MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Breinl

Total Repeats: 22486

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020993	ATA	2	6	44	49	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693374
2	NC_020993	GGA	2	6	70	75	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478693374
3	NC_020993	ATA	2	6	108	113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693374
4	NC_020993	AGA	3	9	145	153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693374
5	NC_020993	GTA	2	6	181	186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693374
6	NC_020993	TAA	2	6	332	337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693375
7	NC_020993	ATT	2	6	350	355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693375
8	NC_020993	TTC	2	6	391	396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478693375
9	NC_020993	CTTT	2	8	402	409	0 %	75 %	0 %	25 %	478693375
10	NC_020993	AAT	3	9	412	420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693375
11	NC_020993	AAT	2	6	460	465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693375
12	NC_020993	T	6	6	514	519	0 %	100 %	0 %	0 %	478693375
13	NC_020993	T	6	6	589	594	0 %	100 %	0 %	0 %	478693375
14	NC_020993	AAAAT	2	10	605	614	80 %	20 %	0 %	0 %	478693375
15	NC_020993	TC	3	6	616	621	0 %	50 %	0 %	50 %	478693375
16	NC_020993	TTAT	2	8	641	648	25 %	75 %	0 %	0 %	478693375
17	NC_020993	T	6	6	668	673	0 %	100 %	0 %	0 %	478693375
18	NC_020993	AAG	2	6	675	680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693375
19	NC_020993	ACG	2	6	740	745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478693376
20	NC_020993	T	7	7	746	752	0 %	100 %	0 %	0 %	478693376
21	NC_020993	TCT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478693376
22	NC_020993	CTAA	2	8	810	817	50 %	25 %	0 %	25 %	478693376
23	NC_020993	ATT	2	6	843	848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693376
24	NC_020993	CAT	2	6	1015	1020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478693377
25	NC_020993	T	6	6	1073	1078	0 %	100 %	0 %	0 %	478693377
26	NC_020993	CCG	2	6	1123	1128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478693377
27	NC_020993	T	7	7	1279	1285	0 %	100 %	0 %	0 %	478693377
28	NC_020993	TA	3	6	1349	1354	50 %	50 %	0 %	0 %	478693378
29	NC_020993	A	6	6	1364	1369	100 %	0 %	0 %	0 %	478693378
30	NC_020993	T	6	6	1372	1377	0 %	100 %	0 %	0 %	478693378
31	NC_020993	ACG	3	9	1444	1452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478693378
32	NC_020993	T	6	6	1462	1467	0 %	100 %	0 %	0 %	478693378
33	NC_020993	T	7	7	1516	1522	0 %	100 %	0 %	0 %	478693378
34	NC_020993	CAG	2	6	1524	1529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478693378
35	NC_020993	AAG	2	6	1748	1753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693379
36	NC_020993	TTA	2	6	1846	1851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693379
37	NC_020993	CTTG	2	8	1869	1876	0 %	50 %	25 %	25 %	478693379
38	NC_020993	ATAGAT	2	12	1914	1925	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	478693379
39	NC_020993	TAAA	2	8	1933	1940	75 %	25 %	0 %	0 %	478693379
40	NC_020993	A	6	6	1943	1948	100 %	0 %	0 %	0 %	478693379
41	NC_020993	TAG	2	6	1987	1992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693379
42	NC_020993	TAA	2	6	1993	1998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693379
43	NC_020993	TGG	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478693379
44	NC_020993	ATT	2	6	2030	2035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693379
45	NC_020993	TTA	2	6	2046	2051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693379
46	NC_020993	AAG	2	6	2110	2115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693379
47	NC_020993	TAA	2	6	2156	2161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693379
48	NC_020993	AGA	2	6	2168	2173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693379
49	NC_020993	TAT	2	6	2204	2209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693379
50	NC_020993	TTG	2	6	2221	2226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478693379
51	NC_020993	CAT	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478693379
52	NC_020993	TAA	2	6	2312	2317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693379
53	NC_020993	AAT	2	6	2322	2327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693379
54	NC_020993	GTG	2	6	2356	2361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478693379
55	NC_020993	AAT	2	6	2626	2631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693380
56	NC_020993	GCA	2	6	2684	2689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478693380
57	NC_020993	AAG	2	6	2698	2703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693380
58	NC_020993	TAT	2	6	2722	2727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693380
59	NC_020993	GAAA	2	8	2764	2771	75 %	0 %	25 %	0 %	478693380
60	NC_020993	TC	3	6	2808	2813	0 %	50 %	0 %	50 %	478693380
61	NC_020993	TTAA	2	8	2816	2823	50 %	50 %	0 %	0 %	478693380
62	NC_020993	A	6	6	2934	2939	100 %	0 %	0 %	0 %	478693380
63	NC_020993	AAAG	2	8	2966	2973	75 %	0 %	25 %	0 %	478693380
64	NC_020993	TAATA	2	10	3004	3013	60 %	40 %	0 %	0 %	478693380
65	NC_020993	AGA	2	6	3017	3022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693380
66	NC_020993	TAT	2	6	3030	3035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693380
67	NC_020993	TAA	2	6	3043	3048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693380
68	NC_020993	ATC	2	6	3106	3111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478693380
