MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 67186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_021012	GAT	2	6	1200332	1200337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147186
19003	NC_021012	ATT	2	6	1200344	1200349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479147186
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19005	NC_021012	GAT	2	6	1200413	1200418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147187
19006	NC_021012	TGA	2	6	1200424	1200429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147187
19007	NC_021012	AGG	2	6	1200502	1200507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479147187
19008	NC_021012	CAT	2	6	1200594	1200599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147187
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19012	NC_021012	AT	3	6	1200899	1200904	50 %	50 %	0 %	0 %	479147187
19013	NC_021012	TTC	2	6	1200916	1200921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479147187
19014	NC_021012	AGA	2	6	1201001	1201006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147187
19015	NC_021012	AATAA	2	10	1201051	1201060	80 %	20 %	0 %	0 %	479147187
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19017	NC_021012	GCA	3	9	1201111	1201119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147188
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19019	NC_021012	AAG	2	6	1201136	1201141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147188
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19025	NC_021012	GA	3	6	1201258	1201263	50 %	0 %	50 %	0 %	479147188
19026	NC_021012	GAAA	2	8	1201269	1201276	75 %	0 %	25 %	0 %	479147188
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19118	NC_021012	AG	3	6	1207372	1207377	50 %	0 %	50 %	0 %	479147192
19119	NC_021012	TGT	2	6	1207413	1207418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479147192
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19232	NC_021012	ATT	2	6	1212964	1212969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479147198
19233	NC_021012	CAGG	2	8	1212991	1212998	25 %	0 %	50 %	25 %	479147198
19234	NC_021012	T	6	6	1213010	1213015	0 %	100 %	0 %	0 %	479147198
19235	NC_021012	GCT	2	6	1213027	1213032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479147198
19236	NC_021012	GTG	2	6	1213033	1213038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479147198
19237	NC_021012	G	7	7	1213089	1213095	0 %	0 %	100 %	0 %	479147198
19238	NC_021012	TG	3	6	1213123	1213128	0 %	50 %	50 %	0 %	479147198
19239	NC_021012	TCC	2	6	1213165	1213170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479147198
19240	NC_021012	A	6	6	1213226	1213231	100 %	0 %	0 %	0 %	479147199
19241	NC_021012	A	7	7	1213290	1213296	100 %	0 %	0 %	0 %	479147199
19242	NC_021012	TATT	2	8	1213299	1213306	25 %	75 %	0 %	0 %	479147199
19243	NC_021012	T	7	7	1213305	1213311	0 %	100 %	0 %	0 %	479147199
19244	NC_021012	TCA	2	6	1213325	1213330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147199
19245	NC_021012	T	8	8	1213347	1213354	0 %	100 %	0 %	0 %	479147199
19246	NC_021012	G	6	6	1213361	1213366	0 %	0 %	100 %	0 %	479147199
19247	NC_021012	ATG	2	6	1213370	1213375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147199
19248	NC_021012	ATT	2	6	1213466	1213471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479147199
19249	NC_021012	ATC	2	6	1213560	1213565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147199
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19252	NC_021012	GCA	2	6	1213793	1213798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147200
19253	NC_021012	A	8	8	1213817	1213824	100 %	0 %	0 %	0 %	479147200
19254	NC_021012	GCA	2	6	1213836	1213841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147200
19255	NC_021012	CTT	3	9	1213857	1213865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479147200
19256	NC_021012	GTG	2	6	1213866	1213871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479147200
19257	NC_021012	A	6	6	1213914	1213919	100 %	0 %	0 %	0 %	479147200
19258	NC_021012	GAC	2	6	1214138	1214143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147200
19259	NC_021012	GAG	2	6	1214175	1214180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479147200
19260	NC_021012	GCG	3	9	1214182	1214190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479147200
19261	NC_021012	TGG	2	6	1214245	1214250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479147200
19262	NC_021012	G	6	6	1214255	1214260	0 %	0 %	100 %	0 %	479147200
19263	NC_021012	ATT	2	6	1214306	1214311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479147200
19264	NC_021012	GTA	2	6	1214337	1214342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147200
19265	NC_021012	AGG	2	6	1214356	1214361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479147200
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19267	NC_021012	AG	3	6	1215332	1215337	50 %	0 %	50 %	0 %	479147201
