MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_021014	GCA	2	6	1086108	1086113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153327
16002	NC_021014	TCA	2	6	1086141	1086146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153327
16003	NC_021014	CGC	2	6	1086342	1086347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479153328
16004	NC_021014	GAG	2	6	1086373	1086378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153328
16005	NC_021014	GCC	2	6	1086418	1086423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479153328
16006	NC_021014	CCA	2	6	1086431	1086436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153328
16007	NC_021014	CTTA	2	8	1086580	1086587	25 %	50 %	0 %	25 %	479153328
16008	NC_021014	ATC	2	6	1086649	1086654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153328
16009	NC_021014	AG	3	6	1086734	1086739	50 %	0 %	50 %	0 %	479153328
16010	NC_021014	TGCACT	2	12	1086753	1086764	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479153328
16011	NC_021014	CAT	2	6	1086795	1086800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153328
16012	NC_021014	ATC	2	6	1086929	1086934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153328
16013	NC_021014	ATC	2	6	1086940	1086945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153328
16014	NC_021014	TCA	2	6	1087112	1087117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153328
16015	NC_021014	CGA	2	6	1087119	1087124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153328
16016	NC_021014	TGA	2	6	1087242	1087247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153328
16017	NC_021014	GGCT	2	8	1087261	1087268	0 %	25 %	50 %	25 %	479153328
16018	NC_021014	TCA	2	6	1087277	1087282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153328
16019	NC_021014	CAAC	2	8	1087283	1087290	50 %	0 %	0 %	50 %	479153328
16020	NC_021014	CTT	2	6	1087312	1087317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153328
16021	NC_021014	ATC	2	6	1087366	1087371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153328
16022	NC_021014	ATC	2	6	1087375	1087380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153328
16023	NC_021014	ATG	2	6	1087385	1087390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153328
16024	NC_021014	GTTC	2	8	1087405	1087412	0 %	50 %	25 %	25 %	479153328
16025	NC_021014	A	6	6	1087441	1087446	100 %	0 %	0 %	0 %	479153328
16026	NC_021014	TAA	2	6	1087459	1087464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153328
16027	NC_021014	TG	3	6	1087501	1087506	0 %	50 %	50 %	0 %	479153329
16028	NC_021014	AAAG	2	8	1087510	1087517	75 %	0 %	25 %	0 %	479153329
16029	NC_021014	CAG	2	6	1087527	1087532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153329
16030	NC_021014	CTT	2	6	1087561	1087566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153329
16031	NC_021014	A	6	6	1087642	1087647	100 %	0 %	0 %	0 %	479153329
16032	NC_021014	TTC	2	6	1087664	1087669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153329
16033	NC_021014	CT	3	6	1087676	1087681	0 %	50 %	0 %	50 %	479153329
16034	NC_021014	GATC	2	8	1087687	1087694	25 %	25 %	25 %	25 %	479153329
16035	NC_021014	TCT	2	6	1087786	1087791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153329
16036	NC_021014	TCCA	2	8	1087940	1087947	25 %	25 %	0 %	50 %	479153329
16037	NC_021014	TCT	2	6	1087989	1087994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153329
16038	NC_021014	TGG	2	6	1088014	1088019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153329
16039	NC_021014	TG	3	6	1088020	1088025	0 %	50 %	50 %	0 %	479153329
16040	NC_021014	AGC	2	6	1088066	1088071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153329
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16042	NC_021014	CTC	2	6	1088161	1088166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153329
16043	NC_021014	TTC	2	6	1088241	1088246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153329
16044	NC_021014	CATT	2	8	1088254	1088261	25 %	50 %	0 %	25 %	479153329
16045	NC_021014	TG	3	6	1088727	1088732	0 %	50 %	50 %	0 %	479153330
16046	NC_021014	TTC	2	6	1088769	1088774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153330
16047	NC_021014	GAA	2	6	1088833	1088838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153330
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16049	NC_021014	CAT	2	6	1088855	1088860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153330
16050	NC_021014	CAA	2	6	1088881	1088886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153330
16051	NC_021014	TGC	2	6	1088891	1088896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153330
16052	NC_021014	TGA	2	6	1088926	1088931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153330
16053	NC_021014	AGC	2	6	1088982	1088987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153330
16054	NC_021014	TCA	2	6	1089057	1089062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153330
16055	NC_021014	ATTCCA	2	12	1089081	1089092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153330
16056	NC_021014	CTCC	2	8	1089103	1089110	0 %	25 %	0 %	75 %	479153330
16057	NC_021014	TTC	2	6	1089128	1089133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153330
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16061	NC_021014	GTAC	2	8	1089309	1089316	25 %	25 %	25 %	25 %	479153330
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16083	NC_021014	TA	3	6	1090734	1090739	50 %	50 %	0 %	0 %	479153332
16084	NC_021014	A	6	6	1090753	1090758	100 %	0 %	0 %	0 %	479153332
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16116	NC_021014	T	7	7	1092425	1092431	0 %	100 %	0 %	0 %	479153334
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16235	NC_021014	TGC	2	6	1101794	1101799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153341
16236	NC_021014	AGA	2	6	1101804	1101809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153341
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16337	NC_021014	CT	4	8	1106534	1106541	0 %	50 %	0 %	50 %	479153344
16338	NC_021014	GGA	2	6	1106569	1106574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153344
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16340	NC_021014	TCCG	2	8	1106615	1106622	0 %	25 %	25 %	50 %	479153344
16341	NC_021014	GA	3	6	1106650	1106655	50 %	0 %	50 %	0 %	479153344
16342	NC_021014	ATC	2	6	1106675	1106680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153344
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16344	NC_021014	GAG	2	6	1106708	1106713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153344
16345	NC_021014	GAA	2	6	1106905	1106910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153344
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16348	NC_021014	A	6	6	1106980	1106985	100 %	0 %	0 %	0 %	479153344
16349	NC_021014	GGA	2	6	1107007	1107012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153344
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16468	NC_021014	TCT	2	6	1116016	1116021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153353
16469	NC_021014	ATC	2	6	1116023	1116028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153353
16470	NC_021014	GCA	2	6	1116065	1116070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153353
16471	NC_021014	TGT	2	6	1116097	1116102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153353
16472	NC_021014	TGA	2	6	1116231	1116236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153353
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16475	NC_021014	GCA	2	6	1116335	1116340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153353
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16492	NC_021014	A	6	6	1117015	1117020	100 %	0 %	0 %	0 %	479153354
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16497	NC_021014	A	6	6	1117303	1117308	100 %	0 %	0 %	0 %	479153354
16498	NC_021014	TTAC	2	8	1117321	1117328	25 %	50 %	0 %	25 %	479153354
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