MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 32304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23118	NC_021013	TGA	2	6	1624441	1624446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151371
23119	NC_021013	GGT	2	6	1624484	1624489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479151371
23120	NC_021013	TGA	2	6	1624519	1624524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151371
23121	NC_021013	GAA	2	6	1624549	1624554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151371
23122	NC_021013	A	6	6	1624557	1624562	100 %	0 %	0 %	0 %	479151371
23123	NC_021013	CAA	2	6	1624593	1624598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479151371
23124	NC_021013	GAA	2	6	1624622	1624627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151371
23125	NC_021013	TGCT	2	8	1624644	1624651	0 %	50 %	25 %	25 %	479151371
23126	NC_021013	TTG	2	6	1624743	1624748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151371
23127	NC_021013	CTG	2	6	1624764	1624769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151371
23128	NC_021013	ATT	2	6	1624782	1624787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479151371
23129	NC_021013	TCAG	2	8	1624795	1624802	25 %	25 %	25 %	25 %	479151371
23130	NC_021013	TGA	2	6	1624861	1624866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151371
23131	NC_021013	CTTC	2	8	1624868	1624875	0 %	50 %	0 %	50 %	479151371
23132	NC_021013	GAA	2	6	1625021	1625026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151371
23133	NC_021013	ATG	2	6	1625085	1625090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151371
23134	NC_021013	AGAC	2	8	1625179	1625186	50 %	0 %	25 %	25 %	479151372
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23136	NC_021013	CCT	2	6	1625313	1625318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479151372
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23139	NC_021013	AAGA	2	8	1625462	1625469	75 %	0 %	25 %	0 %	479151372
23140	NC_021013	CTG	2	6	1625488	1625493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151372
23141	NC_021013	TGT	2	6	1625501	1625506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151372
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23145	NC_021013	TGA	2	6	1625987	1625992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151372
23146	NC_021013	TA	3	6	1626048	1626053	50 %	50 %	0 %	0 %	479151372
23147	NC_021013	AG	3	6	1626078	1626083	50 %	0 %	50 %	0 %	479151372
23148	NC_021013	AC	3	6	1626137	1626142	50 %	0 %	0 %	50 %	479151372
23149	NC_021013	GAC	2	6	1626162	1626167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151372
23150	NC_021013	ATGT	2	8	1626172	1626179	25 %	50 %	25 %	0 %	479151372
23151	NC_021013	AGA	2	6	1626236	1626241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151372
23152	NC_021013	TGA	2	6	1626269	1626274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151372
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23154	NC_021013	GCC	2	6	1626291	1626296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151372
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23156	NC_021013	AGAA	2	8	1626506	1626513	75 %	0 %	25 %	0 %	479151372
23157	NC_021013	TTCCGA	2	12	1626550	1626561	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479151372
23158	NC_021013	TCT	2	6	1626565	1626570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151372
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23175	NC_021013	CTGAGC	2	12	1627717	1627728	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479151372
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23217	NC_021013	A	6	6	1629565	1629570	100 %	0 %	0 %	0 %	479151375
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23224	NC_021013	CTA	2	6	1629857	1629862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151375
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23226	NC_021013	GTAA	2	8	1629910	1629917	50 %	25 %	25 %	0 %	479151375
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23228	NC_021013	A	7	7	1630817	1630823	100 %	0 %	0 %	0 %	479151376
23229	NC_021013	AAT	2	6	1630855	1630860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479151376
23230	NC_021013	ATC	2	6	1630898	1630903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151376
23231	NC_021013	TGT	2	6	1630915	1630920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151376
23232	NC_021013	GAT	2	6	1630952	1630957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151376
23233	NC_021013	TATG	2	8	1630978	1630985	25 %	50 %	25 %	0 %	479151376
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23353	NC_021013	TTG	2	6	1637013	1637018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151383
23354	NC_021013	GGC	2	6	1637036	1637041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151383
23355	NC_021013	GAG	2	6	1637096	1637101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479151383
23356	NC_021013	GAT	2	6	1637156	1637161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151383
23357	NC_021013	GAT	2	6	1637246	1637251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151383
23358	NC_021013	AT	3	6	1637491	1637496	50 %	50 %	0 %	0 %	479151383
23359	NC_021013	GTAT	2	8	1637532	1637539	25 %	50 %	25 %	0 %	479151383
