_021014	T	6	6	1294540	1294545	0 %	100 %	0 %	0 %	479153534
19063	NC_021014	ATC	2	6	1294579	1294584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153534
19064	NC_021014	TGA	2	6	1294610	1294615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153534
19065	NC_021014	TTC	2	6	1294665	1294670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153534
19066	NC_021014	GTCC	2	8	1294697	1294704	0 %	25 %	25 %	50 %	479153534
19067	NC_021014	TGC	2	6	1294746	1294751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153534
19068	NC_021014	TAG	2	6	1294796	1294801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153534
19069	NC_021014	GT	3	6	1294815	1294820	0 %	50 %	50 %	0 %	479153534
19070	NC_021014	TGGGAT	2	12	1294825	1294836	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479153534
19071	NC_021014	GTGC	2	8	1294882	1294889	0 %	25 %	50 %	25 %	479153534
19072	NC_021014	ATG	2	6	1294900	1294905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153534
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19074	NC_021014	GCT	2	6	1295331	1295336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153535
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19076	NC_021014	T	6	6	1295394	1295399	0 %	100 %	0 %	0 %	479153535
19077	NC_021014	TGC	2	6	1295431	1295436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153535
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19079	NC_021014	GCA	2	6	1295502	1295507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153535
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19081	NC_021014	TCTT	2	8	1295550	1295557	0 %	75 %	0 %	25 %	479153535
19082	NC_021014	T	6	6	1295625	1295630	0 %	100 %	0 %	0 %	479153535
19083	NC_021014	ATC	2	6	1295687	1295692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153535
19084	NC_021014	TCA	2	6	1295700	1295705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153535
19085	NC_021014	CAT	2	6	1295735	1295740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153535
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19087	NC_021014	ATG	2	6	1296254	1296259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153536
19088	NC_021014	A	6	6	1296263	1296268	100 %	0 %	0 %	0 %	479153536
19089	NC_021014	AGA	2	6	1296316	1296321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153536
19090	NC_021014	GA	3	6	1296323	1296328	50 %	0 %	50 %	0 %	479153536
19091	NC_021014	TG	3	6	1296331	1296336	0 %	50 %	50 %	0 %	479153536
19092	NC_021014	AGGG	2	8	1296339	1296346	25 %	0 %	75 %	0 %	479153536
19093	NC_021014	GAC	2	6	1296349	1296354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153536
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19096	NC_021014	TG	3	6	1296440	1296445	0 %	50 %	50 %	0 %	479153536
19097	NC_021014	GTCC	2	8	1296611	1296618	0 %	25 %	25 %	50 %	479153536
19098	NC_021014	TGC	2	6	1296629	1296634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153536
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19100	NC_021014	TG	3	6	1296717	1296722	0 %	50 %	50 %	0 %	479153536
19101	NC_021014	A	6	6	1296789	1296794	100 %	0 %	0 %	0 %	479153536
19102	NC_021014	TAT	2	6	1296848	1296853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153536
19103	NC_021014	A	6	6	1296925	1296930	100 %	0 %	0 %	0 %	479153536
19104	NC_021014	TCC	2	6	1296931	1296936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153536
19105	NC_021014	TGA	2	6	1296949	1296954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153536
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19107	NC_021014	A	6	6	1297058	1297063	100 %	0 %	0 %	0 %	479153536
19108	NC_021014	CTT	2	6	1297094	1297099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153536
19109	NC_021014	AT	3	6	1297180	1297185	50 %	50 %	0 %	0 %	479153536
19110	NC_021014	GA	3	6	1297199	1297204	50 %	0 %	50 %	0 %	479153536
19111	NC_021014	ATG	2	6	1297374	1297379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153536
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19114	NC_021014	GCA	2	6	1297537	1297542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153536
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19116	NC_021014	GAG	2	6	1297694	1297699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153536
19117	NC_021014	TGC	2	6	1297713	1297718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153536
19118	NC_021014	GAA	2	6	1297760	1297765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153536
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19123	NC_021014	TGA	2	6	1298074	1298079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153537
19124	NC_021014	T	6	6	1298123	1298128	0 %	100 %	0 %	0 %	479153537
19125	NC_021014	T	7	7	1298206	1298212	0 %	100 %	0 %	0 %	479153537
