MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 67186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_021012	AAC	2	6	1022946	1022951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479147026
16003	NC_021012	CCG	2	6	1022993	1022998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479147026
16004	NC_021012	ATG	2	6	1023055	1023060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147026
16005	NC_021012	GCA	2	6	1023096	1023101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147026
16006	NC_021012	AGC	2	6	1023104	1023109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147026
16007	NC_021012	AGC	2	6	1023140	1023145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147026
16008	NC_021012	AG	4	8	1023160	1023167	50 %	0 %	50 %	0 %	479147026
16009	NC_021012	GAA	2	6	1023191	1023196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147026
16010	NC_021012	GTACAG	2	12	1023210	1023221	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479147026
16011	NC_021012	AAT	2	6	1023270	1023275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479147026
16012	NC_021012	CCG	2	6	1023278	1023283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479147026
16013	NC_021012	AAT	3	9	1023291	1023299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479147026
16014	NC_021012	AAT	2	6	1023318	1023323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479147026
16015	NC_021012	GAA	2	6	1023349	1023354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147026
16016	NC_021012	GAA	2	6	1023406	1023411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147026
16017	NC_021012	AAC	2	6	1023474	1023479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479147026
16018	NC_021012	GTG	2	6	1023496	1023501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479147026
16019	NC_021012	TGG	2	6	1023509	1023514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479147026
16020	NC_021012	GCA	3	9	1023561	1023569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147026
16021	NC_021012	GGA	2	6	1023572	1023577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479147026
16022	NC_021012	AG	3	6	1023597	1023602	50 %	0 %	50 %	0 %	479147026
16023	NC_021012	GAAA	2	8	1023661	1023668	75 %	0 %	25 %	0 %	479147026
16024	NC_021012	GAA	2	6	1023692	1023697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147026
16025	NC_021012	AAG	2	6	1023705	1023710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147026
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16027	NC_021012	CAG	2	6	1023732	1023737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147026
16028	NC_021012	AG	3	6	1023789	1023794	50 %	0 %	50 %	0 %	479147026
16029	NC_021012	GCAG	2	8	1023890	1023897	25 %	0 %	50 %	25 %	479147026
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16032	NC_021012	TAG	2	6	1023997	1024002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147026
16033	NC_021012	GACA	2	8	1024085	1024092	50 %	0 %	25 %	25 %	479147026
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16035	NC_021012	CA	3	6	1024109	1024114	50 %	0 %	0 %	50 %	479147026
16036	NC_021012	AGA	2	6	1024150	1024155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147026
16037	NC_021012	ATGCGT	2	12	1024197	1024208	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479147026
16038	NC_021012	GCA	2	6	1024245	1024250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147026
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16053	NC_021012	ATC	3	9	1025064	1025072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147026
16054	NC_021012	CGTC	2	8	1025081	1025088	0 %	25 %	25 %	50 %	479147026
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16088	NC_021012	TG	3	6	1027095	1027100	0 %	50 %	50 %	0 %	479147029
16089	NC_021012	TGC	2	6	1027166	1027171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479147029
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16101	NC_021012	TA	3	6	1027724	1027729	50 %	50 %	0 %	0 %	479147029
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16114	NC_021012	AG	3	6	1028353	1028358	50 %	0 %	50 %	0 %	479147030
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16117	NC_021012	GCA	2	6	1028476	1028481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147030
16118	NC_021012	CGA	2	6	1028497	1028502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147030
16119	NC_021012	CCG	2	6	1028514	1028519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479147030
16120	NC_021012	GTG	2	6	1028542	1028547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479147030
16121	NC_021012	CGA	2	6	1028614	1028619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147030
16122	NC_021012	A	6	6	1028627	1028632	100 %	0 %	0 %	0 %	479147030
16123	NC_021012	CGGT	2	8	1028635	1028642	0 %	25 %	50 %	25 %	479147030
16124	NC_021012	TCT	2	6	1028654	1028659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479147030
16125	NC_021012	AGT	2	6	1028687	1028692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147030
16126	NC_021012	GGA	2	6	1028720	1028725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479147030
16127	NC_021012	CATC	2	8	1028737	1028744	25 %	25 %	0 %	50 %	479147030
16128	NC_021012	AAT	2	6	1028769	1028774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479147030
16129	NC_021012	CTT	2	6	1028954	1028959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479147031
16130	NC_021012	CAG	2	6	1028982	1028987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147031
16131	NC_021012	AC	3	6	1029018	1029023	50 %	0 %	0 %	50 %	479147031
16132	NC_021012	AG	3	6	1029037	1029042	50 %	0 %	50 %	0 %	479147031
