MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_021014	ATG	2	6	3453084	3453089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155475
51002	NC_021014	CT	3	6	3453096	3453101	0 %	50 %	0 %	50 %	479155475
51003	NC_021014	CA	3	6	3453114	3453119	50 %	0 %	0 %	50 %	479155475
51004	NC_021014	T	7	7	3453192	3453198	0 %	100 %	0 %	0 %	479155475
51005	NC_021014	ATCTT	2	10	3453298	3453307	20 %	60 %	0 %	20 %	479155475
51006	NC_021014	CA	3	6	3453354	3453359	50 %	0 %	0 %	50 %	479155475
51007	NC_021014	TCA	3	9	3453385	3453393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155475
51008	NC_021014	TCA	2	6	3453496	3453501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155475
51009	NC_021014	T	6	6	3453503	3453508	0 %	100 %	0 %	0 %	479155475
51010	NC_021014	GCT	2	6	3453611	3453616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155475
51011	NC_021014	TCTT	2	8	3453690	3453697	0 %	75 %	0 %	25 %	479155475
51012	NC_021014	AAT	2	6	3453743	3453748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155475
51013	NC_021014	GCT	2	6	3453802	3453807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155475
51014	NC_021014	TGCC	2	8	3453914	3453921	0 %	25 %	25 %	50 %	479155475
51015	NC_021014	A	6	6	3453970	3453975	100 %	0 %	0 %	0 %	479155475
51016	NC_021014	TTCC	2	8	3454056	3454063	0 %	50 %	0 %	50 %	479155475
51017	NC_021014	TCC	2	6	3454072	3454077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155475
51018	NC_021014	TGC	2	6	3454200	3454205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155475
51019	NC_021014	ACC	2	6	3454217	3454222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155475
51020	NC_021014	ACA	2	6	3454252	3454257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155475
51021	NC_021014	CTT	2	6	3454260	3454265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155475
51022	NC_021014	GGCA	2	8	3454282	3454289	25 %	0 %	50 %	25 %	479155475
51023	NC_021014	CCAGAT	2	12	3454319	3454330	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479155475
51024	NC_021014	T	6	6	3455977	3455982	0 %	100 %	0 %	0 %	479155476
51025	NC_021014	T	7	7	3455984	3455990	0 %	100 %	0 %	0 %	479155476
51026	NC_021014	ATC	2	6	3456075	3456080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155476
51027	NC_021014	TCA	2	6	3456097	3456102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155476
51028	NC_021014	GTTCCG	2	12	3456142	3456153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155476
51029	NC_021014	TGC	2	6	3456170	3456175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155476
51030	NC_021014	ATCA	2	8	3456240	3456247	50 %	25 %	0 %	25 %	479155476
51031	NC_021014	GAA	2	6	3456281	3456286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155476
51032	NC_021014	CT	4	8	3456309	3456316	0 %	50 %	0 %	50 %	479155476
51033	NC_021014	A	6	6	3456432	3456437	100 %	0 %	0 %	0 %	479155476
51034	NC_021014	GTAAA	2	10	3456466	3456475	60 %	20 %	20 %	0 %	479155476
51035	NC_021014	T	6	6	3456542	3456547	0 %	100 %	0 %	0 %	479155476
51036	NC_021014	CCG	2	6	3456568	3456573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155476
51037	NC_021014	TCT	2	6	3456669	3456674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155476
51038	NC_021014	TTG	2	6	3456694	3456699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155476
51039	NC_021014	AGC	2	6	3456718	3456723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155476
51040	NC_021014	CCA	2	6	3456775	3456780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155476
51041	NC_021014	CCT	2	6	3456905	3456910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155476
51042	NC_021014	CGGA	2	8	3456972	3456979	25 %	0 %	50 %	25 %	479155476
51043	NC_021014	TCA	2	6	3456991	3456996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155476
51044	NC_021014	GGT	2	6	3457074	3457079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155476
51045	NC_021014	GAA	2	6	3457220	3457225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155476
51046	NC_021014	ATT	2	6	3457242	3457247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155476
51047	NC_021014	CTG	2	6	3457428	3457433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155476
51048	NC_021014	GAAA	2	8	3457653	3457660	75 %	0 %	25 %	0 %	479155476
51049	NC_021014	GTA	2	6	3457720	3457725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155476
51050	NC_021014	CCT	2	6	3457733	3457738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155476
51051	NC_021014	GAA	2	6	3457845	3457850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155476
51052	NC_021014	CTG	2	6	3457895	3457900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155476
51053	NC_021014	GAA	2	6	3457919	3457924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155476
51054	NC_021014	T	6	6	3457953	3457958	0 %	100 %	0 %	0 %	479155476
51055	NC_021014	CTG	2	6	3458003	3458008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155476
51056	NC_021014	GT	3	6	3458160	3458165	0 %	50 %	50 %	0 %	479155476
51057	NC_021014	GATAA	2	10	3458172	3458181	60 %	20 %	20 %	0 %	479155476
51058	NC_021014	GGT	2	6	3458190	3458195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155476
51059	NC_021014	A	6	6	3458196	3458201	100 %	0 %	0 %	0 %	479155476
51060	NC_021014	TTTCTC	2	12	3458465	3458476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155476
51061	NC_021014	CAT	2	6	3458619	3458624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155476
