MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 32304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_021013	ATC	2	6	1302296	1302301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151111
18503	NC_021013	GTT	2	6	1302389	1302394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151111
18504	NC_021013	GGT	2	6	1302424	1302429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479151111
18505	NC_021013	T	7	7	1302544	1302550	0 %	100 %	0 %	0 %	479151111
18506	NC_021013	TTC	2	6	1302796	1302801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151112
18507	NC_021013	TGAG	2	8	1302808	1302815	25 %	25 %	50 %	0 %	479151112
18508	NC_021013	TTGT	2	8	1302877	1302884	0 %	75 %	25 %	0 %	479151112
18509	NC_021013	TGA	2	6	1302965	1302970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151112
18510	NC_021013	TTC	2	6	1302973	1302978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151112
18511	NC_021013	TTTGT	2	10	1302989	1302998	0 %	80 %	20 %	0 %	479151112
18512	NC_021013	GA	3	6	1303067	1303072	50 %	0 %	50 %	0 %	479151112
18513	NC_021013	CT	4	8	1303211	1303218	0 %	50 %	0 %	50 %	479151112
18514	NC_021013	CGA	2	6	1303221	1303226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151112
18515	NC_021013	TTC	2	6	1303272	1303277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151112
18516	NC_021013	T	6	6	1303297	1303302	0 %	100 %	0 %	0 %	479151112
18517	NC_021013	TCA	2	6	1303574	1303579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151113
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18519	NC_021013	AAT	2	6	1303658	1303663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479151113
18520	NC_021013	T	6	6	1303683	1303688	0 %	100 %	0 %	0 %	479151113
18521	NC_021013	CGG	2	6	1303749	1303754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151113
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18524	NC_021013	CTT	2	6	1303839	1303844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151113
18525	NC_021013	TCC	2	6	1303931	1303936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479151114
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18528	NC_021013	GT	3	6	1304103	1304108	0 %	50 %	50 %	0 %	479151115
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18533	NC_021013	CTTT	2	8	1304422	1304429	0 %	75 %	0 %	25 %	479151115
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18537	NC_021013	TGTC	2	8	1305360	1305367	0 %	50 %	25 %	25 %	479151116
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18539	NC_021013	T	7	7	1305421	1305427	0 %	100 %	0 %	0 %	479151116
18540	NC_021013	TCT	2	6	1305520	1305525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151117
18541	NC_021013	TA	3	6	1305542	1305547	50 %	50 %	0 %	0 %	479151117
18542	NC_021013	GGTG	2	8	1305553	1305560	0 %	25 %	75 %	0 %	479151117
18543	NC_021013	AAGA	2	8	1305568	1305575	75 %	0 %	25 %	0 %	479151117
18544	NC_021013	GAT	2	6	1305662	1305667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151117
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18550	NC_021013	ATG	2	6	1305994	1305999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151118
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18552	NC_021013	A	6	6	1306128	1306133	100 %	0 %	0 %	0 %	479151118
18553	NC_021013	GAA	2	6	1306142	1306147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151118
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18556	NC_021013	ATG	3	9	1307153	1307161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151119
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18559	NC_021013	CTT	2	6	1307398	1307403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151119
18560	NC_021013	TACGC	2	10	1307425	1307434	20 %	20 %	20 %	40 %	479151119
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18603	NC_021013	CAGA	2	8	1312331	1312338	50 %	0 %	25 %	25 %	479151122
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18608	NC_021013	A	6	6	1312654	1312659	100 %	0 %	0 %	0 %	479151122
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18619	NC_021013	TGCT	2	8	1313794	1313801	0 %	50 %	25 %	25 %	479151124
18620	NC_021013	AT	3	6	1313843	1313848	50 %	50 %	0 %	0 %	479151124
18621	NC_021013	GGT	2	6	1313961	1313966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479151124
18622	NC_021013	TTGCAA	2	12	1313980	1313991	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479151124
18623	NC_021013	CGA	2	6	1314026	1314031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151124
18624	NC_021013	TTG	2	6	1314115	1314120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151124
18625	NC_021013	CAA	2	6	1314218	1314223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479151124
18626	NC_021013	CTT	2	6	1314484	1314489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151125
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18629	NC_021013	TTC	2	6	1314617	1314622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151125
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18632	NC_021013	CAG	2	6	1314698	1314703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151125
18633	NC_021013	AC	3	6	1314722	1314727	50 %	0 %	0 %	50 %	479151125
18634	NC_021013	TTA	2	6	1314740	1314745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479151125
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18641	NC_021013	CT	3	6	1315178	1315183	0 %	50 %	0 %	50 %	479151126
18642	NC_021013	TCA	2	6	1315186	1315191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151126
