MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 32304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_021013	TGA	2	6	1049455	1049460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150908
15002	NC_021013	TGT	2	6	1049467	1049472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150908
15003	NC_021013	ATC	2	6	1049495	1049500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150908
15004	NC_021013	TAA	2	6	1049533	1049538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150908
15005	NC_021013	AAC	2	6	1049561	1049566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150908
15006	NC_021013	AATT	2	8	1049576	1049583	50 %	50 %	0 %	0 %	479150908
15007	NC_021013	ATA	2	6	1049653	1049658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150909
15008	NC_021013	CAAA	3	12	1049677	1049688	75 %	0 %	0 %	25 %	479150909
15009	NC_021013	TCG	2	6	1049726	1049731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150909
15010	NC_021013	TTG	2	6	1049732	1049737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150909
15011	NC_021013	CTG	2	6	1049773	1049778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150909
15012	NC_021013	TTCT	2	8	1049860	1049867	0 %	75 %	0 %	25 %	479150909
15013	NC_021013	TGT	2	6	1049933	1049938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150909
15014	NC_021013	AG	4	8	1049992	1049999	50 %	0 %	50 %	0 %	479150909
15015	NC_021013	GA	3	6	1050077	1050082	50 %	0 %	50 %	0 %	479150909
15016	NC_021013	AGA	2	6	1050086	1050091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150909
15017	NC_021013	CAT	2	6	1050121	1050126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150909
15018	NC_021013	TGA	2	6	1050140	1050145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150909
15019	NC_021013	TTG	2	6	1050266	1050271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150910
15020	NC_021013	GTTTTC	2	12	1050283	1050294	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479150910
15021	NC_021013	TG	3	6	1050344	1050349	0 %	50 %	50 %	0 %	479150910
15022	NC_021013	TTTGT	2	10	1050402	1050411	0 %	80 %	20 %	0 %	479150910
15023	NC_021013	GCAGCC	2	12	1050451	1050462	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479150910
15024	NC_021013	T	6	6	1050505	1050510	0 %	100 %	0 %	0 %	479150910
15025	NC_021013	AAAAG	2	10	1050655	1050664	80 %	0 %	20 %	0 %	479150910
15026	NC_021013	ATA	2	6	1050738	1050743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150911
15027	NC_021013	CT	3	6	1050943	1050948	0 %	50 %	0 %	50 %	479150911
15028	NC_021013	CTG	2	6	1050997	1051002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150911
15029	NC_021013	GTT	2	6	1051010	1051015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150911
15030	NC_021013	CAA	2	6	1051099	1051104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150911
15031	NC_021013	AAAGAA	2	12	1051118	1051129	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479150911
15032	NC_021013	GTT	2	6	1051181	1051186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150911
15033	NC_021013	GAAC	2	8	1051216	1051223	50 %	0 %	25 %	25 %	479150911
15034	NC_021013	TGA	2	6	1051228	1051233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150911
15035	NC_021013	GCAG	2	8	1051243	1051250	25 %	0 %	50 %	25 %	479150911
15036	NC_021013	TGA	2	6	1051270	1051275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150911
15037	NC_021013	TTG	2	6	1051308	1051313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150911
15038	NC_021013	A	6	6	1051329	1051334	100 %	0 %	0 %	0 %	479150911
15039	NC_021013	GCACG	2	10	1051363	1051372	20 %	0 %	40 %	40 %	479150911
15040	NC_021013	TGT	2	6	1051375	1051380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150911
15041	NC_021013	A	6	6	1051386	1051391	100 %	0 %	0 %	0 %	479150911
15042	NC_021013	CTA	2	6	1051428	1051433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150911
15043	NC_021013	TAT	3	9	1051462	1051470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150911
15044	NC_021013	GGTAAA	2	12	1051564	1051575	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479150911
15045	NC_021013	TTC	2	6	1051602	1051607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150911
15046	NC_021013	A	6	6	1051986	1051991	100 %	0 %	0 %	0 %	479150912
15047	NC_021013	GCG	2	6	1052011	1052016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150912
15048	NC_021013	TC	3	6	1052020	1052025	0 %	50 %	0 %	50 %	479150912
15049	NC_021013	TC	3	6	1052221	1052226	0 %	50 %	0 %	50 %	479150912
15050	NC_021013	AT	3	6	1052343	1052348	50 %	50 %	0 %	0 %	479150912
15051	NC_021013	GAT	2	6	1052479	1052484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150912
15052	NC_021013	TTG	2	6	1052522	1052527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150912
15053	NC_021013	GCG	2	6	1052536	1052541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150912
15054	NC_021013	T	6	6	1052591	1052596	0 %	100 %	0 %	0 %	479150912
