MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_021014	AAT	2	6	984189	984194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153239
14502	NC_021014	CT	3	6	984230	984235	0 %	50 %	0 %	50 %	479153239
14503	NC_021014	GCC	2	6	986252	986257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479153240
14504	NC_021014	ATAC	2	8	986291	986298	50 %	25 %	0 %	25 %	479153240
14505	NC_021014	ACT	2	6	986357	986362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153240
14506	NC_021014	TCT	2	6	986372	986377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153240
14507	NC_021014	ATC	2	6	986392	986397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153240
14508	NC_021014	TCC	2	6	986411	986416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153240
14509	NC_021014	TTCC	2	8	986466	986473	0 %	50 %	0 %	50 %	479153240
14510	NC_021014	T	6	6	986487	986492	0 %	100 %	0 %	0 %	479153240
14511	NC_021014	A	6	6	986497	986502	100 %	0 %	0 %	0 %	479153240
14512	NC_021014	CGG	2	6	986549	986554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153240
14513	NC_021014	TGC	2	6	986565	986570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153240
14514	NC_021014	CAG	2	6	986581	986586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153240
14515	NC_021014	CATC	2	8	986592	986599	25 %	25 %	0 %	50 %	479153240
14516	NC_021014	GCC	2	6	986606	986611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479153240
14517	NC_021014	TAG	2	6	986637	986642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153240
14518	NC_021014	GCCG	2	8	986711	986718	0 %	0 %	50 %	50 %	479153240
14519	NC_021014	ACG	2	6	986812	986817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153240
14520	NC_021014	CCA	2	6	986856	986861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153240
14521	NC_021014	CT	3	6	986895	986900	0 %	50 %	0 %	50 %	479153240
14522	NC_021014	TCCA	2	8	987181	987188	25 %	25 %	0 %	50 %	479153241
14523	NC_021014	CCG	2	6	987250	987255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479153241
14524	NC_021014	CTT	2	6	987287	987292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153241
14525	NC_021014	GT	3	6	987342	987347	0 %	50 %	50 %	0 %	479153241
14526	NC_021014	T	6	6	987375	987380	0 %	100 %	0 %	0 %	479153241
14527	NC_021014	GCATA	2	10	987412	987421	40 %	20 %	20 %	20 %	479153241
14528	NC_021014	CAC	2	6	987548	987553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153241
14529	NC_021014	CAC	2	6	987584	987589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153241
14530	NC_021014	T	6	6	987609	987614	0 %	100 %	0 %	0 %	479153241
14531	NC_021014	AGA	2	6	987670	987675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153241
14532	NC_021014	GTC	2	6	987729	987734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153241
14533	NC_021014	AAT	2	6	987845	987850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153241
14534	NC_021014	CTG	3	9	987908	987916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153241
14535	NC_021014	T	6	6	987921	987926	0 %	100 %	0 %	0 %	479153241
14536	NC_021014	ATA	2	6	987973	987978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153241
14537	NC_021014	CTT	2	6	988298	988303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153242
14538	NC_021014	GTA	2	6	988377	988382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153242
14539	NC_021014	TTGT	2	8	988390	988397	0 %	75 %	25 %	0 %	479153242
14540	NC_021014	AGATC	2	10	988426	988435	40 %	20 %	20 %	20 %	479153242
14541	NC_021014	TC	3	6	988439	988444	0 %	50 %	0 %	50 %	479153242
14542	NC_021014	CCA	2	6	988460	988465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153242
14543	NC_021014	CT	3	6	988625	988630	0 %	50 %	0 %	50 %	479153242
14544	NC_021014	AAC	2	6	988701	988706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153242
14545	NC_021014	AAG	2	6	988781	988786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153242
14546	NC_021014	GTCT	2	8	988837	988844	0 %	50 %	25 %	25 %	479153242
14547	NC_021014	TC	4	8	988862	988869	0 %	50 %	0 %	50 %	479153242
14548	NC_021014	GAC	2	6	988898	988903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153242
14549	NC_021014	CTG	2	6	988956	988961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153242
14550	NC_021014	AGA	2	6	988972	988977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153242
14551	NC_021014	CTT	2	6	989007	989012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153242
14552	NC_021014	AGA	2	6	989068	989073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153242
14553	NC_021014	AGA	2	6	989083	989088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153242
14554	NC_021014	TCT	2	6	989113	989118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153242
14555	NC_021014	GCA	2	6	989392	989397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153242
14556	NC_021014	TGA	2	6	989567	989572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153242
14557	NC_021014	TCA	2	6	989609	989614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153242
14558	NC_021014	TCA	2	6	989627	989632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153242
14559	NC_021014	ATA	2	6	989701	989706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153242
14560	NC_021014	AGAA	2	8	989742	989749	75 %	0 %	25 %	0 %	479153242
14561	NC_021014	AAGA	2	8	989780	989787	75 %	0 %	25 %	0 %	479153242
14562	NC_021014	CCAG	2	8	989796	989803	25 %	0 %	25 %	50 %	479153242
14563	NC_021014	ATG	2	6	989830	989835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153242
14564	NC_021014	GTTTCA	2	12	989849	989860	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479153242
14565	NC_021014	GTC	2	6	989896	989901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153242
14566	NC_021014	AGA	2	6	989904	989909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153242
14567	NC_021014	TTA	2	6	989995	990000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153242
14568	NC_021014	CAAA	2	8	990041	990048	75 %	0 %	0 %	25 %	479153242
14569	NC_021014	AAT	2	6	990049	990054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153242
14570	NC_021014	CA	3	6	990062	990067	50 %	0 %	0 %	50 %	479153242
14571	NC_021014	AAGAT	2	10	990071	990080	60 %	20 %	20 %	0 %	479153242
