MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_021014	CTG	2	6	1053584	1053589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153295
15502	NC_021014	TCCA	2	8	1053635	1053642	25 %	25 %	0 %	50 %	479153295
15503	NC_021014	ATTT	2	8	1053653	1053660	25 %	75 %	0 %	0 %	479153295
15504	NC_021014	TTA	2	6	1053661	1053666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153295
15505	NC_021014	T	6	6	1053762	1053767	0 %	100 %	0 %	0 %	479153295
15506	NC_021014	AT	3	6	1053850	1053855	50 %	50 %	0 %	0 %	479153296
15507	NC_021014	T	6	6	1053861	1053866	0 %	100 %	0 %	0 %	479153296
15508	NC_021014	T	6	6	1053896	1053901	0 %	100 %	0 %	0 %	479153296
15509	NC_021014	TCT	2	6	1053931	1053936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153296
15510	NC_021014	T	6	6	1053983	1053988	0 %	100 %	0 %	0 %	479153296
15511	NC_021014	ATA	2	6	1054094	1054099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153297
15512	NC_021014	T	6	6	1054135	1054140	0 %	100 %	0 %	0 %	479153297
15513	NC_021014	GTA	2	6	1054150	1054155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153297
15514	NC_021014	ATA	2	6	1054156	1054161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153297
15515	NC_021014	T	6	6	1054174	1054179	0 %	100 %	0 %	0 %	479153297
15516	NC_021014	GCT	2	6	1054196	1054201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153297
15517	NC_021014	GTT	2	6	1054208	1054213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153297
15518	NC_021014	TGT	2	6	1054222	1054227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153297
15519	NC_021014	GCC	2	6	1054229	1054234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479153297
15520	NC_021014	CA	3	6	1054239	1054244	50 %	0 %	0 %	50 %	479153297
15521	NC_021014	TCT	2	6	1054300	1054305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153297
15522	NC_021014	T	7	7	1054305	1054311	0 %	100 %	0 %	0 %	479153297
15523	NC_021014	T	6	6	1054464	1054469	0 %	100 %	0 %	0 %	479153298
15524	NC_021014	TTC	2	6	1054476	1054481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153298
15525	NC_021014	CTG	2	6	1054505	1054510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153298
15526	NC_021014	CGC	2	6	1054529	1054534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479153298
15527	NC_021014	A	6	6	1054584	1054589	100 %	0 %	0 %	0 %	479153298
15528	NC_021014	A	7	7	1054597	1054603	100 %	0 %	0 %	0 %	479153298
15529	NC_021014	CTG	2	6	1054610	1054615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153298
15530	NC_021014	ATG	2	6	1054657	1054662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153299
15531	NC_021014	AC	3	6	1054665	1054670	50 %	0 %	0 %	50 %	479153299
15532	NC_021014	TCT	2	6	1054697	1054702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153299
15533	NC_021014	TTC	2	6	1054731	1054736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153299
15534	NC_021014	CCA	2	6	1054772	1054777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153299
15535	NC_021014	GCT	2	6	1054778	1054783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153299
15536	NC_021014	GGAT	2	8	1054784	1054791	25 %	25 %	50 %	0 %	479153299
15537	NC_021014	TCC	2	6	1054861	1054866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153299
15538	NC_021014	CTG	2	6	1054869	1054874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153299
15539	NC_021014	CCCG	2	8	1054912	1054919	0 %	0 %	25 %	75 %	479153299
15540	NC_021014	GGAC	2	8	1054932	1054939	25 %	0 %	50 %	25 %	479153299
15541	NC_021014	ATTT	2	8	1054964	1054971	25 %	75 %	0 %	0 %	479153299
15542	NC_021014	CAC	2	6	1055022	1055027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153299
15543	NC_021014	ATA	3	9	1055172	1055180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153299
15544	NC_021014	GCC	2	6	1055344	1055349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479153299
15545	NC_021014	TCT	2	6	1055432	1055437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153299
15546	NC_021014	TGT	2	6	1055667	1055672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153299
15547	NC_021014	TGG	2	6	1055687	1055692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153299
15548	NC_021014	GCTG	2	8	1055696	1055703	0 %	25 %	50 %	25 %	479153299
15549	NC_021014	CAT	2	6	1055732	1055737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153299
15550	NC_021014	CTT	2	6	1055789	1055794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153299
15551	NC_021014	CTT	2	6	1055888	1055893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153299
15552	NC_021014	GGT	2	6	1055916	1055921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153299
15553	NC_021014	CCCG	2	8	1056075	1056082	0 %	0 %	25 %	75 %	479153299
15554	NC_021014	GAT	2	6	1056300	1056305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153300
15555	NC_021014	GAG	2	6	1056319	1056324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153300
15556	NC_021014	TGA	2	6	1056369	1056374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153300
15557	NC_021014	CGG	2	6	1056470	1056475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153300
15558	NC_021014	GAT	2	6	1056495	1056500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153300
15559	NC_021014	GTACG	2	10	1056589	1056598	20 %	20 %	40 %	20 %	479153300
