MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021014	CAGAT	2	10	954765	954774	40 %	20 %	20 %	20 %	479153211
14002	NC_021014	GAT	2	6	954800	954805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153211
14003	NC_021014	TGA	2	6	954820	954825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153211
14004	NC_021014	GCA	2	6	954880	954885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153211
14005	NC_021014	ACC	2	6	954979	954984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153211
14006	NC_021014	TGT	2	6	955056	955061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153211
14007	NC_021014	CTG	2	6	955073	955078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153211
14008	NC_021014	TCT	2	6	955108	955113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153211
14009	NC_021014	TG	3	6	955135	955140	0 %	50 %	50 %	0 %	479153211
14010	NC_021014	ATC	2	6	955197	955202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153211
14011	NC_021014	TCC	2	6	955262	955267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153211
14012	NC_021014	TCT	2	6	955276	955281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153211
14013	NC_021014	CCTG	2	8	955308	955315	0 %	25 %	25 %	50 %	479153211
14014	NC_021014	T	6	6	955329	955334	0 %	100 %	0 %	0 %	479153211
14015	NC_021014	CTG	2	6	955352	955357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153211
14016	NC_021014	ATC	2	6	955404	955409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153211
14017	NC_021014	CTC	2	6	955452	955457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153211
14018	NC_021014	T	7	7	955633	955639	0 %	100 %	0 %	0 %	479153211
14019	NC_021014	CGT	2	6	955787	955792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153211
14020	NC_021014	ATA	2	6	955800	955805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153211
14021	NC_021014	CTC	2	6	955851	955856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153211
14022	NC_021014	TGA	2	6	956187	956192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153212
14023	NC_021014	ATC	2	6	956206	956211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153212
14024	NC_021014	TCT	2	6	956295	956300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153212
14025	NC_021014	ATA	2	6	956530	956535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153214
14026	NC_021014	TGC	2	6	956542	956547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153214
14027	NC_021014	GATA	2	8	956554	956561	50 %	25 %	25 %	0 %	479153214
14028	NC_021014	CTG	2	6	956655	956660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153214
14029	NC_021014	CA	3	6	956713	956718	50 %	0 %	0 %	50 %	479153214
14030	NC_021014	AGAA	2	8	956739	956746	75 %	0 %	25 %	0 %	479153214
14031	NC_021014	TC	3	6	956754	956759	0 %	50 %	0 %	50 %	479153214
14032	NC_021014	GC	3	6	956774	956779	0 %	0 %	50 %	50 %	479153214
14033	NC_021014	AT	3	6	956876	956881	50 %	50 %	0 %	0 %	479153214
14034	NC_021014	ACA	2	6	956906	956911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153214
14035	NC_021014	CAGG	2	8	956917	956924	25 %	0 %	50 %	25 %	479153214
14036	NC_021014	CTG	2	6	956976	956981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153214
14037	NC_021014	CAGT	2	8	957063	957070	25 %	25 %	25 %	25 %	479153214
14038	NC_021014	CAAT	2	8	957135	957142	50 %	25 %	0 %	25 %	479153214
14039	NC_021014	TGC	2	6	957166	957171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153214
14040	NC_021014	ATA	2	6	957172	957177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153214
14041	NC_021014	CGC	2	6	957250	957255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479153214
14042	NC_021014	TCC	2	6	957287	957292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153214
14043	NC_021014	TCC	2	6	957334	957339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153214
14044	NC_021014	GCT	2	6	957350	957355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153214
14045	NC_021014	ACC	2	6	957373	957378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153214
14046	NC_021014	CAT	2	6	957435	957440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153214
14047	NC_021014	AGAA	2	8	957457	957464	75 %	0 %	25 %	0 %	479153214
14048	NC_021014	GCA	2	6	957534	957539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153214
14049	NC_021014	AACC	2	8	957646	957653	50 %	0 %	0 %	50 %	479153214
14050	NC_021014	TAA	2	6	957695	957700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153214
14051	NC_021014	GATC	2	8	957729	957736	25 %	25 %	25 %	25 %	479153214
14052	NC_021014	T	6	6	957823	957828	0 %	100 %	0 %	0 %	479153215
14053	NC_021014	ATC	2	6	957872	957877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153215
14054	NC_021014	AAG	2	6	957880	957885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153215
14055	NC_021014	A	6	6	958069	958074	100 %	0 %	0 %	0 %	479153215
14056	NC_021014	CTA	2	6	958107	958112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153215
14057	NC_021014	CCA	2	6	958149	958154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153215
14058	NC_021014	TCC	2	6	958349	958354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153215
14059	NC_021014	CAGA	2	8	958380	958387	50 %	0 %	25 %	25 %	479153215
14060	NC_021014	CT	3	6	958390	958395	0 %	50 %	0 %	50 %	479153215
14061	NC_021014	AAG	2	6	958423	958428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153215
14062	NC_021014	CCG	2	6	958434	958439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479153215
14063	NC_021014	ATCA	2	8	958459	958466	50 %	25 %	0 %	25 %	479153215
14064	NC_021014	T	7	7	958467	958473	0 %	100 %	0 %	0 %	479153215
14065	NC_021014	CAG	2	6	958569	958574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153216
14066	NC_021014	TTC	2	6	958578	958583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153216
14067	NC_021014	TC	3	6	958592	958597	0 %	50 %	0 %	50 %	479153216
14068	NC_021014	CTTC	2	8	958603	958610	0 %	50 %	0 %	50 %	479153216
14069	NC_021014	TC	3	6	958731	958736	0 %	50 %	0 %	50 %	479153216
14070	NC_021014	CAT	3	9	958811	958819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153216