14572	NC_021014	A	6	6	990086	990091	100 %	0 %	0 %	0 %	479153242
14573	NC_021014	ATC	2	6	990375	990380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153243
14574	NC_021014	GTT	2	6	990406	990411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153243
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14576	NC_021014	T	7	7	990422	990428	0 %	100 %	0 %	0 %	479153243
14577	NC_021014	GAT	2	6	990467	990472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153243
14578	NC_021014	AAT	2	6	990542	990547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153243
14579	NC_021014	A	7	7	990683	990689	100 %	0 %	0 %	0 %	479153243
14580	NC_021014	TGT	2	6	990749	990754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153243
14581	NC_021014	CTG	2	6	990758	990763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153243
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14583	NC_021014	TA	3	6	990872	990877	50 %	50 %	0 %	0 %	479153243
14584	NC_021014	GCT	2	6	990917	990922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153243
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14586	NC_021014	AAT	2	6	990973	990978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153243
14587	NC_021014	GTTC	2	8	990994	991001	0 %	50 %	25 %	25 %	479153243
14588	NC_021014	TCA	2	6	991092	991097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153243
14589	NC_021014	TCTGA	2	10	991147	991156	20 %	40 %	20 %	20 %	479153243
14590	NC_021014	GAAA	2	8	991262	991269	75 %	0 %	25 %	0 %	479153243
14591	NC_021014	GCT	2	6	991300	991305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153243
14592	NC_021014	TA	3	6	991358	991363	50 %	50 %	0 %	0 %	479153243
14593	NC_021014	AT	3	6	991418	991423	50 %	50 %	0 %	0 %	479153243
14594	NC_021014	TTTG	2	8	991445	991452	0 %	75 %	25 %	0 %	479153243
14595	NC_021014	TG	4	8	991504	991511	0 %	50 %	50 %	0 %	479153243
14596	NC_021014	TCT	2	6	991639	991644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153243
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14598	NC_021014	AT	3	6	991777	991782	50 %	50 %	0 %	0 %	479153244
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14601	NC_021014	TCT	2	6	991938	991943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153244
14602	NC_021014	GAA	2	6	992041	992046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153244
14603	NC_021014	TGCA	2	8	992051	992058	25 %	25 %	25 %	25 %	479153244
14604	NC_021014	CAC	2	6	992187	992192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153244
14605	NC_021014	TTC	2	6	992197	992202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153244
14606	NC_021014	AT	3	6	992203	992208	50 %	50 %	0 %	0 %	479153244
14607	NC_021014	T	6	6	992583	992588	0 %	100 %	0 %	0 %	479153245
14608	NC_021014	GTA	2	6	992656	992661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153245
14609	NC_021014	T	6	6	992829	992834	0 %	100 %	0 %	0 %	479153245
14610	NC_021014	GCA	2	6	992918	992923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153245
14611	NC_021014	AAAG	2	8	993007	993014	75 %	0 %	25 %	0 %	479153245
14612	NC_021014	CTT	2	6	993129	993134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153245
14613	NC_021014	TG	3	6	993194	993199	0 %	50 %	50 %	0 %	479153245
14614	NC_021014	GTA	2	6	993212	993217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153245
14615	NC_021014	TCCGG	2	10	993230	993239	0 %	20 %	40 %	40 %	479153245
14616	NC_021014	TGC	2	6	993340	993345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153245
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14618	NC_021014	GACT	2	8	993368	993375	25 %	25 %	25 %	25 %	479153245
14619	NC_021014	GAT	2	6	993376	993381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153245
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14621	NC_021014	TGC	2	6	993484	993489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153245
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14976	NC_021014	AGC	2	6	1016032	1016037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153263
14977	NC_021014	AAG	2	6	1016364	1016369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153264
14978	NC_021014	CTT	2	6	1016388	1016393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153264
14979	NC_021014	CAT	2	6	1016433	1016438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153264
14980	NC_021014	TG	4	8	1016477	1016484	0 %	50 %	50 %	0 %	479153264
14981	NC_021014	ATC	2	6	1016485	1016490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153264
14982	NC_021014	TTC	2	6	1016508	1016513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153264
14983	NC_021014	CAG	2	6	1016546	1016551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153264
14984	NC_021014	AGA	2	6	1016584	1016589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153264
14985	NC_021014	CGG	2	6	1016598	1016603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153264
14986	NC_021014	AGA	2	6	1016653	1016658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153264
14987	NC_021014	CTT	2	6	1016700	1016705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153264
14988	NC_021014	CCAC	2	8	1016754	1016761	25 %	0 %	0 %	75 %	479153264
14989	NC_021014	TGCAAG	2	12	1016772	1016783	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479153264
14990	NC_021014	TGC	2	6	1016863	1016868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153264
14991	NC_021014	TCGA	2	8	1016899	1016906	25 %	25 %	25 %	25 %	479153264
14992	NC_021014	GAT	2	6	1016976	1016981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153264
14993	NC_021014	T	6	6	1016997	1017002	0 %	100 %	0 %	0 %	479153264
14994	NC_021014	T	7	7	1017031	1017037	0 %	100 %	0 %	0 %	479153264
14995	NC_021014	AAAAT	2	10	1019534	1019543	80 %	20 %	0 %	0 %	479153265
14996	NC_021014	CT	3	6	1019584	1019589	0 %	50 %	0 %	50 %	479153265
14997	NC_021014	AAG	2	6	1019642	1019647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153265
14998	NC_021014	TCT	2	6	1019713	1019718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153265
14999	NC_021014	CAC	2	6	1019911	1019916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153265
15000	NC_021014	CAG	2	6	1019929	1019934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153265

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