MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 67186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_021012	TTTC	2	8	3449717	3449724	0 %	75 %	0 %	25 %	479149113
54002	NC_021012	TGG	2	6	3449738	3449743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479149113
54003	NC_021012	CTGG	2	8	3449745	3449752	0 %	25 %	50 %	25 %	479149113
54004	NC_021012	A	6	6	3449764	3449769	100 %	0 %	0 %	0 %	479149113
54005	NC_021012	GGC	2	6	3449796	3449801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479149113
54006	NC_021012	CTGCT	2	10	3449962	3449971	0 %	40 %	20 %	40 %	479149113
54007	NC_021012	ATT	2	6	3450000	3450005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479149113
54008	NC_021012	GAA	2	6	3450011	3450016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479149113
54009	NC_021012	ATTT	2	8	3450027	3450034	25 %	75 %	0 %	0 %	479149113
54010	NC_021012	GAT	2	6	3450046	3450051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479149113
54011	NC_021012	CAG	2	6	3450067	3450072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479149113
54012	NC_021012	AGT	2	6	3450099	3450104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479149113
54013	NC_021012	GTA	2	6	3450130	3450135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479149113
54014	NC_021012	GAT	2	6	3450172	3450177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479149113
54015	NC_021012	TAT	2	6	3450310	3450315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479149114
54016	NC_021012	AGT	2	6	3450361	3450366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479149114
54017	NC_021012	T	6	6	3450382	3450387	0 %	100 %	0 %	0 %	479149114
54018	NC_021012	CGA	2	6	3450512	3450517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479149114
54019	NC_021012	TGTTTT	2	12	3450521	3450532	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	479149114
54020	NC_021012	ATC	2	6	3450538	3450543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479149114
54021	NC_021012	TG	3	6	3450555	3450560	0 %	50 %	50 %	0 %	479149114
54022	NC_021012	ATTG	2	8	3450570	3450577	25 %	50 %	25 %	0 %	479149114
54023	NC_021012	TAT	2	6	3450612	3450617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479149114
54024	NC_021012	GTT	2	6	3450639	3450644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479149114
54025	NC_021012	TGC	2	6	3450723	3450728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479149114
54026	NC_021012	AT	3	6	3450729	3450734	50 %	50 %	0 %	0 %	479149114
54027	NC_021012	CTT	2	6	3450748	3450753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479149114
54028	NC_021012	TAT	2	6	3450766	3450771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479149114
54029	NC_021012	AT	3	6	3450788	3450793	50 %	50 %	0 %	0 %	479149114
54030	NC_021012	GGT	2	6	3450794	3450799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479149114
54031	NC_021012	T	6	6	3450827	3450832	0 %	100 %	0 %	0 %	479149114
54032	NC_021012	ATT	2	6	3450859	3450864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479149114
54033	NC_021012	T	6	6	3450871	3450876	0 %	100 %	0 %	0 %	479149114
54034	NC_021012	A	6	6	3450916	3450921	100 %	0 %	0 %	0 %	479149114
54035	NC_021012	TTTA	2	8	3450928	3450935	25 %	75 %	0 %	0 %	479149114
54036	NC_021012	ATG	2	6	3450976	3450981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479149114
54037	NC_021012	TA	3	6	3451043	3451048	50 %	50 %	0 %	0 %	479149114
54038	NC_021012	GCT	2	6	3451083	3451088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479149114
54039	NC_021012	AT	3	6	3451143	3451148	50 %	50 %	0 %	0 %	479149114
54040	NC_021012	TACTG	2	10	3451157	3451166	20 %	40 %	20 %	20 %	479149114
54041	NC_021012	GGAT	2	8	3451168	3451175	25 %	25 %	50 %	0 %	479149114
54042	NC_021012	T	6	6	3451189	3451194	0 %	100 %	0 %	0 %	479149114
54043	NC_021012	CGTTA	2	10	3451206	3451215	20 %	40 %	20 %	20 %	479149114
54044	NC_021012	TTGC	2	8	3451327	3451334	0 %	50 %	25 %	25 %	479149114
54045	NC_021012	CGA	2	6	3451352	3451357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479149114
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54048	NC_021012	CGGG	2	8	3451434	3451441	0 %	0 %	75 %	25 %	479149115
54049	NC_021012	CGT	2	6	3451447	3451452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479149115
54050	NC_021012	TACT	2	8	3451501	3451508	25 %	50 %	0 %	25 %	479149115
54051	NC_021012	A	7	7	3451546	3451552	100 %	0 %	0 %	0 %	479149115
54052	NC_021012	A	6	6	3451603	3451608	100 %	0 %	0 %	0 %	479149115
54053	NC_021012	ATT	2	6	3451610	3451615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479149115
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54055	NC_021012	TGA	2	6	3451656	3451661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479149115
54056	NC_021012	GGT	2	6	3451708	3451713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479149115
54057	NC_021012	CCGG	2	8	3451745	3451752	0 %	0 %	50 %	50 %	479149115
54058	NC_021012	CAA	2	6	3451765	3451770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479149115
54059	NC_021012	TG	3	6	3451787	3451792	0 %	50 %	50 %	0 %	479149115
54060	NC_021012	CTA	2	6	3451897	3451902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479149115
54061	NC_021012	TCTG	2	8	3451917	3451924	0 %	50 %	25 %	25 %	479149115
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54063	NC_021012	A	6	6	3452042	3452047	100 %	0 %	0 %	0 %	479149115
54064	NC_021012	GAA	2	6	3452057	3452062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479149115
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54068	NC_021012	TCA	2	6	3452283	3452288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479149115
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54070	NC_021012	GA	3	6	3452500	3452505	50 %	0 %	50 %	0 %	479149115
54071	NC_021012	TCA	2	6	3452550	3452555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479149115
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54084	NC_021012	TGA	2	6	3453081	3453086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479149116
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54089	NC_021012	TCA	2	6	3453475	3453480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479149116
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54092	NC_021012	A	8	8	3453854	3453861	100 %	0 %	0 %	0 %	479149117
54093	NC_021012	TTTA	2	8	3453865	3453872	25 %	75 %	0 %	0 %	479149117
54094	NC_021012	GGAT	2	8	3453890	3453897	25 %	25 %	50 %	0 %	479149117
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54101	NC_021012	ATA	2	6	3454059	3454064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479149117
54102	NC_021012	CAA	2	6	3454138	3454143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479149117
54103	NC_021012	TCT	2	6	3454173	3454178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479149117
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54105	NC_021012	A	7	7	3454245	3454251	100 %	0 %	0 %	0 %	479149117
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54110	NC_021012	GCA	2	6	3454477	3454482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479149117
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54114	NC_021012	CCGCA	2	10	3454876	3454885	20 %	0 %	20 %	60 %	479149117
54115	NC_021012	GA	3	6	3454966	3454971	50 %	0 %	50 %	0 %	479149117
54116	NC_021012	AGG	2	6	3455004	3455009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479149117
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54118	NC_021012	ACT	2	6	3455147	3455152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479149118
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54233	NC_021012	CAATG	2	10	3461646	3461655	40 %	20 %	20 %	20 %	479149123
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54241	NC_021012	A	7	7	3462082	3462088	100 %	0 %	0 %	0 %	479149123
54242	NC_021012	GCA	2	6	3462127	3462132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479149123
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