MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021014	GTG	2	6	890108	890113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153134
13002	NC_021014	CAT	2	6	890200	890205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153134
13003	NC_021014	GTG	2	6	890270	890275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153134
13004	NC_021014	TA	3	6	890302	890307	50 %	50 %	0 %	0 %	479153134
13005	NC_021014	GAC	2	6	890308	890313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153134
13006	NC_021014	AC	3	6	890312	890317	50 %	0 %	0 %	50 %	479153134
13007	NC_021014	GCTAT	2	10	890393	890402	20 %	40 %	20 %	20 %	479153134
13008	NC_021014	T	7	7	890445	890451	0 %	100 %	0 %	0 %	479153134
13009	NC_021014	AGC	2	6	890499	890504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153134
13010	NC_021014	A	7	7	890622	890628	100 %	0 %	0 %	0 %	479153134
13011	NC_021014	CCTTT	2	10	890632	890641	0 %	60 %	0 %	40 %	479153134
13012	NC_021014	CA	3	6	890850	890855	50 %	0 %	0 %	50 %	479153135
13013	NC_021014	AGA	2	6	890880	890885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153135
13014	NC_021014	A	6	6	890986	890991	100 %	0 %	0 %	0 %	479153135
13015	NC_021014	A	6	6	891079	891084	100 %	0 %	0 %	0 %	479153135
13016	NC_021014	ATT	2	6	891156	891161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153135
13017	NC_021014	GAA	2	6	891217	891222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153135
13018	NC_021014	GGAAG	2	10	891367	891376	40 %	0 %	60 %	0 %	479153135
13019	NC_021014	TCA	2	6	891480	891485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153135
13020	NC_021014	GAA	2	6	891490	891495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153135
13021	NC_021014	CTGAT	2	10	891530	891539	20 %	40 %	20 %	20 %	479153135
13022	NC_021014	TTCT	2	8	891818	891825	0 %	75 %	0 %	25 %	479153136
13023	NC_021014	CGG	2	6	891836	891841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153136
13024	NC_021014	TGT	2	6	891845	891850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153136
13025	NC_021014	TCT	2	6	891858	891863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153136
13026	NC_021014	GAA	2	6	891864	891869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153136
13027	NC_021014	ATC	2	6	891933	891938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153136
13028	NC_021014	CGG	2	6	891980	891985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153136
13029	NC_021014	GC	3	6	892010	892015	0 %	0 %	50 %	50 %	479153136
13030	NC_021014	GGAAAA	2	12	892029	892040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153136
13031	NC_021014	A	6	6	892202	892207	100 %	0 %	0 %	0 %	479153136
13032	NC_021014	GACC	2	8	892221	892228	25 %	0 %	25 %	50 %	479153136
13033	NC_021014	CCTG	2	8	892417	892424	0 %	25 %	25 %	50 %	479153137
13034	NC_021014	A	6	6	892438	892443	100 %	0 %	0 %	0 %	479153137
13035	NC_021014	GGGA	2	8	892602	892609	25 %	0 %	75 %	0 %	479153138
13036	NC_021014	CTT	2	6	892634	892639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153138
13037	NC_021014	TGA	2	6	892767	892772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153138
13038	NC_021014	GGTAA	2	10	892787	892796	40 %	20 %	40 %	0 %	479153138
13039	NC_021014	ATG	2	6	892946	892951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153138
13040	NC_021014	GGAC	2	8	892954	892961	25 %	0 %	50 %	25 %	479153138
13041	NC_021014	ATC	2	6	893085	893090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153138
13042	NC_021014	GTG	2	6	893094	893099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153138
13043	NC_021014	TCCC	2	8	893101	893108	0 %	25 %	0 %	75 %	479153138
13044	NC_021014	ACGGA	2	10	893132	893141	40 %	0 %	40 %	20 %	479153138
13045	NC_021014	CTC	2	6	893159	893164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153138
13046	NC_021014	CATC	2	8	893167	893174	25 %	25 %	0 %	50 %	479153138
13047	NC_021014	ATCAT	2	10	893181	893190	40 %	40 %	0 %	20 %	479153138
13048	NC_021014	TGA	2	6	893236	893241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153138
13049	NC_021014	AAT	2	6	893280	893285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153139
13050	NC_021014	AGC	2	6	893304	893309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153139
13051	NC_021014	A	8	8	893516	893523	100 %	0 %	0 %	0 %	479153139
13052	NC_021014	ATC	2	6	893605	893610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153139
13053	NC_021014	TGG	2	6	893650	893655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153139
13054	NC_021014	TGCCAT	2	12	893672	893683	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479153139
13055	NC_021014	GCA	2	6	893710	893715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153139
13056	NC_021014	CAT	2	6	893753	893758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153139
13057	NC_021014	ATC	3	9	893772	893780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153139
13058	NC_021014	CAGA	2	8	893804	893811	50 %	0 %	25 %	25 %	479153139
13059	NC_021014	ATCT	2	8	893819	893826	25 %	50 %	0 %	25 %	479153139
13060	NC_021014	AGT	2	6	893888	893893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153139
13061	NC_021014	A	6	6	893916	893921	100 %	0 %	0 %	0 %	479153139
13062	NC_021014	AGT	2	6	893933	893938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153139
13063	NC_021014	GAA	2	6	893970	893975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153139
13064	NC_021014	GTT	2	6	893991	893996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153139
13065	NC_021014	TG	3	6	894015	894020	0 %	50 %	50 %	0 %	479153139
13066	NC_021014	GCA	2	6	894030	894035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153139
13067	NC_021014	CGG	2	6	894110	894115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153139
13068	NC_021014	TA	3	6	894132	894137	50 %	50 %	0 %	0 %	479153139