15560	NC_021014	CAC	2	6	1056621	1056626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153300
15561	NC_021014	CATG	2	8	1056648	1056655	25 %	25 %	25 %	25 %	479153300
15562	NC_021014	GAA	2	6	1056687	1056692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153300
15563	NC_021014	ACC	2	6	1056706	1056711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153300
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15565	NC_021014	CTT	2	6	1056895	1056900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153300
15566	NC_021014	TCT	2	6	1056933	1056938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153300
15567	NC_021014	CTG	2	6	1056942	1056947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153300
15568	NC_021014	CAT	2	6	1056988	1056993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153300
15569	NC_021014	TGA	2	6	1057050	1057055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153300
15570	NC_021014	CAG	2	6	1057073	1057078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153300
15571	NC_021014	ATA	2	6	1057142	1057147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153300
15572	NC_021014	TCA	2	6	1057181	1057186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153300
15573	NC_021014	AC	3	6	1057400	1057405	50 %	0 %	0 %	50 %	479153300
15574	NC_021014	GAT	2	6	1057549	1057554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153300
15575	NC_021014	CGC	2	6	1057653	1057658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479153300
15576	NC_021014	TGC	2	6	1057690	1057695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153300
15577	NC_021014	AAG	2	6	1057696	1057701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153300
15578	NC_021014	TC	3	6	1057766	1057771	0 %	50 %	0 %	50 %	479153300
15579	NC_021014	GCT	2	6	1057773	1057778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153300
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15583	NC_021014	T	7	7	1057913	1057919	0 %	100 %	0 %	0 %	479153300
15584	NC_021014	TTC	2	6	1057938	1057943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153300
15585	NC_021014	ATAC	2	8	1058039	1058046	50 %	25 %	0 %	25 %	479153301
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15587	NC_021014	T	6	6	1058188	1058193	0 %	100 %	0 %	0 %	479153301
15588	NC_021014	TGA	2	6	1058241	1058246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153301
15589	NC_021014	TTC	2	6	1058308	1058313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153301
15590	NC_021014	TC	3	6	1058356	1058361	0 %	50 %	0 %	50 %	479153301
15591	NC_021014	GAA	2	6	1058440	1058445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153301
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15594	NC_021014	CTT	2	6	1058518	1058523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153301
15595	NC_021014	AATCAA	2	12	1058529	1058540	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479153301
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15599	NC_021014	GCA	2	6	1058609	1058614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153301
15600	NC_021014	ACC	3	9	1058626	1058634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153301
15601	NC_021014	CAC	2	6	1058922	1058927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153301
15602	NC_021014	AAG	2	6	1058998	1059003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153301
15603	NC_021014	GCAC	2	8	1059065	1059072	25 %	0 %	25 %	50 %	479153301
15604	NC_021014	TCT	2	6	1059086	1059091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153301
15605	NC_021014	ATC	2	6	1059128	1059133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153301
15606	NC_021014	CCAT	2	8	1059161	1059168	25 %	25 %	0 %	50 %	479153301
15607	NC_021014	TCA	2	6	1059188	1059193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153301
15608	NC_021014	TAC	2	6	1059202	1059207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153301
15609	NC_021014	TCG	2	6	1059305	1059310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153301
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15611	NC_021014	AT	3	6	1059374	1059379	50 %	50 %	0 %	0 %	479153301
15612	NC_021014	TCA	2	6	1059380	1059385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153301
15613	NC_021014	CTG	2	6	1059433	1059438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153301
15614	NC_021014	TCA	2	6	1059476	1059481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153301
15615	NC_021014	TCT	2	6	1059528	1059533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153301
15616	NC_021014	GTC	2	6	1059550	1059555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153301
15617	NC_021014	TTC	2	6	1059715	1059720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153301
15618	NC_021014	TCT	2	6	1059726	1059731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153301
15619	NC_021014	TTC	2	6	1059797	1059802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153301
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15723	NC_021014	TTC	2	6	1066190	1066195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153309
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15999	NC_021014	GTCT	2	8	1086063	1086070	0 %	50 %	25 %	25 %	479153327
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