14071	NC_021014	AAT	2	6	958870	958875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153216
14072	NC_021014	AC	3	6	958882	958887	50 %	0 %	0 %	50 %	479153216
14073	NC_021014	GCC	2	6	958931	958936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479153216
14074	NC_021014	TCC	2	6	958946	958951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153216
14075	NC_021014	CAT	2	6	958963	958968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153216
14076	NC_021014	AAC	2	6	958986	958991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153216
14077	NC_021014	TTG	2	6	958996	959001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153216
14078	NC_021014	TCTCT	2	10	959031	959040	0 %	60 %	0 %	40 %	479153216
14079	NC_021014	AGC	2	6	959055	959060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153216
14080	NC_021014	TGC	2	6	959066	959071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153216
14081	NC_021014	GATC	2	8	959122	959129	25 %	25 %	25 %	25 %	479153216
14082	NC_021014	CTT	2	6	959207	959212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153216
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14084	NC_021014	GAT	2	6	959494	959499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153217
14085	NC_021014	CTG	2	6	959544	959549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153217
14086	NC_021014	TTG	2	6	959583	959588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153217
14087	NC_021014	AAG	2	6	959593	959598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153217
14088	NC_021014	TTC	2	6	959648	959653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153217
14089	NC_021014	AAG	2	6	959678	959683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153217
14090	NC_021014	ATA	2	6	959746	959751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153217
14091	NC_021014	CT	3	6	959790	959795	0 %	50 %	0 %	50 %	479153217
14092	NC_021014	CCA	2	6	959807	959812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153217
14093	NC_021014	GT	3	6	959910	959915	0 %	50 %	50 %	0 %	479153217
14094	NC_021014	TTA	2	6	960268	960273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153218
14095	NC_021014	TAC	2	6	960277	960282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153218
14096	NC_021014	TGA	2	6	960288	960293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153218
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14098	NC_021014	TGA	2	6	960318	960323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153218
14099	NC_021014	CTT	2	6	960352	960357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153218
14100	NC_021014	TCT	2	6	960374	960379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153218
14101	NC_021014	TCA	2	6	960449	960454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153218
14102	NC_021014	CTC	2	6	960466	960471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153218
14103	NC_021014	AAG	2	6	960562	960567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153218
14104	NC_021014	CGT	2	6	960606	960611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153218
14105	NC_021014	TTGT	2	8	960635	960642	0 %	75 %	25 %	0 %	479153218
14106	NC_021014	CTG	2	6	960692	960697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153218
14107	NC_021014	TCT	2	6	960726	960731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153218
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14109	NC_021014	CATA	2	8	960870	960877	50 %	25 %	0 %	25 %	479153218
14110	NC_021014	ATC	2	6	960910	960915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153218
14111	NC_021014	AGA	2	6	961061	961066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153218
14112	NC_021014	GAA	2	6	961068	961073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153218
14113	NC_021014	ACC	2	6	961087	961092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153218
14114	NC_021014	TAT	2	6	961149	961154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153218
14115	NC_021014	TTA	2	6	961157	961162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153218
14116	NC_021014	GGA	2	6	961173	961178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153218
14117	NC_021014	CAC	2	6	961236	961241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153218
14118	NC_021014	TCC	2	6	961349	961354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153218
14119	NC_021014	GGTACC	2	12	961355	961366	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479153218
14120	NC_021014	GATCGG	2	12	961390	961401	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479153218
14121	NC_021014	TC	3	6	961436	961441	0 %	50 %	0 %	50 %	479153218
14122	NC_021014	GAT	2	6	961483	961488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153218
14123	NC_021014	CTTC	2	8	961497	961504	0 %	50 %	0 %	50 %	479153218
14124	NC_021014	ATTCC	3	15	961518	961532	20 %	40 %	0 %	40 %	479153218
14125	NC_021014	GAT	2	6	961621	961626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153218
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14127	NC_021014	AC	3	6	961679	961684	50 %	0 %	0 %	50 %	479153218
14128	NC_021014	AC	3	6	961782	961787	50 %	0 %	0 %	50 %	479153218
14129	NC_021014	TCT	2	6	961791	961796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153218
14130	NC_021014	AT	3	6	961844	961849	50 %	50 %	0 %	0 %	479153218
14131	NC_021014	CT	3	6	961861	961866	0 %	50 %	0 %	50 %	479153218
14132	NC_021014	TTG	2	6	961950	961955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153218
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14135	NC_021014	CCAGT	2	10	962059	962068	20 %	20 %	20 %	40 %	479153218
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14225	NC_021014	TGA	2	6	968884	968889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153222
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14227	NC_021014	ATA	2	6	968986	968991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153222
14228	NC_021014	TC	3	6	969035	969040	0 %	50 %	0 %	50 %	479153222
14229	NC_021014	ATGA	2	8	969072	969079	50 %	25 %	25 %	0 %	479153222
14230	NC_021014	TCATT	2	10	969287	969296	20 %	60 %	0 %	20 %	479153222
