MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 67186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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51002	NC_021012	TGG	2	6	3259211	3259216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479148931
51003	NC_021012	GCA	2	6	3259237	3259242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148931
51004	NC_021012	TGG	2	6	3259274	3259279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479148931
51005	NC_021012	GAA	2	6	3259283	3259288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148931
51006	NC_021012	A	6	6	3259291	3259296	100 %	0 %	0 %	0 %	479148931
51007	NC_021012	CA	3	6	3259297	3259302	50 %	0 %	0 %	50 %	479148931
51008	NC_021012	GGA	2	6	3259307	3259312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148931
51009	NC_021012	GCACT	2	10	3259366	3259375	20 %	20 %	20 %	40 %	479148931
51010	NC_021012	CAT	2	6	3259551	3259556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148931
51011	NC_021012	GAT	2	6	3259657	3259662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148931
51012	NC_021012	AGA	2	6	3259683	3259688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148931
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51014	NC_021012	A	6	6	3259799	3259804	100 %	0 %	0 %	0 %	479148932
51015	NC_021012	TATT	2	8	3259807	3259814	25 %	75 %	0 %	0 %	479148932
51016	NC_021012	CAG	2	6	3259869	3259874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148932
51017	NC_021012	GGC	2	6	3259884	3259889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148932
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51019	NC_021012	GAT	2	6	3260088	3260093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148932
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51022	NC_021012	A	7	7	3260358	3260364	100 %	0 %	0 %	0 %	479148934
51023	NC_021012	CAGT	2	8	3260408	3260415	25 %	25 %	25 %	25 %	479148934
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51033	NC_021012	GGA	2	6	3260683	3260688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148934
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51053	NC_021012	TACAG	2	10	3261488	3261497	40 %	20 %	20 %	20 %	479148935
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51112	NC_021012	TTTA	2	8	3264261	3264268	25 %	75 %	0 %	0 %	479148938
51113	NC_021012	GGTT	2	8	3264318	3264325	0 %	50 %	50 %	0 %	479148938
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51116	NC_021012	GAT	2	6	3264403	3264408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148938
51117	NC_021012	AGA	2	6	3264411	3264416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148938
51118	NC_021012	GGA	2	6	3264418	3264423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148938
51119	NC_021012	AAT	2	6	3264425	3264430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479148938
51120	NC_021012	GAA	2	6	3264491	3264496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148939
51121	NC_021012	CCG	2	6	3264499	3264504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479148939
51122	NC_021012	GAAAG	2	10	3264513	3264522	60 %	0 %	40 %	0 %	479148939
51123	NC_021012	GAA	2	6	3264528	3264533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148939
51124	NC_021012	CGA	2	6	3264619	3264624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148939
51125	NC_021012	GCC	2	6	3264683	3264688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479148939
51126	NC_021012	TA	3	6	3264696	3264701	50 %	50 %	0 %	0 %	479148939
51127	NC_021012	A	6	6	3264755	3264760	100 %	0 %	0 %	0 %	479148939
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51132	NC_021012	AT	4	8	3264901	3264908	50 %	50 %	0 %	0 %	479148939
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51136	NC_021012	T	6	6	3264999	3265004	0 %	100 %	0 %	0 %	479148940
51137	NC_021012	ATGC	2	8	3265075	3265082	25 %	25 %	25 %	25 %	479148940
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51146	NC_021012	AGA	2	6	3265302	3265307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148940
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51151	NC_021012	TGC	2	6	3265610	3265615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148940
51152	NC_021012	AT	3	6	3265629	3265634	50 %	50 %	0 %	0 %	479148940
51153	NC_021012	TGC	2	6	3265665	3265670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148940
51154	NC_021012	T	6	6	3265724	3265729	0 %	100 %	0 %	0 %	479148940
51155	NC_021012	AGAA	2	8	3265826	3265833	75 %	0 %	25 %	0 %	479148940
51156	NC_021012	GTA	2	6	3265888	3265893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148940
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51185	NC_021012	GCA	2	6	3267306	3267311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148940
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51203	NC_021012	ATG	2	6	3268063	3268068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148941