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19221	NC_021014	GGA	2	6	1304823	1304828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153544
19222	NC_021014	CA	3	6	1305048	1305053	50 %	0 %	0 %	50 %	479153545
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19226	NC_021014	TCCT	2	8	1305176	1305183	0 %	50 %	0 %	50 %	479153545
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19228	NC_021014	CA	3	6	1305284	1305289	50 %	0 %	0 %	50 %	479153545
19229	NC_021014	TGC	2	6	1305355	1305360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153545
19230	NC_021014	CTG	2	6	1305434	1305439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153545
19231	NC_021014	TTTC	2	8	1305490	1305497	0 %	75 %	0 %	25 %	479153545
19232	NC_021014	T	6	6	1305509	1305514	0 %	100 %	0 %	0 %	479153545
19233	NC_021014	TCAT	2	8	1305558	1305565	25 %	50 %	0 %	25 %	479153545
19234	NC_021014	ATTTTT	2	12	1305834	1305845	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479153546
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19236	NC_021014	GAT	2	6	1305935	1305940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153546
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19330	NC_021014	TAT	2	6	1311019	1311024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153551
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19332	NC_021014	GCA	2	6	1311104	1311109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153552
19333	NC_021014	CAA	2	6	1311139	1311144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153552
19334	NC_021014	CTT	2	6	1311285	1311290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153552
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19337	NC_021014	CAG	2	6	1311404	1311409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153552
19338	NC_021014	A	6	6	1311444	1311449	100 %	0 %	0 %	0 %	479153552
19339	NC_021014	ATC	2	6	1311609	1311614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153552
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19341	NC_021014	AT	3	6	1311695	1311700	50 %	50 %	0 %	0 %	479153553
19342	NC_021014	TAT	3	9	1311698	1311706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153553
19343	NC_021014	CGT	2	6	1311764	1311769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153553
19344	NC_021014	T	6	6	1311851	1311856	0 %	100 %	0 %	0 %	479153553
19345	NC_021014	CAC	2	6	1311857	1311862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153553
19346	NC_021014	CTG	2	6	1311905	1311910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153553
19347	NC_021014	TGGTG	2	10	1311919	1311928	0 %	40 %	60 %	0 %	479153553
19348	NC_021014	TGA	2	6	1311945	1311950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153553
19349	NC_021014	AAC	2	6	1312288	1312293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153554
19350	NC_021014	TGG	2	6	1312307	1312312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153554
19351	NC_021014	GCA	2	6	1312405	1312410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153554
19352	NC_021014	AGA	2	6	1312443	1312448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153554
19353	NC_021014	TG	3	6	1312498	1312503	0 %	50 %	50 %	0 %	479153554
19354	NC_021014	TCT	2	6	1312578	1312583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153554
19355	NC_021014	AT	3	6	1312621	1312626	50 %	50 %	0 %	0 %	479153554
19356	NC_021014	AGA	2	6	1312737	1312742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153554
19357	NC_021014	A	7	7	1312779	1312785	100 %	0 %	0 %	0 %	479153554
19358	NC_021014	CTTAC	2	10	1312795	1312804	20 %	40 %	0 %	40 %	479153554
19359	NC_021014	TACA	2	8	1312855	1312862	50 %	25 %	0 %	25 %	479153554
19360	NC_021014	CTT	2	6	1312924	1312929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153554
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19362	NC_021014	TCT	2	6	1312968	1312973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153554
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19365	NC_021014	GCA	2	6	1313005	1313010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153554
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19368	NC_021014	TCT	2	6	1313082	1313087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153554
19369	NC_021014	TCC	2	6	1313090	1313095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153554
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19378	NC_021014	CAT	2	6	1313527	1313532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153555
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19380	NC_021014	GTA	2	6	1313570	1313575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153555
19381	NC_021014	GAA	2	6	1313576	1313581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153555
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