MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 32304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26001	NC_021013	CCCGTC	2	12	1816846	1816857	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	479151521
26002	NC_021013	GTTT	2	8	1816941	1816948	0 %	75 %	25 %	0 %	479151521
26003	NC_021013	AGC	2	6	1816968	1816973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151521
26004	NC_021013	CGA	2	6	1817022	1817027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151521
26005	NC_021013	CGG	2	6	1817040	1817045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151521
26006	NC_021013	TCG	2	6	1817125	1817130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151521
26007	NC_021013	GCGCC	2	10	1817312	1817321	0 %	0 %	40 %	60 %	479151521
26008	NC_021013	GAA	2	6	1817401	1817406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151521
26009	NC_021013	CTT	2	6	1817425	1817430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151521
26010	NC_021013	CGA	2	6	1817433	1817438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151521
26011	NC_021013	AGG	2	6	1817466	1817471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479151521
26012	NC_021013	GAA	2	6	1817483	1817488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151522
26013	NC_021013	GCT	2	6	1817593	1817598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151522
26014	NC_021013	CGGT	2	8	1817677	1817684	0 %	25 %	50 %	25 %	479151522
26015	NC_021013	CTG	2	6	1817691	1817696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151522
26016	NC_021013	GGTC	2	8	1817714	1817721	0 %	25 %	50 %	25 %	479151522
26017	NC_021013	CAGC	2	8	1817744	1817751	25 %	0 %	25 %	50 %	479151522
26018	NC_021013	CT	3	6	1817875	1817880	0 %	50 %	0 %	50 %	479151523
26019	NC_021013	CAG	2	6	1818055	1818060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151523
26020	NC_021013	A	6	6	1819613	1819618	100 %	0 %	0 %	0 %	479151524
26021	NC_021013	ACT	2	6	1819633	1819638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151524
26022	NC_021013	AGC	2	6	1819671	1819676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151524
26023	NC_021013	ACT	2	6	1819828	1819833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151524
26024	NC_021013	AGGCCG	2	12	1819843	1819854	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479151524
26025	NC_021013	CGA	2	6	1819880	1819885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151524
26026	NC_021013	GAAA	2	8	1819907	1819914	75 %	0 %	25 %	0 %	479151524
26027	NC_021013	GCA	2	6	1819919	1819924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151524
26028	NC_021013	GGC	2	6	1820018	1820023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151524
26029	NC_021013	CGA	2	6	1820030	1820035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151524
26030	NC_021013	ATT	2	6	1820050	1820055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479151524
26031	NC_021013	CAA	3	9	1820093	1820101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479151524
26032	NC_021013	GCG	2	6	1820185	1820190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151524
26033	NC_021013	AGG	2	6	1820206	1820211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479151524
26034	NC_021013	CTT	2	6	1820226	1820231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151524
26035	NC_021013	TGA	2	6	1820234	1820239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151524
26036	NC_021013	GCC	2	6	1820343	1820348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151524
26037	NC_021013	CG	3	6	1820389	1820394	0 %	0 %	50 %	50 %	479151524
26038	NC_021013	CCAAAG	2	12	1820410	1820421	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479151524
26039	NC_021013	A	6	6	1820820	1820825	100 %	0 %	0 %	0 %	479151525
26040	NC_021013	CTG	2	6	1820827	1820832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151525
26041	NC_021013	AG	3	6	1820844	1820849	50 %	0 %	50 %	0 %	479151525
26042	NC_021013	CT	3	6	1821027	1821032	0 %	50 %	0 %	50 %	479151525
26043	NC_021013	GCG	2	6	1821119	1821124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151525
26044	NC_021013	TGC	2	6	1821161	1821166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151525
26045	NC_021013	GCC	2	6	1821295	1821300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151525
26046	NC_021013	GCC	2	6	1821379	1821384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151525
26047	NC_021013	ATG	2	6	1821406	1821411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151525
26048	NC_021013	ATT	2	6	1821470	1821475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479151525
26049	NC_021013	T	7	7	1821506	1821512	0 %	100 %	0 %	0 %	479151525
26050	NC_021013	AT	3	6	1821528	1821533	50 %	50 %	0 %	0 %	479151525
26051	NC_021013	ATG	2	6	1821577	1821582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151525
26052	NC_021013	TGT	2	6	1821594	1821599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151525
26053	NC_021013	CGA	2	6	1821612	1821617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151525
26054	NC_021013	CAA	3	9	1821693	1821701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479151525
26055	NC_021013	GAC	2	6	1821763	1821768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151525
26056	NC_021013	ATG	2	6	1821790	1821795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151525
26057	NC_021013	CCG	2	6	1821821	1821826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151525
26058	NC_021013	AGC	2	6	1821836	1821841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151525
26059	NC_021013	CAG	2	6	1821913	1821918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151525
26060	NC_021013	TTC	2	6	1821938	1821943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151525
26061	NC_021013	TTA	2	6	1822079	1822084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479151525
26062	NC_021013	CAA	2	6	1822089	1822094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479151525
26063	NC_021013	ATTG	2	8	1822167	1822174	25 %	50 %	25 %	0 %	479151525
26064	NC_021013	GGC	3	9	1822242	1822250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151525
26065	NC_021013	TCAT	2	8	1822274	1822281	25 %	50 %	0 %	25 %	479151525
26066	NC_021013	GGC	2	6	1822291	1822296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151525
26067	NC_021013	ATT	2	6	1822429	1822434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479151525
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26069	NC_021013	GAA	2	6	1822528	1822533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151525
26070	NC_021013	GTC	2	6	1822630	1822635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151525
26071	NC_021013	CGA	2	6	1822755	1822760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151525
26072	NC_021013	TGT	2	6	1822767	1822772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151525
26073	NC_021013	GA	3	6	1823076	1823081	50 %	0 %	50 %	0 %	479151525
26074	NC_021013	GAC	2	6	1823103	1823108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151525
26075	NC_021013	GT	3	6	1823123	1823128	0 %	50 %	50 %	0 %	479151525
26076	NC_021013	CGG	3	9	1823130	1823138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151525
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26083	NC_021013	CCG	2	6	1823327	1823332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151526
26084	NC_021013	AACA	2	8	1823442	1823449	75 %	0 %	0 %	25 %	479151526
26085	NC_021013	ACT	2	6	1823486	1823491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151526
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26087	NC_021013	CGG	3	9	1823783	1823791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151526
26088	NC_021013	TGA	2	6	1823796	1823801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151526
26089	NC_021013	TC	3	6	1823827	1823832	0 %	50 %	0 %	50 %	479151526
26090	NC_021013	CAG	2	6	1823895	1823900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151526
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26094	NC_021013	CGGG	2	8	1824138	1824145	0 %	0 %	75 %	25 %	479151527
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26099	NC_021013	GAC	2	6	1824481	1824486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151527
26100	NC_021013	GCA	2	6	1824487	1824492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151527
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26103	NC_021013	CCA	2	6	1824612	1824617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479151527
26104	NC_021013	GCG	2	6	1824620	1824625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151527
26105	NC_021013	ATC	2	6	1824635	1824640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151527
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26111	NC_021013	GTT	2	6	1824797	1824802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151527
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26113	NC_021013	ACC	3	9	1824929	1824937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479151527
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26353	NC_021013	GTC	2	6	1842732	1842737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151541
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