51062	NC_021014	CACAGG	2	12	3458703	3458714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155476
51063	NC_021014	TGC	2	6	3458774	3458779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155476
51064	NC_021014	CT	3	6	3458820	3458825	0 %	50 %	0 %	50 %	479155476
51065	NC_021014	GAT	2	6	3458831	3458836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155476
51066	NC_021014	T	6	6	3458910	3458915	0 %	100 %	0 %	0 %	479155476
51067	NC_021014	AAG	2	6	3458916	3458921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155476
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51070	NC_021014	CT	3	6	3459061	3459066	0 %	50 %	0 %	50 %	479155476
51071	NC_021014	T	6	6	3459074	3459079	0 %	100 %	0 %	0 %	479155476
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51082	NC_021014	TG	3	6	3459555	3459560	0 %	50 %	50 %	0 %	479155476
51083	NC_021014	TCC	2	6	3459562	3459567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155476
51084	NC_021014	GAA	2	6	3459656	3459661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155476
51085	NC_021014	TAC	2	6	3459720	3459725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155476
51086	NC_021014	GTCAT	2	10	3459751	3459760	20 %	40 %	20 %	20 %	479155476
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51088	NC_021014	AAT	2	6	3460076	3460081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155476
51089	NC_021014	TAA	2	6	3460096	3460101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155476
51090	NC_021014	AC	3	6	3460208	3460213	50 %	0 %	0 %	50 %	479155477
51091	NC_021014	AT	3	6	3460278	3460283	50 %	50 %	0 %	0 %	479155477
51092	NC_021014	GCCT	2	8	3460334	3460341	0 %	25 %	25 %	50 %	479155477
51093	NC_021014	GATCG	2	10	3460427	3460436	20 %	20 %	40 %	20 %	479155477
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51098	NC_021014	ACG	2	6	3460736	3460741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155477
51099	NC_021014	CAC	2	6	3460765	3460770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155477
51100	NC_021014	TGC	2	6	3460828	3460833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155477
51101	NC_021014	TCA	2	6	3460938	3460943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155477
51102	NC_021014	GATA	2	8	3461029	3461036	50 %	25 %	25 %	0 %	479155477
51103	NC_021014	TGA	2	6	3461236	3461241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155477
51104	NC_021014	T	6	6	3461352	3461357	0 %	100 %	0 %	0 %	479155477
51105	NC_021014	CAT	2	6	3461425	3461430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155477
51106	NC_021014	TCT	2	6	3461448	3461453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155477
51107	NC_021014	GAA	2	6	3461793	3461798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155478
51108	NC_021014	GAA	2	6	3461845	3461850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155478
51109	NC_021014	TGA	2	6	3461857	3461862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155478
51110	NC_021014	A	7	7	3461880	3461886	100 %	0 %	0 %	0 %	479155478
51111	NC_021014	CAGA	2	8	3461937	3461944	50 %	0 %	25 %	25 %	479155478
51112	NC_021014	TAA	2	6	3461946	3461951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155478
51113	NC_021014	GAT	2	6	3462047	3462052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155478
51114	NC_021014	AGGA	2	8	3462062	3462069	50 %	0 %	50 %	0 %	479155478
51115	NC_021014	CTT	2	6	3462089	3462094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155478
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51117	NC_021014	TTTTG	2	10	3462311	3462320	0 %	80 %	20 %	0 %	479155478
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51210	NC_021014	TGC	2	6	3468145	3468150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155484
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51223	NC_021014	T	6	6	3468970	3468975	0 %	100 %	0 %	0 %	479155485
51224	NC_021014	TTA	2	6	3468992	3468997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155485
51225	NC_021014	AAG	2	6	3469003	3469008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155485
51226	NC_021014	TTTCTT	2	12	3469035	3469046	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479155485
51227	NC_021014	GCA	2	6	3469082	3469087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155485
51228	NC_021014	A	6	6	3469095	3469100	100 %	0 %	0 %	0 %	479155485
51229	NC_021014	CAA	2	6	3469124	3469129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155485
51230	NC_021014	TCT	2	6	3469139	3469144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155485
51231	NC_021014	CAT	2	6	3469199	3469204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155485
51232	NC_021014	T	7	7	3469288	3469294	0 %	100 %	0 %	0 %	479155486
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51351	NC_021014	CCCG	2	8	3478008	3478015	0 %	0 %	25 %	75 %	479155494
51352	NC_021014	T	6	6	3478020	3478025	0 %	100 %	0 %	0 %	479155494
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51467	NC_021014	TCA	2	6	3483936	3483941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155499
51468	NC_021014	CCA	2	6	3483946	3483951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155499
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51497	NC_021014	T	6	6	3485862	3485867	0 %	100 %	0 %	0 %	479155500
51498	NC_021014	T	6	6	3485896	3485901	0 %	100 %	0 %	0 %	479155500
51499	NC_021014	CATCT	2	10	3485973	3485982	20 %	40 %	0 %	40 %	479155500
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