MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 32304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_021013	CAGG	2	8	2154988	2154995	25 %	0 %	50 %	25 %	479151805
31002	NC_021013	ATCC	2	8	2154999	2155006	25 %	25 %	0 %	50 %	479151805
31003	NC_021013	A	6	6	2155104	2155109	100 %	0 %	0 %	0 %	479151806
31004	NC_021013	AGA	2	6	2155129	2155134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151806
31005	NC_021013	AGA	2	6	2155179	2155184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151806
31006	NC_021013	AGC	2	6	2155197	2155202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151806
31007	NC_021013	CGC	2	6	2155229	2155234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151806
31008	NC_021013	TG	4	8	2157147	2157154	0 %	50 %	50 %	0 %	479151807
31009	NC_021013	CAT	2	6	2157183	2157188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151807
31010	NC_021013	AGC	2	6	2157206	2157211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151807
31011	NC_021013	CAG	2	6	2157325	2157330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151807
31012	NC_021013	T	6	6	2157370	2157375	0 %	100 %	0 %	0 %	479151807
31013	NC_021013	TTTC	2	8	2157408	2157415	0 %	75 %	0 %	25 %	479151807
31014	NC_021013	AAC	2	6	2157433	2157438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479151808
31015	NC_021013	GCA	2	6	2157502	2157507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151808
31016	NC_021013	GCC	2	6	2157552	2157557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151808
31017	NC_021013	ATT	2	6	2158487	2158492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479151809
31018	NC_021013	GAT	2	6	2158522	2158527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151809
31019	NC_021013	TGC	2	6	2158535	2158540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151809
31020	NC_021013	TGG	2	6	2158611	2158616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479151809
31021	NC_021013	GAT	2	6	2158656	2158661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151809
31022	NC_021013	CCA	2	6	2158664	2158669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479151809
31023	NC_021013	CAG	2	6	2158678	2158683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151809
31024	NC_021013	GA	3	6	2158696	2158701	50 %	0 %	50 %	0 %	479151809
31025	NC_021013	CGG	2	6	2158863	2158868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151809
31026	NC_021013	CCA	2	6	2158888	2158893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479151809
31027	NC_021013	GAGATA	2	12	2158894	2158905	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479151809
31028	NC_021013	AGAGAT	2	12	2158917	2158928	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479151809
31029	NC_021013	AG	4	8	2158931	2158938	50 %	0 %	50 %	0 %	479151809
31030	NC_021013	GACG	2	8	2158992	2158999	25 %	0 %	50 %	25 %	479151809
31031	NC_021013	A	7	7	2159140	2159146	100 %	0 %	0 %	0 %	479151809
31032	NC_021013	AGG	2	6	2159183	2159188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479151809
31033	NC_021013	TA	3	6	2159274	2159279	50 %	50 %	0 %	0 %	479151810
31034	NC_021013	AAG	2	6	2159307	2159312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151810
31035	NC_021013	GCG	2	6	2159314	2159319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151810
31036	NC_021013	TGCCAG	2	12	2159382	2159393	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479151810
31037	NC_021013	GAG	2	6	2159403	2159408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479151810
31038	NC_021013	GCT	2	6	2159418	2159423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151810
31039	NC_021013	GAA	2	6	2159424	2159429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151810
31040	NC_021013	T	6	6	2159630	2159635	0 %	100 %	0 %	0 %	479151810
31041	NC_021013	TGCTT	2	10	2159654	2159663	0 %	60 %	20 %	20 %	479151810
31042	NC_021013	TGA	2	6	2159683	2159688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151810
31043	NC_021013	CCA	2	6	2159698	2159703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479151810
31044	NC_021013	TGA	2	6	2159762	2159767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151810
31045	NC_021013	CCGCAG	2	12	2159858	2159869	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479151810
31046	NC_021013	CAA	2	6	2159884	2159889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479151810
31047	NC_021013	GAA	2	6	2159987	2159992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151810
31048	NC_021013	GAA	2	6	2160000	2160005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151810
31049	NC_021013	GCA	2	6	2160027	2160032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151810
31050	NC_021013	CGC	2	6	2160140	2160145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151811
31051	NC_021013	CAG	2	6	2160288	2160293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151811
31052	NC_021013	GAATC	2	10	2160540	2160549	40 %	20 %	20 %	20 %	479151812
31053	NC_021013	GCC	2	6	2160551	2160556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151812
31054	NC_021013	CTG	2	6	2160562	2160567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151812
31055	NC_021013	GAT	2	6	2160578	2160583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151812
31056	NC_021013	GGA	2	6	2160628	2160633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479151812
31057	NC_021013	GCG	2	6	2160664	2160669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151812
31058	NC_021013	AT	3	6	2160679	2160684	50 %	50 %	0 %	0 %	479151812
31059	NC_021013	CTG	2	6	2160722	2160727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151812
31060	NC_021013	CGA	2	6	2160926	2160931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151813
31061	NC_021013	CGA	2	6	2160992	2160997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151813
31062	NC_021013	AC	3	6	2161027	2161032	50 %	0 %	0 %	50 %	479151813
31063	NC_021013	GAT	2	6	2161062	2161067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151813