15055	NC_021013	ACTTGA	2	12	1052782	1052793	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479150913
15056	NC_021013	CAG	2	6	1052900	1052905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150913
15057	NC_021013	GAT	2	6	1052909	1052914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150913
15058	NC_021013	CGG	2	6	1052953	1052958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150913
15059	NC_021013	CAGG	2	8	1052993	1053000	25 %	0 %	50 %	25 %	479150913
15060	NC_021013	GCAC	2	8	1053073	1053080	25 %	0 %	25 %	50 %	479150913
15061	NC_021013	GGA	2	6	1053089	1053094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150913
15062	NC_021013	CT	3	6	1053100	1053105	0 %	50 %	0 %	50 %	479150913
15063	NC_021013	CAA	2	6	1053133	1053138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150913
15064	NC_021013	TAT	2	6	1053166	1053171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150913
15065	NC_021013	GAG	2	6	1053176	1053181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150913
15066	NC_021013	AAG	2	6	1053220	1053225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150913
15067	NC_021013	CCT	2	6	1053240	1053245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150913
15068	NC_021013	ATT	2	6	1053272	1053277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150913
15069	NC_021013	ACAT	2	8	1053287	1053294	50 %	25 %	0 %	25 %	479150913
15070	NC_021013	CA	3	6	1053319	1053324	50 %	0 %	0 %	50 %	479150913
15071	NC_021013	TGT	2	6	1053340	1053345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150913
15072	NC_021013	AAG	2	6	1053352	1053357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150913
15073	NC_021013	GTT	2	6	1053437	1053442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150913
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15075	NC_021013	GTT	2	6	1053698	1053703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150913
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15077	NC_021013	GCTC	2	8	1053975	1053982	0 %	25 %	25 %	50 %	479150913
15078	NC_021013	TTGCAA	2	12	1054035	1054046	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479150913
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15085	NC_021013	TAT	2	6	1054483	1054488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150913
15086	NC_021013	GAG	2	6	1054646	1054651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150913
15087	NC_021013	CCG	2	6	1054730	1054735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150913
15088	NC_021013	TCAAA	2	10	1054809	1054818	60 %	20 %	0 %	20 %	479150913
15089	NC_021013	CAA	2	6	1054819	1054824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150913
15090	NC_021013	GTCC	2	8	1054877	1054884	0 %	25 %	25 %	50 %	479150913
15091	NC_021013	GTG	2	6	1054905	1054910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150913
15092	NC_021013	CAAT	2	8	1054926	1054933	50 %	25 %	0 %	25 %	479150913
15093	NC_021013	TTG	2	6	1054935	1054940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150913
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15096	NC_021013	A	6	6	1055167	1055172	100 %	0 %	0 %	0 %	479150914
15097	NC_021013	AC	3	6	1055203	1055208	50 %	0 %	0 %	50 %	479150914
15098	NC_021013	GTG	2	6	1055238	1055243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150914
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15101	NC_021013	TGT	2	6	1055601	1055606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150914
15102	NC_021013	TCAATG	2	12	1055615	1055626	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479150914
15103	NC_021013	CGA	2	6	1055664	1055669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150914
15104	NC_021013	GT	3	6	1055768	1055773	0 %	50 %	50 %	0 %	479150915
15105	NC_021013	GAC	2	6	1055816	1055821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150915
15106	NC_021013	CGG	3	9	1055830	1055838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150915
15107	NC_021013	CAAA	2	8	1055893	1055900	75 %	0 %	0 %	25 %	479150915
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15111	NC_021013	CTT	2	6	1056191	1056196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150915
15112	NC_021013	AAG	2	6	1056237	1056242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150915
15113	NC_021013	GAAAA	2	10	1056291	1056300	80 %	0 %	20 %	0 %	479150915
15114	NC_021013	GAA	2	6	1056341	1056346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150915
15115	NC_021013	ATGT	2	8	1056635	1056642	25 %	50 %	25 %	0 %	479150916
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15236	NC_021013	GGC	2	6	1072137	1072142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150926
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15352	NC_021013	CGG	2	6	1079600	1079605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150932
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