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14232	NC_021014	T	6	6	969457	969462	0 %	100 %	0 %	0 %	479153223
14233	NC_021014	CTTG	2	8	969638	969645	0 %	50 %	25 %	25 %	479153224
14234	NC_021014	AAG	2	6	969770	969775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153224
14235	NC_021014	ATG	2	6	969792	969797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153224
14236	NC_021014	ATTC	2	8	969818	969825	25 %	50 %	0 %	25 %	479153224
14237	NC_021014	GAT	2	6	969905	969910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153224
14238	NC_021014	AAG	2	6	969917	969922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153224
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14240	NC_021014	AGA	2	6	969989	969994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153224
14241	NC_021014	GAT	2	6	970003	970008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153224
14242	NC_021014	CAA	2	6	970039	970044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153224
14243	NC_021014	AGT	2	6	970108	970113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153224
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14245	NC_021014	TGTCCG	2	12	970209	970220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153224
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14358	NC_021014	TCC	2	6	977204	977209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153229
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14361	NC_021014	TAT	2	6	977605	977610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153230
14362	NC_021014	T	6	6	977610	977615	0 %	100 %	0 %	0 %	479153230
14363	NC_021014	TTC	2	6	977710	977715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153230
14364	NC_021014	CAT	2	6	977724	977729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153230
14365	NC_021014	TAA	2	6	977801	977806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153230
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14381	NC_021014	TGCA	2	8	978525	978532	25 %	25 %	25 %	25 %	479153231
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14386	NC_021014	AGA	2	6	978606	978611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153231
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14451	NC_021014	GCT	2	6	982065	982070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153236
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14454	NC_021014	CGT	2	6	982181	982186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153236
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14461	NC_021014	TCA	2	6	982409	982414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153237
14462	NC_021014	CTA	2	6	982500	982505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153237
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14464	NC_021014	TTC	2	6	982539	982544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153237
14465	NC_021014	TTAT	2	8	982605	982612	25 %	75 %	0 %	0 %	479153238
14466	NC_021014	GCC	2	6	982630	982635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479153238
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14468	NC_021014	TCA	2	6	982683	982688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153238
14469	NC_021014	TCT	2	6	982689	982694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153238
14470	NC_021014	TGCTC	2	10	982695	982704	0 %	40 %	20 %	40 %	479153238
14471	NC_021014	TC	3	6	982801	982806	0 %	50 %	0 %	50 %	479153238
14472	NC_021014	ATG	2	6	982826	982831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153238
14473	NC_021014	ACC	2	6	982927	982932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153238
14474	NC_021014	GAAGTC	2	12	982972	982983	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479153238
14475	NC_021014	TTC	2	6	982988	982993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153238
14476	NC_021014	T	7	7	982997	983003	0 %	100 %	0 %	0 %	479153238
14477	NC_021014	TC	3	6	983130	983135	0 %	50 %	0 %	50 %	479153238
14478	NC_021014	AGA	2	6	983148	983153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153238
14479	NC_021014	AGCGC	2	10	983183	983192	20 %	0 %	40 %	40 %	479153238
14480	NC_021014	TCCTG	2	10	983279	983288	0 %	40 %	20 %	40 %	479153238
14481	NC_021014	ACATTC	2	12	983321	983332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153238
14482	NC_021014	CAT	2	6	983356	983361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153238
14483	NC_021014	TCA	2	6	983366	983371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153238
14484	NC_021014	CTG	2	6	983385	983390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153238
14485	NC_021014	CTG	2	6	983410	983415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153238
14486	NC_021014	GCT	2	6	983438	983443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153238
14487	NC_021014	TG	3	6	983522	983527	0 %	50 %	50 %	0 %	479153238
14488	NC_021014	TGCC	2	8	983592	983599	0 %	25 %	25 %	50 %	479153238
14489	NC_021014	CGT	2	6	983611	983616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153238
14490	NC_021014	GACC	2	8	983637	983644	25 %	0 %	25 %	50 %	479153238
14491	NC_021014	TGT	2	6	983689	983694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153238
14492	NC_021014	TCA	2	6	983720	983725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153238
14493	NC_021014	CTTC	2	8	983862	983869	0 %	50 %	0 %	50 %	479153238
14494	NC_021014	GCCCTT	2	12	983902	983913	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	479153238
14495	NC_021014	CTT	2	6	983917	983922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153238
14496	NC_021014	CTC	2	6	983974	983979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153239
14497	NC_021014	CGC	2	6	983998	984003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479153239
14498	NC_021014	TTC	2	6	984103	984108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153239
14499	NC_021014	ATCAT	2	10	984131	984140	40 %	40 %	0 %	20 %	479153239
14500	NC_021014	CTG	2	6	984152	984157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153239

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