MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_021014	ATC	2	6	1257329	1257334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153503
18502	NC_021014	TGA	2	6	1257370	1257375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153503
18503	NC_021014	AG	3	6	1257506	1257511	50 %	0 %	50 %	0 %	479153504
18504	NC_021014	TGG	2	6	1257534	1257539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153504
18505	NC_021014	CTT	2	6	1257609	1257614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153504
18506	NC_021014	AGC	2	6	1257736	1257741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153504
18507	NC_021014	CAGGAA	2	12	1257843	1257854	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479153504
18508	NC_021014	A	6	6	1257898	1257903	100 %	0 %	0 %	0 %	479153504
18509	NC_021014	GCA	2	6	1257934	1257939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153504
18510	NC_021014	ACTT	2	8	1257957	1257964	25 %	50 %	0 %	25 %	479153504
18511	NC_021014	CAGGAA	2	12	1257989	1258000	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479153504
18512	NC_021014	TCA	2	6	1258044	1258049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153504
18513	NC_021014	ATGC	2	8	1258072	1258079	25 %	25 %	25 %	25 %	479153504
18514	NC_021014	GAT	2	6	1258126	1258131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153504
18515	NC_021014	TTTAC	2	10	1258183	1258192	20 %	60 %	0 %	20 %	479153505
18516	NC_021014	ATT	2	6	1258280	1258285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153505
18517	NC_021014	GGT	2	6	1258312	1258317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153505
18518	NC_021014	GGATT	2	10	1258343	1258352	20 %	40 %	40 %	0 %	479153505
18519	NC_021014	AGA	2	6	1258362	1258367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153505
18520	NC_021014	A	6	6	1258396	1258401	100 %	0 %	0 %	0 %	479153505
18521	NC_021014	TCA	2	6	1258715	1258720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153506
18522	NC_021014	AGGA	2	8	1258733	1258740	50 %	0 %	50 %	0 %	479153506
18523	NC_021014	A	6	6	1258827	1258832	100 %	0 %	0 %	0 %	479153506
18524	NC_021014	GAA	2	6	1258975	1258980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153506
18525	NC_021014	AGA	2	6	1258986	1258991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153506
18526	NC_021014	TGA	3	9	1258992	1259000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153506
18527	NC_021014	ATGAT	2	10	1259001	1259010	40 %	40 %	20 %	0 %	479153506
18528	NC_021014	CAT	2	6	1259108	1259113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153507
18529	NC_021014	GGT	2	6	1259136	1259141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153507
18530	NC_021014	GTG	2	6	1259263	1259268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153507
18531	NC_021014	GAA	2	6	1259296	1259301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153507
18532	NC_021014	GGAT	2	8	1259319	1259326	25 %	25 %	50 %	0 %	479153507
18533	NC_021014	ATG	2	6	1259443	1259448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153507
18534	NC_021014	TA	3	6	1259449	1259454	50 %	50 %	0 %	0 %	479153507
18535	NC_021014	T	6	6	1259478	1259483	0 %	100 %	0 %	0 %	479153507
18536	NC_021014	TG	3	6	1259560	1259565	0 %	50 %	50 %	0 %	479153507
18537	NC_021014	GTT	2	6	1259571	1259576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153507
18538	NC_021014	TATC	2	8	1259674	1259681	25 %	50 %	0 %	25 %	479153507
18539	NC_021014	GGC	2	6	1259729	1259734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153507
18540	NC_021014	AGA	2	6	1259735	1259740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153507
18541	NC_021014	CCA	2	6	1259751	1259756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153507
18542	NC_021014	TGT	2	6	1259837	1259842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153507
18543	NC_021014	GCA	2	6	1259849	1259854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153507
18544	NC_021014	GT	3	6	1259938	1259943	0 %	50 %	50 %	0 %	479153507
18545	NC_021014	GT	3	6	1259961	1259966	0 %	50 %	50 %	0 %	479153507
18546	NC_021014	ATC	2	6	1260114	1260119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153507
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18549	NC_021014	GAT	2	6	1260246	1260251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153507
18550	NC_021014	ATCC	2	8	1260267	1260274	25 %	25 %	0 %	50 %	479153507
18551	NC_021014	GGC	2	6	1260288	1260293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153507
18552	NC_021014	TGT	2	6	1260305	1260310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153507
18553	NC_021014	TGC	2	6	1260316	1260321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153507
18554	NC_021014	GCA	2	6	1260369	1260374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153507
18555	NC_021014	GAAAAG	2	12	1260499	1260510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153507
18556	NC_021014	TAA	2	6	1260554	1260559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153507
18557	NC_021014	GAAA	2	8	1260942	1260949	75 %	0 %	25 %	0 %	479153508
18558	NC_021014	CAG	2	6	1260955	1260960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153508
18559	NC_021014	CAG	2	6	1260962	1260967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153508