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18645	NC_021013	GGT	2	6	1315280	1315285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479151126
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18648	NC_021013	TCA	2	6	1315393	1315398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151126
18649	NC_021013	GTG	3	9	1315440	1315448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479151126
18650	NC_021013	TGG	2	6	1315450	1315455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479151126
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18654	NC_021013	CT	3	6	1315646	1315651	0 %	50 %	0 %	50 %	479151126
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18720	NC_021013	T	6	6	1321937	1321942	0 %	100 %	0 %	0 %	479151131
18721	NC_021013	GAT	2	6	1321946	1321951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151131
18722	NC_021013	TTGTCG	2	12	1321989	1322000	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479151131
18723	NC_021013	TTGAT	2	10	1322046	1322055	20 %	60 %	20 %	0 %	479151131
18724	NC_021013	CTT	2	6	1322125	1322130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151131
18725	NC_021013	CAA	2	6	1322239	1322244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479151131
18726	NC_021013	TCA	2	6	1322355	1322360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151131
18727	NC_021013	GGA	2	6	1322362	1322367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479151131
18728	NC_021013	TAC	2	6	1322369	1322374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151131
18729	NC_021013	GA	3	6	1322382	1322387	50 %	0 %	50 %	0 %	479151131
18730	NC_021013	CCG	2	6	1322541	1322546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151132
18731	NC_021013	T	7	7	1322613	1322619	0 %	100 %	0 %	0 %	479151132
18732	NC_021013	TTAA	2	8	1323234	1323241	50 %	50 %	0 %	0 %	479151133
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18852	NC_021013	AACC	2	8	1331075	1331082	50 %	0 %	0 %	50 %	479151142
18853	NC_021013	TTA	2	6	1331110	1331115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479151142
18854	NC_021013	TAC	2	6	1331127	1331132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151142
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18967	NC_021013	TCA	2	6	1337911	1337916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151148
18968	NC_021013	ATGTG	2	10	1337931	1337940	20 %	40 %	40 %	0 %	479151148
18969	NC_021013	GCT	2	6	1338075	1338080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151148
18970	NC_021013	TCC	2	6	1338192	1338197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479151148
18971	NC_021013	TTC	2	6	1338218	1338223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151148
18972	NC_021013	GAA	2	6	1338274	1338279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151148
18973	NC_021013	AGC	2	6	1338282	1338287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151148
18974	NC_021013	A	6	6	1338307	1338312	100 %	0 %	0 %	0 %	479151148
18975	NC_021013	AGT	2	6	1338444	1338449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151149
18976	NC_021013	TTC	2	6	1338555	1338560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151149
18977	NC_021013	GCATT	2	10	1338581	1338590	20 %	40 %	20 %	20 %	479151149
18978	NC_021013	AATG	2	8	1338649	1338656	50 %	25 %	25 %	0 %	479151149
18979	NC_021013	GGA	2	6	1338735	1338740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479151149
18980	NC_021013	GAC	2	6	1338805	1338810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151149
18981	NC_021013	CAT	2	6	1339126	1339131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151150
18982	NC_021013	CAGA	2	8	1339151	1339158	50 %	0 %	25 %	25 %	479151150
18983	NC_021013	TGA	2	6	1339187	1339192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151150
18984	NC_021013	GAA	3	9	1339281	1339289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151150
18985	NC_021013	TGC	2	6	1339346	1339351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151150
18986	NC_021013	TCTG	2	8	1339378	1339385	0 %	50 %	25 %	25 %	479151150
18987	NC_021013	CTA	2	6	1339417	1339422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151150
18988	NC_021013	ATG	3	9	1339462	1339470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151150
18989	NC_021013	TGA	2	6	1339496	1339501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151150
18990	NC_021013	ATGA	2	8	1339578	1339585	50 %	25 %	25 %	0 %	479151150
18991	NC_021013	TGT	2	6	1339604	1339609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151150
18992	NC_021013	CGG	4	12	1339619	1339630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151150
18993	NC_021013	TCAA	2	8	1339725	1339732	50 %	25 %	0 %	25 %	479151150
18994	NC_021013	AAG	2	6	1339824	1339829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151150
18995	NC_021013	TGA	2	6	1339856	1339861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151150
18996	NC_021013	AGA	2	6	1339900	1339905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151150
18997	NC_021013	GCGCAG	2	12	1339918	1339929	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479151150
18998	NC_021013	GCT	2	6	1339938	1339943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151150
18999	NC_021013	CAA	2	6	1339952	1339957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479151150
19000	NC_021013	AAG	2	6	1339974	1339979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151150

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