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51214	NC_021012	GTT	2	6	3268647	3268652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479148941
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51218	NC_021012	AT	3	6	3268754	3268759	50 %	50 %	0 %	0 %	479148941
51219	NC_021012	TAT	2	6	3268788	3268793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148941
51220	NC_021012	GGC	2	6	3268797	3268802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148941
51221	NC_021012	TGC	2	6	3268808	3268813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148941
51222	NC_021012	GGC	2	6	3268842	3268847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148941
51223	NC_021012	CAT	2	6	3268921	3268926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148941
51224	NC_021012	ATA	2	6	3268936	3268941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479148941
51225	NC_021012	AAATA	2	10	3269167	3269176	80 %	20 %	0 %	0 %	479148941
51226	NC_021012	CAGG	2	8	3269178	3269185	25 %	0 %	50 %	25 %	479148941
51227	NC_021012	AG	3	6	3269228	3269233	50 %	0 %	50 %	0 %	479148941
51228	NC_021012	GA	3	6	3269255	3269260	50 %	0 %	50 %	0 %	479148941
51229	NC_021012	CAGA	2	8	3269292	3269299	50 %	0 %	25 %	25 %	479148941
51230	NC_021012	AGGA	2	8	3269303	3269310	50 %	0 %	50 %	0 %	479148941
51231	NC_021012	GCGAA	2	10	3269331	3269340	40 %	0 %	40 %	20 %	479148941
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51233	NC_021012	CCA	2	6	3269381	3269386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479148941
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51467	NC_021012	AGC	2	6	3283975	3283980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148955
51468	NC_021012	TGA	2	6	3284052	3284057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148955
51469	NC_021012	A	6	6	3284063	3284068	100 %	0 %	0 %	0 %	479148955
51470	NC_021012	TGT	2	6	3284119	3284124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479148955
51471	NC_021012	ATCGGT	2	12	3284126	3284137	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479148955
51472	NC_021012	TTA	2	6	3284263	3284268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148955
51473	NC_021012	CGC	2	6	3284400	3284405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479148955
51474	NC_021012	TCC	2	6	3284450	3284455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479148955
51475	NC_021012	GAG	2	6	3284472	3284477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148955
51476	NC_021012	GA	4	8	3284493	3284500	50 %	0 %	50 %	0 %	479148955
51477	NC_021012	GTG	2	6	3284505	3284510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479148956
51478	NC_021012	GAGC	2	8	3284518	3284525	25 %	0 %	50 %	25 %	479148956
51479	NC_021012	A	6	6	3284535	3284540	100 %	0 %	0 %	0 %	479148956
51480	NC_021012	TG	3	6	3284602	3284607	0 %	50 %	50 %	0 %	479148956
51481	NC_021012	GGA	2	6	3284618	3284623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148956
51482	NC_021012	GGT	2	6	3284628	3284633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479148956
51483	NC_021012	GTC	2	6	3284643	3284648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148956
51484	NC_021012	TGA	2	6	3284651	3284656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148956
51485	NC_021012	TGA	2	6	3284687	3284692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148956
51486	NC_021012	ATG	2	6	3284707	3284712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148956
51487	NC_021012	AGA	2	6	3284756	3284761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148956
51488	NC_021012	TAT	2	6	3284784	3284789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148956
51489	NC_021012	TA	3	6	3284797	3284802	50 %	50 %	0 %	0 %	479148956
51490	NC_021012	ACG	2	6	3284934	3284939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148957
51491	NC_021012	ATG	2	6	3285010	3285015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148957
51492	NC_021012	TGT	2	6	3285041	3285046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479148957
51493	NC_021012	ATC	2	6	3285078	3285083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148957
51494	NC_021012	CAATC	2	10	3285098	3285107	40 %	20 %	0 %	40 %	479148957
51495	NC_021012	GCA	3	9	3285192	3285200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148957
51496	NC_021012	GGTACT	2	12	3285221	3285232	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479148957
51497	NC_021012	ACT	2	6	3285249	3285254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148957
51498	NC_021012	GAGATC	2	12	3285357	3285368	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479148957
51499	NC_021012	GCAG	2	8	3285413	3285420	25 %	0 %	50 %	25 %	479148957
51500	NC_021012	AT	3	6	3285452	3285457	50 %	50 %	0 %	0 %	479148957

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