MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021014	GCA	3	9	675994	676002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152927
10002	NC_021014	GCA	2	6	676042	676047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152927
10003	NC_021014	ATT	2	6	676085	676090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152927
10004	NC_021014	AGA	2	6	676131	676136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152927
10005	NC_021014	AGA	2	6	676160	676165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152927
10006	NC_021014	ATT	2	6	676166	676171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152927
10007	NC_021014	CTT	2	6	676186	676191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152927
10008	NC_021014	CAG	2	6	676256	676261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152927
10009	NC_021014	A	7	7	676278	676284	100 %	0 %	0 %	0 %	479152927
10010	NC_021014	GAA	2	6	676327	676332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152927
10011	NC_021014	TTA	2	6	676407	676412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152927
10012	NC_021014	TGA	2	6	676487	676492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152927
10013	NC_021014	CTT	2	6	676511	676516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152927
10014	NC_021014	CAGA	2	8	676563	676570	50 %	0 %	25 %	25 %	479152927
10015	NC_021014	A	6	6	676630	676635	100 %	0 %	0 %	0 %	479152927
10016	NC_021014	A	6	6	676672	676677	100 %	0 %	0 %	0 %	479152927
10017	NC_021014	AGG	2	6	676697	676702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152927
10018	NC_021014	TGA	2	6	676711	676716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152927
10019	NC_021014	GAG	2	6	676797	676802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152928
10020	NC_021014	CTGAAG	2	12	676848	676859	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479152928
10021	NC_021014	GCA	2	6	676908	676913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152928
10022	NC_021014	GAA	2	6	676947	676952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152928
10023	NC_021014	GAA	2	6	676954	676959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152928
10024	NC_021014	ATT	2	6	677092	677097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152928
10025	NC_021014	GAA	2	6	677241	677246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152928
10026	NC_021014	TAT	2	6	677398	677403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152929
10027	NC_021014	CT	3	6	677451	677456	0 %	50 %	0 %	50 %	479152929
10028	NC_021014	AAG	2	6	677461	677466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152929
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10030	NC_021014	GAG	2	6	677609	677614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152929
10031	NC_021014	A	6	6	677663	677668	100 %	0 %	0 %	0 %	479152929
10032	NC_021014	AGC	2	6	677700	677705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152929
10033	NC_021014	TGA	2	6	677826	677831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152929
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10035	NC_021014	CCT	2	6	677882	677887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152929
10036	NC_021014	TTG	2	6	677919	677924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152929
10037	NC_021014	GTGG	2	8	677960	677967	0 %	25 %	75 %	0 %	479152929
10038	NC_021014	TTG	2	6	678048	678053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152929
10039	NC_021014	A	6	6	678061	678066	100 %	0 %	0 %	0 %	479152929
10040	NC_021014	GCA	2	6	678158	678163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152929
10041	NC_021014	TCT	2	6	678166	678171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152929
10042	NC_021014	ATG	2	6	678186	678191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152929
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10052	NC_021014	TAT	2	6	678584	678589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152929
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10056	NC_021014	GAT	2	6	678898	678903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152930
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10058	NC_021014	TCCT	2	8	678998	679005	0 %	50 %	0 %	50 %	479152930
10059	NC_021014	GGATG	2	10	679060	679069	20 %	20 %	60 %	0 %	479152930
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10061	NC_021014	GCA	2	6	679147	679152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152930
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10107	NC_021014	CTT	2	6	681487	681492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152932
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10110	NC_021014	GAA	2	6	681574	681579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152932
10111	NC_021014	GA	3	6	681591	681596	50 %	0 %	50 %	0 %	479152932
10112	NC_021014	TTTAC	2	10	681609	681618	20 %	60 %	0 %	20 %	479152932
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10119	NC_021014	A	7	7	684307	684313	100 %	0 %	0 %	0 %	479152933
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10121	NC_021014	GAT	2	6	684733	684738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152933
10122	NC_021014	GTA	2	6	684817	684822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152933
10123	NC_021014	A	6	6	684822	684827	100 %	0 %	0 %	0 %	479152933
10124	NC_021014	ACT	2	6	684833	684838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152933
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10233	NC_021014	GA	3	6	690418	690423	50 %	0 %	50 %	0 %	479152939
10234	NC_021014	AGC	3	9	690425	690433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152939
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10237	NC_021014	TGAC	2	8	690506	690513	25 %	25 %	25 %	25 %	479152939
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10478	NC_021014	TCA	2	6	706040	706045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152956
10479	NC_021014	GGA	2	6	706146	706151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152956
10480	NC_021014	TTC	2	6	706226	706231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152956
10481	NC_021014	A	7	7	706285	706291	100 %	0 %	0 %	0 %	479152956
10482	NC_021014	A	6	6	706321	706326	100 %	0 %	0 %	0 %	479152956
10483	NC_021014	CAG	2	6	706443	706448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152956
10484	NC_021014	AGC	2	6	706487	706492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152956
10485	NC_021014	CTT	2	6	706516	706521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152956
10486	NC_021014	ATC	2	6	706549	706554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152956
10487	NC_021014	CAGG	2	8	706675	706682	25 %	0 %	50 %	25 %	479152956
10488	NC_021014	TTC	2	6	706706	706711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152956
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10490	NC_021014	ACG	2	6	706784	706789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152956
10491	NC_021014	TGA	2	6	706871	706876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152956
10492	NC_021014	GCA	2	6	706990	706995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152956
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10497	NC_021014	AACAA	2	10	707197	707206	80 %	0 %	0 %	20 %	479152956
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10499	NC_021014	AGA	2	6	707295	707300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152956
10500	NC_021014	TTC	2	6	707307	707312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152956

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