18560	NC_021014	AAG	2	6	1260968	1260973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153508
18561	NC_021014	AG	3	6	1261033	1261038	50 %	0 %	50 %	0 %	479153508
18562	NC_021014	GAAA	2	8	1261067	1261074	75 %	0 %	25 %	0 %	479153508
18563	NC_021014	A	6	6	1261072	1261077	100 %	0 %	0 %	0 %	479153508
18564	NC_021014	TCT	2	6	1261090	1261095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153508
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18566	NC_021014	GAAAA	2	10	1263746	1263755	80 %	0 %	20 %	0 %	479153509
18567	NC_021014	A	6	6	1263769	1263774	100 %	0 %	0 %	0 %	479153509
18568	NC_021014	TGA	3	9	1263902	1263910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153510
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18570	NC_021014	CTT	2	6	1264039	1264044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153510
18571	NC_021014	ATG	2	6	1264063	1264068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153510
18572	NC_021014	CAG	2	6	1264082	1264087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153510
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18574	NC_021014	T	6	6	1264192	1264197	0 %	100 %	0 %	0 %	479153510
18575	NC_021014	TGTT	2	8	1264313	1264320	0 %	75 %	25 %	0 %	479153510
18576	NC_021014	TATT	2	8	1264469	1264476	25 %	75 %	0 %	0 %	479153510
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18583	NC_021014	CGG	2	6	1264730	1264735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153510
18584	NC_021014	ATGAT	2	10	1264770	1264779	40 %	40 %	20 %	0 %	479153510
18585	NC_021014	CTG	2	6	1264859	1264864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153511
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18588	NC_021014	A	7	7	1265017	1265023	100 %	0 %	0 %	0 %	479153511
18589	NC_021014	GCTG	2	8	1265024	1265031	0 %	25 %	50 %	25 %	479153511
18590	NC_021014	TAT	2	6	1265077	1265082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153511
18591	NC_021014	T	7	7	1265165	1265171	0 %	100 %	0 %	0 %	479153511
18592	NC_021014	GAT	2	6	1265196	1265201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153511
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18601	NC_021014	GGC	2	6	1265549	1265554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153512
18602	NC_021014	GGC	2	6	1265599	1265604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153512
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18607	NC_021014	GTA	2	6	1265840	1265845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153512
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18610	NC_021014	AGA	2	6	1265965	1265970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153512
18611	NC_021014	A	6	6	1265977	1265982	100 %	0 %	0 %	0 %	479153512
18612	NC_021014	TG	3	6	1266005	1266010	0 %	50 %	50 %	0 %	479153512
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18617	NC_021014	CA	3	6	1266107	1266112	50 %	0 %	0 %	50 %	479153512
18618	NC_021014	AT	3	6	1266145	1266150	50 %	50 %	0 %	0 %	479153512
18619	NC_021014	GCG	2	6	1266159	1266164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153512
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18719	NC_021014	AT	3	6	1273219	1273224	50 %	50 %	0 %	0 %	479153519
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18734	NC_021014	GCT	2	6	1274321	1274326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153520
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18736	NC_021014	CTT	2	6	1274414	1274419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153520
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18742	NC_021014	ATC	2	6	1274702	1274707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153520
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18837	NC_021014	TGA	3	9	1279563	1279571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153522
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18844	NC_021014	TCT	2	6	1280043	1280048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153523
18845	NC_021014	A	6	6	1280050	1280055	100 %	0 %	0 %	0 %	479153523
18846	NC_021014	ATG	2	6	1280107	1280112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153523
18847	NC_021014	CTG	2	6	1280389	1280394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153523
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18849	NC_021014	GAT	2	6	1280551	1280556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153523
18850	NC_021014	CACAGA	2	12	1280559	1280570	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479153523
18851	NC_021014	GGC	2	6	1280635	1280640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153523
18852	NC_021014	T	6	6	1280656	1280661	0 %	100 %	0 %	0 %	479153523
18853	NC_021014	GAG	2	6	1280680	1280685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153523
18854	NC_021014	AGA	2	6	1280766	1280771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153523
18855	NC_021014	CCGG	2	8	1280817	1280824	0 %	0 %	50 %	50 %	479153523
18856	NC_021014	ATA	2	6	1280898	1280903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153523
18857	NC_021014	GA	3	6	1280924	1280929	50 %	0 %	50 %	0 %	479153524
18858	NC_021014	GCT	2	6	1280986	1280991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153524
