MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_021014	CTT	2	6	3384135	3384140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155420
50003	NC_021014	CAT	2	6	3384162	3384167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155420
50004	NC_021014	GGA	2	6	3384246	3384251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155420
50005	NC_021014	TGT	2	6	3384331	3384336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155420
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50010	NC_021014	GCA	2	6	3384532	3384537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155420
50011	NC_021014	TAT	2	6	3384819	3384824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155421
50012	NC_021014	TTCT	2	8	3384825	3384832	0 %	75 %	0 %	25 %	479155421
50013	NC_021014	CAT	2	6	3384867	3384872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155421
50014	NC_021014	TTTC	2	8	3385786	3385793	0 %	75 %	0 %	25 %	479155422
50015	NC_021014	CCA	2	6	3385797	3385802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155422
50016	NC_021014	TAA	2	6	3385821	3385826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155422
50017	NC_021014	TCT	2	6	3385828	3385833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155422
50018	NC_021014	CTT	2	6	3385841	3385846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155422
50019	NC_021014	TTTC	2	8	3386004	3386011	0 %	75 %	0 %	25 %	479155422
50020	NC_021014	CTG	2	6	3386340	3386345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155423
50021	NC_021014	CGG	2	6	3386386	3386391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155423
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50023	NC_021014	TGG	2	6	3386526	3386531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155423
50024	NC_021014	CTTC	2	8	3386598	3386605	0 %	50 %	0 %	50 %	479155423
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50031	NC_021014	T	6	6	3387256	3387261	0 %	100 %	0 %	0 %	479155424
50032	NC_021014	CCA	2	6	3387297	3387302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155424
50033	NC_021014	GCG	2	6	3387344	3387349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155424
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50037	NC_021014	CAT	3	9	3387506	3387514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155424
50038	NC_021014	CGGA	2	8	3387551	3387558	25 %	0 %	50 %	25 %	479155424
50039	NC_021014	TC	3	6	3387563	3387568	0 %	50 %	0 %	50 %	479155424
50040	NC_021014	ATG	2	6	3387609	3387614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155424
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50042	NC_021014	TGA	2	6	3387688	3387693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155424
50043	NC_021014	GAT	2	6	3387728	3387733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155424
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50109	NC_021014	GCA	2	6	3391863	3391868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155428
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50117	NC_021014	AAG	2	6	3392117	3392122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155428
50118	NC_021014	TGC	2	6	3392317	3392322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155428
50119	NC_021014	TCC	2	6	3392403	3392408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155428
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50122	NC_021014	TCT	2	6	3392575	3392580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155428
50123	NC_021014	GCT	2	6	3392595	3392600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155428
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50133	NC_021014	TAA	2	6	3393162	3393167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155429
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50137	NC_021014	GAT	2	6	3393271	3393276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155429
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50193	NC_021014	TGT	2	6	3396251	3396256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155432
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50203	NC_021014	CTG	2	6	3397230	3397235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155433
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50210	NC_021014	ATC	2	6	3397375	3397380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155433
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50213	NC_021014	TACA	2	8	3397488	3397495	50 %	25 %	0 %	25 %	479155434
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50217	NC_021014	GCT	2	6	3397732	3397737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155434
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50221	NC_021014	TCC	2	6	3397818	3397823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155434
50222	NC_021014	AAG	2	6	3397881	3397886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155434
50223	NC_021014	GATA	2	8	3397926	3397933	50 %	25 %	25 %	0 %	479155434
50224	NC_021014	TCA	2	6	3397961	3397966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155434
50225	NC_021014	A	7	7	3398011	3398017	100 %	0 %	0 %	0 %	479155434
50226	NC_021014	TA	3	6	3398018	3398023	50 %	50 %	0 %	0 %	479155434
50227	NC_021014	CTTT	2	8	3398047	3398054	0 %	75 %	0 %	25 %	479155434
50228	NC_021014	CAA	2	6	3398133	3398138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155434
50229	NC_021014	T	6	6	3398159	3398164	0 %	100 %	0 %	0 %	479155434
50230	NC_021014	ATA	2	6	3398179	3398184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155434
50231	NC_021014	CTT	2	6	3398272	3398277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155435
50232	NC_021014	GTC	2	6	3398322	3398327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155435
50233	NC_021014	CCG	2	6	3398333	3398338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155435
50234	NC_021014	GAT	2	6	3398343	3398348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155435
50235	NC_021014	CTTA	2	8	3398358	3398365	25 %	50 %	0 %	25 %	479155435
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50455	NC_021014	TCGT	2	8	3416577	3416584	0 %	50 %	25 %	25 %	479155452
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50464	NC_021014	GTT	2	6	3416981	3416986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155452
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50466	NC_021014	ACA	2	6	3417152	3417157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155452
50467	NC_021014	CTT	2	6	3417208	3417213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155452
50468	NC_021014	ACC	2	6	3417461	3417466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155453
50469	NC_021014	CTTC	2	8	3417469	3417476	0 %	50 %	0 %	50 %	479155453
50470	NC_021014	GGA	2	6	3417501	3417506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155453
50471	NC_021014	AAC	2	6	3417553	3417558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155453
50472	NC_021014	A	6	6	3417668	3417673	100 %	0 %	0 %	0 %	479155453
50473	NC_021014	TCT	2	6	3417699	3417704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155453
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50478	NC_021014	CAT	2	6	3417891	3417896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155453
50479	NC_021014	GTA	2	6	3417898	3417903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155453
50480	NC_021014	TGG	2	6	3417959	3417964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155453
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50492	NC_021014	TGC	2	6	3418888	3418893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155454
50493	NC_021014	TC	3	6	3418909	3418914	0 %	50 %	0 %	50 %	479155454
50494	NC_021014	GCT	2	6	3418920	3418925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155454
50495	NC_021014	CTG	2	6	3419000	3419005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155454
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50500	NC_021014	GCT	2	6	3419163	3419168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155454

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