16133	NC_021012	TGATG	2	10	1029148	1029157	20 %	40 %	40 %	0 %	479147031
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16136	NC_021012	ACAGGC	2	12	1029265	1029276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147031
16137	NC_021012	TTG	2	6	1029378	1029383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479147031
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16139	NC_021012	ACG	2	6	1029548	1029553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147031
16140	NC_021012	ACAG	2	8	1029584	1029591	50 %	0 %	25 %	25 %	479147031
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16143	NC_021012	TGA	2	6	1029676	1029681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147031
16144	NC_021012	GTAT	2	8	1029823	1029830	25 %	50 %	25 %	0 %	479147031
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16146	NC_021012	TCT	2	6	1029984	1029989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479147031
16147	NC_021012	ATCA	2	8	1030007	1030014	50 %	25 %	0 %	25 %	479147031
16148	NC_021012	GGC	2	6	1030034	1030039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479147031
16149	NC_021012	AGT	2	6	1030111	1030116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147031
16150	NC_021012	AAT	2	6	1030127	1030132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479147031
16151	NC_021012	GAG	2	6	1030392	1030397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479147032
16152	NC_021012	TGGT	2	8	1030459	1030466	0 %	50 %	50 %	0 %	479147032
16153	NC_021012	AAAG	2	8	1030493	1030500	75 %	0 %	25 %	0 %	479147032
16154	NC_021012	AGT	2	6	1030766	1030771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147033
16155	NC_021012	GCAG	2	8	1030838	1030845	25 %	0 %	50 %	25 %	479147033
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16160	NC_021012	TGG	2	6	1031026	1031031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479147033
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16162	NC_021012	CAA	2	6	1031143	1031148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479147033
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16180	NC_021012	CTTC	2	8	1032047	1032054	0 %	50 %	0 %	50 %	479147033
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16184	NC_021012	TTC	2	6	1032269	1032274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479147033
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16186	NC_021012	GA	3	6	1032388	1032393	50 %	0 %	50 %	0 %	479147033
16187	NC_021012	CAT	2	6	1032406	1032411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147033
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16193	NC_021012	GAT	2	6	1032622	1032627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147033
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16202	NC_021012	TGAT	2	8	1033309	1033316	25 %	50 %	25 %	0 %	479147034
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16204	NC_021012	TA	3	6	1033418	1033423	50 %	50 %	0 %	0 %	479147034
16205	NC_021012	T	6	6	1033473	1033478	0 %	100 %	0 %	0 %	479147034
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16207	NC_021012	TAG	2	6	1033627	1033632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147034
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16210	NC_021012	TTC	2	6	1035368	1035373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479147035
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16212	NC_021012	AAAT	2	8	1035419	1035426	75 %	25 %	0 %	0 %	479147035
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16215	NC_021012	GAA	2	6	1035485	1035490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147035
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16218	NC_021012	TGG	2	6	1035923	1035928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479147036
16219	NC_021012	ACAAG	2	10	1035947	1035956	60 %	0 %	20 %	20 %	479147036
16220	NC_021012	AAG	2	6	1035996	1036001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147036
16221	NC_021012	AGG	2	6	1036016	1036021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479147036
16222	NC_021012	CAGA	2	8	1036024	1036031	50 %	0 %	25 %	25 %	479147036
16223	NC_021012	TA	3	6	1036054	1036059	50 %	50 %	0 %	0 %	479147036
16224	NC_021012	GAA	2	6	1036084	1036089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147036
16225	NC_021012	CTT	2	6	1036284	1036289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479147037
16226	NC_021012	AATCAG	2	12	1036290	1036301	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479147037
16227	NC_021012	AGAA	2	8	1036303	1036310	75 %	0 %	25 %	0 %	479147037
16228	NC_021012	ATG	2	6	1036318	1036323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147037
16229	NC_021012	TGAT	2	8	1036342	1036349	25 %	50 %	25 %	0 %	479147037
16230	NC_021012	CCGT	2	8	1036453	1036460	0 %	25 %	25 %	50 %	479147037
16231	NC_021012	AGA	2	6	1036492	1036497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147037
16232	NC_021012	AGC	2	6	1036501	1036506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147037
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16353	NC_021012	CCG	2	6	1042849	1042854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479147042
16354	NC_021012	GAAC	2	8	1042973	1042980	50 %	0 %	25 %	25 %	479147042
16355	NC_021012	CTT	2	6	1042996	1043001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479147042
16356	NC_021012	CA	3	6	1043011	1043016	50 %	0 %	0 %	50 %	479147042
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16361	NC_021012	ATC	2	6	1043632	1043637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147043
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