MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 32304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26502	NC_021013	TCA	3	9	1850889	1850897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151547
26503	NC_021013	TTGC	2	8	1850922	1850929	0 %	50 %	25 %	25 %	479151547
26504	NC_021013	ATG	2	6	1850985	1850990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151547
26505	NC_021013	CTG	2	6	1851141	1851146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151547
26506	NC_021013	CCT	2	6	1851157	1851162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479151547
26507	NC_021013	TTC	2	6	1851170	1851175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151547
26508	NC_021013	GATT	2	8	1851218	1851225	25 %	50 %	25 %	0 %	479151547
26509	NC_021013	T	6	6	1851238	1851243	0 %	100 %	0 %	0 %	479151547
26510	NC_021013	T	6	6	1851281	1851286	0 %	100 %	0 %	0 %	479151547
26511	NC_021013	TGAA	2	8	1851368	1851375	50 %	25 %	25 %	0 %	479151547
26512	NC_021013	GCC	2	6	1851381	1851386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151547
26513	NC_021013	GTT	2	6	1851534	1851539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151547
26514	NC_021013	TCAT	2	8	1851609	1851616	25 %	50 %	0 %	25 %	479151547
26515	NC_021013	T	7	7	1851627	1851633	0 %	100 %	0 %	0 %	479151547
26516	NC_021013	ATT	2	6	1851723	1851728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479151548
26517	NC_021013	CTG	2	6	1851859	1851864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151548
26518	NC_021013	CAA	2	6	1851933	1851938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479151548
26519	NC_021013	CTGT	2	8	1851959	1851966	0 %	50 %	25 %	25 %	479151548
26520	NC_021013	CAG	2	6	1851984	1851989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151548
26521	NC_021013	TCG	2	6	1852004	1852009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151548
26522	NC_021013	ATC	2	6	1852036	1852041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151548
26523	NC_021013	TTG	2	6	1852056	1852061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151548
26524	NC_021013	T	6	6	1852180	1852185	0 %	100 %	0 %	0 %	479151548
26525	NC_021013	ATT	2	6	1852584	1852589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479151549
26526	NC_021013	A	6	6	1852616	1852621	100 %	0 %	0 %	0 %	479151549
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26529	NC_021013	TTCCG	2	10	1852786	1852795	0 %	40 %	20 %	40 %	479151549
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26532	NC_021013	ATC	2	6	1852846	1852851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151549
26533	NC_021013	AT	3	6	1852867	1852872	50 %	50 %	0 %	0 %	479151549
26534	NC_021013	T	6	6	1852872	1852877	0 %	100 %	0 %	0 %	479151549
26535	NC_021013	TTGCAA	2	12	1852944	1852955	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479151549
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26537	NC_021013	CATG	2	8	1853203	1853210	25 %	25 %	25 %	25 %	479151549
26538	NC_021013	AAT	2	6	1853271	1853276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479151549
26539	NC_021013	AAT	2	6	1853286	1853291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479151549
26540	NC_021013	CTGC	2	8	1853331	1853338	0 %	25 %	25 %	50 %	479151549
26541	NC_021013	CCGC	2	8	1853387	1853394	0 %	0 %	25 %	75 %	479151549
26542	NC_021013	T	6	6	1853464	1853469	0 %	100 %	0 %	0 %	479151549
26543	NC_021013	CTT	2	6	1853478	1853483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151549
26544	NC_021013	TTC	2	6	1853484	1853489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151549
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26546	NC_021013	TTAA	2	8	1853581	1853588	50 %	50 %	0 %	0 %	479151550
26547	NC_021013	GAC	2	6	1853637	1853642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151550
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26549	NC_021013	CT	3	6	1853789	1853794	0 %	50 %	0 %	50 %	479151550
26550	NC_021013	GTT	2	6	1853916	1853921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151550
26551	NC_021013	T	6	6	1853920	1853925	0 %	100 %	0 %	0 %	479151550
26552	NC_021013	GCC	2	6	1853949	1853954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151550
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26554	NC_021013	CAA	2	6	1854154	1854159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479151550
26555	NC_021013	TTC	2	6	1854170	1854175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151550
26556	NC_021013	TTC	2	6	1854251	1854256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151550
26557	NC_021013	CTGTT	2	10	1854275	1854284	0 %	60 %	20 %	20 %	479151550
26558	NC_021013	CTGT	2	8	1854328	1854335	0 %	50 %	25 %	25 %	479151550
26559	NC_021013	T	6	6	1854420	1854425	0 %	100 %	0 %	0 %	479151550
26560	NC_021013	AC	3	6	1854457	1854462	50 %	0 %	0 %	50 %	479151550
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26562	NC_021013	ACAA	2	8	1854567	1854574	75 %	0 %	0 %	25 %	479151550
26563	NC_021013	ACT	2	6	1854621	1854626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151550
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26565	NC_021013	TGA	2	6	1855011	1855016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151551
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26570	NC_021013	ATT	2	6	1855298	1855303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479151552
26571	NC_021013	AACA	2	8	1855316	1855323	75 %	0 %	0 %	25 %	479151552
26572	NC_021013	CAT	2	6	1855435	1855440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151553
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26586	NC_021013	GAT	2	6	1856016	1856021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151553
26587	NC_021013	TCA	2	6	1856046	1856051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151553
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26589	NC_021013	GAG	2	6	1856121	1856126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479151553
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26597	NC_021013	ACTG	2	8	1856937	1856944	25 %	25 %	25 %	25 %	479151554
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26599	NC_021013	CAG	2	6	1856997	1857002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151554
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26601	NC_021013	TG	3	6	1857133	1857138	0 %	50 %	50 %	0 %	479151554
26602	NC_021013	TCT	2	6	1857139	1857144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151554
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26608	NC_021013	CAA	2	6	1857555	1857560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479151554
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26613	NC_021013	GAAA	2	8	1858228	1858235	75 %	0 %	25 %	0 %	479151555
26614	NC_021013	TGC	2	6	1858244	1858249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151555
26615	NC_021013	GCG	2	6	1858254	1858259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151555
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26617	NC_021013	CAG	2	6	1858298	1858303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151555
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26967	NC_021013	ACCTGT	2	12	1880624	1880635	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479151574
26968	NC_021013	GCA	2	6	1880640	1880645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151574
26969	NC_021013	TGA	2	6	1880855	1880860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151574
26970	NC_021013	TGT	2	6	1880870	1880875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151574
26971	NC_021013	TTG	2	6	1880887	1880892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151574
26972	NC_021013	TATG	2	8	1880948	1880955	25 %	50 %	25 %	0 %	479151574
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26975	NC_021013	AGTTGA	2	12	1881131	1881142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151574
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26978	NC_021013	TAG	2	6	1881226	1881231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151574
26979	NC_021013	AGAA	2	8	1881314	1881321	75 %	0 %	25 %	0 %	479151574
26980	NC_021013	TAA	2	6	1881351	1881356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479151574
26981	NC_021013	ATTT	2	8	1881373	1881380	25 %	75 %	0 %	0 %	479151574
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26983	NC_021013	ATCTGC	2	12	1881395	1881406	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479151574
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26988	NC_021013	AGT	2	6	1881653	1881658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151574
26989	NC_021013	T	6	6	1881658	1881663	0 %	100 %	0 %	0 %	479151574
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26995	NC_021013	GTA	2	6	1881893	1881898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151574
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26999	NC_021013	T	6	6	1882040	1882045	0 %	100 %	0 %	0 %	479151574
27000	NC_021013	GTA	2	6	1882065	1882070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151574

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