23360	NC_021013	AGA	2	6	1637542	1637547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151383
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23362	NC_021013	TTAAG	2	10	1637562	1637571	40 %	40 %	20 %	0 %	479151383
23363	NC_021013	AAGAA	2	10	1637593	1637602	80 %	0 %	20 %	0 %	479151383
23364	NC_021013	GATG	2	8	1637665	1637672	25 %	25 %	50 %	0 %	479151383
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23368	NC_021013	AGA	2	6	1637713	1637718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151383
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23372	NC_021013	CGG	2	6	1638028	1638033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151384
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23381	NC_021013	GGCA	2	8	1638484	1638491	25 %	0 %	50 %	25 %	479151385
23382	NC_021013	GT	3	6	1638529	1638534	0 %	50 %	50 %	0 %	479151385
23383	NC_021013	TTC	2	6	1638552	1638557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151385
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23388	NC_021013	TGA	2	6	1638997	1639002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151385
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23433	NC_021013	GGC	2	6	1641981	1641986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151386
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23437	NC_021013	CAG	2	6	1642195	1642200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151386
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23439	NC_021013	GACA	2	8	1642559	1642566	50 %	0 %	25 %	25 %	479151387
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23444	NC_021013	CGG	2	6	1642914	1642919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151388
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23448	NC_021013	GTA	2	6	1643122	1643127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151388
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23453	NC_021013	CTCATA	2	12	1643351	1643362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151388
23454	NC_021013	GATT	2	8	1643382	1643389	25 %	50 %	25 %	0 %	479151388
23455	NC_021013	CGG	2	6	1643601	1643606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151388
23456	NC_021013	TAT	2	6	1643616	1643621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479151388
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23459	NC_021013	GGT	2	6	1643833	1643838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479151388
23460	NC_021013	GTA	2	6	1643884	1643889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151388
23461	NC_021013	TGA	2	6	1643916	1643921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151388
23462	NC_021013	GCG	2	6	1643954	1643959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151388
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23464	NC_021013	GGCAA	2	10	1644100	1644109	40 %	0 %	40 %	20 %	479151388
23465	NC_021013	GTT	3	9	1644112	1644120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151388
23466	NC_021013	A	6	6	1645668	1645673	100 %	0 %	0 %	0 %	479151389
23467	NC_021013	GCT	2	6	1645699	1645704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151389
23468	NC_021013	TTA	2	6	1645799	1645804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479151389
23469	NC_021013	TGA	2	6	1645824	1645829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151389
23470	NC_021013	GTTCA	2	10	1645864	1645873	20 %	40 %	20 %	20 %	479151389
23471	NC_021013	GGT	2	6	1645897	1645902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479151389
23472	NC_021013	TTA	2	6	1645934	1645939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479151389
23473	NC_021013	CGG	3	9	1645992	1646000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151389
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23475	NC_021013	ATG	2	6	1646426	1646431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151389
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23480	NC_021013	AAG	2	6	1646866	1646871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151389
23481	NC_021013	GTA	2	6	1646893	1646898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151389
23482	NC_021013	CAG	2	6	1646944	1646949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151389
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23487	NC_021013	TGA	2	6	1647422	1647427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151390
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23491	NC_021013	ATA	2	6	1647586	1647591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479151390
23492	NC_021013	A	6	6	1647635	1647640	100 %	0 %	0 %	0 %	479151390
23493	NC_021013	A	6	6	1647642	1647647	100 %	0 %	0 %	0 %	479151390
23494	NC_021013	CTT	2	6	1647687	1647692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151390
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23496	NC_021013	ATT	2	6	1647724	1647729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479151390
23497	NC_021013	CT	3	6	1647739	1647744	0 %	50 %	0 %	50 %	479151390
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23499	NC_021013	TGA	2	6	1647911	1647916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151390
23500	NC_021013	A	6	6	1647927	1647932	100 %	0 %	0 %	0 %	479151390

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