MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_021014	AGATA	2	10	1152249	1152258	60 %	20 %	20 %	0 %	479153387
17002	NC_021014	CAA	2	6	1152345	1152350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153387
17003	NC_021014	GAC	2	6	1152424	1152429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153387
17004	NC_021014	GCG	2	6	1152434	1152439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153387
17005	NC_021014	TCT	2	6	1152459	1152464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153387
17006	NC_021014	GCGG	2	8	1152543	1152550	0 %	0 %	75 %	25 %	479153387
17007	NC_021014	AAAG	2	8	1152619	1152626	75 %	0 %	25 %	0 %	479153387
17008	NC_021014	GCT	2	6	1152636	1152641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153387
17009	NC_021014	A	6	6	1152649	1152654	100 %	0 %	0 %	0 %	479153387
17010	NC_021014	CAG	2	6	1152714	1152719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153387
17011	NC_021014	GGA	2	6	1152738	1152743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153387
17012	NC_021014	ACT	2	6	1152802	1152807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153387
17013	NC_021014	GCA	2	6	1152942	1152947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153387
17014	NC_021014	AAGT	2	8	1152955	1152962	50 %	25 %	25 %	0 %	479153387
17015	NC_021014	CA	3	6	1153415	1153420	50 %	0 %	0 %	50 %	479153388
17016	NC_021014	CAG	2	6	1153450	1153455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153388
17017	NC_021014	GAA	2	6	1153536	1153541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153388
17018	NC_021014	GGA	2	6	1153593	1153598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153388
17019	NC_021014	AGAA	2	8	1153630	1153637	75 %	0 %	25 %	0 %	479153388
17020	NC_021014	AACC	2	8	1153658	1153665	50 %	0 %	0 %	50 %	479153388
17021	NC_021014	ATG	2	6	1153686	1153691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153388
17022	NC_021014	GAT	2	6	1153734	1153739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153388
17023	NC_021014	AGA	2	6	1153745	1153750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153388
17024	NC_021014	GAAA	2	8	1153777	1153784	75 %	0 %	25 %	0 %	479153388
17025	NC_021014	A	7	7	1153795	1153801	100 %	0 %	0 %	0 %	479153388
17026	NC_021014	GAA	2	6	1153806	1153811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153388
17027	NC_021014	TGC	2	6	1153856	1153861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153388
17028	NC_021014	A	7	7	1153871	1153877	100 %	0 %	0 %	0 %	479153388
17029	NC_021014	A	6	6	1153887	1153892	100 %	0 %	0 %	0 %	479153388
17030	NC_021014	AGA	2	6	1154053	1154058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153388
17031	NC_021014	CAG	2	6	1154319	1154324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153388
17032	NC_021014	TGG	2	6	1154338	1154343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153388
17033	NC_021014	GCA	2	6	1154366	1154371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153388
17034	NC_021014	ATG	2	6	1154380	1154385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153388
17035	NC_021014	TGAC	2	8	1154420	1154427	25 %	25 %	25 %	25 %	479153388
17036	NC_021014	A	7	7	1154470	1154476	100 %	0 %	0 %	0 %	479153389
17037	NC_021014	CGG	2	6	1154520	1154525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153389
17038	NC_021014	ATC	2	6	1154617	1154622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153389
17039	NC_021014	CAT	2	6	1154721	1154726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153389
17040	NC_021014	GGC	2	6	1154850	1154855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153389
17041	NC_021014	GAAAA	2	10	1154861	1154870	80 %	0 %	20 %	0 %	479153389
17042	NC_021014	GCG	2	6	1155019	1155024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153390
17043	NC_021014	CTT	2	6	1155027	1155032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153390
17044	NC_021014	TGA	2	6	1155055	1155060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153390
17045	NC_021014	GCA	2	6	1155114	1155119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153390
17046	NC_021014	ATGA	2	8	1155183	1155190	50 %	25 %	25 %	0 %	479153390
17047	NC_021014	GCG	2	6	1155210	1155215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153390
17048	NC_021014	AG	3	6	1155217	1155222	50 %	0 %	50 %	0 %	479153390
17049	NC_021014	CGGT	2	8	1155235	1155242	0 %	25 %	50 %	25 %	479153390
17050	NC_021014	TGA	2	6	1155260	1155265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153390
17051	NC_021014	AGA	2	6	1155266	1155271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153390
17052	NC_021014	GGA	2	6	1155272	1155277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153390