18859	NC_021014	TGG	2	6	1281012	1281017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153524
18860	NC_021014	ATG	2	6	1281024	1281029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153524
18861	NC_021014	AGC	2	6	1281052	1281057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153524
18862	NC_021014	A	6	6	1281130	1281135	100 %	0 %	0 %	0 %	479153524
18863	NC_021014	ATGA	2	8	1281161	1281168	50 %	25 %	25 %	0 %	479153524
18864	NC_021014	GGCAG	2	10	1281261	1281270	20 %	0 %	60 %	20 %	479153524
18865	NC_021014	GAT	2	6	1281296	1281301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153524
18866	NC_021014	GGT	2	6	1281304	1281309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153524
18867	NC_021014	T	6	6	1281317	1281322	0 %	100 %	0 %	0 %	479153524
18868	NC_021014	TCC	2	6	1281426	1281431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153524
18869	NC_021014	TA	3	6	1281446	1281451	50 %	50 %	0 %	0 %	479153524
18870	NC_021014	GGA	2	6	1281475	1281480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153524
18871	NC_021014	TGG	2	6	1281495	1281500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153524
18872	NC_021014	CTG	2	6	1281520	1281525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153524
18873	NC_021014	GA	3	6	1281606	1281611	50 %	0 %	50 %	0 %	479153524
18874	NC_021014	AGGC	2	8	1281617	1281624	25 %	0 %	50 %	25 %	479153524
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18877	NC_021014	GCAG	2	8	1281847	1281854	25 %	0 %	50 %	25 %	479153524
18878	NC_021014	GAA	2	6	1281893	1281898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153524
18879	NC_021014	GAA	2	6	1281960	1281965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153524
18880	NC_021014	GAA	2	6	1281986	1281991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153524
18881	NC_021014	T	6	6	1282167	1282172	0 %	100 %	0 %	0 %	479153525
18882	NC_021014	GTAGA	2	10	1282195	1282204	40 %	20 %	40 %	0 %	479153525
18883	NC_021014	GTAT	2	8	1282256	1282263	25 %	50 %	25 %	0 %	479153525
18884	NC_021014	GCA	2	6	1282314	1282319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153525
18885	NC_021014	AAC	2	6	1282624	1282629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153526
18886	NC_021014	GGAT	2	8	1282651	1282658	25 %	25 %	50 %	0 %	479153526
18887	NC_021014	CGG	2	6	1282714	1282719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153526
18888	NC_021014	CTG	2	6	1282771	1282776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153526
18889	NC_021014	CT	3	6	1282777	1282782	0 %	50 %	0 %	50 %	479153526
18890	NC_021014	CT	3	6	1282801	1282806	0 %	50 %	0 %	50 %	479153526
18891	NC_021014	GTT	2	6	1282814	1282819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153526
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18893	NC_021014	A	7	7	1282954	1282960	100 %	0 %	0 %	0 %	479153526
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18905	NC_021014	CATCAC	2	12	1283384	1283395	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	479153526
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18934	NC_021014	TGA	2	6	1285046	1285051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153528
18935	NC_021014	GCG	2	6	1285076	1285081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153528
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18938	NC_021014	GCGG	2	8	1285198	1285205	0 %	0 %	75 %	25 %	479153528
18939	NC_021014	ATC	2	6	1285225	1285230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153528
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18942	NC_021014	ATG	2	6	1285364	1285369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153528
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18947	NC_021014	ATC	2	6	1285611	1285616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153529
18948	NC_021014	GAT	2	6	1285628	1285633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153529
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18950	NC_021014	T	6	6	1285715	1285720	0 %	100 %	0 %	0 %	479153529
18951	NC_021014	TCT	2	6	1285741	1285746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153529
18952	NC_021014	GAA	2	6	1285790	1285795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153529
18953	NC_021014	GTT	2	6	1285802	1285807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153529
18954	NC_021014	CTT	2	6	1285865	1285870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153529
18955	NC_021014	GATC	2	8	1285891	1285898	25 %	25 %	25 %	25 %	479153529
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18957	NC_021014	GGA	2	6	1285982	1285987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153529
18958	NC_021014	GAT	2	6	1286042	1286047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153529
18959	NC_021014	ATT	2	6	1286169	1286174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153529
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18961	NC_021014	A	6	6	1286184	1286189	100 %	0 %	0 %	0 %	479153529
18962	NC_021014	TGAAC	2	10	1286206	1286215	40 %	20 %	20 %	20 %	479153529
18963	NC_021014	GGA	2	6	1286242	1286247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153529
18964	NC_021014	AG	3	6	1286273	1286278	50 %	0 %	50 %	0 %	479153529
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