19268	NC_021012	T	6	6	1215475	1215480	0 %	100 %	0 %	0 %	479147201
19269	NC_021012	CCGG	2	8	1215520	1215527	0 %	0 %	50 %	50 %	479147201
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19283	NC_021012	GCT	2	6	1216400	1216405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479147201
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19314	NC_021012	TCA	2	6	1220169	1220174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147205
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19327	NC_021012	TA	3	6	1220814	1220819	50 %	50 %	0 %	0 %	479147206
19328	NC_021012	ATG	2	6	1220877	1220882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147206
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19332	NC_021012	TG	3	6	1221001	1221006	0 %	50 %	50 %	0 %	479147206
19333	NC_021012	GAT	2	6	1221050	1221055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147206
19334	NC_021012	CGA	2	6	1221066	1221071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147206
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19336	NC_021012	A	7	7	1221095	1221101	100 %	0 %	0 %	0 %	479147206
19337	NC_021012	A	6	6	1221144	1221149	100 %	0 %	0 %	0 %	479147206
19338	NC_021012	TGA	2	6	1221169	1221174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147206
19339	NC_021012	TGA	2	6	1221187	1221192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147206
19340	NC_021012	AGAAA	2	10	1221217	1221226	80 %	0 %	20 %	0 %	479147206
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19342	NC_021012	AGC	2	6	1221302	1221307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147206
19343	NC_021012	AT	3	6	1223203	1223208	50 %	50 %	0 %	0 %	479147207
19344	NC_021012	A	8	8	1223234	1223241	100 %	0 %	0 %	0 %	479147207
19345	NC_021012	GAAA	2	8	1223289	1223296	75 %	0 %	25 %	0 %	479147208
19346	NC_021012	GGT	2	6	1223297	1223302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479147208
19347	NC_021012	AG	3	6	1223314	1223319	50 %	0 %	50 %	0 %	479147208
19348	NC_021012	TCTT	2	8	1223373	1223380	0 %	75 %	0 %	25 %	479147208
19349	NC_021012	CAGA	2	8	1223394	1223401	50 %	0 %	25 %	25 %	479147208
19350	NC_021012	CAGG	2	8	1223493	1223500	25 %	0 %	50 %	25 %	479147208
19351	NC_021012	AGA	2	6	1223513	1223518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147208
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19472	NC_021012	AAG	2	6	1231893	1231898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147215
19473	NC_021012	GAC	2	6	1231907	1231912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147215
19474	NC_021012	GCC	2	6	1231958	1231963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479147215
19475	NC_021012	CGAT	2	8	1232028	1232035	25 %	25 %	25 %	25 %	479147215
19476	NC_021012	CTT	2	6	1232171	1232176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479147215
19477	NC_021012	T	6	6	1232204	1232209	0 %	100 %	0 %	0 %	479147215
19478	NC_021012	GGT	2	6	1232266	1232271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479147215
19479	NC_021012	CAG	2	6	1232342	1232347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147215
19480	NC_021012	CCG	2	6	1232361	1232366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479147215
19481	NC_021012	TGA	2	6	1232367	1232372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147215
19482	NC_021012	ATC	2	6	1232423	1232428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147215
19483	NC_021012	ATT	2	6	1232456	1232461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479147215
19484	NC_021012	AG	3	6	1232567	1232572	50 %	0 %	50 %	0 %	479147215
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19487	NC_021012	ATG	2	6	1232696	1232701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147215
19488	NC_021012	ATG	2	6	1232708	1232713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147215
19489	NC_021012	TCT	2	6	1232725	1232730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479147215
19490	NC_021012	GC	3	6	1232754	1232759	0 %	0 %	50 %	50 %	479147215
19491	NC_021012	TCA	2	6	1232805	1232810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147215
19492	NC_021012	GAT	3	9	1232818	1232826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147215
19493	NC_021012	GCA	2	6	1232876	1232881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147215
19494	NC_021012	AGC	2	6	1232884	1232889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147215
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19496	NC_021012	A	6	6	1232938	1232943	100 %	0 %	0 %	0 %	479147215
19497	NC_021012	GAA	2	6	1232948	1232953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147215
19498	NC_021012	GGA	2	6	1233028	1233033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479147215
19499	NC_021012	ATC	2	6	1233071	1233076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147215
19500	NC_021012	ATG	2	6	1233129	1233134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147215

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