MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_021014	CGC	2	6	1222922	1222927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479153461
18002	NC_021014	CAAC	2	8	1222942	1222949	50 %	0 %	0 %	50 %	479153461
18003	NC_021014	GA	3	6	1223041	1223046	50 %	0 %	50 %	0 %	479153461
18004	NC_021014	AC	3	6	1223052	1223057	50 %	0 %	0 %	50 %	479153461
18005	NC_021014	CGA	2	6	1223105	1223110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153461
18006	NC_021014	TG	3	6	1223133	1223138	0 %	50 %	50 %	0 %	479153461
18007	NC_021014	TATG	2	8	1223167	1223174	25 %	50 %	25 %	0 %	479153462
18008	NC_021014	ACT	2	6	1223190	1223195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153462
18009	NC_021014	TCC	2	6	1223240	1223245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153462
18010	NC_021014	AG	3	6	1223251	1223256	50 %	0 %	50 %	0 %	479153462
18011	NC_021014	AGG	2	6	1223295	1223300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153462
18012	NC_021014	GCA	2	6	1223433	1223438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153462
18013	NC_021014	T	6	6	1223441	1223446	0 %	100 %	0 %	0 %	479153462
18014	NC_021014	TAT	2	6	1223448	1223453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153462
18015	NC_021014	GGC	2	6	1223472	1223477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153462
18016	NC_021014	GCT	2	6	1223527	1223532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153462
18017	NC_021014	AAAG	2	8	1223550	1223557	75 %	0 %	25 %	0 %	479153462
18018	NC_021014	AGGTA	2	10	1223596	1223605	40 %	20 %	40 %	0 %	479153462
18019	NC_021014	GAA	2	6	1223615	1223620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153463
18020	NC_021014	GAA	2	6	1223736	1223741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153463
18021	NC_021014	CAT	2	6	1223750	1223755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153463
18022	NC_021014	AAGA	2	8	1223762	1223769	75 %	0 %	25 %	0 %	479153463
18023	NC_021014	ACG	2	6	1223835	1223840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153463
18024	NC_021014	A	6	6	1223907	1223912	100 %	0 %	0 %	0 %	479153463
18025	NC_021014	ATT	2	6	1223980	1223985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153463
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18027	NC_021014	TTTA	2	8	1224044	1224051	25 %	75 %	0 %	0 %	479153463
18028	NC_021014	A	7	7	1224407	1224413	100 %	0 %	0 %	0 %	479153464
18029	NC_021014	GAAAT	2	10	1224432	1224441	60 %	20 %	20 %	0 %	479153464
18030	NC_021014	GCA	2	6	1224457	1224462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153464
18031	NC_021014	GGC	2	6	1224507	1224512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153464
18032	NC_021014	CAG	2	6	1224574	1224579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153464
18033	NC_021014	AGC	2	6	1224600	1224605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153464
18034	NC_021014	TCC	2	6	1224624	1224629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153464
18035	NC_021014	GGC	2	6	1224710	1224715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153464
18036	NC_021014	AGG	2	6	1224794	1224799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153464
18037	NC_021014	TTG	3	9	1224916	1224924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153465
18038	NC_021014	AAGTG	2	10	1225001	1225010	40 %	20 %	40 %	0 %	479153465
18039	NC_021014	CGG	2	6	1225013	1225018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153465
18040	NC_021014	GGA	2	6	1225040	1225045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153465
18041	NC_021014	GAA	2	6	1225112	1225117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153466
18042	NC_021014	AG	3	6	1225156	1225161	50 %	0 %	50 %	0 %	479153466
18043	NC_021014	GAC	2	6	1225211	1225216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153466
18044	NC_021014	CAG	2	6	1225275	1225280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153466
18045	NC_021014	CAG	2	6	1225294	1225299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153466
18046	NC_021014	GAC	2	6	1225328	1225333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153466
18047	NC_021014	GGA	2	6	1225348	1225353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153466
18048	NC_021014	GAT	2	6	1225403	1225408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153466
18049	NC_021014	CAG	2	6	1225523	1225528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153466