31064	NC_021013	CGG	2	6	2161073	2161078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151813
31065	NC_021013	TGA	2	6	2161109	2161114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151813
31066	NC_021013	ATC	2	6	2161191	2161196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151813
31067	NC_021013	GGC	2	6	2161281	2161286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151813
31068	NC_021013	A	6	6	2161291	2161296	100 %	0 %	0 %	0 %	479151813
31069	NC_021013	AGC	2	6	2161411	2161416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151813
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31071	NC_021013	CGC	2	6	2161587	2161592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151813
31072	NC_021013	CGA	2	6	2161610	2161615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151813
31073	NC_021013	GCA	2	6	2161641	2161646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151813
31074	NC_021013	AGG	2	6	2161654	2161659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479151813
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31076	NC_021013	AATG	2	8	2161719	2161726	50 %	25 %	25 %	0 %	479151814
31077	NC_021013	GCC	2	6	2161735	2161740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151814
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31081	NC_021013	AGG	2	6	2162787	2162792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479151816
31082	NC_021013	TTG	2	6	2162850	2162855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151817
31083	NC_021013	TAC	2	6	2162861	2162866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151817
31084	NC_021013	GGA	2	6	2162887	2162892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479151817
31085	NC_021013	TGAA	2	8	2163009	2163016	50 %	25 %	25 %	0 %	479151817
31086	NC_021013	AATGG	2	10	2163100	2163109	40 %	20 %	40 %	0 %	479151817
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31088	NC_021013	GAT	2	6	2163163	2163168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151817
31089	NC_021013	ATGA	2	8	2163232	2163239	50 %	25 %	25 %	0 %	479151818
31090	NC_021013	A	6	6	2163245	2163250	100 %	0 %	0 %	0 %	479151818
31091	NC_021013	ATA	2	6	2163302	2163307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479151818
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31093	NC_021013	ATA	2	6	2163353	2163358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479151818
31094	NC_021013	GGAAT	2	10	2163387	2163396	40 %	20 %	40 %	0 %	479151818
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31098	NC_021013	ATGAA	2	10	2163479	2163488	60 %	20 %	20 %	0 %	479151818
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31100	NC_021013	AAT	2	6	2163583	2163588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479151818
31101	NC_021013	GAA	2	6	2163628	2163633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151818
31102	NC_021013	TGT	2	6	2163710	2163715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151819
31103	NC_021013	GAT	2	6	2163771	2163776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151819
31104	NC_021013	AAAG	2	8	2163812	2163819	75 %	0 %	25 %	0 %	479151819
31105	NC_021013	GATG	2	8	2163954	2163961	25 %	25 %	50 %	0 %	479151819
31106	NC_021013	TA	3	6	2163990	2163995	50 %	50 %	0 %	0 %	479151819
31107	NC_021013	GTT	2	6	2163996	2164001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151819
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31109	NC_021013	ATGA	2	8	2164041	2164048	50 %	25 %	25 %	0 %	479151819
31110	NC_021013	TAA	2	6	2164137	2164142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479151819
31111	NC_021013	ATTT	2	8	2164189	2164196	25 %	75 %	0 %	0 %	479151820
31112	NC_021013	AGA	2	6	2164216	2164221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151820
31113	NC_021013	ATG	2	6	2164238	2164243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151820
31114	NC_021013	TAT	2	6	2164259	2164264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479151820
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31116	NC_021013	ATG	2	6	2164290	2164295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151820
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31229	NC_021013	GAT	2	6	2171482	2171487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151828
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31231	NC_021013	TGA	2	6	2171566	2171571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151828
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31233	NC_021013	CCCG	2	8	2171719	2171726	0 %	0 %	25 %	75 %	479151828
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31235	NC_021013	ACT	2	6	2172054	2172059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151829
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31342	NC_021013	CCG	2	6	2180571	2180576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151834
31343	NC_021013	GGGC	2	8	2180611	2180618	0 %	0 %	75 %	25 %	479151834
31344	NC_021013	GTTTC	2	10	2180670	2180679	0 %	60 %	20 %	20 %	479151834
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31347	NC_021013	TGA	2	6	2180967	2180972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151834
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31466	NC_021013	CCA	2	6	2186911	2186916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479151840
31467	NC_021013	AAG	2	6	2186926	2186931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151840
31468	NC_021013	A	6	6	2186955	2186960	100 %	0 %	0 %	0 %	479151840
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31472	NC_021013	CGGG	2	8	2187104	2187111	0 %	0 %	75 %	25 %	479151840
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31492	NC_021013	AGA	2	6	2188012	2188017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151840
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31496	NC_021013	CCG	2	6	2188444	2188449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151841
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