13069	NC_021014	GCTA	2	8	894150	894157	25 %	25 %	25 %	25 %	479153139
13070	NC_021014	GCA	2	6	894201	894206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153139
13071	NC_021014	ATC	2	6	894222	894227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153139
13072	NC_021014	A	6	6	894270	894275	100 %	0 %	0 %	0 %	479153139
13073	NC_021014	A	7	7	894309	894315	100 %	0 %	0 %	0 %	479153140
13074	NC_021014	TTTAA	2	10	894328	894337	40 %	60 %	0 %	0 %	479153140
13075	NC_021014	TCT	2	6	894348	894353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153140
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13080	NC_021014	A	6	6	894501	894506	100 %	0 %	0 %	0 %	479153140
13081	NC_021014	CAGA	2	8	894604	894611	50 %	0 %	25 %	25 %	479153140
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13087	NC_021014	CAGT	2	8	894869	894876	25 %	25 %	25 %	25 %	479153140
13088	NC_021014	AGC	2	6	894941	894946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153140
13089	NC_021014	CAG	2	6	895051	895056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153140
13090	NC_021014	CAC	2	6	895134	895139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153140
13091	NC_021014	GGA	2	6	895167	895172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153140
13092	NC_021014	ATTAT	2	10	895193	895202	40 %	60 %	0 %	0 %	479153141
13093	NC_021014	TG	3	6	895293	895298	0 %	50 %	50 %	0 %	479153141
13094	NC_021014	GAA	2	6	895320	895325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153141
13095	NC_021014	T	6	6	895346	895351	0 %	100 %	0 %	0 %	479153141
13096	NC_021014	TGA	2	6	897102	897107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153142
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13098	NC_021014	TGC	2	6	897222	897227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153142
13099	NC_021014	AT	3	6	897366	897371	50 %	50 %	0 %	0 %	479153142
13100	NC_021014	AGA	2	6	897441	897446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153142
13101	NC_021014	GGT	2	6	897472	897477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153142
13102	NC_021014	TAC	2	6	897579	897584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153142
13103	NC_021014	ATA	2	6	897626	897631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153142
13104	NC_021014	CAA	2	6	897642	897647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153142
13105	NC_021014	ATT	2	6	897659	897664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153142
13106	NC_021014	TTC	2	6	897697	897702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153142
13107	NC_021014	CAG	2	6	897715	897720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153142
13108	NC_021014	GAT	2	6	897787	897792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153142
13109	NC_021014	AT	3	6	897798	897803	50 %	50 %	0 %	0 %	479153142
13110	NC_021014	CTG	2	6	897846	897851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153142
13111	NC_021014	TC	3	6	897871	897876	0 %	50 %	0 %	50 %	479153142
13112	NC_021014	CCAG	2	8	898118	898125	25 %	0 %	25 %	50 %	479153142
13113	NC_021014	AAC	2	6	898236	898241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153142
13114	NC_021014	GTAT	2	8	898289	898296	25 %	50 %	25 %	0 %	479153142
13115	NC_021014	GTG	2	6	898300	898305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153142
13116	NC_021014	AGC	2	6	898341	898346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153142
13117	NC_021014	TAT	2	6	898375	898380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153142
13118	NC_021014	TGCC	2	8	898476	898483	0 %	25 %	25 %	50 %	479153142
13119	NC_021014	GCA	2	6	898552	898557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153142
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13121	NC_021014	GTCATT	2	12	898654	898665	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479153143
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13236	NC_021014	AG	3	6	904648	904653	50 %	0 %	50 %	0 %	479153149
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13241	NC_021014	TAT	2	6	905134	905139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153151
13242	NC_021014	AGA	2	6	905158	905163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153151
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13245	NC_021014	CAAA	2	8	905397	905404	75 %	0 %	0 %	25 %	479153152
13246	NC_021014	A	7	7	905402	905408	100 %	0 %	0 %	0 %	479153152
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13248	NC_021014	ATC	3	9	905567	905575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153152
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13355	NC_021014	CTG	3	9	912142	912150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153159
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13482	NC_021014	AT	3	6	919916	919921	50 %	50 %	0 %	0 %	479153171
13483	NC_021014	TCA	2	6	919925	919930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153171
13484	NC_021014	CTG	2	6	919978	919983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153171
13485	NC_021014	TGAT	2	8	919990	919997	25 %	50 %	25 %	0 %	479153171
13486	NC_021014	ACG	2	6	920038	920043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153171
13487	NC_021014	ATA	2	6	920092	920097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153171
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13490	NC_021014	TCC	2	6	920204	920209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153172
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13492	NC_021014	ATA	2	6	920331	920336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153172
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13497	NC_021014	AAG	2	6	921550	921555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153173
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