69	NC_020993	A	7	7	3148	3154	100 %	0 %	0 %	0 %	478693380
70	NC_020993	TAT	2	6	3172	3177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693380
71	NC_020993	AAG	2	6	3216	3221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693380
72	NC_020993	ATA	2	6	3526	3531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693381
73	NC_020993	AG	3	6	3548	3553	50 %	0 %	50 %	0 %	478693381
74	NC_020993	A	6	6	3591	3596	100 %	0 %	0 %	0 %	478693381
75	NC_020993	ATT	2	6	3639	3644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693381
76	NC_020993	ACT	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478693381
77	NC_020993	GAT	2	6	3744	3749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693381
78	NC_020993	TGG	3	9	3785	3793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478693381
79	NC_020993	TGG	2	6	3797	3802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478693381
80	NC_020993	ATTGGT	2	12	3861	3872	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478693381
81	NC_020993	A	6	6	3878	3883	100 %	0 %	0 %	0 %	478693381
82	NC_020993	ATG	2	6	3889	3894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693381
83	NC_020993	TAA	2	6	3911	3916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693381
84	NC_020993	GCAAT	2	10	3942	3951	40 %	20 %	20 %	20 %	478693381
85	NC_020993	TAA	2	6	3968	3973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693381
86	NC_020993	A	7	7	4116	4122	100 %	0 %	0 %	0 %	478693382
87	NC_020993	ATA	2	6	4133	4138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693382
88	NC_020993	TGTA	2	8	4167	4174	25 %	50 %	25 %	0 %	478693382
89	NC_020993	TTA	2	6	4177	4182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693382
90	NC_020993	TTG	2	6	4418	4423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478693383
91	NC_020993	GTT	2	6	4449	4454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478693383
92	NC_020993	TGA	2	6	4542	4547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693383
93	NC_020993	CAA	2	6	4581	4586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478693383
94	NC_020993	TTG	2	6	4610	4615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478693383
95	NC_020993	AGCA	2	8	4638	4645	50 %	0 %	25 %	25 %	478693383
96	NC_020993	TAA	2	6	4662	4667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693383
97	NC_020993	GTT	2	6	4715	4720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478693383
98	NC_020993	A	7	7	4867	4873	100 %	0 %	0 %	0 %	478693383
99	NC_020993	ATT	2	6	4890	4895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693383
100	NC_020993	CAATTA	2	12	4975	4986	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	478693383
101	NC_020993	TATG	2	8	5008	5015	25 %	50 %	25 %	0 %	478693383
102	NC_020993	A	6	6	5087	5092	100 %	0 %	0 %	0 %	478693383
103	NC_020993	TTC	2	6	5109	5114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478693383
104	NC_020993	AGA	2	6	5151	5156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693383
105	NC_020993	AGA	2	6	5160	5165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693383
106	NC_020993	AT	3	6	5175	5180	50 %	50 %	0 %	0 %	478693383
107	NC_020993	TAAA	2	8	5186	5193	75 %	25 %	0 %	0 %	478693383
108	NC_020993	AAG	2	6	5216	5221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693383
109	NC_020993	T	6	6	5248	5253	0 %	100 %	0 %	0 %	478693383
110	NC_020993	AAG	2	6	5267	5272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693383
111	NC_020993	CTG	4	12	5309	5320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478693383
112	NC_020993	TAT	2	6	5322	5327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693383
113	NC_020993	TTA	2	6	5351	5356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693383
114	NC_020993	TA	3	6	5383	5388	50 %	50 %	0 %	0 %	478693383
115	NC_020993	ATT	2	6	6469	6474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693384
116	NC_020993	TTAT	2	8	6505	6512	25 %	75 %	0 %	0 %	478693384
117	NC_020993	CA	3	6	6591	6596	50 %	0 %	0 %	50 %	478693384
118	NC_020993	TAT	2	6	6638	6643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693384
119	NC_020993	GAA	2	6	6671	6676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693384
120	NC_020993	TTTA	2	8	6700	6707	25 %	75 %	0 %	0 %	478693384
121	NC_020993	ATT	2	6	6721	6726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693384
122	NC_020993	T	6	6	6731	6736	0 %	100 %	0 %	0 %	478693384
123	NC_020993	TGA	2	6	6755	6760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693384
124	NC_020993	TATCT	2	10	6864	6873	20 %	60 %	0 %	20 %	478693384
125	NC_020993	TAT	2	6	6881	6886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693384
126	NC_020993	TA	3	6	6907	6912	50 %	50 %	0 %	0 %	478693384
127	NC_020993	AT	3	6	6918	6923	50 %	50 %	0 %	0 %	478693384
128	NC_020993	T	6	6	6958	6963	0 %	100 %	0 %	0 %	478693384
129	NC_020993	TAT	2	6	6980	6985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693384
130	NC_020993	TAT	2	6	6994	6999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693384
131	NC_020993	ATT	2	6	7019	7024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693384
132	NC_020993	AGT	2	6	7042	7047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693384
133	NC_020993	ATT	2	6	7072	7077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693384
134	NC_020993	TA	3	6	7128	7133	50 %	50 %	0 %	0 %	478693384
135	NC_020993	T	6	6	7140	7145	0 %	100 %	0 %	0 %	478693384
136	NC_020993	TGAT	2	8	7166	7173	25 %	50 %	25 %	0 %	478693384
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