18050	NC_021014	CA	3	6	1225531	1225536	50 %	0 %	0 %	50 %	479153466
18051	NC_021014	CAA	2	6	1225603	1225608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153466
18052	NC_021014	ATGG	2	8	1225708	1225715	25 %	25 %	50 %	0 %	479153466
18053	NC_021014	GCA	2	6	1225719	1225724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153466
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18055	NC_021014	GCT	2	6	1225834	1225839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153466
18056	NC_021014	TGA	2	6	1225843	1225848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153466
18057	NC_021014	GCC	2	6	1225865	1225870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479153466
18058	NC_021014	CCCA	2	8	1225938	1225945	25 %	0 %	0 %	75 %	479153466
18059	NC_021014	GAAA	2	8	1225948	1225955	75 %	0 %	25 %	0 %	479153466
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18068	NC_021014	GAAA	2	8	1226200	1226207	75 %	0 %	25 %	0 %	479153467
18069	NC_021014	GAG	2	6	1226229	1226234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153467
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18083	NC_021014	GCA	2	6	1226882	1226887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153468
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18085	NC_021014	ATC	2	6	1226933	1226938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153468
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18088	NC_021014	CA	3	6	1226963	1226968	50 %	0 %	0 %	50 %	479153468
18089	NC_021014	AGG	2	6	1227000	1227005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153468
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18117	NC_021014	AAGA	2	8	1228485	1228492	75 %	0 %	25 %	0 %	479153470
18118	NC_021014	CAA	2	6	1228511	1228516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153470
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18122	NC_021014	GGA	2	6	1228748	1228753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153470
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18127	NC_021014	GGATAT	2	12	1234204	1234215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153472
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18130	NC_021014	TGC	2	6	1234257	1234262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153472
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18145	NC_021014	TG	3	6	1236304	1236309	0 %	50 %	50 %	0 %	479153473
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18233	NC_021014	GTG	2	6	1242223	1242228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153481
18234	NC_021014	AT	3	6	1242238	1242243	50 %	50 %	0 %	0 %	479153481
18235	NC_021014	TGCG	2	8	1242291	1242298	0 %	25 %	50 %	25 %	479153481
18236	NC_021014	TAT	2	6	1242379	1242384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153481
18237	NC_021014	AGAT	2	8	1242455	1242462	50 %	25 %	25 %	0 %	479153481
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18349	NC_021014	GGGC	2	8	1248134	1248141	0 %	0 %	75 %	25 %	479153492
18350	NC_021014	GGC	2	6	1248166	1248171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153492
18351	NC_021014	GAT	2	6	1248222	1248227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153492
18352	NC_021014	GCAG	2	8	1248285	1248292	25 %	0 %	50 %	25 %	479153492
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18354	NC_021014	GAC	2	6	1248433	1248438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153492
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18462	NC_021014	TGA	2	6	1255302	1255307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153502
18463	NC_021014	AG	3	6	1255326	1255331	50 %	0 %	50 %	0 %	479153502
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18465	NC_021014	A	6	6	1255442	1255447	100 %	0 %	0 %	0 %	479153502
18466	NC_021014	TAT	2	6	1255457	1255462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153502
18467	NC_021014	ATT	2	6	1255507	1255512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153502
18468	NC_021014	T	6	6	1255511	1255516	0 %	100 %	0 %	0 %	479153502
18469	NC_021014	ATG	2	6	1255613	1255618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153502
18470	NC_021014	AATT	2	8	1255719	1255726	50 %	50 %	0 %	0 %	479153502
18471	NC_021014	GCT	2	6	1255741	1255746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153502
18472	NC_021014	A	6	6	1255758	1255763	100 %	0 %	0 %	0 %	479153502
18473	NC_021014	ATGA	2	8	1255819	1255826	50 %	25 %	25 %	0 %	479153502
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