17053	NC_021014	CAG	2	6	1155312	1155317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153391
17054	NC_021014	GAAA	2	8	1155320	1155327	75 %	0 %	25 %	0 %	479153391
17055	NC_021014	A	6	6	1155461	1155466	100 %	0 %	0 %	0 %	479153391
17056	NC_021014	AAG	2	6	1155478	1155483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153391
17057	NC_021014	TCA	2	6	1155522	1155527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153391
17058	NC_021014	GAA	2	6	1155550	1155555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153391
17059	NC_021014	CTT	2	6	1155734	1155739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153391
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17062	NC_021014	GACT	2	8	1156005	1156012	25 %	25 %	25 %	25 %	479153391
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17067	NC_021014	TGG	2	6	1156324	1156329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153392
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17083	NC_021014	ACT	2	6	1157344	1157349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153392
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17088	NC_021014	A	7	7	1157687	1157693	100 %	0 %	0 %	0 %	479153392
17089	NC_021014	TAT	3	9	1157707	1157715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153392
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17099	NC_021014	GCTTT	2	10	1159513	1159522	0 %	60 %	20 %	20 %	479153393
17100	NC_021014	GCTG	2	8	1159540	1159547	0 %	25 %	50 %	25 %	479153393
17101	NC_021014	GCT	2	6	1159552	1159557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153393
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17107	NC_021014	GTT	3	9	1159667	1159675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153393
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17234	NC_021014	AGA	2	6	1168458	1168463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153400
17235	NC_021014	GGA	2	6	1168485	1168490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153400
17236	NC_021014	GGA	2	6	1168520	1168525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153400
17237	NC_021014	TCG	2	6	1168578	1168583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153400
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17263	NC_021014	AAT	2	6	1169542	1169547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153401
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17338	NC_021014	CGT	2	6	1174695	1174700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153405
17339	NC_021014	CTG	2	6	1174765	1174770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153405
17340	NC_021014	CAGC	2	8	1174782	1174789	25 %	0 %	25 %	50 %	479153405
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17343	NC_021014	T	6	6	1175198	1175203	0 %	100 %	0 %	0 %	479153405
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17345	NC_021014	TTTC	2	8	1175288	1175295	0 %	75 %	0 %	25 %	479153406
17346	NC_021014	TCA	2	6	1175336	1175341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153406
17347	NC_021014	GAT	2	6	1175383	1175388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153406
17348	NC_021014	TCC	2	6	1175405	1175410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153406
17349	NC_021014	GGCAC	2	10	1175446	1175455	20 %	0 %	40 %	40 %	479153406
17350	NC_021014	CAT	2	6	1175482	1175487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153406
17351	NC_021014	TCC	2	6	1175519	1175524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153406
17352	NC_021014	CTG	2	6	1175539	1175544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153406
17353	NC_021014	ATC	2	6	1175593	1175598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153406
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17358	NC_021014	TG	3	6	1175840	1175845	0 %	50 %	50 %	0 %	479153406
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17364	NC_021014	CAT	2	6	1176184	1176189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153406
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17371	NC_021014	AG	3	6	1176716	1176721	50 %	0 %	50 %	0 %	479153406
17372	NC_021014	AT	3	6	1176743	1176748	50 %	50 %	0 %	0 %	479153406
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17457	NC_021014	TTTC	2	8	1185271	1185278	0 %	75 %	0 %	25 %	479153414
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17461	NC_021014	TAG	2	6	1185407	1185412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153414
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17467	NC_021014	TTC	2	6	1185565	1185570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153414
17468	NC_021014	GT	3	6	1185575	1185580	0 %	50 %	50 %	0 %	479153414
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